圖1: 理想情況下PCR產(chǎn)物與循環(huán)數(shù)關(guān)系 圖2 理論情況下PCR產(chǎn)物量與循環(huán)數(shù)關(guān)系。 圖3 實(shí)際情況下PCR產(chǎn)物數(shù)與循環(huán)數(shù)的關(guān)系 剛開始的時(shí)候酶,緩沖液,能量,dNTP等都是充足的,PCR按照理論情況下的擴(kuò)增(A: 指數(shù)期),限速因子為底物的量; 隨著時(shí)間的增加,產(chǎn)物越來(lái)越多,每次循環(huán)所需要的酶也就越來(lái)越多,當(dāng)達(dá)到B(線性期)階段的時(shí)候,所有的酶都參與了擴(kuò)增,因此每個(gè)循環(huán)之后產(chǎn)物增加量是恒定的,和酶的數(shù)量相關(guān),此時(shí)限制產(chǎn)物增加的因素是酶; 當(dāng)達(dá)到C(衰退期)階段時(shí)候,酶逐漸失活,dNTP消耗殆盡,產(chǎn)物增加量逐漸減少; 直至到D階段,沒有任何產(chǎn)物生成,數(shù)目保持恒定。 我們可以將每條PCR產(chǎn)物帶上一個(gè)熒光標(biāo)記(具體怎么回事下節(jié)講解),這樣的話有多少個(gè)PCR產(chǎn)物就有多少單位的熒光,因此: 熒光 正比于 DNA產(chǎn)物數(shù)目 某種關(guān)系于 DNA初始量 因此我們通過機(jī)器收集熒光的量就能知道DNA初始量了,那么機(jī)器如何收集熒光呢? 圖4 固定循環(huán)數(shù)測(cè)定熒光強(qiáng)度值 圖5 固定熒光強(qiáng)度測(cè)試循環(huán)數(shù) 只要我們把R0設(shè)置合適,R0這條水平線就能切割到所有的處于對(duì)數(shù)期的曲線,我們qPCR采用的就是這種模式,下面我們來(lái)看下為什么這種模式能夠反映出DNA初始量(以下推導(dǎo)中l(wèi)g代表以2為底的對(duì)數(shù))。 一大波推導(dǎo)公式來(lái)襲~可直接看最后公式 如果你有一個(gè)實(shí)驗(yàn)組和一個(gè)對(duì)照組,那么實(shí)驗(yàn)組比對(duì)照組的比值就是2^-△△Ct,意思就是說實(shí)驗(yàn)組的mRNA水平是對(duì)照組的多少倍(Fold change)。 那么為什么不能用圖4(固定循環(huán)數(shù),測(cè)最終熒光強(qiáng)度值)的方式來(lái)衡量初始濃度呢?那是因?yàn)楣潭ㄑh(huán)數(shù)的情況下,有很多樣品不處于對(duì)數(shù)期,熒光的量與初始濃度沒有特定的關(guān)系,無(wú)法計(jì)算初始濃度。 好了,不知道你是否已經(jīng)明白其中的原理,我們下一節(jié)將介紹qPCR儀器運(yùn)行的原理,讓你真正理解qPCR~ “這哪是最清晰的QPCR講解???” “客官請(qǐng)息怒,科研狗會(huì)努力做好,希望提出寶貴意見!汪汪汪” |
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來(lái)自: ypgao > 《核酸技術(shù)》