近期《自然》雜志發(fā)表日本研究團隊的新發(fā)現(xiàn)：CLIP1-LTK融合基因，這是全新的非小細胞肺癌驅(qū)動基因。CLIP1-LTK融合攜帶率很低，在非小細胞肺癌中僅為0.4%。臨床前研究顯示ALK抑制劑勞拉替尼可抑制CLIP1-LTK融合腫瘤，一例CLIP1-LTK融合非小細胞肺癌患者接受勞拉替尼治療有效。

僅0.4%的非小細胞肺癌患者攜帶CLIP1-LTK融合

日本研究團隊對多機構(gòu)肺癌基因組篩查平臺（LC-SCRUM-Asia）中已知驅(qū)動基因陰性的非小細胞肺癌（NSCLC）樣本進行全轉(zhuǎn)錄組測序（WTS）。在2020年10月至2020年12月期間分析的75份樣本中，在一例患者（1號患者）中識別到染色體12q24上的CLIP1和染色體15q15上的LTK的框內(nèi)融合轉(zhuǎn)錄本。LTK和ALK構(gòu)成受體酪氨酸激酶的ALK/LTK亞家族，而CLIP1是微管正端追蹤蛋白家族的成員。

研究團隊使用兩組引物進行PCR和逆轉(zhuǎn)錄（RT-PCR）去檢測1號患者鎖骨上淋巴結(jié)和肝臟這兩個部位轉(zhuǎn)移瘤組織樣本中的擴增子，證實編碼融合蛋白的轉(zhuǎn)錄本存在于該患者的轉(zhuǎn)移瘤中。Sanger測序驗證了表達轉(zhuǎn)錄本中CLIP1外顯子16與LTK外顯子11的融合序列。此外，研究團隊還進行了分離熒光原位雜交（FISH）分析，進一步驗證該患者存在LTK重排。

研究團隊利用上述的RT-PCR檢測了來自LC-SCRUM-Asia平臺的不同類型肺癌患者的572個腫瘤樣本，不論其驅(qū)動基因狀態(tài)。CLIP1-LTK融合在檢測的30例小細胞肺癌中均為陰性。在分析的542份NSCLC樣本中，有兩份CLIP1-LTK融合轉(zhuǎn)錄本呈陽性（ 0.4%）。

目前發(fā)現(xiàn)的CLIP1-LTK融合陽性的三個腫瘤（來自1-3號患者的腫瘤）的其他已知的驅(qū)動基因檢測呈陰性，這表明CLIP1-LTK融合與其他已知的驅(qū)動基因是相互排斥的。研究團隊還進行了ALK免疫組化分析，已被批準作為檢測ALK融合的免疫組化檢測方法顯示這三個腫瘤ALK融合均為陰性。這三個具有CLIP1-LTK融合的腫瘤在組織學上均被分類為腺癌，三例患者均有吸煙史。

臨床前研究顯示CLIP1-LTK融合具有致癌活性。

勞拉替尼治療CLIP1-LTK融合有效

由于LTK和ALK在各自的激酶結(jié)構(gòu)域中具有近80%的相同性，因此研究團隊推測ALK抑制劑可能可以抑制攜帶CLIP1-LTK融合的細胞增殖。使用Ba/F3-CLIP1-LTK細胞進行的實驗顯示勞拉替尼的半數(shù)抑制濃度（IC50）為1.1 nM，而其他ALK抑制劑（阿來替尼、布加替尼、塞瑞替尼、克唑替尼、恩區(qū)替尼）的IC50值均在10μm范圍內(nèi)。相比之下，奧希替尼不如ALK抑制劑有效，IC50值高于100 nM。動物實驗顯示10mg/kg勞拉替尼相比對照組可明顯抑制裸鼠體內(nèi)NIH3T3-CLIP1-LTK細胞形成的腫瘤生長。

圖一 細胞實驗和裸鼠實驗結(jié)果

前述1號患者最先接受了四個周期的卡鉑、培美曲塞和帕博利珠單抗（K藥）的一線治療，腫瘤縮小。然而，在隨后使用培美曲塞加K藥進行維持治療后，CT檢查顯示疾病進展迅速，原發(fā)腫瘤和多發(fā)轉(zhuǎn)移瘤（包括肝轉(zhuǎn)移瘤）均明顯增大?；颊吣[瘤ctDNA的WTS和Sanger測序顯示CLIP1-LTK融合，LTK重排通過FISH確認。

根據(jù)臨床前研究結(jié)果，經(jīng)1號患者簽署知情同意，日本國家癌癥中心醫(yī)院東部審查委員會批準非標簽使用勞拉替尼。1號患者以每天一次100毫克的常規(guī)劑量服用勞拉替尼?；颊邇蓚€月和五個月的隨訪CT圖像顯示原發(fā)腫瘤和多發(fā)轉(zhuǎn)移瘤快速、實質(zhì)性縮小。此外，全身PET掃描顯示，所有原發(fā)性和轉(zhuǎn)移性腫瘤對勞拉替尼治療均有反應。這些結(jié)果表明，攜帶CLIP1-LTK融合基因的NSCLC患者可能從勞拉替尼治療獲益。

圖二 1號患者勞拉替尼服用前后病灶變化，e為CT肺部和肝臟影像，f為PET全身掃描影像

期待CLIP1-LTK融合的中國研究

日本研究團隊基于日本人群樣本，在0.4%的NSCLC標本中檢出CLIP1-LTK融合，而臨床前研究和治療個案提示ALK抑制劑如勞拉替尼可有效治療CLIP1-LTK融合NSCLC。由于CLIP1-LTK融合的罕見，目前尚不清楚以CLIP1-LTK融合為標志的NSCLC是否會表現(xiàn)出獨特的臨床特征。日本研究團隊正使用 LC-SCRUM-Asia隊列（n=1500）對CLIP1-LTK融合進行回顧性篩查，將提供更詳細的患病率和臨床病理特征信息。

中國人群與日本人群基因特征相似性高，因此中國NSCLC患者中也可能存在CLIP1-LTK融合。由于中國患者規(guī)模巨大，即使CLIP1-LTK只是0.4%的比例，患者絕對數(shù)量也很多，期待中國研究團隊也開展相關(guān)研究以了解中國NSCLC患者中CLIP1-LTK融合比例、臨床特征，也能為這些罕見基因患者提供更多的治療選擇。