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碧云天講堂:Western Blot全面解決方案第一講——樣品制備

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-04-13


Western Blot 又稱為蛋白質(zhì)印跡,是分子生物學(xué)、生物化學(xué)和免疫遺傳學(xué)中常用的基于抗原抗體之間特異免疫反應(yīng)的一種定量或定性檢測(cè)蛋白的實(shí)驗(yàn)方法。 

其基本原理為:聚丙烯酰胺凝膠電泳將不同分子量的蛋白質(zhì)樣品分離,分離后的蛋白被轉(zhuǎn)移到固相支撐物(雜交膜)上,一抗特異性識(shí)別目標(biāo)蛋白,通過HRP、AP、生物素、地高辛或者熒光探針等標(biāo)記的二抗識(shí)別一抗,最終通過顯色、熒光或者化學(xué)發(fā)光等方法將目標(biāo)蛋白可視化,從而對(duì)目標(biāo)蛋白進(jìn)行定性和定量分析。

Western Blot實(shí)驗(yàn)原理示意圖

良好的開始是成功的一半,充分裂解并保存良好的優(yōu)質(zhì)的蛋白樣品對(duì) Western Blot 實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要。下面我們將從蛋白樣品制備的方法和試劑選擇上給大家一些建議。

一 .

了解目標(biāo)蛋白

目標(biāo)蛋白因其物種來(lái)源和組織特異性的不同,在種類和性質(zhì)上有很大差異,因此并沒有一種制備方法可以適用于所有蛋白的提取。這就需要我們進(jìn)行全面的分析后才能選擇最合適的蛋白制備方法。

首先要了解:樣品是來(lái)自什么物種?目標(biāo)蛋白定位在哪種組織或細(xì)胞器?是可溶蛋白還是不可溶蛋白?是高豐度蛋白還是低豐度蛋白?在制備時(shí)需要保持蛋白的天然活性,還是需要變性蛋白?

其次要知道:哪種方法或試劑能夠防止蛋白降解、聚集、沉淀、變性、去修飾?哪種方法能夠去除高豐度蛋白干擾,富集低豐度蛋白?哪種能去除核酸、多糖、脂肪等雜質(zhì)?哪種方法能在有限的實(shí)驗(yàn)條件下,簡(jiǎn)便快速地獲得高純度且完整性好的蛋白?

比如說(shuō),有些蛋白只在特定的細(xì)胞或細(xì)胞器中以較低豐度分布,這時(shí)候可能需要分離特定的細(xì)胞或細(xì)胞器,以達(dá)到獲得的蛋白樣品可滿足WB檢測(cè)的下限;還有的蛋白在常規(guī)裂解液中易聚集或沉淀,尤其是一些多次跨膜的蛋白或核內(nèi)蛋白,這種情況下就需要大家查閱參考文獻(xiàn)來(lái)了解目標(biāo)蛋白的性質(zhì)和常用的提取方法。

對(duì)于特定組分的分離,可選用碧云天亞細(xì)胞組分分離試劑盒,相關(guān)產(chǎn)品如下:

產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品包裝

P0027

細(xì)胞核蛋白與細(xì)胞漿蛋白抽提試劑盒

50次

P0028

細(xì)胞核蛋白與細(xì)胞漿蛋白抽提試劑盒

100次

P0033

細(xì)胞膜蛋白與細(xì)胞漿蛋白提取試劑盒

100次

C3601

細(xì)胞線粒體分離試劑盒

50-100次

C3606

組織線粒體分離試劑盒

50-100次

碧云天亞細(xì)胞組分分離試劑

二 .

