在中醫(yī)的理論中，十二原穴最早是出自《靈樞·九針十二原》：“陽中之少陰，肺也，其原出于太淵，太淵二；陽中之太陽，心也，其原出于大陵，大陵二；陰中之少陽，肝也，其原出于太沖，太沖二；陰中之至陰，脾也，其原出于太白，太白二；陰中之太陰，腎也，其原出于太溪，太溪二；膏之原，出于鳩尾，鳩尾一；肓之原，出于脖胦，脖胦一。 凡十二原者，主治五臟六腑之有疾者也。脹取三陽，滯取三陰?！?指的是臟腑原氣輸注、經(jīng)過及留止于十二經(jīng)脈四肢部的腧穴，主要分布于腕踝關(guān)節(jié)附近。

到了《難經(jīng)·六十六難》里面，十二原穴與《靈樞》略有不同：“六十六難曰：經(jīng)言肺之原出于太淵，心之原出于大陵，肝之原出于太沖，脾之原出于太白，腎之原出于太溪，少陰之原出于兌骨，膽之原出于丘墟，胃之原出于沖陽，三焦之原出于陽池，膀胱之原出于京骨，大腸之原出于合谷，小腸之原出于腕骨。十二經(jīng)皆以俞為原者，何也？”

按人體兩側(cè)相對應(yīng)的來看，其實(shí)《難經(jīng)》上所說的十二原穴總共有二十四個(gè)，而《靈樞》上所說的原穴除鳩尾與脖胦兩穴各一之外，其余的太淵、大陵、太沖、太白、太溪五穴在身體兩側(cè)都各有一個(gè)也即是十個(gè)原穴，《針炙甲乙經(jīng)·十二原第六》中所指十二原與《靈樞》基本無異。

后世的針灸學(xué)說大多奉《難經(jīng)》上的十二原穴為基準(zhǔn)，如《針炙聚英·十二原穴》：“三焦行于諸陽，故置一俞曰原。又曰：三焦者，水谷之道路，原氣之別使也，主通行三氣，經(jīng)歷五臟六腑。原者，三焦之尊號，故所至輒為原也。太淵(肺)、大陵(心包)、太沖(肝)、太白(脾)、太溪(腎)、神門(心)、陽池(三焦)、京骨(膀胱)、丘墟(膽)、沖陽(胃)、合谷(大腸)、腕骨(小腸)。

金元時(shí)期的針經(jīng)較少有十二原穴的內(nèi)容，如《針經(jīng)指南》與《子午流注針經(jīng)》中均無十二原穴的相關(guān)內(nèi)容，明代針經(jīng)較為多見。

現(xiàn)代的中醫(yī)以《難經(jīng)》中所說的十二原穴做為基準(zhǔn)，為別為：

1)、太淵穴：位于腕前區(qū)，橈骨莖突與舟狀骨之間，拇長展肌腱尺側(cè)凹陷中。

2)、大陵穴：在腕前區(qū)，腕掌側(cè)遠(yuǎn)端橫紋中，掌長肌腱與橈側(cè)腕屈肌腱之間。

3)、神門穴：在腕前區(qū)，腕掌側(cè)遠(yuǎn)端橫紋尺側(cè)端，尺側(cè)腕屈肌腱的橈側(cè)凹陷處。

4)、太白穴：在跖區(qū)，第1跖趾關(guān)節(jié)近端赤白肉際凹陷中。

5)、太沖穴：在足背，第1、2跖骨間，跖骨底結(jié)合部前方凹陷中，或觸及動(dòng)脈搏動(dòng)。

6)、太溪穴：在踝區(qū)，內(nèi)踝尖與跟腱之間的凹陷中。

7)、合谷穴：在手背，第2掌骨橈側(cè)的中點(diǎn)處。簡便取穴法：以一手的拇指指間關(guān)節(jié)橫紋，放在另一手拇、食指之間的指蹼緣上，當(dāng)拇指尖下是穴。

8)、陽池穴：在腕后區(qū)，腕背側(cè)遠(yuǎn)端橫紋中，指伸肌腱尺側(cè)緣凹陷中。

9)、腕骨穴：在手掌尺側(cè)，當(dāng)?shù)?掌骨基底與鉤骨之間，赤白肉際凹陷處。

10)、沖陽穴：位于人體的足背最高處，當(dāng)拇長伸肌腱和趾長伸肌腱之間，足背動(dòng)脈搏動(dòng)處。

11)：丘墟穴：在踝區(qū)，外踝的前下方，趾長伸肌腱的外側(cè)凹陷中。

12)：京骨穴：在足部，第5跖骨粗隆下方，赤白肉際處。