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一文搞定P2A,T2A

 老學究ev2fmzu9 2023-07-16 發(fā)布于江蘇

轉(zhuǎn)自:一文搞定P2A,T2A (baidu.com)

在生物醫(yī)學研究中,有時需要使用單個質(zhì)粒在細胞或生物體中同時表達多個基因,為此,已經(jīng)采用了幾種策略:

  1. 多個啟動子融合到基因的開放閱讀框架(ORFs);

  2. 基因間剪接信號的插入;由單一啟動子驅(qū)動表達的基因融合;

  3. 基因間蛋白裂解位點的插入;

  4. 基因間內(nèi)核糖體進入位點(IRESs)的插入。

這里重點介紹下IRES,因為IRES的使用很廣泛,原因主要有以下幾點:基因在IRES前后的共同表達; IRES后添加亞細胞定位序列的可行性; 含有IRES的商業(yè)表達質(zhì)粒的可用性。然而,IRES有兩個主要的局限性,首先就是因為IRES 通常都會大于500bp ,這可能會讓構(gòu)建病毒的質(zhì)粒變大,降低了病毒的滴度;其次就是位于IRES后的基因的翻譯效率遠低于位于IRES前的基因。因此自剪切多肽2A就應運而生,能夠克服以上兩個弊端。

自剪切多肽2A的命名及作用機制:自剪切多肽2A是源于口蹄疫病毒,2A多肽的平均長度為18-22個氨基酸。"2A"這個名稱是指小核糖核酸病毒多蛋白的一個特定區(qū)域,是由研究人員采用的系統(tǒng)命名法產(chǎn)生的。如下圖:

最近的報道表明,核糖體跳過了2A肽C端甘氨酸-脯氨酸肽鍵的合成,導致2A肽與其直接下游肽之間的分裂,結(jié)果如下。當然更深入的機制就是2A肽剪切反應發(fā)生在核糖體肽基轉(zhuǎn)移酶中心,且翻譯終止釋放因子Erf1、erf3密切參與此過程。

有4種2A Peptide目前研究的比較多,我們也對這4個效率做個總結(jié)。這是4中2A Peptide,包括P2A,T2A,E2A,F2A,前面的GSG 是為了提高切割效率加的序列。

作者先是構(gòu)建了幾個質(zhì)粒,將各個2A Peptide構(gòu)建到GFP 和mCherry 兩種熒光蛋白中間,后期可以用免疫熒光來進行觀察。

先是在HEK293細胞中研究切割效率,從B 圖可以直觀的看到P2A 的切割效率最高,計算的方式就是 切割效率=切割的/(切割的+未切割的) ,我們來看A圖,actin 為內(nèi)參,C 是對照。接著看下α-GFP ,切割的條帶越明顯說明切割效率越好,當然前提是表達的質(zhì)粒量是一樣的。B 圖就是對A 圖的定量分析。C圖的免疫熒光也是同樣的道理,因為發(fā)生了切割,綠色與紅色就是兩個不同的蛋白,不會發(fā)生重合,綠色越亮,效率越好。這些都說明了P2A 的切割效率最好。

當然作者也做了鼠的,斑馬魚的比較,結(jié)果都是P2A 的切割效率最好?,F(xiàn)在你們明白該選什么構(gòu)建比較好了嗎?

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