裂解液的選擇

蛋白樣品制備,首先要選擇合適的裂解液。一般裂解液包含以下幾個(gè)組分: 

1. 緩沖系統(tǒng):裂解液pH過高或過低都可能使蛋白質(zhì)變性析出或水解,因此通常采用近似生理pH的buffer來(lái)作緩沖體系。Tris-HCl緩沖液因其緩沖能力強(qiáng),不容易與其它離子形成不溶物,且與整個(gè)電泳系統(tǒng)兼容性好,因此是裂解的首選緩沖液。 

2. 鹽離子濃度:通常大家習(xí)慣以生理鹽濃度作為裂解液的鹽離子濃度。在提胞漿蛋白等易溶組分時(shí),也有通過低鹽而實(shí)現(xiàn)低滲,從而使細(xì)胞脹破以實(shí)現(xiàn)質(zhì)膜分離的,這種情況下一般使用不超過50mM的NaCl。當(dāng)鹽離子濃度過高時(shí),部分蛋白可能會(huì)因鹽析而出現(xiàn)沉淀, 此外過高的離子濃度會(huì)導(dǎo)致泳道內(nèi)局部電流過大,容易跑出笑臉狀條帶。實(shí)際過程中即使有少數(shù)蛋白可能需要高鹽提取的,也會(huì)借助透析等方法除去可能產(chǎn)生干擾的鹽分,最終NaCl濃度一般不能高于500mM。 

3. 變性劑:常用的變性劑有兩類,一類是以尿素或硫脲為代表的變性劑,另一類則是各種表面活性劑(俗稱去垢劑)。變性劑的作用主要是為了使蛋白變性溶解,在膜蛋白和包涵體蛋白提取時(shí)經(jīng)常會(huì)加入尿素助溶。 

4. 蛋白酶、去修飾酶抑制劑:組織或細(xì)胞內(nèi)通常含有大量的蛋白酶和去修飾酶,由于細(xì)胞在裂解過程中會(huì)釋放出多種內(nèi)源性的蛋白酶、磷酸酶、去乙?;傅龋菀讓?dǎo)致目標(biāo)蛋白降解或去修飾,從而影響后續(xù)的蛋白檢測(cè)。所以在裂解時(shí)還需加入一些酶抑制劑。

常見的蛋白酶抑制劑有:PMSF、Aprotinin、Leupeptin、 Pepstatin,AEBSF-HCl等,其中PMSF對(duì)多種不同活性中心的蛋白酶都有極好的抑制作用而且效率高,因此基本是必加的試劑。

另外,做磷酸化蛋白的Western blot時(shí),還需要加入磷酸酶抑制劑,避免磷酸化形式的蛋白發(fā)生去磷酸化。類似地,檢測(cè)乙?;鞍椎臅r(shí)候還需要加入去乙酰化酶抑制劑。 

碧云天生產(chǎn)多種多樣的蛋白樣品制備用酶抑制劑產(chǎn)品,以下是碧云天不同類型的蛋白酶、磷酸酶、去乙?;敢种苿┗旌衔?/strong>:

產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品包裝

P1005

蛋白酶抑制劑混合物(通用型, 100X)

1ml

P1006

蛋白酶抑制劑混合物(通用型, 100X)

5ml

P1008

蛋白酶抑制劑混合物(通用型, 質(zhì)譜兼容, 50X)

1ml

P1009

蛋白酶抑制劑混合物(通用型, 質(zhì)譜兼容, 50X)

5ml

P1010

蛋白酶抑制劑混合物(哺乳動(dòng)物樣品抽提用, 100X)

1ml

P1011

蛋白酶抑制劑混合物(哺乳動(dòng)物樣品抽提用, 100X)

5ml

P1015

蛋白酶抑制劑混合物(植物樣品抽提用, 100X)

1ml

P1016

蛋白酶抑制劑混合物(植物樣品抽提用, 100X)

5ml

P1020

蛋白酶抑制劑混合物(真菌或酵母抽提用, 100X)

1ml

P1021

蛋白酶抑制劑混合物(真菌或酵母抽提用, 100X)

5ml

P1025

蛋白酶抑制劑混合物(細(xì)菌抽提用, 100X)

1ml

P1026

蛋白酶抑制劑混合物(細(xì)菌抽提用, 100X)

