各位老師好,我是范珊珊。今天很榮幸和各位老師一起探討一下與Rett Syndrome相關(guān)的一些遺傳學知識。 Rett綜合征最初是由奧地利的Andres Rett博士于1966首次報道,當時發(fā)現(xiàn)有22名兒童,均是女孩,表現(xiàn)出部分獲得性技能喪失,比如手部技能障礙和交流障礙,這種嚴重的神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育異常性疾病,就以首次發(fā)現(xiàn)者的醫(yī)生名字命名,稱為Rett 綜合征(RS,RTT)。20年后,隨一份來自瑞典、葡萄牙和法國的35名受影響女孩的報道后廣為人知。 Rett綜合征,主要累及女性,被認為是繼Down綜合征之后,影響女性智力發(fā)育的第二大重要原因。發(fā)病率為 1/10000~1/15000。 女性RTT患者通常有正常的出生史和發(fā)育史。 女性患者的RTT病情進展通常會表現(xiàn)4個階段: ?階段I,早期起病期,一般出生后6~18個月起病。這一階段的發(fā)育遲緩可能由于癥狀較模糊而被家長所忽視。但回顧性數(shù)據(jù)分析表明,這些兒童中的大多數(shù)在嬰兒早期有細微的行為差異。他們被描述為非常平靜,呼吸、哭聲微弱這一階段通常持續(xù)幾個月,但有些可持續(xù)一年以上。 ?階段II,病情迅速進展期,通常在1歲~4歲之間。可表現(xiàn)為語言功能降低或者喪失,手的技能降低,且部分患兒存在單一模式手的刻板動作;坐和走的功能受限,自閉癥的行為,呼吸不規(guī)律,頭部發(fā)育落后等。 階段III,病情穩(wěn)定期,通常在2歲~10歲之間,表現(xiàn)為運動障礙,癲癇發(fā)作;行為有所改善(煩躁,哭緩解),警覺性,注意力,和溝通技巧有所改善。一些嚴重的女性患者可能會在該階段病逝。 階段IV期,或晚期運動惡化階段,行動不便、肌肉無力、強直、痙攣,肌張力障礙??偟膩碚f,在該階段不會觀察到認知、溝通、或手部技能下降表現(xiàn),但會常見進食障礙和體重增加困難。 RTT患兒有許多臨床表型,且與其他綜合征有重疊的表型,給臨床診斷帶來了困難。診斷RTT主要依靠臨床表現(xiàn)。2001 年的診斷標準中: 含有 8 條必需標準、5 條排除標準和 8 條支持標準,以上標準都沒有準確描述必要條件之一———生后頭圍增長減速。因為不是每個典型的RTT患兒都有生后頭圍增長減速,但為了不漏診,2010 年的國際RTT臨床研究協(xié)會提出新的修訂版診斷標準,診斷標準將生后頭圍增長減速放置于所有診斷指標之前,強調(diào)有此表現(xiàn)就應該疑診RTT。2010 年的診斷標準中對支持標準不作要求,對診斷典型的RTT更簡單、確切。 在RTT患者當中,有一個超級罪犯基因MECP2,在已診斷明確的的典型RTT女性患者當中,攜帶有MECP2基因點突變/小片段插入缺失突變的患者比例為80%左右,8%是由于該基因的部分或整個基因缺失,剩余部分可能是由于其他變異,比如CDKL5或FOXG1導致。 非典型RTT患者該比例攜帶有MECP2基因點突變/小片段插入缺失突變的患者比例為40%左右,3%是由于該基因的部分或整個基因缺失導致。 常見的突變類型包括:錯義突變、無義突變、移碼突變、插入/缺失、以及部分或整個基因的缺失。 MECP2基因編碼X連鎖的甲基化CpG結(jié)合蛋白-2,是一種高豐度的染色質(zhì)結(jié)合蛋白。MECP2不僅可以通過調(diào)節(jié)DNA甲基化途徑影響甲基化過程,還可以作為轉(zhuǎn)錄抑制因子調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄,從而維持修飾神經(jīng)元成熟。