現(xiàn)如今，隨著癌癥研究的不斷深入，以及測(cè)序的持續(xù)高溫，TCGA在科研界中保持極高的曝光率。大量的科研人員利用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)來幫助自己尋找感興趣的靶點(diǎn)，或是對(duì)自己的科研成果進(jìn)行驗(yàn)證。

今天，小編給大家?guī)硪粋€(gè)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的第三方online tools，叫做“LinkedOmics”，幫助大家更加方便的使用TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)。（http://www./login.php）

1.這個(gè)網(wǎng)站需要大家先去注冊(cè)，但是注冊(cè)非常的便捷，使用自己的郵箱即可。

3.選擇你需要的數(shù)據(jù)類型，即研究的目標(biāo)，如miRNA數(shù)據(jù)、mRNA數(shù)據(jù)、甲基化數(shù)據(jù)、突變位點(diǎn)等。這里注釋了數(shù)據(jù)來源以及數(shù)據(jù)平臺(tái)。小編想去看在TCGA數(shù)據(jù)中一個(gè)lncRNA H19的mRNA表達(dá)水平在甲狀腺癌中的差異，所以選擇了RNAseq的數(shù)據(jù)。

4.這一步是Optional的，是對(duì)樣本的進(jìn)一步篩選；

5.這一步在輸入框中寫上基因名字；

6.此處因?yàn)樾【幭肟碒19這個(gè)lncRNA的生存分析等結(jié)果，所以選擇clincial的選項(xiàng)，統(tǒng)計(jì)方法選擇非參數(shù)檢驗(yàn)(Nonparametric tests)；

7.如果大家是想去看和H19存在共表達(dá)的基因，或是查找被H19調(diào)控的miRNA的correlation，可以根據(jù)自己的需求，在上一步選擇對(duì)應(yīng)的數(shù)據(jù)類型；

8.點(diǎn)擊遞交后，頁(yè)面會(huì)生成你所感興趣的基因的分析結(jié)果

然后點(diǎn)擊view，就會(huì)生成你所感興趣的圖。比如生存分析如下圖所示：

這網(wǎng)站極其方便易學(xué)，不用我們?nèi)CGA中費(fèi)力的查找具體信息，希望可以幫助到大家，為你們的研究也帶來便利。