陸龜?shù)难莼?，亞達(dá)加拉的區(qū)分

縱向發(fā)育的是同源起源的特征（異級(jí)特征），橫向發(fā)育的是平行起源的同級(jí)特征，是同級(jí)水平的平行關(guān)系。這就是基于分支形成導(dǎo)致的異和同級(jí)的特征的同源起源，平行起源，結(jié)果形成了同源起源的異級(jí)的 2 對(duì)姐妹群（縱向關(guān)系）和同源起源的同級(jí)的一對(duì)姐妹群（平行關(guān)系）。即同源起源的特征可以產(chǎn)生異級(jí)的和同級(jí)的平行關(guān)系，或同源起源的特征既可以派生出異級(jí)的一對(duì)真正祖-裔關(guān)系的姐妹群，又可派生出同級(jí)的一對(duì)偽祖-裔關(guān)系的姐妹群。

縱向發(fā)育的是同源起源的特征（異級(jí)特征），橫向發(fā)育的是平行起源的同級(jí)特征，是同級(jí)水平的平行關(guān)系。這就是基于分支形成導(dǎo)致的異和同級(jí)的特征的同源起源，平行起源，結(jié)果形成了同源起源的異級(jí)的 2 對(duì)姐妹群（縱向關(guān)系）和同源起源的同級(jí)的一對(duì)姐妹群（平行關(guān)系）。即同源起源的特征可以產(chǎn)生異級(jí)的和同級(jí)的平行關(guān)系，或同源起源的特征既可以派生出異級(jí)的一對(duì)真正祖-裔關(guān)系的姐妹群，又可派生出同級(jí)的一對(duì)偽祖-裔關(guān)系的姐妹群。

三個(gè)分類單元中，如果其中兩個(gè)分類單元共有的獨(dú)比三個(gè)分類單元共有的性狀普遍性更低，這兩個(gè)分類單元的相互關(guān)系則近于與第三分類單元轉(zhuǎn)換成進(jìn)化語(yǔ)言，關(guān)系意味著兩個(gè)分類單元具有一個(gè)不為第三分類單元所共有的祖先。近裔共性（ synapomorphy )據(jù)以識(shí)別類群（自然類群）的性狀（同源）。女分類單元均位于終端，節(jié)點(diǎn)（分支點(diǎn)）即代表假設(shè)祖先，確定節(jié)點(diǎn)的近裔共性則被視為新的物（即先前存在的性狀所發(fā)生的遺傳性變化）。

單系亞群：例如, C. agastus-subgroup, C. albulus subgroup, C. decipiens subgroup 等。示C. decipiens group單系群（右）和C. agastus subgroup, C. albulus subgroup, C. decipiens subgroup等單系亞群（左）基節(jié)斑的鑲嵌進(jìn)化。B2（白卡爾小異長(zhǎng)足虻亞群C. baicalensis subgroup）：陽(yáng)莖鞘側(cè)面觀遠(yuǎn)側(cè)端部單純(□)，既無(wú)端緣呈形式多樣的端腹突(□)，也無(wú)膨大的端部(□)（陽(yáng)莖鞘向端部去漸次收縮呈錐形，緊密包裹陽(yáng)莖）(□)。

姐妹群的起源及演化。其中近祖的分支表示姐妹群的起源，是姐妹群來(lái)源的“指示劑”。第一種方式：在一個(gè)分支中，虛擬的母種和一對(duì)姐妹群共同構(gòu)成一個(gè)單系群，其共有衍征源于母種派生出的一對(duì)由兩個(gè)女兒種共享的祖-裔特征——同源同形或同源異形的異級(jí)特征。分裂產(chǎn)生的特征是每一個(gè)姐妹的共近裔特征，或假共近裔特征（偽姐妹群，趙1995），兩個(gè)姐妹的共近裔特征共同構(gòu)成一對(duì)共近祖特征，這一對(duì)共近祖特征存儲(chǔ)在虛擬的親本種中。

