從事基礎(chǔ)研究、前沿技術(shù)研究和社會公益研究的科研機構(gòu)，是我國科技創(chuàng)新的重要力量。建設(shè)一支穩(wěn)定服務(wù)于國家目標(biāo)、獻身科技事業(yè)的高水平研究隊伍，是發(fā)展我國科技事業(yè)的希望所在。

經(jīng)過30年來的改革實踐，我國從科學(xué)研究理念到科技工作地位，從科技體制機制到科研環(huán)境條件，從科研布局到科技實力等各個方面都發(fā)生了歷史性的深刻變化。通過以競爭擇優(yōu)為主的經(jīng)費配置方式改革，各類創(chuàng)新主體的競爭意識明顯增強；通過改革導(dǎo)向和激勵機制，科研機構(gòu)面向市場的能力顯著提升；通過改革人事和分配制度，科技人員的積極性明顯提高。這一系列改革舉措，為各類創(chuàng)新主體不斷注入新的活力，體制機制與政策環(huán)境得到優(yōu)化，為新時期全面推進和完善國家創(chuàng)新體系建設(shè)奠定了基礎(chǔ)。

改革以前，我國科研力量和科技資源主要集中在獨立科研機構(gòu)。經(jīng)過改革，已經(jīng)形成了科研院所、高校、企業(yè)和科技中介機構(gòu)等各具優(yōu)勢和特色的創(chuàng)新主體，科技系統(tǒng)結(jié)構(gòu)布局得到重大調(diào)整。通過改革，改變了主要依靠行政手段管理科技工作的局面，競爭擇優(yōu)機制在科技資源配置中發(fā)揮主導(dǎo)作用，對宏觀調(diào)控、政策引導(dǎo)和績效評價等現(xiàn)代管理手段的使用力度不斷加大。政府科技計劃管理改革持續(xù)進行，項目全面實行招標(biāo)，競爭資助機制不斷強化；科技政策法規(guī)體系不斷完善，政策法規(guī)對科技發(fā)展的引導(dǎo)、支持和規(guī)范作用加強；科研機構(gòu)普遍推行“開放、流動、競爭、協(xié)作”的機制，加大了用人和分配制度改革，科研機構(gòu)內(nèi)部平均主義和大鍋飯的局面基本打破；競爭擇優(yōu)和分配激勵政策，激發(fā)了科技人員的競爭意識和創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)積極性，促進了科技成果轉(zhuǎn)化。通過改革，精干了科研隊伍，科研院所數(shù)量大幅度減少，從改革前的5000多家，減少到目前（截至2009年9月，下同——編者注）的3775多家。

轉(zhuǎn)制院所

在改革中，全國共有1300多家開發(fā)類院所轉(zhuǎn)為或進入企業(yè)，其中376個中央級技術(shù)開發(fā)院所實行企業(yè)化轉(zhuǎn)制，從體制上解決了大批應(yīng)用開發(fā)類院所長期游離于企業(yè)之外的問題，基本建立起科技型企業(yè)的運行機制。據(jù)2007年對中央級轉(zhuǎn)制科研機構(gòu)的調(diào)查統(tǒng)計，85%以上的院所建立了企業(yè)會計制度和全員勞動合同制度，90%以上的院所加入了企業(yè)社會保障體系。在轉(zhuǎn)企的同時推進了改制，以產(chǎn)權(quán)多元化和規(guī)范法人治理結(jié)構(gòu)為重點加快建立現(xiàn)代企業(yè)制度。目前中央級轉(zhuǎn)制院所下屬企業(yè)全面完成了公司制改造并有20多個企業(yè)成功上市。江蘇、浙江、寧夏、武漢、沈陽等地開發(fā)類院所全部一步到位改制為股份制企業(yè)。

根據(jù)對247家中央級轉(zhuǎn)制院所的調(diào)查，2007年這247家中央級轉(zhuǎn)制院所科技經(jīng)費收入為153.18億元，其中來自政府部委的縱向科技經(jīng)費為26.14億元，比2000年增長了2倍多；來自行業(yè)企業(yè)的橫向科技經(jīng)費為127.04億元，是2000年的4倍；完成科研項目7205項，較上年增長13.38%；獲得國家級獎勵38項，較上年增長15.15%；申報專利3674項，獲得專利授權(quán)1775項，較上年增長12.20%，在授權(quán)專利中發(fā)明專利占55.66%。

