RAS是第一個被發(fā)現(xiàn)的人類腫瘤基因(oncogene)。KRAS基因的全名叫Kirsten rats arcomaviral oncogene homolog,翻成中文是“Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物”。KARS基因編碼的蛋白是一種小GTP酶(smallGTPase),它屬于RAS超蛋白家族。 1. KRAS基因的分類 在人的基因組中,有 2 個 KRAS 基因。一個是 KRAS1,位于第6號染色體的短臂上;另一個是 KRAS2,位于第 12 號染色體的短臂上。其中,KRAS1 是“假基因”,不能被轉(zhuǎn)錄成 RNA,所以它是沒有功能的。而KRAS2才是“真基因”,能夠轉(zhuǎn)錄、并且翻譯成蛋白,具有生物學(xué)活性。通常公司和文獻(xiàn)報道中所研究的KRAS基因和蛋白,是指“KRAS2”基因及其蛋白產(chǎn)物。 KRAS基因?qū)儆赗AS基因家族。RAS基因家族當(dāng)中,還有NRAS (neuroblastoma-RAS)和HRAS (Harvey-RAS)。 2. KRAS蛋白的結(jié)構(gòu)和位置 KRAS蛋白質(zhì)有188個氨基酸,它的分子量是21.6KD。擁有GTPase酶活性的鳥嘌呤核苷結(jié)合蛋白。 KRAS蛋白定位在細(xì)胞膜的內(nèi)側(cè),通過一個法呢?;‵arnesyl)的修飾基團(tuán)【1】,連到細(xì)胞膜上。法呢?;?,是通過翻譯后的蛋白修飾,在法呢酰基轉(zhuǎn)移酶【2】的作用下,加到KRAS蛋白上的【3】。 來源:Farnesyltransferaseinhibitorsinhematologicmalignancies:newhorizonsintherapy 3. KRAS相關(guān)通路 正常細(xì)胞中,細(xì)胞膜上的EGFR、HER2、ErbB3和ErbB4等受體單體與細(xì)胞膜外配體結(jié)合形成二聚體,二聚體自身磷酸化,再磷酸化下游的信號蛋白。其中一條信號通路可激活Grb2-Shc,再激活SOS蛋白,進(jìn)而可激活KRAS蛋白。 KRAS通路 在細(xì)胞內(nèi),KRAS蛋白在失活和激活狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變,當(dāng)KRAS與鳥嘌呤核苷二磷酸(GDP)結(jié)合時,它處于失活狀態(tài),當(dāng)它與鳥嘌呤核苷三磷酸(GTP)結(jié)合時,它處于激活狀態(tài),并且可以激活下游信號通路。 下游信號通路 大部分細(xì)胞中的KRAS處于失活狀態(tài),當(dāng)它被激活后,可以激活多條下游信號通路,其中包括MAPK信號通路,PI3K信號通路,和Ral-GEFs信號通路。這些信號通路在促進(jìn)細(xì)胞生存、增殖和細(xì)胞因子釋放方面具有重要作用。 4. KRAS活性的調(diào)節(jié)因子 KRAS在失活與激活狀態(tài)之間的轉(zhuǎn)換受到兩類因子的調(diào)節(jié)。 一類是鳥嘌呤核苷酸交換因子(GEF),這類蛋白催化KRAS與GTP的結(jié)合,從而促進(jìn)KRAS的激活,其中包括SOS蛋白(屬GEFs/鳥苷釋放因子/鳥苷酸交換因子)。 另一類是GTP酶(GTPase)激活蛋白(GAPs),這類蛋白能夠促進(jìn)與KRAS結(jié)合的GTP水解成為GDP終止活性狀態(tài),從而抑制KRAS的活性。 由于 RAS 在許多重要細(xì)胞信號網(wǎng)絡(luò)的軸上處于中心位置,因此它們與許多癌癥標(biāo)志有關(guān)。