高苯丙氨酸血癥是一類常見的氨基酸代謝異常類疾病,一般是與苯丙氨酸羥化酶缺乏或其輔酶四氫生物蝶呤缺乏有關,是一種治療、可預防的疾病,為遺傳代謝病防治史的典范。 基因檢測在該疾病的輔助診斷及治療干預過程中起到重要作用,一般對于臨床懷疑高苯丙氨酸血癥病例,常規(guī)會進行相關5個基因的檢測(注意PAH基因的外顯子缺失問題),但有時會發(fā)現(xiàn)檢測陰性或檢出單雜合變異不能完全解釋臨床表型的現(xiàn)象。日常接觸一些新生兒遺傳病基因檢測工作,在去年工作時發(fā)現(xiàn)DNAJC12基因同樣會引起苯丙氨酸的升高,一直未碰到相關病例,故未做深入研究,今又看到類似病例,故簡單查閱下相關進展,分享一下,主要集中在DNAJC12基因的分子致病機制與目前已報到變異類型情況,更多關于相關病例臨床信息、治療干預及預后信息詳見原始文獻。
DNAJC12基因與高苯丙氨酸血癥的最初報道見于2017年1月份(Epub),研究人員在6名高苯丙氨酸血癥患者的常見相關基因(PAH、GCH1、PTS、QDPR、PCBD1)中未發(fā)現(xiàn)可以解釋臨床表型的已知致病/疑似致病突變,進一步通過全外顯子測序將致病基因定位到了DNAJC12。利用谷歌學術檢索,以“DNAJC12 Mutation”作為關鍵詞檢索,截止到2018年2月份,大約已有6篇相關類似文獻報道,其中4篇為病例報道[1-4](其中1篇為帕金森),1篇為綜述類[5],1篇為針對中國HPA群體的PAH變異研究,提及了高苯丙氨酸血癥患兒應關注DNAJC12,但未做詳細研究[6]。在2017年11月份的綜述(Molecular Genetics and Metabolism,IF=9.89)中,作者建議將DNAJC12基因補充到高苯丙氨酸血癥的基因檢測指南中。 查看omim數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)已經(jīng)收錄“DNAJC12”與“Hyperphenylalaninemia, mild,non-BH4-deficient”對應關系(收錄日期為2017年3月2號,第一篇報道為2017年1月26日,意味著在發(fā)表后的大約30幾天就已經(jīng)更新收錄了,不得不佩服OMIM的強大)。反過來看,以“Hyperphenylalaninemia”為關鍵詞檢索OMIM數(shù)據(jù)庫,其實是可以檢索到DNAJC12基因的(rank 12),另通過genecard查詢,也可以在DNAJC12頁面“GeneCards Summary for DNAJC12 Gene”部分看到DNAJC12基因與高苯丙氨酸血癥的對應關系。這也提示我們應該建立一種機制,定期的對“疾病-表型-基因”相關知識進行更新,哪怕是簡單檢索下OMIM數(shù)據(jù)庫也好。(文獻鳥,Stork,可以訂制關鍵詞,定期發(fā)送相關最新文獻到個人郵箱,或許可以嘗試下)
先簡單回看幾個概念,有助于對DNAJC12基因導致苯丙氨酸升高分子機制的理解,主要針對分子伴侶、HSP70s、HSP40s。
分子機制:簡單來講DNAJC12(代指相關蛋白,不與基因作區(qū)分,下同)可通過與HSP70的協(xié)同作用共同調節(jié)苯丙氨酸羥化酶的聚合,保證苯丙氨酸羥化酶可以達到自然態(tài),發(fā)揮相關功能,所以若DNAJC12基因發(fā)生異常,則導致PAH不能正確折疊,進而影響苯丙氨酸的代謝。具體作用機制見下圖[5]。(直接引用文獻5相關總結,更為詳細信息可查詢最原始文獻)。 a) DNAJC12通過特定結構域與PAH結合; b) DNAJC12與HSP70-ATP復合物(HPD模體)相互作用; c) 未折疊的PAH快速短暫的與HSP70相互作用,在J結構域和PAH協(xié)同作用下ATP發(fā)生水解導致HSP70構象發(fā)生改變,會進一步穩(wěn)定PAH與HSP70的相互作用; d) 一種NEF(核苷酸交換因子,與HSP70-ADP親和力強于HSP70-ATP)與HSP70結合; e) ADP游離; f) ATP結合; g) PAH釋放(因為PAH與HSP70-ATP親和力低),達到自然態(tài)(native) h) 未達到自然態(tài)的PAH,DNAJC12重新結合,重復以上循環(huán)。
下表為目前相關病例報道情況,參考自文獻[5]的總結。關于各個研究中各病例的詳細情況可具體查看相關對應文獻。注意病例報道中的文獻1和文獻4病例推測重疊,因檢出突變完全相同,病例性別相同、同為摩洛哥近親家庭該患兒,故不做描述。 *來自參考文獻[5]相關正文,最初未檢索到該文獻,針對該文獻目的性檢索,同樣未檢索到(不知為什么,若找到請告知,謝謝~),即使去雜志主頁,也未檢索到(http://journals./toc/iema/5),故后續(xù)該研究的相關變異未列出。文獻信息為:F. Leal, R. Navarrete, M. Castro, I. Vitoria, M.Bueno-Delgado, A. Belanger-Quintana, A. Morais, C. Pedron, C. Garcia-Jimenez,V. Hamilton, L.R. Desviat,M. Ugarte, B. Perez, Spanishhyperphenylalaninemia cases bearing a high frequentmutation in the DNAJC12 gene,J. Inborn. Error Metab. Screen 5 (2017) 131。