轉(zhuǎn)制院所發(fā)揮其技術(shù)和人才優(yōu)勢，在行業(yè)科技進步中發(fā)揮了重要的骨干和引領(lǐng)作用，承擔(dān)了大量國家科技計劃和行業(yè)重點研發(fā)任務(wù)，取得了一批重要創(chuàng)新成果，并積極向行業(yè)企業(yè)推廣和擴散，有力地促進了行業(yè)企業(yè)技術(shù)水平的提升。據(jù)統(tǒng)計，2007年247家中央級轉(zhuǎn)制院所共轉(zhuǎn)讓技術(shù)成果1800多個，受益企業(yè)達1.5萬家。

科技產(chǎn)業(yè)規(guī)模和效益大幅度提高，形成了一批具有市場競爭力的科技企業(yè)或企業(yè)集團。轉(zhuǎn)制前，各科研院所也興辦了一些科技產(chǎn)業(yè)，但受事業(yè)單位體制的制約，科技產(chǎn)業(yè)做不大，“小富即安”的現(xiàn)象比較普遍。企業(yè)化轉(zhuǎn)制后，通過調(diào)整產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)和規(guī)范管理制度，科研院所產(chǎn)業(yè)發(fā)展速度明顯加快，成本管理加強，效益大幅度提高。據(jù)統(tǒng)計，2007年247個中央級轉(zhuǎn)制院所總收入1065億元，實現(xiàn)利潤81.7億元，上交稅金48億元，均為2000年的4倍以上。在中央級轉(zhuǎn)制院所中，有100多家總收入超過1億元，有10多家收入超過20億元。如長沙中聯(lián)重工科技發(fā)展股份有限公司是由原建設(shè)部長沙建設(shè)機械研究院改制而成的高科技上市公司，2007年實現(xiàn)銷售收入近135億元，利潤總額近17億元，上交稅收5億元，成為中國工程機械行業(yè)的龍頭企業(yè)，進入全球工程機械50強。武漢郵電科研院所轉(zhuǎn)制后發(fā)展成為業(yè)內(nèi)知名的通信設(shè)備制造商與解決方案提供商，以超高速率、超大容量和超長距離光通信技術(shù)為代表的一批成果達到世界先進水平，產(chǎn)品遠銷37個國家和地區(qū)。

公益類科研機構(gòu)

公益類科研機構(gòu)分類改革工作自2001年開始啟動，到2008年底，65個部門所屬公益類科研院所實行分類改革全部完成。先期啟動改革的中國氣象局、水利部、國土資源部、國家林業(yè)局、國家測繪局、中國地震局6個部門所屬科研院所已基本完成階段性改革任務(wù)，通過了有關(guān)部門組織的聯(lián)合驗收，改革取得了重要的階段性成就。

在學(xué)科結(jié)構(gòu)調(diào)整上，按照強化國家目標(biāo)和突出學(xué)科優(yōu)勢的原則，各院所加強了重點學(xué)科，淘汰落后學(xué)科，扶植新興學(xué)科。通過結(jié)構(gòu)調(diào)整，組織結(jié)構(gòu)和人才結(jié)構(gòu)更加優(yōu)化，學(xué)科結(jié)構(gòu)更加合理，新設(shè)了一批新興學(xué)科，如地質(zhì)科學(xué)研究院將原有87個研究領(lǐng)域和方向整合為5個重大研究領(lǐng)域和學(xué)科群，加強了資源環(huán)境和地學(xué)前沿學(xué)科建設(shè)。職能處室撤并1/3以上，行政管理人員數(shù)量減少了一半。中國林科院院部及非營利研究所內(nèi)設(shè)機構(gòu)按照“精干、高效”的原則，進一步精簡職能部門和管理人員。院部職能處室經(jīng)兩次精簡，機構(gòu)數(shù)由19個減少到8個，下降58%，編制由255人減少到77人，下降70%。科技人才層次明顯提高，學(xué)歷層次和年代結(jié)構(gòu)趨向合理。根據(jù)2008年對96家公益類科研機構(gòu)的調(diào)查，2007年擁有碩士、博士學(xué)歷的科技人員合計達58.5%，45歲以下科技人員的比例已達到71%。

