有的童鞋看到這種圖頭就大了：哇，夏老師，我知道這個是講染色體啊基因啊相關(guān)性啊什么blablabla的……

實(shí)際上Circos圖，說穿了，就是Excel表格的一種可視化展示方式，如果變成表格的話，大概是這樣的：

中間的數(shù)值，代表了行與列之間的相關(guān)性，比如相關(guān)系數(shù)啊等等……

當(dāng)然Cricos圖也是有表現(xiàn)形式的，比如，單純相關(guān)性的話，就會用線條表示，線條的粗細(xì)代表相關(guān)性的數(shù)值：

如果這個相關(guān)性是有方向性的話，那就會在發(fā)出方的線條不接到環(huán)上，大概就是這樣：

如果上色的話，線條的顏色會使用到達(dá)方的顏色，你會發(fā)現(xiàn)，有的時候這個條帶有粗有細(xì)，那是因?yàn)楸砀駮羞@樣的情況：

From A to B的時候，數(shù)值是2，而From B to A的時候，數(shù)值是5，那怎么辦呢，這樣的話，就在兩端用不同的粗細(xì)來表示了。比如上面這個列表的話，就會展示成這樣的Circos圖：

大概就是這么個意思吧。一般來說，很多基因的遠(yuǎn)端互作啊，近端互作，會用Circos圖來表示，因?yàn)橥饷嬉蝗θ旧w，這樣基因組展示出來比較漂亮，說實(shí)話，你未必真的能從里面看出什么門道。

當(dāng)然，Circos圖還有升級版，就是像剛開始我們看到的那張圖一樣，里面具有不同的Track，也就是分層，意思就是把基因的突變啊，染色體位置啊，表達(dá)啊，這些七七八八的東西，都囊括在一張圖里展示出來：

圖很漂亮，但沒什么卵用，根本看不出什么東西來。我們回過頭來，看看之前的這張圖，這篇文獻(xiàn)是doi:10.1016/j.placenta.2013.11.007.，講的是人胎盤轉(zhuǎn)錄組的分析。我們把這個Circos圖放大一點(diǎn)看，實(shí)際上里面有6層Track：

第一層就是染色體，接著幾層是基因表達(dá)的熱圖，最里面的相關(guān)性聯(lián)網(wǎng)，就是基于GO的BP分析，將參與相關(guān)生物學(xué)功能的基因連在一起。

好了，你們大概能看懂了吧？可能有人要問了：哇，夏老師，道理我都懂，但為什么這期是第六期？上次不還是（4）么？嗯，因?yàn)橹虚g有2期我忘了用這個標(biāo)題了，所以上次應(yīng)該是（5），這次就自然是（6）了。想要看上面這篇文獻(xiàn)的話，就回復(fù)“公克”（不要在評論區(qū)回復(fù)）到我星球上去看吧。好了，今天就策到這里吧，祝你們心明眼亮。