綜合目前相關研究,主要檢出突變情況如下。多為烈性突變,如外顯子缺失、無義突變、剪切突變等,由于報道突變數(shù)量較少,無法判定有無熱點突變。
在http://www./網(wǎng)站diseasetools中輸入phenylalanine,發(fā)現(xiàn)如下結果,仔細看下還是可以找到DNAJC12基因的身影的,不錯。 2. 高苯丙氨酸基因突變數(shù)據(jù)庫http://www./home/home.asp 復查下pku位點突變數(shù)據(jù)庫,發(fā)現(xiàn)在“NEWPUBLICATIONS”章節(jié),提到了DNAJC12基因,看來這個數(shù)據(jù)庫更新也算及時,不錯。 3. 全外顯子檢測中表型分析較為關鍵,嘗試以“hyperphenylalaninemia”作為初始表型,看看會出現(xiàn)什么結果,不同分析工具展示結果必然有所差別,這與不同工具的分析原理有關,這里僅列舉幾個例子,當然也可以以文獻報道病例的表型作為初始表型進行分析,或許結果會有很大不同。 a) Phenolyzer:DNAJC12出現(xiàn)在了seedgene位置,不錯。 b) Phenomizer/findzebra:未明確發(fā)現(xiàn)DNAJC12基因。 4. 關于參考文獻 所有參考文獻在最后列出,通過多種途徑都可以下載到的。比如: a) http:///s/?q=DNAJC12&t=0 b) http://gen.lib./scimag/index.php c) http:/// (以上不定期抽風) d) 百度學術:http://xueshu.baidu.com/部分提供了免費全文下載鏈接,實在不行百度文獻求助也可以,微信每天免費求助2篇 e) 學校圖書館: VPN? 學號? 參考文獻: 1. de Sain-van der Velden, M.G.M., et al., Beneficial Effect of BH4 Treatment in a15-Year-Old Boy with Biallelic Mutations in DNAJC12. JIMD Rep, 2018. 2. vanSpronsen, F.J., et al., Heterogeneousclinical spectrum of DNAJC12-deficient hyperphenylalaninemia: from attentiondeficit to severe dystonia and intellectual disability. Journal of MedicalGenetics, 2017: p. jmedgenet-2017-104875. 3. Straniero,L., et al., DNAJC12 and dopa‐responsive non‐progressive Parkinsonism. Annals of Neurology, 2017. 82(4):p. 640. 4. Anikster,Y., et al., Biallelic Mutations inDNAJC12 Cause Hyperphenylalaninemia, Dystonia, and Intellectual Disability.American Journal of Human Genetics, 2017. 100(2):p. 257. 5. Blau,N., et al., DNAJC12 deficiency: A newstrategy in the diagnosis of hyperphenylalaninemias. Molecular Genetics& Metabolism, 2017. 6. Liu,N., et al., Spectrum of PAH gene variantsamong a population of Han Chinese patients with phenylketonuria from northernChina. Bmc Medical Genetics, 2017. 18(1):p. 108. 作者介紹: 劉超,南開大學遺傳學碩士畢業(yè),畢業(yè)后(13年6月份)即從事遺傳病的基因輔助診斷工作,目前在深圳基因啟示錄科技有限公司(精準基因分公司),主要負責新生兒及兒童遺傳病的基因輔助診斷、藥物基因組檢測研發(fā)工作。 |
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