日韩黑丝制服一区视频播放|日韩欧美人妻丝袜视频在线观看|九九影院一级蜜桃|亚洲中文在线导航|青草草视频在线观看|婷婷五月色伊人网站|日本一区二区在线|国产AV一二三四区毛片|正在播放久草视频|亚洲色图精品一区

分享

基于靶標(biāo)和熒光技術(shù)的先導(dǎo)化合物高通量篩選實(shí)例探析

 cityonsea 2019-02-12

高通量藥物篩選技術(shù)(High throughput screening,HTS)是20世紀(jì)80年代后期發(fā)展起來的一種用于新藥研發(fā)中的高新技術(shù),它是在傳統(tǒng)的篩選技術(shù)基礎(chǔ)上,以分子水平和細(xì)胞水平的實(shí)驗(yàn)方法為基礎(chǔ),以微板形式作為實(shí)驗(yàn)工具載體,以自動(dòng)化操作系統(tǒng)執(zhí)行實(shí)驗(yàn)過程,以靈敏快速的檢測儀器采集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。以計(jì)算機(jī)對(duì)實(shí)驗(yàn)獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理,在同一時(shí)間內(nèi)對(duì)數(shù)以千、萬計(jì)的樣品進(jìn)行檢測,并以相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫支持整個(gè)技術(shù)體系的正常運(yùn)轉(zhuǎn)[1]。


高通量藥物篩選分析技術(shù)很多,可以分為熒光分析法、放射性法和化學(xué)發(fā)光法等[2]。熒光分析法的優(yōu)點(diǎn)包括價(jià)格相對(duì)便宜,無放射性標(biāo)記,安全性好,可重復(fù)性好及容易處理,特別是近年來熒光物質(zhì)的標(biāo)記技術(shù)和熒光檢測技術(shù)的突破性進(jìn)展使熒光分析法在HTS中的應(yīng)用日益廣泛。熒光分析法主要包括熒光強(qiáng)度分析法、熒光偏振法、熒光共振能量轉(zhuǎn)移法、熒光極化、熒光關(guān)聯(lián)光譜法?,F(xiàn)對(duì)前三種方法在先導(dǎo)化合物篩選的應(yīng)用實(shí)例進(jìn)行探析。


1熒光強(qiáng)度分析


依據(jù)熒光強(qiáng)度的變化進(jìn)行檢測,如熒光生成檢測法中反應(yīng)后熒光強(qiáng)度增加;在熒光淬滅檢測法中,熒光強(qiáng)度減弱。該方法操作簡便,適于微量化。


曹鴻鵬等[3]以中國分離的甲、乙型流感病毒制備神經(jīng)氨酸酶,以有熒光特性的化合物為酶反應(yīng)底物,建立了適合高通量篩選神經(jīng)氨酸酶抑制劑的熒光分析法。試驗(yàn)過程主要包括流感病毒神經(jīng)氨酸酶的制備,米氏常數(shù)Km值的測定,藥物對(duì)流感病毒神經(jīng)氨酸酶抑制劑的篩選?;衔颩UNANA是神經(jīng)氨酸酶的特異性底物,在神經(jīng)氨酸酶作用下產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物在355 nm 照射激發(fā)下,可以產(chǎn)生460 nm 熒光,熒光強(qiáng)度的變化,可以靈敏地反應(yīng)神經(jīng)氨酸酶活性。經(jīng)過一系列試驗(yàn)參數(shù)優(yōu)化,對(duì)1200個(gè)樣品進(jìn)行了篩選,有12個(gè)樣品對(duì)甲型流感病毒神經(jīng)氨酸酶活性產(chǎn)生較好的抑制作用和量效關(guān)系。


孫緬恩等[4]為了尋找作用于中樞神經(jīng)系統(tǒng)NOS的化合物,應(yīng)用熒光檢測方法建立了適用于高通量篩選的微量快速方法。生物體內(nèi)NOS催化產(chǎn)生NO的反應(yīng)需要NADPH作為輔助因子,在產(chǎn)生NO的同時(shí)伴隨著NADPH被轉(zhuǎn)化為NADP+,使反應(yīng)體系中NADPH濃度降低。NADPH在350nm波長的激發(fā)光照射下,產(chǎn)生波長為450 nm的熒光。反應(yīng)體系中熒光值的降低速率可以反映NADPH含量變化,因而可以間接反映NOS的活性。實(shí)驗(yàn)共篩樣品5600個(gè)。圖1是5600個(gè)樣品對(duì)NOS活性影響的統(tǒng)計(jì)結(jié)果,樣品活性表現(xiàn)為正態(tài)分布。


圖1、NOS為靶標(biāo)的樣品篩選結(jié)果[4]


