來源:奇點糕 2023-03-20 13:51 我國自主研發(fā)的循環(huán)游離DNA(cfDNA)甲基化檢測技術ELSA-seq,能較為敏感地篩查肺癌、結直腸癌等6種常見癌癥,并顯著減少晚期癌癥的發(fā)生,從而提高癌癥患者整體的5年生存率! 眾所周知,早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療是抗擊癌癥的重中之重,特別是隨著人口老齡化和飲食、煙酒等患癌風險因素的影響越發(fā)明顯,全世界的癌癥發(fā)病和死亡率都在上升[1],要抗擊來勢洶洶的癌癥“魔軍”,做不到這“三早”可真就難了。
大道理好懂,但知易行難啊。要想真正落實“三早”,首先要有效果確切的癌癥早期篩查手段,然而只有肺癌、結直腸癌等寥寥幾種癌癥的篩查達到了這條要求;其次篩查還得方便快捷,最好一次就能篩查多種癌癥,不然只為篩查一種癌癥就請假跑趟醫(yī)院,大家伙還真不見得有足夠的動力[2]。
聽起來這兩個問題都不好解決?但換成正蓬勃發(fā)展的癌癥液體活檢,破局可能就不難了,而且隨著液體活檢技術的升級,檢測越來越精準和可靠,全面推廣液體活檢用于癌癥篩查,獲益可能超乎想象!
“滴血驗癌”已經(jīng)越來越觸手可及了
近期在權威期刊《腫瘤學年鑒》(Annals of Oncology)上,復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士團隊發(fā)表的一項最新研究結果顯示:我國自主研發(fā)的循環(huán)游離DNA(cfDNA)甲基化檢測技術ELSA-seq,能較為敏感地篩查肺癌、結直腸癌等6種常見癌癥,并顯著減少晚期癌癥的發(fā)生,從而提高癌癥患者整體的5年生存率!
研究者基于ELSA-seq技術分析癌癥患者和非患者人群的cfDNA甲基化特征,開發(fā)了兩種篩查模型(MCDBT-1/2),其中MCDBT-1在獨立驗證隊列中的篩查特異性高達98.9%,敏感性也有69.1%;按我國癌癥發(fā)病數(shù)據(jù)推算,全面推廣該篩查能使6種常見癌癥的晚期患者減少38.7-46.4%,將5年生存率相對提升四成[3]!
論文首頁截圖
關注癌癥液體活檢領域的讀者們,應該不會對ELSA-seq技術感到陌生,它可是近幾年屢次登上重要會議和期刊的業(yè)內“明星”,能夠大范圍覆蓋與癌癥相關的CpG位點,從而準確篩查癌癥并進行組織溯源,而在這次研究中它要負責篩查6種兇名赫赫的常見癌癥:肺癌、結直腸癌、食管癌、肝癌、卵巢癌和胰腺癌。
本次研究的整體思路也與既往研究相似,首先基于開源數(shù)據(jù)構建cfDNA甲基化定制檢測Panel并初步驗證,再將該Panel用于分析1693例回顧性cfDNA樣本(癌癥患者735例,非癌癥人群958例),分別訓練和驗證MCDBT-1/2模型,最終在獨立驗證前瞻性隊列(n=946,癌癥/非癌癥各473例,特征匹配)中驗證模型。
研究流程圖
在Panel構建階段,根據(jù)CpG位點的共甲基化水平和相鄰CpG位點的基因組距離,研究者分別確定了6種癌癥各自特異性的甲基化區(qū)域,有效區(qū)分癌癥患者和非癌癥人群的甲基化模式,且準確性和可靠性經(jīng)機器學習模型驗證。
模型構建圖
基于上述Panel構建的MCDBT-1/2模型,區(qū)別主要是前者為極高特異性模型(Cut-off值為99.5%),后者為高特異性(Cut-off值為99.0%),二者的敏感性也因此有所差異,適用于癌癥發(fā)病風險不同的人群,不過從研究的各項評估來看,MCDBT-2模型的整體表現(xiàn)都與MCDBT-1相似。
構建模型階段的訓練集數(shù)據(jù)顯示,MCDBT-1模型篩查6種癌癥的整體特異性為99.7%(95% CI: 98.9%-100.0%)、敏感性為75.2%(70.6%-79.4%),與既往研究相當;而在驗證集中,MCDBT-1模型篩查的特異性為100.0%(95% CI: 97.0%-100.0%)、敏感性為69.4%(70.6%-79.4%)。
在獨立驗證隊列中,MCDBT-1模型的特異性為98.9%(97.6%-99.7%),敏感性為69.1%(64.8%-73.3%)。細化來看,MCDBT-1模型篩查I-II期癌癥的敏感性為43.8%,篩查I-III期的敏感性則為54.0%,篩查早期肝癌表現(xiàn)相對最優(yōu),但對女性人群敏感性偏低(51.2%/71.3%),可能與兩性癌癥發(fā)病譜差異有關。
MCDBT-1模型的整體表現(xiàn)
液體活檢一次性篩查多種癌癥時,還需要準確對癌癥所在的部位進行溯源(Top predicted origin,TPO),從而指導后續(xù)的診療,MCDBT-1模型在這一項上表現(xiàn)較好,在獨立驗證隊列中的溯源準確性(TPO1)達到83.2%。
說了這么半天的數(shù)據(jù),液體活檢到底是怎么能轉化出“減少40%晚期癌癥、癌癥5年生存率相對提升40%”的巨大獲益呢?研究者們根據(jù)模型覆蓋的6種癌癥在我國實際的發(fā)病率和確診分期,重新估算了MCDBT-1模型在真實世界中的表現(xiàn)。
估算顯示,MCDBT-1模型的真實世界篩查敏感性為70.5%,以它開展全面的癌癥早篩,就能讓38.7-46.4%的患者在相對早期(I/II期)被確診,改變當前約60%患者在相對晚期(III/IV期)才被確診的現(xiàn)狀;配合根治性治療,則能使上述6種癌癥的5年生存率絕對值從31.4%提升至41.8-44.1%,相對提高了四成。
液體活檢帶來的癌癥分期變化和對生存率的影響
一次檢查就能早篩6種常見高危癌癥,各方面表現(xiàn)還如此之好,奇點糕真得給液體活檢狠狠點個贊,期待它在各方面的表現(xiàn)能夠越來越好,覆蓋更多的癌癥并且更加精準,盡快成為防癌抗癌的利器! 參考文獻: [1]Chen S, Cao Z, Prettner K, et al. Estimates and Projections of the Global Economic Cost of 29 Cancers in 204 Countries and Territories From 2020 to 2050[J]. JAMA Oncology, 2023. [2]Callison K, Pesko M F, Phillips S, et al. Cancer Screening after the Adoption of Paid-Sick-Leave Mandates[J]. New England Journal of Medicine, 2023, 388(9): 824-832. [3]Gao Q, Lin Y P, Li B S, et al. Unintrusive multi-cancer detection by circulating cell-free DNA methylation sequencing (THUNDER): development and independent validation studies[J]. Annals of Oncology, 2023.
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