因此,如果MECP2基因產(chǎn)生突變導致其編碼的蛋白功能異常,可能對神經(jīng)系統(tǒng)的生長和發(fā)育造成損害。 該蛋白共有486個氨基酸,包含2個主要功能區(qū):MBD和TRD。 MBD區(qū)域,含有85個氨基酸,為蛋白質(zhì)染色質(zhì)定位所需 ,該突變可能改變蛋白的二級結(jié)構(gòu),導致MECP2蛋白與5-甲基胞嘧啶的結(jié)合能力下降。 TRD功能區(qū),由104個氨基酸組成,它與組蛋白脫乙?;负娃D(zhuǎn)錄因子SIN3A相互作發(fā)揮轉(zhuǎn)錄抑制作用。 MECP2中已知的致病變異約有80-85%的變異位于MBD、TRD和C端末區(qū)。 RettBASE是由澳大利亞的Westmead兒童醫(yī)院建立,網(wǎng)站中記錄了所有的和RTT疾病相關(guān)的所有基因的突變信息。 據(jù)該網(wǎng)站記錄,目前已知的與RTT疾病相關(guān)的MECP2基因變異共有896項。 為了探討中國RTT患者與MECP2這個基因的關(guān)系,2007年,國內(nèi)的一篇報道對121名RTT患者進行了MECP2基因的測序分析,整體的實驗策略是先對121名患者的MECP2基因的2-4號外顯子區(qū)進行測序,如果沒有發(fā)現(xiàn)致病突變,則對1號外顯子進行測序分析。若仍為陰性結(jié)果,則使用MLPA的方法檢測MECP2基因的大片段缺失。 分析結(jié)果顯示: 在121名RTT患者當中,MECP2基因的總體檢出率是84.3%,其中典型RTT的MECP2的檢出率是87.9%,非典型RTT的檢出率是57.1%。 在檢出的突變位點當中,T158M突變型最為常見,所占比例是15.7%,隨后是R168X (11.8%)。 突變類型當中,錯義突變(43.1%)、無義突變(26.5%)、移碼突變(17.6%)。 1號外顯子中檢出突變所占比例稀少,僅有0.9%。 大片段缺失檢出率是10.5%,所有的缺失突變均出現(xiàn)在exon3、exon4或2者都有,表型嚴重程度和缺失的片段大小無相關(guān)性。 不知道大家有沒有注意到一個問題,RTT患者為何累及的多為女性? 這還是要從RTT患者當中的超級罪犯基因MECP2說起: MECP2基因位于X染色體Xq28區(qū)域,其對應的遺傳方式是屬于X連鎖顯性遺傳(XLD)。 以前我們介紹過染色體的概念,每個人是由23對染色體組成,其中決定男女性別的主要是第23對性染色體,女性是XX,男性是XY。單基因遺傳病的遺傳方式,按照致病基因是位于常染色體還是性染色體,可以分成2大類:常染色體遺傳疾病,和性染色體連鎖遺傳病。 其中性連鎖遺傳病就是由于性染色體上的基因所決定的性狀,在群體分布上存在明顯的性別差異。 如果決定一種遺傳病的致病基因位于X染色體上,并隨X染色體在上下代之間傳遞,我們就稱之為X連鎖遺傳病。 X連鎖顯性遺傳病的定義的就是等位基因之一突變,雜合狀態(tài)下即可發(fā)病。 X連鎖顯性遺傳病的女性雜合子患者和正常男性婚配,類似于常染色體顯性遺傳,其將致病基因遺傳給兒子和女兒的概率均是50%。 男性只有一條X染色體,其X染色體的等位基因不是成對存在的,在Y染色體上缺少相對應的等位基因,稱為半合子,其X染色體上的基因都可表現(xiàn)出相應的癥狀或疾病。X連鎖顯性遺傳病中的男性患者,其致病基因一定會傳給女兒,而不會傳給兒子,故女兒都將是患者,兒子全部正常。 那么對于RTT疾病來說,為何報道的多為女性患者呢? 