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文獻(xiàn)精讀|SEER數(shù)據(jù)庫回顧性分析三陰乳腺癌生存

 醫(yī)科研 2021-01-25

  

歡迎來到醫(yī)科研,這里是白介素2的讀書筆記,跟我一起聊臨床與科研的故事, 生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘,R語言,TCGA、GEO數(shù)據(jù)挖掘。


摘要

  • 本文的研究目的是分析三陰乳腺癌與非三陰的預(yù)后比較。

  • 通過回顧性的分析 SEER數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù),分析指標(biāo)包括:OS與 Cancer specific survival。

  • 結(jié)果包括在各個分期,亞組中的生存分析,當(dāng)然也包括了單因素與多因素生存分析。

  • 然后,作者還使用了自己機(jī)構(gòu)的一個數(shù)據(jù)集來驗證分析結(jié)果。

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納入分析的基線數(shù)據(jù)

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首先,這基本上是每篇文章的必備資料,必須報告用于分析的基線資料。
當(dāng)然,我們這里的資料并不完整展示。大概就是包括年齡,分期分級,人種這些信息。通常這個內(nèi)容,作為文章的 Table1
在本文中,作者還分析了另外一個自己的數(shù)據(jù)集,因此作者也對此做了展示,包含兩個基線資料的表格。

單因素生存分析

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從國家癌癥研究所監(jiān)測、流行病學(xué)和最終結(jié)果(SEER)數(shù)據(jù)中比較三陰性乳腺癌(TNBC)中各個亞型的總生存期的單因素分析。

Kaplam-Meier法生存分析

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KM法分析 SEER數(shù)據(jù)庫的 Cancer specific survival

不同分期的單因素與多因素分析

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應(yīng)用了單因素與多因素生存分析,在不同腫瘤分期的生存情況。

結(jié)論

本文的分析包括兩個數(shù)據(jù)集,一個數(shù)據(jù)集來源于 SEER數(shù)據(jù)庫,另外一個為作者自己的數(shù)據(jù)集。結(jié)論為三陰乳腺癌的預(yù)后比非三陰要差。
分析的方法比較簡單,其余結(jié)果未展示,主要是在另外一個數(shù)據(jù)集進(jìn)行一次驗證。


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