合作社的資金包括自有資金和借入資金。自有資金是通過成員出資、提取公積金、國家財(cái)政直接補(bǔ)助、他人捐贈等途徑獲得的，合作社對其享有占有、使用和處分的權(quán)利，并以此作為參與盈余分配和承擔(dān)債務(wù)的依據(jù)，體現(xiàn)的是合作社與成員的產(chǎn)權(quán)關(guān)系。借入資金是通過向成員借款、向外單位或個人借款、向銀行貸款等途徑獲得的，合作社對其只有使用權(quán)，到期后要償還本金和支付利息，體現(xiàn)的是合作社與債權(quán)人的債權(quán)債務(wù)關(guān)系。正確區(qū)分和核算自有資金和借入資金，對合作社的生產(chǎn)經(jīng)營、資產(chǎn)處置、盈余分配等經(jīng)濟(jì)活動具有重要意義。
　　一、自有資金
　　1、成員出資。成員出資是成員按照合作社章程規(guī)定，自愿繳納的資金，是區(qū)別合作社成員與非成員的標(biāo)志，是成員參與合作社盈余分配的重要依據(jù)，也是承擔(dān)合作社經(jīng)營風(fēng)險(xiǎn)的主要依據(jù)。
　　成員入社投入貨幣資金和非貨幣資產(chǎn)時，按實(shí)際收到的金額和投資各方確認(rèn)的價(jià)值，借記“庫存現(xiàn)金”、“銀行存款”、“固定資產(chǎn)”、“產(chǎn)品物資”、“無形資產(chǎn)”等科目，按其合作社與成員確認(rèn)的股金額，貸記“股金”科目，實(shí)際出資與確認(rèn)的股金額之間的差額，貸記或借記“資本公積”科目。
　　【例1】合作社收到成員入社投入現(xiàn)金20萬元，存款10萬元，農(nóng)業(yè)機(jī)械5臺評估確認(rèn)價(jià)為3萬元，協(xié)議確認(rèn)股金額32萬元。會計(jì)分錄為：
　　借:庫存現(xiàn)金 200000
　　　 銀行存款 100000
固定資產(chǎn) 30000
貸：股金 320000
資本公積 10000
2、公積金。公積金是合作社按照章程規(guī)定或者成員大會決議從當(dāng)年盈余中提取的。公積金用于彌補(bǔ)虧損、擴(kuò)大生產(chǎn)經(jīng)營或者轉(zhuǎn)為成員出資。每年提取的公積金要按照章程規(guī)定量化為每個成員的份額。
合作社從當(dāng)年實(shí)現(xiàn)的可分配盈余中，按章程規(guī)定的比例提取公積金時，借“盈余分配—各項(xiàng)分配”科目，貸“盈余公積”科目。會計(jì)分錄為：
【例2】年終，合作社實(shí)現(xiàn)可分配盈余100000元，按章程規(guī)定提取10%的公積金。會計(jì)分錄為：
借：盈余分配—各項(xiàng)分配 10000
貸：盈余公積—各成員 10000
3、國家財(cái)政直接補(bǔ)助資金。國家財(cái)政直接補(bǔ)助資金是國家財(cái)政為支持和鼓勵合作社發(fā)展直接撥付的補(bǔ)助資金。形成財(cái)產(chǎn)的國家財(cái)政補(bǔ)助資金要平均量化為每個成員的份額，該份額僅作盈余分配依據(jù)，成員退社后不再享有。合作社在解散、破產(chǎn)清算時，這部分財(cái)產(chǎn)也不得作為可分配剩余資產(chǎn)分配給成員，處置辦法由國務(wù)院規(guī)定。
合作社收到國家財(cái)政直接補(bǔ)助資金時，借記“庫存現(xiàn)金”、“銀行存款”等科目，貸記“專項(xiàng)應(yīng)付款”科目。合作社按照國家財(cái)政補(bǔ)助資金的項(xiàng)目用途，取得固定資產(chǎn)、農(nóng)業(yè)資產(chǎn)、無形資產(chǎn)等時，按實(shí)際支出，借記“固定資產(chǎn)”、“牲畜（禽）資產(chǎn)”、“林木資產(chǎn)”、“無形資產(chǎn)”等科目，貸記“庫存現(xiàn)金”、“銀行存款”等科目，同時借記“專項(xiàng)應(yīng)付款”科目，貸記“專項(xiàng)基金”科目；用于開展信息、培訓(xùn)、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)與認(rèn)證、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)、市場營銷和技術(shù)推廣等項(xiàng)目支出時，借記“專項(xiàng)應(yīng)付款”科目，貸記“庫存現(xiàn)金”、“銀行存款”等科目。