根據(jù)對中央級公益類科研機構(gòu)的調(diào)查結(jié)果顯示，政府對公益科研的投入在持續(xù)加大，公益類科研機構(gòu)的創(chuàng)新和服務(wù)能力顯著提升。2007年，96家公益類科研機構(gòu)總收入為106.57億元，比上年增長35.2%；其中，國家新增基本科研業(yè)務(wù)費、修繕購置專項經(jīng)費、研究生培養(yǎng)補助經(jīng)費、增撥離退休人員費等合計為19.19億元，占全年總收入的18.01%，全年總收入增加額的69.15%。96家公益類科研機構(gòu)縱向科技經(jīng)費收入為34.13億元，較上年增長59.5%；橫向科技收入為14.38億元。96家公益類科研機構(gòu)共完成科研項目4477項，獲得國家級獎勵33項，申請受理專利475項，授權(quán)專利258項，在國內(nèi)核心期刊發(fā)表論文9190篇，分別比上年增長9.95%、13.79%、34.94%、22.27%和8.68%。在授權(quán)的專利中，發(fā)明專利占69.37%，還取得了一批在國內(nèi)外有較大影響和應(yīng)用前景的科研成果。

中國科學(xué)院

新中國成立以來，經(jīng)過60年的努力，中國科學(xué)院已發(fā)展成為國家在科學(xué)技術(shù)方面的最高學(xué)術(shù)機構(gòu)和全國自然科學(xué)與高新技術(shù)的綜合研究與發(fā)展中心。60年來，中國科學(xué)院在國家科技規(guī)劃、科技政策制定等方面發(fā)揮了重要作用，取得了一系列重大科研成果，為我國的科技事業(yè)、國民經(jīng)濟和社會發(fā)展及國防建設(shè)做出了重要貢獻，還為國家培養(yǎng)和輸送了一大批優(yōu)秀科技創(chuàng)新人才。

中國科學(xué)院在基礎(chǔ)科學(xué)研究領(lǐng)域先后取得了許多重大的科研成果，如哥德巴赫猜想研究、數(shù)學(xué)定理的機器證明、哈密爾頓系統(tǒng)的辛幾何算法、新核素合成、高溫超導(dǎo)、碳納米管的制備和應(yīng)用、非線性光學(xué)晶體、過渡金屬原子簇結(jié)構(gòu)和性質(zhì)以及金屬有機化學(xué)等。同時，為我國信息、能源、材料、資源、農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥、空間和國家安全等方面的研究和發(fā)展以及形成科技戰(zhàn)略儲備做出了重要貢獻。

在國防科技方面，中國科學(xué)院曾參與“兩彈一星”攻關(guān)，艱苦拼搏、協(xié)同作戰(zhàn)，開拓了許多國際上新興、國內(nèi)完全空白的科技領(lǐng)域，研制成功一大批新型材料、特種元器件、精密儀器和測試設(shè)備，在核武器研制、核燃料工業(yè)的開拓、彈道的應(yīng)用基礎(chǔ)理論和技術(shù)基礎(chǔ)和反導(dǎo)研究方面取得了許多重要突破。中國科學(xué)院率先在我國開拓出一批新型科學(xué)技術(shù)學(xué)科核心領(lǐng)域，取得了一大批國內(nèi)領(lǐng)先的重要成果，建立了不朽的功勛。近年來，中國科學(xué)院面向國家安全、國防戰(zhàn)略需求和國防科技發(fā)展前沿，在航天航空、新概念武器、軍事海洋、軍事信息、反恐和軍用新材料、元器件等技術(shù)領(lǐng)域，重大成果不斷涌現(xiàn)，圓滿完成載人航天工程應(yīng)用系統(tǒng)總體及配套任務(wù)、首次月球探測工程地面應(yīng)用系統(tǒng)及有效載荷和VLBT測控任務(wù)等；自主研制成功“創(chuàng)新1號”存儲轉(zhuǎn)發(fā)通信小衛(wèi)星。

