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【精選】外泌體蛋白組學(xué)最新進(jìn)展:可促進(jìn)非酒精性肝炎,介導(dǎo)癌癥化療藥物耐受等

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-09-02

景杰學(xué)術(shù)/精選

編者按:我們將定期推送與蛋白質(zhì)組學(xué)、翻譯后修飾等相關(guān)文章的盤(pán)點(diǎn)與概覽。內(nèi)容涵蓋精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、表觀(guān)遺傳學(xué)與組蛋白修飾、外泌體、植物蛋白質(zhì)組學(xué)等方面。歡迎關(guān)注!

上一期我們回顧了外泌體蛋白組學(xué)的最新進(jìn)展,了解到外泌體可促進(jìn)神經(jīng)回路發(fā)育,靶向治療腎臟疾病等研究應(yīng)用。(【精選】外泌體蛋白組學(xué)最新進(jìn)展04,今天繼續(xù)給大家?guī)?lái)8月外泌體蛋白組學(xué)研究的精選研究!

最近,一年一度的國(guó)家自然科學(xué)基金申請(qǐng)項(xiàng)目評(píng)審結(jié)果公布了,首先我們來(lái)看一下今年外泌體領(lǐng)域相關(guān)的中標(biāo)基金。從統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)來(lái)看,今年的外泌體相關(guān)的國(guó)家自然科學(xué)基金中標(biāo)項(xiàng)目總計(jì)600項(xiàng),總金額達(dá)2.54億元,較去年增長(zhǎng)44.3%。

  外泌體相關(guān)基金情況,圖片來(lái)源外泌體資訊網(wǎng)【1】

蛋白質(zhì)組學(xué)廣泛運(yùn)用在外泌體相關(guān)研究中,今天介紹的三篇外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)精選文章,第一篇來(lái)自梅奧醫(yī)學(xué)中心的科學(xué)家團(tuán)隊(duì),運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)等技術(shù),揭示了細(xì)胞外囊泡攜帶的整合素β1在非酒精性肝炎中的作用。 第二篇文章運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)研究,揭示了口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞通過(guò)釋放更多的細(xì)胞外囊泡將順鉑釋放出細(xì)胞來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)化療藥物的耐受。第三篇文章介紹了一種新的方法,利用斑馬魚(yú)胚胎開(kāi)發(fā)體內(nèi)模型,使用成像方法和蛋白質(zhì)組學(xué)分析的組合,研究?jī)?nèi)源外泌體的組成和控制其生物發(fā)生、命運(yùn)和對(duì)靶細(xì)胞作用的分子機(jī)制。
1.J Hepatol:蛋白質(zhì)組學(xué)揭示外泌體攜帶的整合素β1在非酒精性肝炎中的作用

非酒精性脂肪性肝炎(NASH)是目前導(dǎo)致肝臟相關(guān)死亡的主要原因之一,最新研究發(fā)現(xiàn),單核細(xì)胞衍生的巨噬細(xì)胞在肝臟的積聚,會(huì)促發(fā)非酒精性脂肪性肝炎的炎癥反應(yīng)。然而,肝細(xì)胞脂毒性如何引發(fā)炎癥尚不清楚。2019年8月6日,梅奧醫(yī)學(xué)中心(Mayo Clinic)的科學(xué)家團(tuán)隊(duì),在國(guó)際專(zhuān)業(yè)學(xué)術(shù)期刊Journal of Hepatology ( IF=18.946)發(fā)表研究成果,運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)等技術(shù),揭示脂毒性肝細(xì)胞衍生的細(xì)胞外囊泡富含活性整合素β1(ITGβ1),促進(jìn)小鼠NASH中的單核細(xì)胞粘附,促進(jìn)肝臟炎癥反應(yīng)。 



研究人員用載體或毒性脂質(zhì)介質(zhì)溶血磷脂酰膽堿(LPC)處理肝細(xì)胞,從條件培養(yǎng)基中分離EV(樣品策略)并進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。研究表明整合素信號(hào)通路在脂毒性肝細(xì)胞來(lái)源的EV中過(guò)表達(dá),免疫金電子顯微鏡和納米級(jí)流式細(xì)胞儀也證實(shí)了具有活性ITGβ1的LPC-EV的富集。研究發(fā)現(xiàn)整合素β1的細(xì)胞粘附分子在非酒精性脂肪性肝炎的進(jìn)展中起關(guān)鍵作用。ITGβ1作為細(xì)胞外囊泡的載體在脂毒性應(yīng)激下從肝細(xì)胞釋放,并介導(dǎo)單核細(xì)胞與肝竇內(nèi)皮細(xì)胞的粘附,這是肝臟炎癥的必要步驟。在NASH的小鼠模型中,阻斷ITGβ1可減少肝臟炎癥,損傷和纖維化。因此,ITGβ1抑制可以作為NASH的新治療策略。

 ITGβ1促進(jìn)小鼠NASH中的單核細(xì)胞粘附,促進(jìn)肝臟炎癥反應(yīng)
2.Cancers:蛋白質(zhì)組學(xué)揭示外泌體介導(dǎo)的口腔鱗癌細(xì)胞的順鉑耐藥機(jī)制

