液態(tài)活檢(liquid biopsy)已經(jīng)成為臨床腫瘤學(xué)的一門“顯學(xué)”,其學(xué)術(shù)意義和臨床應(yīng)用前景也越來越明朗。液態(tài)活檢按照檢測對象分類,主要可以分為核酸層面的ctDNA和細(xì)胞層面的循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)。 胰腺導(dǎo)管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC)是一種惡性腫瘤,患者被確診時往往已處于晚期,甚至病灶已經(jīng)轉(zhuǎn)移。臨床上可通過手術(shù)切除進(jìn)行治療的病人約為15~20%,早期PDAC患者的五年生存率僅為5%左右。目前雖然五年生存率已經(jīng)提高到27%,但80%的病人仍然面臨著治療后的復(fù)發(fā)。 目前臨床上廣泛采用的PDAC腫瘤標(biāo)志物是CA19–9,其檢測靈敏度是79%,特異性是82%。但CA19-9還不是最理想的檢測標(biāo)志物,例如在急性胰腺炎等狀況下CA19-9也會升高。本研究中,西班牙科學(xué)家以臨床上確診的PDAC病人為研究對象,對其外周血中的總cfDNA、腫瘤特異的ctDNA和CTC分別進(jìn)行了分析,并將結(jié)果與患者總生存期(overall survival, OS)之間的相關(guān)性進(jìn)行了分析。 共有45名PDAC患者參與了此次研究,入組時間為2009年10月至2014年5月。根據(jù)病人免疫組化的結(jié)果,將病人分為三個級別:可手術(shù)切除患者、未轉(zhuǎn)移晚期患者、轉(zhuǎn)移患者。31名病人進(jìn)行了cfDNA和KRAS突變含量的檢測;35名病人進(jìn)行了CTC的檢測。其中21名病人同時進(jìn)行了cfDNA和CTC的分析,7名病人在檢測前接受了gemcitabine治療。 患者血漿中cfDNA的總含量 31名患者血漿中純化得到DNA,對RNaseP基因進(jìn)行定量檢測,以RNaseP的含量作為血漿中cfDNA總含量的指標(biāo)(RNaseP的含量通過微滴式數(shù)字PCR分析得到)。在20ul血漿中RNaseP總含量的平均值為93個拷貝(范圍:6~1,663)。分析顯示病人血漿中cfDNA總含量隨著腫瘤的發(fā)展而升高,但兩者間并沒有統(tǒng)計學(xué)意義上的相關(guān)性,和患者的總生存期也不存在相關(guān)性。具體結(jié)果見下圖。 血漿中腫瘤特異性ctDNA(KRAS突變)的檢測 根據(jù)COSMIC數(shù)據(jù)庫,本研究對血漿中PDAC相關(guān)的ctDNA以KRAS突變?yōu)闄z測對象,檢測的突變位點分別是:G12D,G12R和G12V,檢測直接采用了Bio-Rad公司的PrimePCR KRAS檢測試劑盒。選擇這三個位點作為檢測對象的原因是G12D,G12R和G12V分別占到PDAC原發(fā)腫瘤突變的51 %, 29 %和12 %。 實驗前分別對三個位點檢測試劑盒的特異性進(jìn)行了測試。其中G12D和G12R試劑盒之間不存在非特異的檢測結(jié)果,而G12V試劑盒會產(chǎn)生G12D非特異性的檢出。所以本研究中,每個樣品對應(yīng)的突變陽性微滴在3個以上才被判定為陽性。 對患者樣品檢測前,將含有G12D突變的胰腺癌細(xì)胞系SUIT-2以250ng,100ng,50ng 和25ng DNA的含量加入正常人1ml的血漿中,純化后利用PrimePCR KRAS G12D ddPCR檢測試劑盒進(jìn)行檢測。結(jié)果顯示在模擬條件下,ddPCR的實測結(jié)果與理論值的correlation coefficient為0.99(p 對31名患者血漿中KRAS突變位點的分析結(jié)果如下:其中8名患者的血漿中含有KRAS突變,檢出率為26%。其中G12D突變的為6人,G12R和G12V的病人各1人。3名為可通過手術(shù)治療,1名為未轉(zhuǎn)移晚期,4名為轉(zhuǎn)移患者。由于PDAC還有其他低頻的KRAS突變位點,因此本研究中26%的檢出率有可能被低估。3名可通過手術(shù)治療的病人中檢出KRAS突變意味著在還未發(fā)生病灶轉(zhuǎn)移及釋放CTC進(jìn)入血液循環(huán)的情況下,就可檢測到ctDNA。 