在熒光強(qiáng)度高通量篩選方法中,需要測定總的熒光強(qiáng)度,篩選化合物的自身熒光和猝滅效應(yīng)可能會(huì)干擾測定結(jié)果,在最后的計(jì)算中可以作為異常數(shù)據(jù)除去,達(dá)到提高篩選精確性的目的。

 

2熒光偏振法(FP)


任何熒光分子都可用其“吸收躍遷矩”MA 和“發(fā)射躍遷矩”ME 來描述。對(duì)于給定分子,其MA 和ME 分別有固定的取向。實(shí)驗(yàn)測得的發(fā)光強(qiáng)度分子正比于其吸收躍遷矩MA與偏振光取向(P)間夾角T的余弦平方,發(fā)射躍遷矩ME與檢偏器取向(A)夾角U的余弦平方[5]。偏振度是發(fā)射光強(qiáng)度的一個(gè)比值,無方向性,由分子大小決定。原理圖如下圖2。


圖2、藥物篩選熒光偏振原理圖1[6]

 

圖3、藥物篩選熒光偏振原理圖2[6]

 

設(shè)計(jì)藥物影響G蛋白偶聯(lián)受體超家族中跨膜受體介導(dǎo)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),分離足夠的GPCR,具有完整的構(gòu)象和可溶性形式的穩(wěn)定性以及合適的熒光配體的設(shè)計(jì)是提高FP效率和成功率的關(guān)鍵因素。近年來放射性配體結(jié)合試驗(yàn)逐漸被FP取代,用于發(fā)現(xiàn)GPCR的新型拮抗劑和激動(dòng)劑并確定它們的結(jié)合親和力,主要原因是實(shí)驗(yàn)成本降低和放射性的健康危害。GPCR的FP測定設(shè)置通常在熒光標(biāo)記的配體與其受體結(jié)合后增加FP值。在競爭結(jié)合FP測定中,未標(biāo)記的配體或相互作用的小分子抑制劑的存在導(dǎo)致標(biāo)記的配體分子的置換,從而增加它們的翻滾運(yùn)動(dòng)而這又可以被檢測為FP值的降低[6]。


薛妮娜等[7]在采用熒光偏振法建立HSP90抑制劑的高通量篩選模型中,以VER00051001為分子探針,依次變化HSP90α濃度和分子探針濃度,4 ℃孵育不同時(shí)間,檢測熒光偏振值,建立最終選用80 nM分子探針,2. 01μg/mLHSP90α蛋白的抑制劑熒光偏振篩選模型。最終結(jié)果顯示GA的IC50值為55 nM,NVP-AUY922的IC50值為13nM。具體結(jié)果如下圖4。

 

圖4、 GA和NVP-AUY922對(duì)HSP90α的親和抑制活性檢測[7]

 

3熒光共振能量轉(zhuǎn)移法

 

FRET是指熒光供體受激發(fā)后不發(fā)射出光子而將激發(fā)的能量轉(zhuǎn)移到熒光受體的現(xiàn)象。產(chǎn)生FRET需要滿足3個(gè)條件:熒光供體和受體之間距離接近(1~10 nm);供體的發(fā)射光譜與受體的激發(fā)光譜有重疊;供體和受體之間遷移偶極子的方向平行[8]。


Klink等在TKI篩選模型中應(yīng)用了TR-FRET檢測技術(shù),其原理如下:將作為供體的稀土元素鋱(Tb,激發(fā)波長為340 nm,發(fā)射波長為495 nm)與ADP單克隆抗體結(jié)合,作為受體的熒光素Alexa Fluor 633(發(fā)射波長為520 nm)與ADP結(jié)合,體系中尚未發(fā)生酶促反應(yīng)時(shí),Alexa Huor 633可借助ADP與ADP單克隆抗體的特異性結(jié)合與Tb接近,并發(fā)生FRET;當(dāng)酶促反應(yīng)發(fā)生時(shí),PTK將ATP的磷酸根轉(zhuǎn)移到底物蛋白上,從而生成磷酸化底物和ADP,后者可與熒光素-ADP競爭結(jié)合ADP單克隆抗體,因此隨著反應(yīng)的進(jìn)行,Tb-ADP單克隆抗體與熒光素-ADP的結(jié)合減少,致使Tb與熒光素間的能量傳遞也逐漸減少,Alexa Huor 633發(fā)出的熒光強(qiáng)度降低;體系中供試化合物若具有PTK抑制作用,將會(huì)阻止酶促反應(yīng)進(jìn)行,導(dǎo)致Alexa Fluor 633發(fā)出的熒光強(qiáng)度不變或部分降低[9][10]。原理圖如下圖5。


圖5、TKI篩選模型中TR-FRET的應(yīng)用[9]

 

4時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移法和熒光偏振法用于先導(dǎo)化合物篩選的比較實(shí)例



