資訊編號(hào):ZX2016001006 題目: 最常見急性淋巴細(xì)胞白血病亞型的遺傳特征 研究人員: 圣猶達(dá)兒童研究醫(yī)院 華盛頓大學(xué)兒科癌癥基因組項(xiàng)目和兒童腫瘤國際研究小組 發(fā)表時(shí)間: 2016.10.24 論文題目: 《Deregulation of DUX4 and ERG in acute lymphoblastic leukemia》 期刊名稱: 《Nature Genetics》 癌癥類型: B前體急性淋巴細(xì)胞白血?。˙-ALL) 癌癥簡介: 1、白血病是最常見的兒童癌癥類型。 2、急性淋巴細(xì)胞白血?。ˋLL)占兒童癌癥約30%,B-ALL是ALL最常見類型,約占80%。 研究進(jìn)展: 1、目前缺乏許多B-ALL病例的遺傳基礎(chǔ)的信息。 2、目前有發(fā)現(xiàn)來自一些患者的血液樣品中的獨(dú)特基因模式,想確定該信號(hào)背后的潛在分子事件。 研究手段: 微陣列和轉(zhuǎn)錄組測序 研究樣品: 1913名B-ALL患者(包括兒童,青少年,年輕成人) 分析要點(diǎn): 1、通過對(duì)1913名B-ALL患者進(jìn)行微陣列和轉(zhuǎn)錄組測序分析,鑒定出7.6%的患者具有描述的獨(dú)特遺傳譜。 2、ChIP測序分析蛋白質(zhì)如何與DNA互作,揭示兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子間的關(guān)系。 分析結(jié)果: 1、在對(duì)1913名B-ALL患者進(jìn)行微陣列和轉(zhuǎn)錄組測序分析時(shí),發(fā)現(xiàn)7.6%的患者具有描述的獨(dú)特遺傳譜,并揭示了在B-ALL中有一系列的分子事件涉及兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的相互作用。 2、ChIP測序發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子基因DUX4的重排發(fā)生在所有B-ALL病例中,導(dǎo)致DUX4的高水平表達(dá)。DUX4結(jié)合到轉(zhuǎn)錄因子ERG的基因上,導(dǎo)致ERG的表達(dá)下調(diào)。ERG表達(dá)的下調(diào)通過缺失部分基因或通過另一種形式的ERG(ERGalt)的表達(dá)來損害ERG的功能,從而導(dǎo)致ERG轉(zhuǎn)錄因子的活性喪失,導(dǎo)致白血病。 3、DUX4的基因重排存在于所有具有不同基因表達(dá)譜的患者中,且DUX4的基因重排是在白血病發(fā)生的早期獲得的克隆事件。 研究意義: 希望該研究的兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子間的關(guān)系的確定可以導(dǎo)致新的診斷檢測的產(chǎn)生。 |
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