5ml

P1030

蛋白酶抑制劑混合物(His-Tag蛋白純化用, 100X)

1ml

P1031

蛋白酶抑制劑混合物(His-Tag蛋白純化用, 100X)

5ml

P1045

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(通用型, 50X)

各2ml

P1046

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(通用型, 50X)

各10ml

P1048

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(通用型, 質(zhì)譜兼容, 50X)

各1ml

P1049

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(通用型, 質(zhì)譜兼容, 50X)

各5ml

P1050

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(哺乳動(dòng)物樣品抽提用, 50X)

各2ml

P1051

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(哺乳動(dòng)物樣品抽提用, 50X)

各10ml

P1055

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(植物樣品抽提用, 50X)

各2ml

P1056

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(植物樣品抽提用, 50X)

各10ml

P1060

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(真菌或酵母抽提用, 50X)

各2ml

P1061

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(真菌或酵母抽提用, 50X)

各10ml

P1065

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(細(xì)菌抽提用, 50X)

各2ml

P1066

蛋白酶磷酸酶抑制劑混合物(細(xì)菌抽提用, 50X)

各10ml

P1081

磷酸酶抑制劑混合物A (50X)

2ml

P1082

磷酸酶抑制劑混合物A (50X)

10ml

P1086

磷酸酶抑制劑混合物B (50X)

2ml

P1087

磷酸酶抑制劑混合物B (50X)

10ml

P1091

磷酸酶抑制劑混合物C (50X)

2ml

P1092

磷酸酶抑制劑混合物C (50X)

10ml

P1096

磷酸酶抑制劑混合物D (50X)

2ml

P1097

磷酸酶抑制劑混合物D (50X)

10ml

P1112

去乙酰化酶抑制劑混合物(100X)

1ml

P1113

去乙?;敢种苿┗旌衔?100X)

5ml

ST506

PMSF (100mM)

10ml

不同類型的蛋白酶、磷酸酶、去乙酰化酶抑制劑混合物

5. 還原劑:許多蛋白天然條件下存在二硫鍵而形成多個(gè)分子的聚合體,另有少數(shù)蛋白在制樣的過程中也會(huì)自發(fā)形成二硫鍵,在裂解液中引入還原劑可以有效地還原二硫鍵,常用的還原劑有B-巰基乙醇,DTT等。常見的上樣緩沖液中會(huì)含有DTT。

裂解液的選擇至關(guān)重要,碧云天生產(chǎn)適用于多種組織和細(xì)胞的裂解液,以下是碧云天裂解液相關(guān)產(chǎn)品與比較:

向右滑動(dòng)查看

三 .

蛋白樣品制備操作

使用裂解液對(duì)細(xì)胞/組織進(jìn)行裂解,以釋放蛋白質(zhì)等細(xì)胞成分

3.1、細(xì)胞蛋白樣品制備

懸浮細(xì)胞:可直接離心收集,并用PBS等洗滌1-2次去除培養(yǎng)液中的血清和雜質(zhì)便可以裂解。

貼壁細(xì)胞:吸凈培養(yǎng)液后,直接加入裂解液裂解,或者在吸凈培養(yǎng)液后用PBS等洗滌1-2次后,加入裂解液裂解,收集細(xì)胞裂解液時(shí)可以根據(jù)具體情況使用細(xì)胞鏟和細(xì)胞刮進(jìn)行適當(dāng)?shù)妮o助。也可以在胰酶消化后參考懸浮細(xì)胞的方式裂解,但很多蛋白都可以被胰酶消化,并在WB檢測(cè)時(shí)可能會(huì)檢測(cè)到消化出來(lái)的短片段。根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要,也可用細(xì)胞刮或細(xì)胞鏟刮下或鏟下細(xì)胞,或用移液器吸取PBS將細(xì)胞從容器壁上吹打下來(lái),再像懸浮細(xì)胞那樣洗滌后再裂解。

