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[SABCS熱點(diǎn)] 克隆進(jìn)化與乳腺癌亞型——Samuel Aparicio教授訪談

 漸近故鄉(xiāng)時(shí) 2016-01-24

編者按:

  隨著下一代測序技術(shù)的應(yīng)用和對乳腺癌克隆進(jìn)化與基因突變模式的深入了解,對乳腺癌未來的診斷、治療會產(chǎn)生哪些影響?在第38屆圣安東尼奧乳腺癌(SABCS)大會上,《腫瘤瞭望》對加拿大英屬哥倫比亞大學(xué)Samuel Aparicio教授進(jìn)行了采訪。




  乳腺癌具有患者間與同一患者腫瘤內(nèi)的基因組變異性。以患者間的異源性分類早期乳腺癌生物亞型,目前臨床常用的分型方法是根據(jù)HER-2、ER等的表達(dá)分為管腔A型(luminal A)、管腔B型(luminal B)、類正常乳腺型(normal breast-like)、HER-2型和基底細(xì)胞樣(basal-like)乳腺癌。


  隨著下一代測序技術(shù)的應(yīng)用,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多新的乳腺癌驅(qū)動基因,這些新進(jìn)展促使我們對早期乳腺重新進(jìn)行分子分型。如TCGA(The Cancer Genome Atlas Network) 將早期乳腺癌分類為10個亞型(表1),其臨床特點(diǎn)和預(yù)后各不相同。


  表1 早期乳腺癌TCGA分型


  *ER:雌激素受體;PR:孕激素受體;HER-2:人類表皮生長因子受體2


  Pereiral等通過測序2433例乳腺癌樣本,發(fā)現(xiàn)40個腫瘤抑制基因和癌基因的驅(qū)動基因(多重驅(qū)動),這些基因參與的生物學(xué)過程包括AKT信號、細(xì)胞周期調(diào)節(jié)、染色質(zhì)功能、DNA損傷與凋亡、MAPK信號、組織架構(gòu)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、泛素化等。并且發(fā)現(xiàn)ER+乳腺癌患者PI3K突變與不同的生存相關(guān)。


  對同一患者腫瘤內(nèi)的基因組變異研究發(fā)現(xiàn),腫瘤細(xì)胞亞群的克隆動態(tài)改變可區(qū)分為自然克隆改變,藥物抵抗、轉(zhuǎn)移所致的克隆改變,及其他更復(fù)雜的情況如免疫逃逸、腫瘤休眠等所致的克隆改變。


  評估克隆進(jìn)化的方式包括:克隆、克隆基因型、克隆譜系、克隆動態(tài)、克隆進(jìn)化等。研究克隆關(guān)系需要的遺傳信息包括:DNA序列改變、DNA甲基化模式、組蛋白修飾、基因表達(dá)模式等??寺∵M(jìn)化的時(shí)空特性及其作為治療的結(jié)果是癌癥的一般特性。


以下為《腫瘤瞭望》對Samuel Aparicio教授的采訪 以下為訪談全文(翻譯稿):


《腫瘤瞭望》:早期乳腺癌和晚期乳腺癌的克隆動力學(xué)有何不同?

  Aparicio教授:目前已經(jīng)知道隨著時(shí)間的推移癌癥在不斷變化,疾病也處于一種不穩(wěn)定狀態(tài)。隨著下一代測序技術(shù)和單細(xì)胞測序技術(shù)的發(fā)展,通過基因組學(xué)研究現(xiàn)在已經(jīng)能夠?qū)υl(fā)癌和轉(zhuǎn)移性癌癥的克隆模式進(jìn)行分析。六年前,我們報(bào)告了第一個這樣的研究,比較了同一位患者在九年的間隔中其轉(zhuǎn)移性乳腺癌的克隆進(jìn)化。事實(shí)上,在克隆成分上轉(zhuǎn)移癌與原發(fā)癌存在很大差異。我們?nèi)栽谂α私膺@些模式怎樣引導(dǎo)我們對疾病的演變進(jìn)行思考。


《腫瘤瞭望》:在藥物使用等壓力作用下,乳腺癌克隆動力學(xué)有何趨勢?

  Aparicio教授:目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn),當(dāng)乳腺癌患者初次診斷發(fā)現(xiàn)微轉(zhuǎn)移,如未能被抗雄激素治療成功抑制將會出現(xiàn)耐藥突變克隆,一些需要很多年才能出現(xiàn)。例如,在激素治療中,現(xiàn)在已經(jīng)明確一些對激素治療抵抗的ER陽性乳腺癌患者,由于獲得ESR受體基因突變而使癌癥復(fù)發(fā)。在其他腫瘤中也存在類似情況。這種情況主要見于化療或輔助內(nèi)分泌治療時(shí)。


《腫瘤瞭望》:體細(xì)胞突變和線粒體突變在腫瘤中陸續(xù)被發(fā)現(xiàn),現(xiàn)有的乳腺癌分型有無不合理之處?

  Aparicio教授:體細(xì)胞突變改變了我們的思維。很明顯,例如,按ER陽性和ER陰性的分類法或是按TCGA分為10個亞型的方法分型的患者,PIK3CA 突變的預(yù)后意義是不同的。線粒體基因突變很有意義,但線粒體DNA(有報(bào)告發(fā)現(xiàn)疾病時(shí)線粒體DNA片段化并整合入核基因組)是否對疾病真正有意義,目前在此領(lǐng)域尚言之過早。


《腫瘤瞭望》目前的研究能否指導(dǎo)治療決策?

  Aparicio教授:這方面有很多事情我們需要牢記。第一個是,當(dāng)考慮到患者的長期管理和診斷評估時(shí),我們必須記住患者的病情是隨著時(shí)間的推移而變化的。如果患者對治療無反應(yīng),應(yīng)該更經(jīng)常地進(jìn)行活檢。由于克隆進(jìn)化,疾病起始時(shí)的診斷評估和治療中期的診斷評估可能不同。同樣重要的是,由于腫瘤的異質(zhì)性,對大腫瘤診斷評估往往很復(fù)雜,一次活檢可能無法提供全面足夠的信息。其對于診斷和醫(yī)療實(shí)踐的直接影響仍待進(jìn)一步研究,但我相信不久的將來這些研究將產(chǎn)生影響。我們也知道對患者分型很重要,尤其是對一些ER陽性亞型,我們知道有4%的乳腺癌患者有染色體11q的擴(kuò)增,其預(yù)后比ER陽性乳腺癌平均預(yù)后要差很多。很久以前就可以用PAM50 或其他實(shí)驗(yàn)進(jìn)行檢測。所以當(dāng)將患者納入臨床試驗(yàn)或想到早期復(fù)發(fā)或?qū)χ委煹挚沟幕颊邥r(shí),我們必須特別關(guān)注這些問題。


專家簡介


  Samuel Aparicio教授


  加拿大英屬哥倫比亞大學(xué)(UBC)病理部和醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室教授,Nan& Lorraine Robertson乳腺癌研究機(jī)構(gòu)主席,2014年獲得Aubrey J Tingle獎。同時(shí),Aparicio教授領(lǐng)導(dǎo)著乳腺和分子腫瘤學(xué)BCCA部。Aparicio教授的研究涵蓋癌癥基因組、小鼠遺傳模型、高通量篩選、小分子化學(xué)探針和乳腺癌的轉(zhuǎn)化研究。


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(來源:《腫瘤瞭望》編輯部)





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