KRAS突變位點檢測呈陽性患者血漿中cfDNA的含量顯著高于陰性患者。KRAS檢測陽性患者的總生存期顯著短于陰性患者,前者為60天,后者為772天(p = 0.001)。分析結(jié)果見下圖。 PDAC原發(fā)病灶中KRAS突變位點的檢測 上述31名患者中的12名取得了原發(fā)灶的組織塊,提取DNA后進(jìn)行了毛細(xì)管電泳測序。測序結(jié)果表明:5名血漿中KRAS檢測呈陽性的病人,其中3名在原發(fā)灶組織中也檢測到了相同的突變,另外2名組織塊的測序結(jié)果顯示為陰性。 上述血漿檢測和原發(fā)灶測序結(jié)果的比較意義有二:首先,由于胰腺癌病灶一般通過超聲內(nèi)腔鏡下細(xì)針抽吸活檢術(shù)(endoscopic ultrasound-guided fine-needle aspiration,EUS-FNA)獲得,因此并非每個病人都能獲得原發(fā)病灶組織,所以血液的ctDNA檢測能作為一種無創(chuàng)檢測的方式了解腫瘤(相關(guān)閱讀請直接回復(fù)數(shù)字“006”);其次,即使獲得了病灶組織,不可避免其中會混有來自諸如基質(zhì)組織等的大量正常細(xì)胞,由于毛細(xì)管測序的靈敏度限制往往會造成漏檢。 PDAC患者中的CTC分析 對35名PDAC患者CTC的分析結(jié)果如下:其中7名患者檢測到CTC,檢出率為20%。其中1名為可通過手術(shù)治療,6名為轉(zhuǎn)移患者。前者僅檢測到1個CTC,后者分別檢測到1~13個CTC。 CTC檢測呈陽性患者的總生存期顯著短于陰性患者,前者為88天,后者為393天(p = 0.0108)。分析結(jié)果見下圖。 相比于其他實體瘤,PDAC患者中CTC的檢出率是較低的。例如結(jié)直腸癌病人中,同樣采用強生公司CellSearch系統(tǒng),CTC的檢出率為36%。另一方面,測得的CTC個數(shù)PDAC也少于其他腫瘤。如本研究中PDAC患者中測得的CTC數(shù)為1~13個,相比于前列腺癌和乳腺癌,約57%和25%的病人能夠檢測出至少5個CTC。 在PDAC患者中CTC低檢出率的另一個原因是CellSearch系統(tǒng)的檢測方法。CellSearch系統(tǒng)是根據(jù)EpCAM和CK來識別CTC的,最近一項小鼠模型的研究表明PDAC腫瘤細(xì)胞中僅有27%表達(dá)EpCAM,約有40%的細(xì)胞表達(dá)間質(zhì)分子標(biāo)志物Zeb1。這說明對處于上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial to mesenchymal transition, EMT)的CTC而言,由于其低表達(dá)水平的EpCAM和CK,也許需要其他的CTC檢測方式。 ctDNA與CTC分析結(jié)果的一致性 21名同時有ctDNA和CTC檢測數(shù)據(jù)的患者,其中5名CTC檢測為陽性的患者中4名檢測到了KRAS突變的ctDNA,其中1名ctDNA檢測為陽性的患者CTC結(jié)果呈陰性??傮w上,ctDNA和CTC分析具有一致性。 化療對ctDNA檢測的影響 1. 7名病人在檢測前接受了gemcitabine治療,其中僅一名患者的ctDNA檢測呈KRAS突變陽性,其余均為陰性。 2. 4例原發(fā)灶組織通過測序檢測為KRAS突變陽性,其中僅1例的血漿中ctDNA檢測也呈陽性,其余3例血漿檢測為陰性,這3例患者在血液檢測前都接受了gemcitabine治療。 總結(jié) 1. 對于PDAC,ctDNA是腫瘤早期檢測和預(yù)后評估的有效分子標(biāo)志物。 2. cfDNA總含量有望成為腫瘤分期的參考指標(biāo),但需更大規(guī)模的群體研究。 3. CellSearch系統(tǒng)對PDAC患者CTC的檢出率較低,對病灶轉(zhuǎn)移的晚期患者更有效,這種情況下對臨床治療的幫助不大。 4. 對于PDAC患者的CTC檢測,需要依賴于更多的細(xì)胞標(biāo)志物。(轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)網(wǎng)360zhyx.com) |
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