不管是懸浮細(xì)胞,還是貼壁細(xì)胞,裂解操作都是相同的:加完裂解液后,將細(xì)胞置于冰上,使其充分裂解。對(duì)于裂解不充分的細(xì)胞也可以再進(jìn)行冰浴超聲。裂解之后離心取上清進(jìn)行后續(xù)的蛋白濃度測(cè)定,加上樣緩沖液煮沸等操作。

貼壁細(xì)胞通常推薦吸除培養(yǎng)液后直接加入裂解液裂解,因?yàn)榇藭r(shí)細(xì)胞基本上是單層的,可以充分接觸裂解液,裂解更快快速和充分。

有一些研究人員喜歡使用1XSDS-PAGE上樣緩沖液直接裂解細(xì)胞。這樣操作的優(yōu)勢(shì)是快速便捷,缺點(diǎn)是后續(xù)不方便測(cè)定蛋白濃度以校準(zhǔn)每個(gè)上樣孔的蛋白量。

3.2、組織蛋白樣品制備

組織蛋白提取則相對(duì)較復(fù)雜,首先應(yīng)設(shè)法除去血液、脂肪等非目標(biāo)組織。在制備脾臟、心臟和胎盤等富含血液的組織時(shí),尤其要洗凈血液,防止后續(xù)因內(nèi)源IgG產(chǎn)生干擾。可用PBS或生理鹽水(加PMSF)洗滌2-3次去除組織中血液。也可以根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)需要,在小鼠等實(shí)驗(yàn)動(dòng)物心臟用生理鹽水等灌流至肝臟和四肢顏色發(fā)白時(shí),再采集特定的組織樣品。采集好的組織樣品可以立即進(jìn)行后續(xù)的處理,也可以在低溫冷凍保存待后續(xù)處理。

取好的組織樣品需要進(jìn)行破碎處理,否則難以裂解充分處理。實(shí)驗(yàn)室常用的破碎方法有勻漿法、研磨法等。最常見的比較便捷的方法是按照一定比例加入裂解液,用玻璃勻漿器或者適當(dāng)?shù)碾妱?dòng)勻漿設(shè)備進(jìn)行勻漿處理;最穩(wěn)妥可靠的方法是把組織樣品液氮冷凍后再研缽內(nèi)研磨成粉末,然后再加入裂解液裂解。組織樣品充分裂解后,離心取上清進(jìn)行后續(xù)操作。

勻漿法和液氮研磨法


四 .

操作過程中的注意事項(xiàng)

注意事項(xiàng)

防止降解  

前面已提到,一些組織和細(xì)胞內(nèi)經(jīng)常含有蛋白酶,在提取蛋白的過程中,有可能剪切目標(biāo)蛋白,所以我們可以從以下幾個(gè)方面來(lái)盡量避免蛋白被降解:

1、使用蛋白酶抑制劑抑制細(xì)胞或組織中釋放的蛋白酶活性。

2、低溫操作。提取蛋白時(shí),避開蛋白酶的最適活性溫度。所有的步驟都可在低溫下完成,所有的試劑都需預(yù)冷,以降低蛋白酶活性,防止蛋白降解。

3、加快提取速度,一次不要處理過多的樣品

避免雜質(zhì)的干擾 

電在蛋白提取中經(jīng)??赡軙?huì)混入一些雜質(zhì),后期影響電泳分離效果,常見雜質(zhì)有: 

1、器材污染  在提取蛋白時(shí)盡可能使用潔凈器具,防止樣本被污染。尤其在處理組織樣本時(shí),一些反復(fù)用的器具如勻漿器、研磨杵、研缽等需保持干凈。 

2、核酸或脂類的干擾 核酸和脂類都可能與蛋白質(zhì)結(jié)合,如果制備的樣品中含有大量的脂類或核酸,則有可能影響目的蛋白泳動(dòng)速率,或者可能形成大的復(fù)合物而不能進(jìn)入濃縮膠。核酸通??梢酝ㄟ^超聲處理或者使用1ml注射器(帶針頭)反復(fù)抽吸的方法打斷成小片段。在制備脂肪組織或者脂肪肝組織樣品時(shí),在制樣后低溫離心或?qū)悠贩胖糜诘蜏兀蟛糠钟椭瑫?huì)漂浮在液面并很可能結(jié)凍,此時(shí)設(shè)法去除油脂或者吸取相應(yīng)的水相液體即可有效減小脂類的干擾。

五 .

