來源:不育識(shí)遺

什么是轉(zhuǎn)錄本？

一個(gè)基因想要行使功能，需要先經(jīng)過轉(zhuǎn)錄，變成mRNA飄出細(xì)胞核去，和核糖體一起翻譯蛋白。轉(zhuǎn)錄時(shí)，先形成了mRNA的前體Pre-mRNA，經(jīng)過剪切后才形成了成熟的mRNA。剪切有時(shí)候有很多種剪法，不同剪法對(duì)應(yīng)不同的轉(zhuǎn)錄本。

對(duì)于檢測(cè)報(bào)告中如何體現(xiàn)轉(zhuǎn)錄本，讓我們看看ACMG指南中怎么說的吧。

當(dāng)描述編碼變異時(shí)，應(yīng)該在報(bào)告中使用和提供每個(gè)基因的一個(gè)參考轉(zhuǎn)錄本。該轉(zhuǎn)錄本應(yīng)該是最長的已知轉(zhuǎn)錄本或者是最具臨床相關(guān)性的轉(zhuǎn)錄本[1]。

首先，在絕大多數(shù)時(shí)候，遺傳檢測(cè)報(bào)告中都使用了已知最長的那個(gè)轉(zhuǎn)錄本。這是最保險(xiǎn)的做法，不太會(huì)出現(xiàn)某個(gè)外顯子上的變異注釋到其它轉(zhuǎn)錄本的內(nèi)含子上，從而被認(rèn)為對(duì)蛋白沒有作用。

然而，有些特殊情況需要注意。有的時(shí)候最長的那條轉(zhuǎn)錄本，可能不是“最具臨床相關(guān)性”的那個(gè)。

假如某個(gè)基因的有紅、綠、藍(lán)三個(gè)外顯子，它可能有三種選擇性剪切的形式，分別在大腦、心臟和腸道特異性表達(dá)。在進(jìn)行基因檢測(cè)時(shí)，由于是對(duì)DNA進(jìn)行測(cè)序，不管樣本取哪里都可以測(cè)到所有外顯子，而不需要考慮哪個(gè)組織表達(dá)哪些轉(zhuǎn)錄本的問題（RNA測(cè)序或許會(huì)考慮）。如果受檢患者的表型是心臟上的毛病，那么在解釋變異時(shí)，就要懷疑這個(gè)變異的致病性了，因?yàn)檫@個(gè)變異在心臟中根本不體現(xiàn)功能。

還有一點(diǎn)需要提到，在將一些特殊病例整理成文章的時(shí)候，也要注意標(biāo)明轉(zhuǎn)錄本。有很多文章不注意這一點(diǎn)，這會(huì)造成別人引用時(shí)心里沒底：雖然默認(rèn)是報(bào)最長的那個(gè)，萬一他報(bào)了個(gè)別的呢？因?yàn)椤癱.123A>T”這樣的描述，很可能在某個(gè)基因中不是唯一的。

參考文獻(xiàn)：

[1] http://acmg./doku.php?id=start