Nicolas Wyhs[11]等利用化合物文庫在篩選甲基化DNA和甲基-CpG結(jié)合域蛋白2(MBD2)結(jié)合的抑制劑過程中,分別采用了時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移法和熒光偏振法進(jìn)行了篩選前期模型優(yōu)化。原理圖如下圖6和7。

 

圖6、MBD2與DNA的結(jié)合的TR-FRET測定[11]


圖7、MBD2與DNA的結(jié)合的FT測定[11]

 

分別用兩種方法測定熒光標(biāo)記甲基化DNA和MBD2的相互作用,最終確定時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移的高通量篩選條件為30nM寡核苷酸和25nM MBD2,設(shè)定陽性和陰性對(duì)照,最終熒光偏振法確定的高通量篩選條件為10nM寡核苷酸和200nM MBD2。實(shí)驗(yàn)具體結(jié)果如下圖8。


圖8、測定時(shí)間分辨熒光共振能量轉(zhuǎn)移(TR-FRET)和熒光偏振(FP)MBD2-MBD DNA結(jié)合測定的性能(A、B)。使用25nM標(biāo)記的底物寡核苷酸以384孔格式進(jìn)行對(duì)照處理的TR-FRET和FP測定的性能(C、D)[11]

 

泳道1(DMSO載體對(duì)照)和泳道3(過量未標(biāo)記未甲基化的DNA)是陰性抑制劑對(duì)照;泳道2是陽性抑制劑對(duì)照,由過量的無熒光團(tuán)的甲基化DNA組成。泳道4是測定陰性對(duì)照,顯示缺乏與5'-熒光素標(biāo)記的未甲基化DNA的結(jié)合。相對(duì)于DMSO媒介物對(duì)照(泳道1)計(jì)算Z'因子[12]。結(jié)果顯示與熒光偏振測定(Z'因子= 0.08)相比,TR-FRET測定顯示出顯著更好的信噪比(Z'因子= 0.59)。如所預(yù)期的,陰性對(duì)照(高過量未標(biāo)記的未甲基化寡核苷酸)在任一測定中均未顯著破壞MBD和甲基化DNA的結(jié)合。選定TR-FRET進(jìn)行化合物庫1280個(gè)化合物的篩選和后期的劑量反應(yīng)曲線得到最終4個(gè)活性化合物[11]?;衔飵斐醪胶Y選結(jié)果如下圖9。


圖9、化合物文庫篩選圖[11]

 

總  結(jié):

目前,在新藥研發(fā)過程中,通過熒光檢測技術(shù)高通量篩選蛋白酶、蛋白激酶及其抑制劑、抗體等小分子已經(jīng)成為了研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)。根據(jù)具體篩選的條件可以選用熒光技術(shù)的一種,同時(shí)還可以通過設(shè)定參照計(jì)算Z和Z'值來選取比較合適的熒光檢測方法。雖然熒光技術(shù)在HTS中的應(yīng)用還受到儀器裝置、篩選方法等條件的限制。但是熒光檢測不會(huì)像SPA(閃爍分析法)檢測產(chǎn)生放射性污染,也不需要像表面等離子共振法和核磁共振法需要特殊的儀器和設(shè)備以及沒有并行化不足問題,操作安全度高,可操作性強(qiáng),獲得研究機(jī)構(gòu)的認(rèn)可程度會(huì)越來越強(qiáng)。隨著新的熒光檢測技術(shù)不斷涌現(xiàn),會(huì)有更多的新藥篩選模型應(yīng)用于實(shí)踐,新藥的研制周期可能會(huì)因此縮短。


藥渡咨詢

戰(zhàn)略規(guī)劃、產(chǎn)品線規(guī)劃、新產(chǎn)品上市、新藥盡調(diào)估值、專利風(fēng)險(xiǎn)及價(jià)值培育、產(chǎn)品立項(xiàng)(生物藥、化藥、中成藥)、原料藥/輔料/藥包材市場調(diào)研、產(chǎn)品轉(zhuǎn)讓交易、醫(yī)藥全產(chǎn)業(yè)鏈信息檢索

    本站是提供個(gè)人知識(shí)管理的網(wǎng)絡(luò)存儲(chǔ)空間,所有內(nèi)容均由用戶發(fā)布,不代表本站觀點(diǎn)。請(qǐng)注意甄別內(nèi)容中的聯(lián)系方式、誘導(dǎo)購買等信息,謹(jǐn)防詐騙。如發(fā)現(xiàn)有害或侵權(quán)內(nèi)容,請(qǐng)點(diǎn)擊一鍵舉報(bào)。
    轉(zhuǎn)藏 分享 獻(xiàn)花(0

    0條評(píng)論

    發(fā)表

    請(qǐng)遵守用戶 評(píng)論公約

    類似文章 更多