原因一是對于X連鎖顯性遺傳病來說,女性有2條X染色體,其中任何一條X染色體上存在等位基因,就會發(fā)病,而男性只有一條X染色體,所以在生育率正常的情況下,家系中女性患者的數(shù)目要比男性患者多約一倍。 原因二是男性RTT患者,表型嚴重,多于出生后即出現(xiàn)嚴重的新生兒腦病,并于短期內(nèi)死亡。那么為何X連鎖顯性遺傳疾病中男性患者的病情會比女性嚴重呢?主要包括以下3點原因: 由于群體中致病基因頻率很低,女性純合子的概率很小,臨床多見的女性一般都是患病雜合子; 女性雜合子患者由于還存在一個正常的等位基因,在不完全顯性的情況下,病情比男性輕,且差異較大; 女性患者由于X染色體的隨機失活,當帶有致病基因的X染色體失活時病情較輕,且常有變化。 在罕見的幸存的男性,最常見的臨床表現(xiàn)是嚴重的新生兒發(fā)病腦病與畸形,異常音、不自主運動、嚴重的癲癇發(fā)作,呼吸異常。 嚴重的新生兒腦病表型在女性RTT患者中很少見。 但是也有特例, Clayton-Smith等的一篇報道顯示,男性RTT患者中,由于存在體細胞嵌合現(xiàn)象,導致即使攜帶了MECP2基因突變,也并沒有引起嚴重的疾病表型。 體細胞嵌合現(xiàn)象也可以解釋一些其他的X染色體顯性遺傳疾病出現(xiàn)在男性患者當中,但是沒有引起致死的現(xiàn)象。 典型女性RTT或非典型RTT患者,即使均攜帶MECP2的雜合突變,其臨床表型嚴重程度也各不相同,有些患者表型很輕,甚至不會出現(xiàn),而有些則相當嚴重。 原因就是女性中存在的X染色體隨機失活現(xiàn)象。 女性的兩條X染色體在胚胎發(fā)育早期就有一條隨機失活,稱為X染色體失活或Lyon化; 對于女性為雜合子突變的X連鎖顯性遺傳病來說,女性體內(nèi)部分體細胞中帶有致病基因突變的X染色體失活,另一部分未攜帶致病基因突變的X染色體失活。而男性患者中不存在這種機制,若為半合子突變,在不考慮體細胞嵌合的情況下,全身體細胞均是突變型,因此病情會很重。所以在X連鎖顯性遺傳病中,女性雜合子患者的病癥往往比男性患者的較輕。 但是由于X染色體失活是隨機發(fā)生的,不同的女性RTT患者中X染色體失活的比例不同,所以在臨床疾病表現(xiàn)程度上,會有輕重的區(qū)別。 那么對于檢出MECP2基因突變的RTT患者,我們應如何進行遺傳咨詢呢? 對于女性患者雙親來說: RTT臨床99%為散發(fā)病例,1%有明確家系,散發(fā)病例絕大部分為新生MECP2基因突變,也可能遺傳具有致病突變的生殖細胞嵌合體父親或母親,或遺傳自由于X染色體隨機失活而無或僅有輕度表現(xiàn)的攜帶者母親,由于嵌合體父或母親及攜帶者母親無或僅有輕度臨床表現(xiàn),致使部分病例為臨床散發(fā)。 如果已知女性由于X染色體隨機失活而無或僅有輕度表現(xiàn)的攜帶者母親,其后代攜帶MECP2致病突變的概率是50%。 男性患者的雙親:男性患者的父親不會是攜帶者,母親可能是由于X染色體隨機失活而無或僅有輕度表現(xiàn)的攜帶者。 所以對于先證者基因型明確的家庭來說,其父母雙親最好進行一下分子遺傳學的檢測。 若先證者的雙親擬再生育,其生育健康小孩的概率也必須建立在先證者致病基因突變已明確,父母對應的基因位點也明確的基礎(chǔ)上進行。 若檢出先證者母親是攜帶者,攜帶相同的MECP2基因突變,那么其將致病基因遺傳給后代的概率是50%。 若雙親中均未攜帶相同的MECP2基因突變,那么可能出現(xiàn)以下2種情況: 一是先證者為denovo突變,那么雙親再生育患病后代概率將會非常低; 二是雙親中存在生殖細胞嵌合現(xiàn)象。 