在高技術(shù)研究與發(fā)展領(lǐng)域，中國科學(xué)院各有關(guān)研究所積極承擔(dān)國家重點基礎(chǔ)研究計劃、國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃、國家重點科技攻關(guān)計劃等國家重大科技任務(wù)，加強與企業(yè)的合作，取得了一系列重大成果，如工業(yè)機器人產(chǎn)業(yè)化、小型化超強超短激光、納米材料、有機合成化學(xué)、40萬千瓦蒸發(fā)冷卻電機、曙光3000超級服務(wù)器、“龍芯”系列通用CPU芯片和“曙光”、“深騰”系列超級計算機、甲醇制取低碳烯烴技術(shù)開發(fā)及工業(yè)性試驗、高性能碳纖維技術(shù)攻關(guān)及工業(yè)規(guī)模生產(chǎn)、煤制乙二醇技術(shù)及其規(guī)模產(chǎn)業(yè)化等，為我國信息技術(shù)和自動化、化工與材料、能源等領(lǐng)域的科技發(fā)展做出了重要貢獻。

為國家培養(yǎng)和輸送高層次科技人才，是中國科學(xué)院對國家和社會的一個重要貢獻。60年來，中國科學(xué)院為國家培養(yǎng)和輸送了10萬余名研究生。

建院60年來，中國科學(xué)院科技事業(yè)發(fā)展的實踐豐富了對科技創(chuàng)新活動規(guī)律的認識，深化了對建設(shè)中國特色國家創(chuàng)新體系的認識，顯著提升了中國科學(xué)院的創(chuàng)新能力，取得了許多來之不易、十分寶貴的經(jīng)驗，概括起來就是“六個始終堅持”：一是始終堅持將面向國家戰(zhàn)略需求和面向世界科技前沿緊密結(jié)合起來，不斷明晰戰(zhàn)略定位，不斷凝練創(chuàng)新目標(biāo)，著力提升自主創(chuàng)新能力；二是始終堅持立足中國國情，認知規(guī)律，不斷前瞻，適時實施科技創(chuàng)新發(fā)展戰(zhàn)略，努力發(fā)揮代表國家最高水平的科技國家隊和引領(lǐng)我國科技發(fā)展“火車頭”和“思想庫”的作用；三是始終堅持解放思想，改革創(chuàng)新，與時俱進，更新觀念，不斷革新科技管理體制，解放和發(fā)展科技生產(chǎn)力，發(fā)揮科技改革探索者的作用；四是始終堅持正確的知識分子政策，堅持以人為本，以事業(yè)的發(fā)展凝聚人，以正確的價值觀引導(dǎo)人，以良好的創(chuàng)新環(huán)境吸引人，以合理的待遇激勵人，以創(chuàng)新實踐培養(yǎng)造就人，充分發(fā)揮科技創(chuàng)新隊伍的積極性、主動性和創(chuàng)造性，建設(shè)一流的科技創(chuàng)新隊伍；五是始終堅持聯(lián)合合作，開展與地方、企業(yè)和研究型大學(xué)多種形式的合作，促進產(chǎn)學(xué)研結(jié)合，促進高科技產(chǎn)業(yè)化，促進知識轉(zhuǎn)移與技術(shù)擴散；六是始終堅持對外開放，以開放的心態(tài)對待人類創(chuàng)造的一切新知識，有效利用全球科技創(chuàng)新資源，在交流合作中共同發(fā)展，提升自主創(chuàng)新的起點和水平。

中國科學(xué)院知識創(chuàng)新工程現(xiàn)已進入第三階段。改革的目的是增強研究所核心競爭力，凝練并提升創(chuàng)新目標(biāo)，探索建立科技布局自主調(diào)整、人才隊伍動態(tài)優(yōu)化、與國家創(chuàng)新體系各單元聯(lián)合發(fā)展、資源配置與科技評價自覺適應(yīng)發(fā)展要求的機制，逐步建立現(xiàn)代科研院所制度和研究所分類管理的科學(xué)基礎(chǔ)，通過典型先行、分類指導(dǎo)、以點帶面、有序推進，帶動全院研究所快速發(fā)展。

2008年，中國科學(xué)院共申請專利5616件，專利授權(quán)2665件，分別比上年增長26.94%、21.30%。在申請專利和授權(quán)專利中，發(fā)明專利分別占85.8%、78.8%?？萍既藛T作為第一作者2007年被國際三大檢索系統(tǒng)收錄的論文24 045篇，比2006年增長6.5%。獲國家自然科學(xué)獎17項，國家技術(shù)發(fā)明獎3項，國家科技進步獎14項?？萍汲晒D(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化使社會企業(yè)當(dāng)年新增銷售收入964億元，實現(xiàn)利稅135億元。