耐藥性的出現(xiàn)是口腔鱗狀細(xì)胞癌(OSCC)化療中面臨的主要挑戰(zhàn),近期研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞外囊泡被確定為許多癌癥類(lèi)型耐藥的關(guān)鍵調(diào)節(jié)器,但相關(guān)的機(jī)制尚不清楚。2019年8月14日,專(zhuān)業(yè)學(xué)術(shù)期刊Cancer(IF=6.162)在線(xiàn)發(fā)表了來(lái)自澳大利亞Monash University的科學(xué)家團(tuán)隊(duì),運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)揭示了EV在介導(dǎo)口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞對(duì)順鉑的反應(yīng)中的作用。

 

研究人員從OSCC細(xì)胞系中分離和表征了EV,顯示出對(duì)順鉑敏感性的差異,并進(jìn)一步應(yīng)用蛋白質(zhì)組學(xué),分析H103和H103 / cisD2分泌的EV的蛋白質(zhì)組差異。結(jié)果表明表明,順鉑處理引起分泌的納米囊泡的顯著變化,抗性H103 / cisD2和H314細(xì)胞共享高度相似的EV蛋白質(zhì)譜,包括EVs中金屬離子轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白ATP1B3的下調(diào),暗示耐藥細(xì)胞可能改變了藥物遞送。

EV的蛋白質(zhì)組學(xué)分析

ICP-MS分析顯示,順鉑在抗性細(xì)胞中積累較少,但在其EV中檢測(cè)到較高水平。猜測(cè)對(duì)順鉑耐藥的細(xì)胞系可能通過(guò)釋放更多的細(xì)胞外囊泡將順鉑釋放出細(xì)胞來(lái)實(shí)現(xiàn)耐受。使用質(zhì)子泵抑制劑抑制細(xì)胞的EV分泌后,可觀(guān)察到順鉑抗性H314細(xì)胞中藥物敏感性增加,因此控制EV分泌可能是增強(qiáng)癌癥治療功效的潛在策略。

3.連續(xù)兩篇文章,報(bào)道利用斑馬魚(yú)進(jìn)行內(nèi)源外泌體的活體成像研究

現(xiàn)階段針對(duì)EV功能研究大多是從癌細(xì)胞中收集外泌體,內(nèi)源性外泌體在體內(nèi)的狀況,以及它們?cè)谏顒?dòng)與疾病發(fā)生中的作用在很大程度上是未知的。造成這個(gè)的原因主要是追蹤這些納米尺寸的物體一直受到成像技術(shù)的低分辨率和缺乏適當(dāng)?shù)膭?dòng)物模型的阻礙。

近日,來(lái)自法國(guó)巴黎笛卡爾大學(xué)的Frederik J. Verweij等人,連續(xù)在國(guó)際專(zhuān)業(yè)學(xué)術(shù)期刊Developmental Cell(IF=9.190)與Trends in Cell Biology (IF=16.588)發(fā)表文章,報(bào)道了利用斑馬魚(yú)胚胎模型,使用成像方法和蛋白質(zhì)組學(xué)分析的組合,研究?jī)?nèi)源外泌體的組成和控制其生物發(fā)生、命運(yùn)和對(duì)靶細(xì)胞作用的分子機(jī)制。

研究人員在斑馬魚(yú)胚胎中表達(dá)CD63-pHluorin報(bào)告基因,用于示蹤體內(nèi)外泌體。該熒光報(bào)告分子特異性地靶向(晚期)內(nèi)體并在外泌體上分泌,允許體外單個(gè)細(xì)胞中外泌體的釋放可視化。結(jié)合成像方法和label-free蛋白質(zhì)組學(xué)定量分析,從而實(shí)現(xiàn)在整個(gè)動(dòng)物體內(nèi)追蹤直至到達(dá)最終目的地,并揭示其生物學(xué)功能。研究發(fā)現(xiàn)外泌體從卵黃合胞體層(YSL)大量釋放到血流中,這些外泌體被尾靜脈叢的巨噬細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞捕獲、內(nèi)吞和降解,具有清除劑受體和活力依賴(lài)性??傊?,研究首次揭示了體內(nèi)內(nèi)源性外泌體的分泌、擴(kuò)散和被靶細(xì)胞攝取以及這些過(guò)程的關(guān)鍵分子介質(zhì)。

體內(nèi)內(nèi)源性外泌體實(shí)現(xiàn)對(duì)器官間通訊的實(shí)時(shí)跟蹤

在標(biāo)題為Extracellular Vesicles: Catching the Light in Zebrafish的觀(guān)點(diǎn)文章中,研究人員進(jìn)一步闡釋了,斑馬魚(yú)胚胎模型的使用使得外泌體能夠在前所未有的時(shí)空分辨率下用光學(xué)和電子顯微鏡觀(guān)察,這有助于研究?jī)?nèi)源性外泌體的生理性和病理性功能及其機(jī)制。并總結(jié)了幾個(gè)可能運(yùn)用斑馬魚(yú)胚胎模型來(lái)解決的EV生物學(xué)的多個(gè)問(wèn)題,比如說(shuō),可以在斑馬魚(yú)胚胎中分析EV分泌和擴(kuò)散,或研究標(biāo)記EV的遠(yuǎn)距離攝取和命運(yùn)。

斑馬魚(yú),解開(kāi)內(nèi)源性外泌體秘密的新模型

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