所以對于這種情況下,應該也是臨床中遇見的比較多的情況,對于RTT患者的雙親來說,如果擬再生育,最好還是做一下產(chǎn)前檢測。 2005年的一篇報道,顯示已生育一攜帶MECP2突變的患病女兒,但雙親未攜帶的情況下,其再生育出與先證者女孩攜有相同突變型的比例是1/9。 那么如果RTT患者想孕育后代,其生健康寶寶的概率又是如何呢? 只要是攜帶MECP2相關(guān)變異的RTT患者,將致病基因遺傳給后代的概率均是50%,即使典型RTT患者不能再生育。 生育的攜帶者女孩,即使考慮到X染色體失活現(xiàn)象,患RTT疾病的概率仍是高風險。 生育的攜帶者男孩,很可能就會出現(xiàn)嚴重的新生兒腦病,即使存活1年,也會患有嚴重的智力障礙。 MECP2基因突變關(guān)聯(lián)疾病除RTT之外還包括:X連鎖隱性遺傳的新生兒腦病、X連鎖精神發(fā)育遲滯,以及遺傳模式較為復雜的自閉癥相關(guān)。 與MECP2相關(guān)的X連鎖精神發(fā)育遲滯,女性患者的臨床表型可能表現(xiàn)從輕度到重度智力殘疾與躁狂抑郁精神病。受影響的男性通常有嚴重的智力障礙。 RTT患者,尤其是患者的臨床表型中不存在小頭畸形,抽搐或脊柱側(cè)后凸畸形的患者,臨床上可能被診斷為自閉癥,但是MECP2基因并不能算是引起自閉癥的主要基因。 如果男性患兒中出現(xiàn)了嚴重的新生兒腦病,或是重癥肌無力,或存在X連鎖智力障礙的家族史,則應該考慮MECP2基因突變相關(guān)的疾病。 女性典型RTT患者當中,如果未檢測到MECP2基因突變,在出生后6個月內(nèi)出現(xiàn)癲癇發(fā)作,則可能攜帶有CDKL5基因突變。CDKL5最初是在伴有早期癲癇發(fā)作癥狀的RTT患者當中發(fā)現(xiàn),在RTT-like患者當中,所占比例不是很高?,F(xiàn)在普遍認為,CDKL5基因突變多與伴有早期癲癇發(fā)作和認知障礙的女性患者,以及早發(fā)難治性癲癇伴有嚴重智力障礙的男性患者中相關(guān)。 現(xiàn)已報道的與RTT疾病相關(guān)的CDKL5基因變異,據(jù)Rettbase數(shù)據(jù)庫記載,也已有255項。 FOXG1,14q12,主要是在在發(fā)育遲緩出現(xiàn)之前會有短期的正常時期,隨后出現(xiàn)嚴重的智力障礙,發(fā)育遲緩,出生后畸形,癲癇發(fā)作,運動障礙和肌張力低下等癥狀。這個基因呢是位于常染色體中,屬于常染色體顯性遺傳,其對應的遺傳模式和MECP2基因不同,男性,女性患者均會出現(xiàn)。所以對于存在這種基因突變的RTT患者,其對應的RTT表型在男性、女性中的分布以及遺傳咨詢均和以上所說的不同。這也體現(xiàn)了單基因遺傳病的復雜情況。 現(xiàn)在已知的與RTT疾病關(guān)聯(lián)的基因共有3個,分別是MECP2、CDKL5和FOXG1,但是臨床中仍然有一部分RTT患者沒有在這3個基因中發(fā)現(xiàn)致病突變,那么會不會存在新的RTT致病基因,我們還沒有發(fā)現(xiàn)的可能呢?最新的一篇報道給了我們新的提示: 這是2016年發(fā)表在Hum Genet(5.138)雜志上的一篇文章,這篇文章對未檢測到已知MECP2, CDKL5 、FOXG1致病基因突變,但臨床表型存在刻板的手部動作,頭小畸形,和12個月的年齡后發(fā)病的22個臨床中懷疑是RTT疾病的家系進行了全外顯子組測序。 