隨著中國(guó)關(guān)鍵醫(yī)療設(shè)備國(guó)產(chǎn)化政策的推進(jìn)，華大智造（MGI）圍繞DNBSEQTM核心技術(shù)推出了多款不同規(guī)格的測(cè)序儀和自動(dòng)化解決方案以滿足不同戶用的需求。其中靈活高效型的MGISEQ-2000、超高通量級(jí)的DNBSEQ-T7可適配臨床、科研和檢測(cè)服務(wù)等各類應(yīng)用場(chǎng)景，那V8在其平臺(tái)上的表現(xiàn)到底如何呢？本期將為大家?guī)?lái)具體測(cè)評(píng)。

我們將從數(shù)據(jù)有效性、覆蓋度、均一性以及變異檢出能力這4個(gè)維度進(jìn)行剖析。

比對(duì)率（ mapping rate ）反映了樣本測(cè)序數(shù)據(jù)與參考基因組的相似性，是衡量整體測(cè)序準(zhǔn)確性和是否存在污染性DNA的整體指標(biāo)。比對(duì)率越高越好。對(duì)于人類全基因組重測(cè)序，比對(duì)率通常應(yīng)該達(dá)到99%以上。

在本次測(cè)序中，V8在兩種樣本、兩款測(cè)序儀上均展現(xiàn)出優(yōu)異的比對(duì)率，各文庫(kù)的比對(duì)率均超過(guò)99.5%。

捕獲效率是指測(cè)得比對(duì)到目標(biāo)區(qū)域的序列（有效序列）占全部比對(duì)到參考基因組的序列的比例；捕獲效率的高低不影響數(shù)據(jù)質(zhì)量，只影響數(shù)據(jù)的有效比例。捕獲效率越高，則覆蓋同樣深度所需的數(shù)據(jù)量就越小，測(cè)序成本越低。

在本次測(cè)試中，用MGIEasy外顯子組酶切文庫(kù)制備試劑盒在MGISP-100上進(jìn)行自動(dòng)化文庫(kù)構(gòu)建的方案在兩個(gè)平臺(tái)上均展現(xiàn)了出色的捕獲效率，這與酶切片段化方案可以獲得更高的文庫(kù)復(fù)雜度相一致。

在捕獲建庫(kù)過(guò)程中，PCR擴(kuò)增會(huì)導(dǎo)致靶標(biāo)序列的不同區(qū)域放大程度不一致，從而引入人為的偏差，生成一些重復(fù)數(shù)據(jù)。這些重復(fù)數(shù)據(jù)沒(méi)價(jià)值且會(huì)浪費(fèi)測(cè)序數(shù)據(jù)，因此越低越好。

在本次測(cè)評(píng)中，V8在兩個(gè)測(cè)序平臺(tái)均展現(xiàn)出了非常低的冗余率。

覆蓋度指測(cè)序數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)拼接、比對(duì)后，被定位到目標(biāo)區(qū)域序列上的比例。它反映了我們的測(cè)序結(jié)果對(duì)于我們目標(biāo)測(cè)序區(qū)域的覆蓋情況。同樣的目標(biāo)區(qū)域、相同測(cè)序總量下，覆蓋度越均勻、越高越好。

在本次測(cè)評(píng)中，我們觀察到，在兩個(gè)測(cè)序平臺(tái)下，V8均展現(xiàn)出了出色的覆蓋度。1x覆蓋度超過(guò)99%，20x 接近98%，30x 均超過(guò)97%。得益于超低的數(shù)據(jù)冗余率，使得數(shù)據(jù)量比上期少一半的情況下，覆蓋度仍然與上一期表現(xiàn)一致。

Fold-80堿基罰分是指要將 80% 的堿基提高到平均覆蓋率所需的額外測(cè)序的倍數(shù)。較低罰分值表明不同的靶標(biāo)區(qū)域的覆蓋深度的差異較小。在假設(shè)完美統(tǒng)一的情況下，罰分為1。

在本次測(cè)評(píng)中，V8在兩個(gè)平臺(tái)上均體現(xiàn)了出色的均一性，Fold-80堿基罰分均低于1.5。

對(duì)細(xì)胞系NA12878樣本（Cell）和正常人基因組DNA（Blood）的突變位點(diǎn)（SNV和Indel）的檢出情況進(jìn)行分析，比對(duì)預(yù)期突變數(shù)量，突變的實(shí)際檢出情況與標(biāo)準(zhǔn)高度一致，對(duì)SNV和Indel檢測(cè)的靈敏度分別在99%以上與90%左右。

以上為本次MGI對(duì)安捷倫最新全外產(chǎn)品V8 測(cè)評(píng)數(shù)據(jù)的初步展示，通過(guò)MGI兩個(gè)平臺(tái)的測(cè)評(píng)，V8在數(shù)據(jù)有效性、覆蓋度、均一性以及變異檢出能力這4個(gè)維度均展現(xiàn)出可靠且優(yōu)異的性能。此外，MGISP-100自動(dòng)化方案也可與酶切建庫(kù)產(chǎn)品完美兼容，減少人為誤差，提高捕獲效率和操作便利性。