蛋白濃度測(cè)定

蛋白提取完成后,可以用BCA法或Bradford法測(cè)定濃度,以確保上樣量穩(wěn)定可控,也可以通過SDS-PAGE后考馬斯亮藍(lán)法染膠或者在轉(zhuǎn)膜后通過麗春紅染色等判斷每個(gè)孔的上樣量是否一致,以及蛋白是否裂解充分、有無(wú)降解等。

為了保證每個(gè)泳道的上樣量一致,經(jīng)常需要將高濃度的樣品調(diào)低濃度或減少用量,或?qū)⒌蜐舛鹊臉颖緷饪s或加大用量。調(diào)低樣本濃度一般可直接用裂解液稀釋。濃縮樣本則建議進(jìn)行超濾操作,以保證操作前后離子濃度變化不大。

碧云天蛋白濃度測(cè)定相關(guān)產(chǎn)品

產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品包裝

P0006

Bradford蛋白濃度測(cè)定試劑盒

1000次

P0006C

Bradford蛋白濃度測(cè)定試劑盒(去垢劑兼容型)

800次

P0007

蛋白標(biāo)準(zhǔn)(5mg/ml BSA)

1ml

P0009

BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(增強(qiáng)型)

5000次

P0010

BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(增強(qiáng)型)

500次

P0010S

BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒(增強(qiáng)型)

200次

P0011

BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒

5000次

P0012

BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒

500次

P0012S

BCA蛋白濃度測(cè)定試劑盒

200次

P0017

考馬斯亮藍(lán)快速染色液

250ml

P0017A

考馬斯亮藍(lán)染色試劑盒(常規(guī)法)

1盒

P0017B

考馬斯亮藍(lán)染色液(常規(guī)法)

250ml

P0017C

考馬斯亮藍(lán)染色脫色液(常規(guī)法)

500ml

P0017F

BeyoBlue?考馬斯亮藍(lán)超快染色液

250ml

P0017S

快速銀染試劑盒

25次

ST030

Coomassie brilliant blue G250

5g

ST031

Coomassie brilliant blue R250

5g

P0022

麗春紅染色液

120ml

蛋白濃度分析測(cè)定相關(guān)產(chǎn)品

樣品制備的要點(diǎn)我們就介紹到這里最后附上一個(gè)大神總結(jié)的口訣

免疫印跡七步走,蛋白提取是重頭。

緩沖體系要得當(dāng),中性略堿是主流。

離子濃度莫極端,鉀鹽切記謹(jǐn)慎投。

尿素硫脲有奇效,去垢劑需更深究。

防止降解頗重要,抑制劑要正確謀。

PMSF作用廣,EDTA性價(jià)優(yōu)。

切莫漏加還原劑,巰基分子破二硫。

RIPA buffer是首選,特殊提取細(xì)運(yùn)籌。

裂解細(xì)胞無(wú)他巧,勿借胰酶把懶偷。

組織裂解先除血,千方百計(jì)研磨透。

全程低溫要把握,快速操作記心頭。

避免雜質(zhì)生干擾,勿引蛋白核酸油。

提完濃度要測(cè)準(zhǔn),跑膠染色見良莠。

常帶內(nèi)參顯嚴(yán)謹(jǐn),結(jié)果明朗不發(fā)愁。

勤學(xué)苦練基本功,他日名聲傳五洲。

非常感謝您對(duì)碧云天的關(guān)注和支持,

碧云天愿與您攜手

為中國(guó)生命科學(xué)事業(yè)的騰飛貢獻(xiàn)一份力量!

電話:400-1683301,800-8283301  

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