共在14個家系中發(fā)現(xiàn)了致病基因突變,其中5個家系患者攜帶已知神經(jīng)系統(tǒng)關(guān)聯(lián)的致病基因,包括與早期嬰兒癲癇腦病相關(guān)的HCN1基因,Dravet綜合征相關(guān)的SCN1A基因等; 其他17個攜帶有以前未證明和神經(jīng)系統(tǒng)疾病關(guān)聯(lián)的致病基因突變,例如錨蛋白(Ankyrin)(一類富含錨蛋白重復序列功能域的蛋白);CHRNA5(神經(jīng)元的乙酰膽堿受體α5亞單位)。 為了證明這些非神經(jīng)系統(tǒng)關(guān)聯(lián)疾病基因,表型和基因型的相關(guān)性,從這些基因中挑選了6個存在缺失突變的基因在線蟲中進行了功能驗證,由于RTT疾病多伴有運動障礙,實驗中觀察了線蟲的運動和神經(jīng)系統(tǒng)表型,結(jié)果發(fā)現(xiàn),這些基因多可以引起線蟲的運動功能缺陷。 所以WES仍是分析這些比較特殊病例的一個強有力的分析工具,而新的疾病關(guān)聯(lián)基因的發(fā)現(xiàn)和證實,確實也是需要一個嚴謹而漫長的過程。 總之,對于RTT疾病來說,MECP2基因仍是我們?nèi)孕柚攸c關(guān)注的超級罪犯基因,在對于RTT患者選用的檢測方式中,如果從患者的經(jīng)濟利益考慮,我們最優(yōu)推薦,針對MECP2基因進行2,3,4的外顯子測序檢測點突變和小插入缺失,再加上使用MLPA的檢測方式進行大片段的檢測。 但是這種情況下,若存在CDKL5 、FOXG1基因突變的RTT患者,就會漏檢。 所以如果患者的經(jīng)濟條件允許,又比較著急的情況下,我們還是會推薦全外顯子組測序+MLPA的組合檢測方式,這樣,RTT患者在分子診斷層面漏檢的幾率將會非常低。而且現(xiàn)在全外的測序成本越來越低,若臨床中懷疑該疾病,但是沒有確診,患者的經(jīng)濟條件又允許的情況下,WES+MLPA將會是一個性價比最優(yōu)的組合。 以上就是RTT疾病中的遺傳學特征,及相應的遺傳咨詢和檢測方式選擇。感謝各位老師在百忙之中抽出時間收聽我們這次課程。下面我們進入提問環(huán)節(jié),各位老師有任何相關(guān)問題,都歡迎您在群內(nèi)提出,我們共同進行交流。 現(xiàn)場提問 1.如果針對MECP2基因進行一代測序+MLPA,這種方式的檢出率大概是多少?
答:針對MECP2基因進行2,3,4的外顯子測序檢測點突變和小插入缺失,再加上使用MLPA的檢測方式進行大片段的檢測。那么根據(jù)已有的統(tǒng)計顯示,該種檢測方式的檢出率約是:(~)80%+(~)10%。 2.現(xiàn)在RTT疾病中基因型和表型之間有對應關(guān)系嗎? 答:目前已有的研究其實有挺多,但是一直沒有一個相符的結(jié)果。有報道說,即使攜帶相同的基因突變,可能由于X染色體失活的機制,在表型上也是會有很大的差別。但是又有報道說,攜帶錯義突變的患者表型會比無義突變的患者表型輕。 3.使用全外顯發(fā)現(xiàn)新基因的那篇文章中,在RS疾病中發(fā)現(xiàn)的與神經(jīng)系統(tǒng)不相關(guān)的那些基因都是和什么疾病相關(guān)的? 答:BTBD9—不安腿綜合征,ATP8B1--家族性肝內(nèi)膽汁淤積癥。其他的好多基因,在OMIM數(shù)據(jù)庫中還沒有與已知疾病的報道,但是好多基因都與神經(jīng)元生物學和功能相關(guān),如神經(jīng)元的乙酰膽堿受體亞單位CHRNA5,神經(jīng)元電壓門控性鈣通道CACNA1等。
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