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Circulation:重磅!科學(xué)家對(duì)心肌梗死后心力衰竭患者進(jìn)行排序

 子孫滿(mǎn)堂康復(fù)師 2021-03-28
急性心肌梗死(MI)通常先于心力衰竭(HF)。盡管發(fā)現(xiàn)了許多潛在的候選指標(biāo),但很少有與心肌梗死后心力衰竭相關(guān)的生物標(biāo)志物在主流臨床試驗(yàn)中得到廣泛接受。更值得關(guān)注的是,近年來(lái)預(yù)防心梗后心衰的新治療方法開(kāi)發(fā)有限。在生物標(biāo)記物和藥物發(fā)現(xiàn)方面,需要優(yōu)先考慮心梗后心衰的候選藥物。

基于此,來(lái)自新加坡國(guó)立大學(xué)醫(yī)學(xué)院的 RICHARDS Mark 教授帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì),結(jié)合了兩個(gè)強(qiáng)大的無(wú)偏發(fā)現(xiàn)工具,基于適體的蛋白質(zhì)組學(xué)和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),使用來(lái)自2個(gè)不同急性心肌梗死患者隊(duì)列的人血漿和4個(gè)小鼠和人類(lèi)心臟單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究,對(duì)83名心肌梗死后心力衰竭患者進(jìn)行了優(yōu)先排序。相關(guān)研究成果以“Prioritizing Candidates of Post–Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics”為題,在線(xiàn)發(fā)表在《Circulation
》雜志上。



研究人員使用基于適配子的親和捕獲血漿蛋白質(zhì)組學(xué)在新西蘭隊(duì)列(CDCS[冠心病隊(duì)列研究])中測(cè)量心肌梗死后1個(gè)月的1305個(gè)血漿蛋白,包括181名心肌梗死后隨后因心力衰竭住院的患者,而250名心肌梗死后患者在中位隨訪(fǎng)4.9年后無(wú)事件。結(jié)果表明在疾病控制中心隊(duì)列中,心衰組和對(duì)照組的患者在性別和種族方面匹配良好,但在年齡和體重指數(shù)方面則不匹配。


加下來(lái),研究人員將血漿蛋白與心肌梗死后4個(gè)月測(cè)得的左室射血分?jǐn)?shù)相關(guān)聯(lián),并利用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析鑒定了可能在心肌梗死后心衰中協(xié)同調(diào)控的蛋白質(zhì)。新加坡隊(duì)列研究(通過(guò)逆轉(zhuǎn)心臟重塑改善心肌梗死的預(yù)后)223例心肌梗死后患者,其中33例因心力衰竭住院(中位隨訪(fǎng),2.0年),采用Fisher薈萃分析、基于再抽樣的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)進(jìn)一步富集血漿蛋白,以及機(jī)器學(xué)習(xí)。并且對(duì)1128種SOMAmer掃描蛋白的差異表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),在FDR≤5%時(shí),有212種差異表達(dá)蛋白與MI HF后事件相關(guān),并發(fā)現(xiàn)212個(gè)差異表達(dá)蛋白中有96個(gè)與MI后4個(gè)月測(cè)得的LVEF相關(guān)。




最后研究人員將差異表達(dá)蛋白與其差異表達(dá)基因交叉引用,這些差異表達(dá)基因來(lái)自于從小鼠心肌梗死模型分離的非肌細(xì)胞心肌細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄體,以及來(lái)自小鼠心衰模型和人類(lèi)心衰患者的心肌細(xì)胞的單細(xì)胞和單核轉(zhuǎn)錄體。通過(guò)無(wú)監(jiān)督的分層聚類(lèi)顯示HF組有3個(gè)模塊, HF1(153個(gè)蛋白質(zhì))、HF2(662個(gè)蛋白質(zhì))和HF3(313個(gè)蛋白質(zhì)),對(duì)照組中有2個(gè)模塊, Ctrl1(824個(gè)蛋白質(zhì))和Ctrl2(304個(gè)蛋白質(zhì));這14種蛋白分別是TFF3、B2M(β2微球蛋白)、CST3(胱抑素C)、EPHA2(Ephrin-A2)、EFNA4(Ephrin-A4)、EFNA5(Ephrin-A5)、TNFRSF1α、TNFRSF1β和RELT(腫瘤壞死因子受體超家族成員1α、1β和19L)、DSC2(橋粒蛋白-2)、IL15RA(白細(xì)胞介素-15受體亞單位A)、CD59糖蛋白,胰島素樣結(jié)合因子(igf6),Cytoscape13展示了這些蛋白質(zhì)在HF和對(duì)照組中形成的頂部樞紐。



綜上所述,心肌梗死后30天獲得的血漿大規(guī)模蛋白質(zhì)組學(xué)顯示212個(gè)血漿蛋白與隨后的心衰住院相關(guān)。在這些候選蛋白中,96個(gè)與心肌梗死后4個(gè)月測(cè)得的LVEF相關(guān)。生物信息學(xué)富集進(jìn)一步揭示了在心肌梗死后心力衰竭患者中單個(gè)模塊的63個(gè)高度相關(guān)的蛋白質(zhì),但在無(wú)事件患者中沒(méi)有。一個(gè)獨(dú)立的心肌梗死后隊(duì)列血漿蛋白的薈萃分析顯示36種蛋白與心肌梗死后心力衰竭相關(guān)。小鼠心肌梗死和心衰模型系統(tǒng)或患有擴(kuò)張型心肌病的人類(lèi)受試者的無(wú)偏單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組進(jìn)一步確定了30個(gè)候選基因,其中15個(gè)候選基因與4個(gè)月LVEF相關(guān)。在83個(gè)優(yōu)先選擇的候選蛋白中,6個(gè)最高優(yōu)先級(jí)的蛋白質(zhì)在患者隊(duì)列的血漿蛋白質(zhì)組學(xué)分析和單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析中是共同的;2個(gè)候選蛋白是MI HF、NT-proBNP和TNNT的成熟生物標(biāo)記物,而其他4個(gè)是新出現(xiàn)的生物標(biāo)記物,ANGPT2、THBS2、LTBP4,和FSTL3。兩個(gè)獨(dú)立的心肌梗死后隊(duì)列的大規(guī)模血漿蛋白質(zhì)組學(xué),交叉參照小鼠心肌梗死和TAC-HF模型系統(tǒng)的單細(xì)胞分辨率無(wú)偏轉(zhuǎn)錄組,確定了83種蛋白質(zhì)作為心肌梗死后心力衰竭的潛在生物標(biāo)志物和藥物發(fā)現(xiàn)靶點(diǎn)。這些蛋白中有許多是分泌性基質(zhì)細(xì)胞蛋白,突出了心肌梗死后心衰時(shí)細(xì)胞外基質(zhì)的突出。

參考文獻(xiàn)
1、Chan, Mark Y et al. “Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics.” Circulation vol. 142,15 (2020): 1408-1421. doi:10.1161/CIRCULATIONAHA.119.045158

2、Dennis, Kathleen E et al. “Augmented cardiac formation of oxidatively-induced carbonylated proteins accompanies the increased functional severity of post-myocardial infarction heart failure in the setting of type 1 diabetes mellitus.” Cardiovascular pathology : the official journal of the Society for Cardiovascular Pathology vol. 22,6 (2013): 473-80. doi:10.1016/j.carpath.2013.03.001

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