地方科研院所

各地方按照中央要求，結(jié)合本地實際積極推進科研院所改革，大部分地方開發(fā)類院所轉(zhuǎn)制基本完成，對公益類院所進行了改革試點。據(jù)統(tǒng)計，目前全國各地方已有近800多家應(yīng)用開發(fā)類院所完成了企業(yè)化轉(zhuǎn)制，占地方開發(fā)類院所總數(shù)的80%以上。江蘇、浙江、寧夏、重慶、青島、沈陽、武漢、廣州、杭州等地，轉(zhuǎn)制院所全面完成了股份制改造，初步建立起現(xiàn)代企業(yè)制度，為科技產(chǎn)業(yè)發(fā)展注入了極大的活力。

各地方也參照部門屬公益類院所的改革要求，結(jié)合實際情況，啟動了地方公益類院所的改革工作，取得了較大進展和初步成效。如寧夏農(nóng)林科學(xué)院整體改革基本到位，采取體制改革中走在了地方農(nóng)業(yè)院所改革的前頭。該院的基本思路是整體推進分類改革，其中具有面向市場能力的6個研究所已整體轉(zhuǎn)制為科技型企業(yè)。經(jīng)過逐步調(diào)整，目前一個精干高效的非營利科研機構(gòu)和由其投資參股、控股的若干個科技型企業(yè)組成的新的寧夏農(nóng)林科學(xué)院的框架初步形成。改革后的寧夏農(nóng)科院科研經(jīng)費較大幅度增長，科研實力有所增強，寧夏農(nóng)科院主持的項目“寧夏沙漠化土地綜合治理及沙產(chǎn)業(yè)開發(fā)”獲得2007年國家科技進步二等獎。2006年、2007年連續(xù)兩年爭取到的經(jīng)費超過2000萬元，尤其是2007年獲批各類科研項目89項，其中國家項目27項，比上年提高80%。吉林省農(nóng)科院經(jīng)過3年左右的改革調(diào)整，以內(nèi)部調(diào)整和重組為重點的綜合改革試點任務(wù)基本完成，形成了“一院兩體”的架構(gòu)，即在一個農(nóng)科院的總體框架下分設(shè)研究開發(fā)和科技產(chǎn)業(yè)化兩個主體，兩個主體通過兩條紐帶聯(lián)結(jié)：一是資產(chǎn)紐帶，省政府授權(quán)農(nóng)科院對其投入企業(yè)的國有資產(chǎn)享有出資人權(quán)益；二是技術(shù)紐帶，科研主體向產(chǎn)業(yè)化主體提供技術(shù)成果，轉(zhuǎn)化收益反哺研究開發(fā)。改革后吉林農(nóng)科院創(chuàng)新活力和能力顯著提高，有力地支撐和引導(dǎo)了吉林省農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。

高等院校

高等院校是我國培養(yǎng)高層次創(chuàng)新人才的重要基地，是我國基礎(chǔ)研究和高技術(shù)領(lǐng)域原始創(chuàng)新的主力軍之一，是解決國民經(jīng)濟重大科技問題，實現(xiàn)技術(shù)轉(zhuǎn)移、成果轉(zhuǎn)化的生力軍。加快建設(shè)一批高水平大學(xué)，特別是一批世界知名的高水平研究型大學(xué)，是我國加速科技創(chuàng)新、建設(shè)國家創(chuàng)新體系的需要。目前我國已經(jīng)形成了一批規(guī)模適當(dāng)、學(xué)科綜合和人才匯聚的高水平大學(xué)，在科技創(chuàng)新方面，特別是基礎(chǔ)研究、前沿技術(shù)研究、社會公益研究等領(lǐng)域的原始創(chuàng)新方面發(fā)揮了重要作用。國家鼓勵、推動高等院校與企業(yè)和科研院所進行全面合作，加大為國家、區(qū)域和行業(yè)發(fā)展服務(wù)的力度，加快大學(xué)重點學(xué)科和科技創(chuàng)新平臺建設(shè)，培養(yǎng)和匯聚一批具有國際領(lǐng)先水平的學(xué)科帶頭人，建設(shè)一支學(xué)風(fēng)優(yōu)良、富有創(chuàng)新精神和國際競爭力的高校教師隊伍，進一步加快大學(xué)內(nèi)部管理體制的改革步伐，優(yōu)化大學(xué)內(nèi)部的教育結(jié)構(gòu)和科技組織結(jié)構(gòu)，創(chuàng)新運行機制和管理制度，建立科學(xué)合理的綜合評價體系，建立有利于提高創(chuàng)新人才培養(yǎng)質(zhì)量和創(chuàng)新能力，人盡其才、人才輩出的運行機制，積極探索建立具有中國特色的現(xiàn)代大學(xué)制度。

