又到一年開學季,高校各大實驗室又涌進來一波波的小哥哥,小姐姐。對于初來乍到的小鮮肉來說,除了練好插槍頭的基本功外,其次就是跑好westernblot了。平時在實驗室中,經(jīng)常會聽到一些小師弟小師妹在抱怨:“為什么好看的westernblot條帶都是別人家的,而我的條帶跑得跟shi一樣”?今天小編就帶大家一起來探討跑好wb的幾條秘籍。 1. 選擇好的抗體 眾所周知,wb的基本原理就是利用抗體與抗原的特異性結合,來檢測特定蛋白的表達。所以,首先要選好的抗體。選抗體盡可能找一些靠譜的大品牌公司的抗體(如abcam,CST,Sigma)。 下面我們介紹一個網(wǎng)站——Citeab來說明下抗體的選擇。 網(wǎng)址:https://www./ 打開以后我們可以輸入要檢索的基因名字,比如foxo3a: 我們可以在左側選擇一抗/二抗、單抗/多抗、物種、應用技術、修飾、廠家等,比如我們選擇WB: 在文章右側就會出現(xiàn)對應的信息:在每個產品右側會有citations的數(shù)量,比如第二個: 我們可以直接單擊View PDF查看使用這個抗體發(fā)表的文章: 2. 制備合格的樣品 制備合格的的樣品,是成功的一半。裂解液的選擇也是關鍵(裂解液的選擇參考下表)。如果要提取做IP,coIP的蛋白樣品的話,則需要選取不含SDS的裂解液。在抽提蛋白時,要在裂解液中添加蛋白酶抑制劑,如果檢測的磷酸化蛋白,則要在裂解液中添加磷酸化酶抑制劑,并且要在冰上操作,避免蛋白降解。為了充分裂解樣品,也可以選用超聲處理細胞或組織樣品,超聲能充分破碎細胞膜和剪切DNA。但如果提取用于做IP的樣品,則不建議用超聲處理樣品。 3.膠要均勻,且濃度合適 選擇合適的膠濃度并膠要配均勻(PAGE膠濃度的分離范圍如下表)。膠如果配得不均勻的話,跑出來的條帶可能不齊或出現(xiàn)“微笑”“哭臉”狀條帶。要讓條帶跑得漂亮些的話,可以提前配好膠塊,用水打濕紙巾將膠板包起來放四度冰箱過夜,第二天再跑膠。 4.選擇合適的電泳電壓 電泳的電壓要合適,電壓過高容易導致電泳液和膠發(fā)熱。一般選擇60-80V跑濃縮膠,而選用100-120V跑分離膠。 5.選擇合適的膜 現(xiàn)在常用的膜有PVDF膜或NC膜。PVDF膜分辨率高,背景低,具有溶劑耐受性,機械強度高,適合于SDS存在下與蛋白的結合。可用于常規(guī)染色,考馬斯亮藍染色,ECL和免疫檢測,使用前需用100%甲醇浸泡30秒。NC膜同樣具有高靈敏度和低背景的特點,但干的NC膜較脆,無溶劑耐受性,使用前用緩沖液濕潤即可。常規(guī)染色,可用于放射性和非放射性檢測??讖?.45um的NC膜適用于一般蛋白,蛋白分子量小于20KD則選擇0.2um的NC膜。 6. 轉膜時間要恰當 轉膜時間的長短直接影響到轉膜效果。濕轉的話,要根據(jù)目標蛋白分子量的大小選擇合適的轉膜時間(參考下表)。若使用Bio-Rad Trans-BlotTurbo System半干轉的話,則選擇2.5A 轉7-15分鐘。如果單獨半干轉一塊膠的話,則選用1.5A 轉7-15分鐘。轉膜時注意趕走氣泡。 7.選擇合適的封閉液 化學發(fā)光法:用含5%脫脂牛奶的TBST;熒光法用5%脫脂牛奶的TBS;在搖床上室溫封閉1小時。 8. 選擇合適的抗體孵育濃度 抗體的孵育濃度直接關系到檢測結果。過高容易出現(xiàn)雜帶。相反,過低則有可能導致檢測到的條帶不清晰??贵w具體的稀釋濃度參照抗體說明書。一抗一般推薦四度搖床孵育過夜,二抗一般室溫孵育1-2小時。 9.洗膜 洗膜一般用TBST洗3次,每次5-10分鐘。 10.檢測條帶 第十:檢測。通常有2種方法來檢測條帶:一種是化學發(fā)光,化學發(fā)光法是最廣泛的檢測方法,若二抗上標記的過氧化物酶或辣根過氧化物酶,可以用ECL底物發(fā)生氧化還原反應。采用化學發(fā)光法檢測時,化學發(fā)光液A液和B液要現(xiàn)配現(xiàn)用,注意避光。另外一種是熒光法,通過采用合適的熒光標記抗體,結合oddessy儀器,實現(xiàn)多重wb分析。無須加發(fā)光液即可檢測到條帶。 以上這些就是做好wb的一些小tips,小伙伴們,你們get到了么? |
|
來自: 關節(jié)達人 > 《骨科專業(yè)知識》