RAS是人類癌癥中最常出現(xiàn)突變的致癌基因,目前已經(jīng)在所有人類腫瘤的大約1/5中發(fā)現(xiàn)了突變引起的RAS蛋白激活。 KRAS基因的三種主要突變 既然KRAS如此重要,且KRAS基因上的致癌突變十分清楚,那么,為什么到現(xiàn)在為止,仍未上市一個直接針對KRAS基因的靶向藥物?原因在于KRAS蛋白是一種無特征、近乎球形的結(jié)構(gòu),無明顯結(jié)合位點(diǎn),很難合成一種能靶向結(jié)合并抑制其活性的化合物。長期以來無法攻克,KRAS已成為腫瘤藥研發(fā)領(lǐng)域"不可成藥"靶標(biāo)的代名詞。 困難點(diǎn)在于: 1) KRAS的作用泛圍很廣,KRAS的正常活性也是許多正常細(xì)胞功能所需要的活性,如選取直接抑制KRAS的藥物,則該藥物毒性可能會很大,副作用也可能會很強(qiáng)。且KRAS與NRAS、HRAS有很高的同源性,能抑制KRAS活性的藥物,就很可能會抑制NRAS、HRAS的活性。那么,這個藥物的毒性就可能很大。 2) 目前已知的KRAS的活性功能域,主要是KRAS與GDP、或GTP結(jié)合的口袋狀的功能域。與蛋白激酶與ATP的親和力較弱不同, KRAS與GTP、或GDP的結(jié)合非常強(qiáng),親合系數(shù)達(dá)到PicoMolar(皮摩爾濃度,10^-12)級。而正常細(xì)胞里面的GDP與GTP的濃度,達(dá)到了MicroMolar(微摩爾濃度,10^-6)級。所以,細(xì)胞內(nèi)正常的GDP與GTP的濃度,比與KRAS結(jié)合所需的濃度,高了10的6次方倍。而RAS缺乏足夠大的能夠結(jié)合小分子的口袋;故要做出一種小分子化合物,其與KRAS的結(jié)合能力,要能與GDP、或者GTP相匹敵,非常難。 3) 設(shè)計(jì)一種只針對性抑制突變KRAS蛋白的活性藥物,而盡量少影響正常KRAS蛋白的活性,需要此種化合物對突變的KRAS有很好的選擇性。這是藥物設(shè)計(jì)的又一個難題。 4) 然而,間接靶向KRAS的策略也是困難重重,包括阻斷KRAS細(xì)胞膜定位和靶向KRAS下游的信號分子,如RAF、MEK、ERK和PI3K等家族成員。具體而言,間接途徑的困難包括:(1)RAS是正常細(xì)胞生長和存活相關(guān)的必需途徑,靶向必需途徑首先面臨嚴(yán)重的毒副作用,導(dǎo)致療效指數(shù)非常狹窄甚至沒有;(2)補(bǔ)償逃逸機(jī)制,以及(3)由于嚴(yán)格調(diào)節(jié)導(dǎo)致的信號反饋和冗余。 近年來,針對KRAS突變體的共價抑制劑研究的突破讓通過異構(gòu)位點(diǎn)(allosteric)靶向KRAS突變體成為可能。在KRASG12C突變體中,與突變生成的胱氨酸共價結(jié)合的小分子更傾向與和GDP結(jié)合的KRAS蛋白相結(jié)合。而這一結(jié)合降低GTP與KRAS的親和力,同時阻礙GEF催化GTP替換GDP,將KRASG12C突變體鎖死在失活狀態(tài)。KRASG12C突變體上這一結(jié)合“口袋“的發(fā)現(xiàn)催生了多款靶向KRASG12C突變體的小分子共價抑制劑。以下是國內(nèi)外KRAS靶點(diǎn)藥物的在研企業(yè): 全球在研KRAS抑制劑(藥智網(wǎng)早前數(shù)據(jù),不完全統(tǒng)計(jì)) 中國在研KRAS抑制劑(藥智網(wǎng)早前數(shù)據(jù),不完全統(tǒng)計(jì)) |
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