據(jù)初步統(tǒng)計，2008年，在全國理工農(nóng)醫(yī)類高校中，從事科技活動的人員總數(shù)為39.2萬人，其中研究與發(fā)展人員為20.1萬人年，這些高校共獲得科技經(jīng)費654.5億元，比上年增長20.2%。共承擔(dān)各類科技課題30.9萬項，其中研究與發(fā)展課題25.8萬項。當(dāng)年投入課題經(jīng)費505.5億元，其中基礎(chǔ)研究經(jīng)費占22.3%，應(yīng)用研究經(jīng)費占41.4%，試驗發(fā)展研究經(jīng)費占14.0%。

2008年，全國理工農(nóng)醫(yī)類高校共出版科技專著2881部，比上年增長10.67%，在國外學(xué)術(shù)刊物上發(fā)表學(xué)術(shù)論文12.9萬篇；簽訂技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同8408項，當(dāng)年實際收入19.8億元，申請專利4.1萬件，比上年增長36.7%；獲得專利授權(quán)1.9萬件，比上年增長26.7%，其中獲國外專利授權(quán)82件。

在2008年度的國家科學(xué)技術(shù)獎勵項目中，高校的兩位院士獲得國家最高科學(xué)技術(shù)獎；全國高校獲得國家自然科學(xué)獎二等獎16項，占授獎總數(shù)的47.1%；全國高校獲得國家技術(shù)發(fā)明獎通用項目30項，占授獎總數(shù)的81%，其中，有3個項目共同獲得技術(shù)發(fā)明獎一等獎；全國高校獲得科學(xué)技術(shù)進步獎通用項目69項，占總數(shù)的38%。

教育部作為16個國家科技重大專項領(lǐng)導(dǎo)小組成員單位，積極參與重大專項的論證規(guī)劃工作，高校已經(jīng)成為民口重大專項共性技術(shù)研發(fā)的主力軍，共有150余所高校不同程度地參與重大專項的研發(fā)。

2008年科技部共批復(fù)立項“973計劃”74項，高校作為第一承擔(dān)單位并任首席科學(xué)家的項目占立項總數(shù)的58.1%。重大科學(xué)研究計劃共批準立項35項，高校作為第一承擔(dān)單位的項目占立項總數(shù)的57.1%。

教育部十分重視重點實驗室的管理工作。伴隨著國家重點實驗室的建設(shè)與發(fā)展，教育部自1991年起建立高校開放實驗室，1999年正式建立教育部重點實驗室。目前共有教育部重點實驗室436個，分布在全國31個省、自治區(qū)和直轄市。逐步形成了以國家實驗室、國家重點實驗室、教育部重點實驗室和省部共建教育部重點實驗室組成的高校研究實驗基地結(jié)構(gòu)體系。經(jīng)過近20年的建設(shè)和發(fā)展，教育部重點實驗室已成為高?；A(chǔ)研究的中堅力量，培養(yǎng)、吸引高層次創(chuàng)新人才和穩(wěn)定基礎(chǔ)研究隊伍的重要基地，產(chǎn)生創(chuàng)新成果、培養(yǎng)創(chuàng)新人才的搖籃，開展高水平國際學(xué)術(shù)交流與合作的重要基地，成為國家科技創(chuàng)新體系的重要組成部分。

為加強地方高校特色和優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)，推動學(xué)科交叉，優(yōu)化科技資源配置，更好地為地方經(jīng)濟建設(shè)和社會發(fā)展服務(wù)，教育部于2003年啟動省部共建教育部重點實驗室計劃，遴選一批高校實驗室作為省部共建教育部重點實驗室建設(shè)管理，把推動并規(guī)范地方高校省部共建教育部重點實驗室建設(shè)工作作為國家創(chuàng)新體系（高校）建設(shè)的重要組成部分。

