![]() 研究背景 主要結(jié)果 1、 PacBio 16S rRNA全長測序比單V4區(qū)測序具有更高的分類分辨率。 ![]() 2、 三種測序方法均表明,水澇后對根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)有顯著影響,澇漬后兩種土壤(中性/酸性)根際地桿菌Geobacter相對豐度均有所增加。 ![]() 3 、共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)的模塊化分析顯示,當(dāng)使用單V4測序時,澇漬增加了一些氮循環(huán)相關(guān)微生物的相對豐度,而使用PacBio 16S測序方法時,增加了磷循環(huán)相關(guān)微生物的數(shù)量。 ![]() 4 、核心微生物分析進(jìn)一步揭示,不同物種的富集成員可能在維持細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和生態(tài)功能的穩(wěn)定性方面起著核心作用。 本研究探討了水澇條件下根際富集的微生物在幫助大豆抵御脅迫中的作用。此外,與二代多樣性測序相比,全長16S測序提供了更好的準(zhǔn)確性,并能夠從復(fù)雜的環(huán)境微生物組樣本中進(jìn)行準(zhǔn)確的物種水平鑒定。 參考文獻(xiàn):Effects of Waterlogging on Soybean Rhizosphere Bacterial Community Using V4, LoopSeq, and PacBio 16S rRNA Sequence. 發(fā)表期刊:Microbiol Spectrum (IF= 5.465) 發(fā)表時間:2022年2月23日 樣本類型:大豆根際土 DOI:10.1128/spectrum.02011-21 |
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