
RNA按照能否編碼蛋白可分為:編碼蛋白的RNA和非編碼RNA。(百度百科:RNA可根據(jù)結(jié)構(gòu)和功能的不同分為信使RNA和非編碼RNA。) 我們之前高中階段學(xué)到的信使RNA(mRNA)、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)和核糖體RNA(rRNA)三種RNA僅為在蛋白質(zhì)的合成過(guò)程中起著明顯作用的RNA。其中mRNA便是編碼蛋白的RNA,tRNA和rRNA便是非編碼RNA。然而還有許多非編碼RNA也有重要作用并未被確證并寫(xiě)進(jìn)高中課本中,如今天提及的非編碼RNA。 非編碼RNA又可以分為結(jié)構(gòu)性的ncRNA以及調(diào)控性的ncRNA。 對(duì)于結(jié)構(gòu)性的ncRNA。就是常規(guī)參與到整個(gè)常規(guī)的翻譯過(guò)程當(dāng)中,屬于正常的過(guò)程,包括tRNA和rRNA。 目前研究的主要關(guān)注點(diǎn)還是在于調(diào)控性的ncRNA,按照核苷酸鏈的長(zhǎng)度可以將調(diào)控性的非編碼RNA分為小、中和長(zhǎng)非編碼RNA。 小非編碼RNA:miRNA,piRNA,siRNA,cisRNA,telsRNA被認(rèn)為是短的非編碼RNA,大小在20-50個(gè)核苷酸之間。 miRNA(microRNA):是一個(gè)長(zhǎng)度差不多22nt的核苷酸序列。它的主要功能是通過(guò)在轉(zhuǎn)錄過(guò)程中通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)來(lái)降低mRNA的表達(dá)。研究熱點(diǎn)! piRNA(PIWI-inteeracting RNA):是一種長(zhǎng)25-33nt的ncRNA。piRNA通過(guò)與piwi亞家族Argonaute蛋白質(zhì)形成RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物而發(fā)揮作用。這些piRNA復(fù)合體轉(zhuǎn)錄后調(diào)控以及表觀遺傳調(diào)控。研究熱點(diǎn)! 小干擾RNA(siRNA):主要參與RNA的沉默。在基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)當(dāng)中,通過(guò)構(gòu)建某一個(gè)基因互補(bǔ)的siRNA,達(dá)到敲低基因表達(dá)的作用。不過(guò)隨著CRISPR的出現(xiàn),好多基礎(chǔ)使用都有CRISPR來(lái)替代了siRNA的干擾了。熱度下降! crasiRNA 和 telsRNAs:相關(guān)的研究挺少的。crasiRNA是一類(lèi)著絲點(diǎn)相互作用的ncRNA。而telsRNA則是和端粒存在相互作用的RNA。研究較少!
中等長(zhǎng)度非編碼RNA:snoRNA,tiRNA,snRNA,scRNA,PROMPTs等被歸類(lèi)為中等長(zhǎng)度的非編碼RNA,大小在50-200個(gè)核苷酸之間。 核仁RNA(small nucleolar RNA, snoRNA):是一類(lèi)小RNA分子,主要指導(dǎo)其他RNA(核糖體RNA,轉(zhuǎn)移RNA和小核RNA)的化學(xué)修飾。snoRNA主要分為兩類(lèi),與甲基化相關(guān)的C / D盒snoRNA和與偽尿苷化相關(guān)的H / ACA盒snoRNA。研究熱度一般! 小核RNA(small nuclear RNA, snRNA):是一類(lèi)小RNA分子,它們被RNA聚合酶II或RNA聚合酶III轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的。它們的主要功能是處理細(xì)胞核中的信使前RNA(hnRNA)。研究不溫不火! 小細(xì)胞質(zhì)RNA(small cytoplasmic RNA, scRNA):位于細(xì)胞質(zhì)當(dāng)中的一類(lèi)小RNA。研究較少! 啟動(dòng)子上游轉(zhuǎn)錄物(Promoter upstream transcripts, PROMPTs):是一類(lèi)由反向鏈沿雙向轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的長(zhǎng)度不一的非編碼RNA。大多數(shù)的PROMPTs在產(chǎn)生之后就迅速被降解,但是有某些PROMPT的表達(dá)在應(yīng)激條件下會(huì)發(fā)生變化。研究較少!
長(zhǎng)鏈非編碼RNA:一類(lèi)具有最大調(diào)控效力且包含200個(gè)以上核苷酸的RNA被分類(lèi)為長(zhǎng)非編碼RNA。 其他RNA: circRNA:我們通常研究的基因都是線(xiàn)性結(jié)構(gòu)的,基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯都是從5'-3'的方向進(jìn)行的。與線(xiàn)性RNA不同,環(huán)狀RNA(circRNA)形成一個(gè)共價(jià)閉合的連續(xù)環(huán)。在環(huán)狀RNA中,通常存在于RNA分子中的3'和5'末端已連接在一起的情況。對(duì)于circRNA而言,有一部分是存在編碼蛋白的功能的,但是有一些也是非編碼的,其形式基因調(diào)節(jié)功能。研究熱點(diǎn)! tRNA衍生片段(tRNA-derived fragments, tRFs):是由tRNA降解形成的成一些非編碼的小片段。這類(lèi)片段也會(huì)發(fā)揮出和其他ncRNA一樣的調(diào)節(jié)功能。逐年遞增,但未像lncRNA井噴增長(zhǎng)!
lncRNA和miRNA是研究熱點(diǎn),發(fā)表文章較多!其他的相對(duì)來(lái)說(shuō)還是少一些。相對(duì)來(lái)說(shuō)比較新一些的類(lèi)似circRNA, tRFs以及piRNA文章發(fā)表相對(duì)來(lái)說(shuō)還算少,且也是近十年剛剛開(kāi)始研究的。 1.ncRNA分類(lèi)及文章發(fā)表統(tǒng)計(jì)-- 醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)百科 2.Dahariya S, Paddibhatla I, Kumar S, Raghuwanshi S, Pallepati A, Gutti RK. Long non-coding RNA: Classification, biogenesis and functions in blood cells. Mol Immunol. 2019 Aug;112:82-92. doi: 10.1016/j.molimm.2019.04.011. Epub 2019 May 9. PMID: 31079005.
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