省部共建教育部重點實驗室統(tǒng)一由省（自治區(qū)、直轄市）教育廳（教委）向教育部科技司申報。同等條件下，向中西部和東北老工業(yè)基地地區(qū)高校傾斜。立項建設(shè)的省部共建重點實驗室建設(shè)期為一至兩年，建設(shè)期滿，由教育部和地方教育行政部門組織專家進行驗收。省部共建教育部重點實驗室由教育部和各省、自治區(qū)、直轄市的教育行政部門共同管理，由高等學(xué)校負責(zé)項目的具體實施和直接管理。目前全國省部共建教育部重點實驗室共有156個。

2008年，在資源、環(huán)境、節(jié)能減排、生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展、信息和產(chǎn)業(yè)升級等領(lǐng)域，有14個國家工程實驗室和83個教育部重點實驗室獲得立項，新批準國家工程技術(shù)研究中心12個。一些重點高校面向科技重大專項，成立了教育部深空探測聯(lián)合研究中心、教育部新型飛行器聯(lián)合研究中心和教育部復(fù)雜油氣地質(zhì)構(gòu)造研究中心。為推進國際熱核反應(yīng)堆（ITER）計劃工作，成立了磁約束核聚變教育部研究中心，協(xié)調(diào)和組織有關(guān)高校做好人才培養(yǎng)培訓(xùn)和共同參與ITER重大基礎(chǔ)科學(xué)問題研究等方面的籌備工作。

2008年1月，國家開始進行“211工程”三期建設(shè)，目標(biāo)一是要繼續(xù)瞄準學(xué)科前沿和國家重大需求，加強重點學(xué)科建設(shè)，使更多的重點學(xué)科進入國際先進行列；二是突出創(chuàng)新人才和隊伍建設(shè)，進一步提高教師隊伍水平，著力提高人才培養(yǎng)質(zhì)量，努力造就一批學(xué)術(shù)領(lǐng)軍人物；三是加強高校公共服務(wù)體系建設(shè)，推進優(yōu)質(zhì)教育資源的社會共享；四是推進機制體制創(chuàng)新，創(chuàng)造有利于發(fā)揮人才創(chuàng)造性、多出重大成果的條件；五是認真做好建設(shè)規(guī)劃，加強項目論證和評審，強化稽查和審計，切實提高資金使用效益。

2004年，國務(wù)院批轉(zhuǎn)教育部《2003—2007年教育振興行動計劃》，決定繼續(xù)實施“985工程”二期建設(shè)，目標(biāo)是鞏固一期建設(shè)成果，為創(chuàng)建世界一流大學(xué)和一批國際知名的高水平研究型大學(xué)進一步奠定堅實基礎(chǔ)，使一批學(xué)科達到或接近國際一流學(xué)科水平，經(jīng)過更長時間努力，建成若干所世界一流大學(xué)。

目前，“985工程”二期建設(shè)進展順利。“985工程”學(xué)校堅持以人為本，廣納賢才，把師資隊伍建設(shè)作為學(xué)校工作的重中之重，不斷加強對人才工作的領(lǐng)導(dǎo)，全面實施“985工程”二期建設(shè)人才隊伍建設(shè)計劃；以國際科技前沿和國家重大需求為導(dǎo)向，以突出特色、實現(xiàn)跨越式發(fā)展為宗旨，圍繞經(jīng)濟建設(shè)和社會發(fā)展中的重大問題，建設(shè)平臺和基地共計372個；圍繞公共服務(wù)體系、公共基礎(chǔ)設(shè)施和實驗室等內(nèi)容進行了一系列的條件支撐建設(shè)；深入貫徹實施全方位、開放式發(fā)展戰(zhàn)略，不斷擴大學(xué)校的對外開放，豐富國際合作交流的內(nèi)容，堅持務(wù)實、高效和長久的合作，逐步提升國際化水平；通過管理體制創(chuàng)新，運行機制創(chuàng)新，積極探索世界一流大學(xué)建設(shè)的新機制。