【例3】合作社收到國家財(cái)政直接補(bǔ)助資金10萬元，其中：7萬元用來購買辦公場所,1萬元購買辦公桌椅，1萬元用于農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣，1萬元用于成員培訓(xùn)。會計(jì)分錄為：
①收到補(bǔ)助資金時：
借:銀行存款 100000
貸：專項(xiàng)應(yīng)付款 100000
②購買管理用固定資產(chǎn)時：
借：固定資產(chǎn)—辦公室 70000
—桌椅 10000
貸：銀行存款 80000
同時，轉(zhuǎn)入“專項(xiàng)基金” 科目
借：專項(xiàng)應(yīng)付款 80000
貸：專項(xiàng)基金 80000
③用于農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣和成員培訓(xùn)時：
借：專項(xiàng)應(yīng)付款 —技術(shù)推廣 10000
—成員培訓(xùn) 10000
貸：銀行存款 20000
4、他人捐贈資金。他人捐贈資金是合作社收到他人捐贈的貨幣資金和非貨幣資產(chǎn)的總稱。形成財(cái)產(chǎn)的他人捐贈資金也要平均量化到每個成員，作為盈余分配依據(jù)，成員退社后不再享有。
合作社實(shí)際收到他人捐贈的貨幣資金和非貨幣資產(chǎn)時，借記“庫存現(xiàn)金”、“銀行存款”、“固定資產(chǎn)”、“產(chǎn)品物資”等科目，貸記“專項(xiàng)基金”科目。
【例4】合作社收到某公司捐贈的拖拉機(jī)一臺，所附發(fā)票售價(jià)為1.7萬元，相關(guān)稅費(fèi)及運(yùn)輸費(fèi)共計(jì)0.3萬元。會計(jì)分錄為：
借：固定資產(chǎn)—拖拉機(jī) 20000
貸：專項(xiàng)基金 20000
二、借入資金
1、借款。借款是指合作社從銀行等金融機(jī)構(gòu)以及外部單位和個人借入的各項(xiàng)款項(xiàng)。包括短期借款和長期借款，借款期限在一年以下（含一年）為短期借款，借款期限在一年以上的為長期借款。
合作社借款從銀行、信用社或其他金融機(jī)構(gòu)，以及外部單位和個人借入款時，借記“庫存現(xiàn)金、銀行存款”科目，貸記“短期借款” 、“長期借款”科目。
【例5】合作社從農(nóng)村信用社貸款20000元，期限6個月，直接轉(zhuǎn)存合作社賬戶。會計(jì)分錄為：
借：銀行存款 20000
貸：短期借款 20000
【例6】合作社借甲公司30000元，期限為2年，所得支票存入農(nóng)村信用社。會計(jì)分錄為：
借：銀行存款—信用社 30000
貸：長期借款—甲公司 30000
2、成員往來。成員往來是指合作社與其成員的經(jīng)濟(jì)往來業(yè)務(wù)。成員往來雖然不屬于負(fù)債類科目，但《農(nóng)民專業(yè)合作社財(cái)務(wù)會計(jì)制度（試行）》規(guī)定，資產(chǎn)負(fù)債表中“應(yīng)付款項(xiàng)”項(xiàng)目應(yīng)根據(jù)“應(yīng)付款”和“成員往來”各明細(xì)賬戶年末貸方余額合計(jì)數(shù)填列，因此將成員往來貸方余額列為負(fù)債。
合作社與其成員發(fā)生應(yīng)付款項(xiàng)和收回應(yīng)收款項(xiàng)時，借記“庫存現(xiàn)金”、“銀行存款”、“產(chǎn)品物資”等科目，貸記“成員往來”科目；償還應(yīng)付款項(xiàng)和發(fā)生應(yīng)收款項(xiàng)時，借記“成員往來”科目，貸記“庫存現(xiàn)金”、“銀行存款”等科目。
【例7】合作社賒購甲成員水果10000元，10天后，償還其全部欠款。會計(jì)分錄為：
①賒購業(yè)務(wù)發(fā)生時：
借：產(chǎn)品物資 10000
貸：成員往來—甲成員 10000
②償還甲成員欠款時:
借：成員往來—甲成員 10000
貸：庫存現(xiàn)金 10000