這些計劃項目的實施，為我國建設(shè)若干所世界一流大學(xué)和一批世界一流學(xué)科發(fā)揮了重要作用，有力地推動了我國高等教育發(fā)展和高等教育質(zhì)量的提高，已經(jīng)形成了一批規(guī)模適當(dāng)、學(xué)科綜合和人才匯聚的高水平大學(xué)，在基礎(chǔ)研究、前沿技術(shù)研究、社會公益研究等領(lǐng)域的原始創(chuàng)新方面發(fā)揮了重要作用。10年來，通過這些重點建設(shè)項目的實施，我國高水平大學(xué)建設(shè)成效顯著，人才培養(yǎng)、科學(xué)研究、社會服務(wù)能力都有了很大提高，其中研究生培養(yǎng)能力提高了5倍，科研經(jīng)費增長了7倍，被SCI國際檢索系統(tǒng)收錄的論文數(shù)量增長了近7倍，具有博士學(xué)位的教師增加了近5倍，儀器設(shè)備總值增長了4倍。一批高水平大學(xué)與世界一流大學(xué)的差距明顯縮小。成功探索了發(fā)展中國家如何從國情出發(fā)，集中力量、突出重點建設(shè)高水平大學(xué)之路。按國際可比指標(biāo)SCI論文發(fā)表數(shù)統(tǒng)計，有40多個學(xué)科已接近國際先進水平。

高水平大學(xué)在不斷提升辦學(xué)水平的同時，對其他高等學(xué)校的發(fā)展起到了巨大的帶動輻射作用，從而促進了我國高等教育總體水平的提高。在“211工程”和“985工程”建設(shè)中，立足國情，從實現(xiàn)資源共享、帶動高等教育整體發(fā)展的思路出發(fā)，通過10年建設(shè)，從無到有，初步構(gòu)建了中國獨有的高等教育公共服務(wù)體系，為及時了解世界學(xué)術(shù)信息，共享學(xué)術(shù)資源，促進高等教育提高水平提供了有力的支撐。同時也推動了高等學(xué)校轉(zhuǎn)變資源建設(shè)觀念。

隨著學(xué)科水平的不斷提高，越來越多發(fā)達國家的高校和研究機構(gòu)紛紛與我國高水平大學(xué)建立聯(lián)合科研機構(gòu)，加強學(xué)術(shù)和技術(shù)合作，提升合作交流的深度和層次。極大地提高了我國高等教育的國際地位和影響力。目前，已有英國、法國、德國等27個國家和地區(qū)與我國簽署了相互承認學(xué)歷和學(xué)位的政府間協(xié)議。北京大學(xué)已與世界上49個國家的200多所大學(xué)簽訂了校際合作協(xié)議，并與國際知名大學(xué)建立了研究中心和實驗室，與IBM等15個國際知名企業(yè)建立了研究中心。近年來，10多位諾貝爾獎得主訪問北京大學(xué)，劍橋、耶魯、哈佛、牛津等著名大學(xué)校長先后成為北大的座上客。復(fù)旦大學(xué)每年邀請80多位外籍專家長期來校參與教學(xué)、科研，邀請500多位外籍專家進行短期訪學(xué)，300多位國際知名學(xué)者受聘為復(fù)旦大學(xué)名譽教授、名譽博士。清華大學(xué)在與海外130所大學(xué)簽訂合作協(xié)議的基礎(chǔ)上，重點與哈佛、麻省理工學(xué)院等10多所一流大學(xué)開展合作，聯(lián)合舉辦培訓(xùn)班、研修班，實施研究生聯(lián)合培養(yǎng)計劃，選派有潛力的青年教師到本學(xué)科領(lǐng)域世界著名大學(xué)學(xué)習(xí)進修等。

通過高等教育管理體制的全面改革，解決了辦學(xué)部門“條塊分割、條條分割、小而全、大而全”的問題，優(yōu)化了布局結(jié)構(gòu)，資源得到共享，學(xué)科建設(shè)得到加強，辦學(xué)質(zhì)量和效益明顯提高。一些高校通過合并，形成“強強聯(lián)合”，啟動了世界一流大學(xué)和高水平研究型大學(xué)的建設(shè)，推動了高校創(chuàng)新體系建設(shè)和創(chuàng)新能力的提高，使一批大學(xué)成為科學(xué)研究、高層次人才培養(yǎng)和高技術(shù)企業(yè)孵化的重要基地，也為我國科技領(lǐng)域下一步發(fā)展與改革工作探索和積累了經(jīng)驗，奠定了一定基礎(chǔ)。