動(dòng)物分類學(xué)基本知識(shí)動(dòng)物分類學(xué)是一門歷史悠久的動(dòng)物學(xué)分支學(xué)科。種群概念被引入動(dòng)物分類學(xué)。根據(jù)不同的指導(dǎo)思想可以分成不同學(xué)派，影響較大的是傳統(tǒng)分類學(xué)、數(shù)值分類學(xué)、支序分類學(xué)和進(jìn)化分類學(xué)。傳統(tǒng)分類學(xué)（classical taxonomy）又稱林奈分類學(xué)，基于模式種的概念，根據(jù)形態(tài)、生理、生態(tài)等特征的異同進(jìn)行分類，在不同特征間存在加權(quán)（即對(duì)各種特征的分類學(xué)重要性不是平等看待，認(rèn)為某些特征重要而另一些不重要）。

然而，如果按照進(jìn)化分類學(xué)派的做法，依據(jù)相似性將生第14章進(jìn)化分類學(xué)派及其與支序分類學(xué)派的論戰(zhàn)。進(jìn)化分類學(xué)派希望在重建系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及分類系統(tǒng)中盡量包含更多的進(jìn)化內(nèi)容，而不僅僅是種化過(guò)程或分支過(guò)程，認(rèn)為如果僅憑這種狹義的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系還不能代表真正的進(jìn)化過(guò)程和實(shí)質(zhì)，還應(yīng)將分類單元形態(tài)特征上的改變以及不同分類單元之間的分歧程度和間隔距離考慮在內(nèi)，同時(shí)還應(yīng)考慮不同分類單元的進(jìn)化級(jí)和適應(yīng)區(qū)及更多生態(tài)生物學(xué)內(nèi)容。

生物進(jìn)化與分類原理2.圖13.3傳統(tǒng)分類系統(tǒng)的不穩(wěn)定性在更換一種生物的情況下，分類系統(tǒng)就可能由兩綱系統(tǒng)（ A ）變成三綱系統(tǒng)（ B )13.2分支過(guò)程的推導(dǎo)13.2.1共祖近度支序系統(tǒng)學(xué)認(rèn)為，最能或唯一反映系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的依據(jù)是分類單元之間的血緣關(guān)系( geneological relationship )，或者說(shuō)是進(jìn)化關(guān)系，反映不同分類單元之間確切血緣關(guān)系的本質(zhì)為它們與共同祖先的相對(duì)近度（ relative recency of common ancestor )。特征矩陣分類單元6.

姐妹群的起源與演化。縱向關(guān)系的姐妹群是異級(jí)關(guān)系，其表現(xiàn)形式為同源同形或同源異形的異級(jí)特征，她們是系統(tǒng)的縱向發(fā)育，系統(tǒng)之樹因此而得以長(zhǎng)高。又稱“偽姐妹群”（趙 1995）或“異級(jí)姐妹群”（魏and羅 2023）。即圖5中A1和A2因各自秉承來(lái)自母種A的a—a1和a—a2兩對(duì)共近裔特征而成為一對(duì)美女關(guān)系的姐妹群（偽姐妹群或異級(jí)姐妹群）。這樣經(jīng)分裂而來(lái)的特征是姐妹群的共近祖特征，或稱虛假的共近裔特征（構(gòu)成偽姐妹群）。

在大多數(shù)情況下，遺傳型相似性是從表現(xiàn)型相似性推論的，所以應(yīng)當(dāng)使用的與其說(shuō)是遺傳型相似性，不如說(shuō)是表現(xiàn)型相似性，這是可以討論的。所作的基本假設(shè)是：表現(xiàn)型相似性的程度，通常但不總是對(duì)應(yīng)于遺傳型相似性的程度，遺傳型相似性和表現(xiàn)型相似性可以不一致，情況有兩種，第一，趨同產(chǎn)生表現(xiàn)型相似性，但是不產(chǎn)生遺傳型相似性。遺傳型相似性是單一祖先基因庫(kù)的表達(dá)，組群成員間的遺傳型相似性越大，在遺傳型上與共同祖先種越類似。

祖先、后裔、姊妹類群與系統(tǒng)發(fā)育假設(shè)的檢驗(yàn)。示各種可能的系統(tǒng)發(fā)育假設(shè),分支圖式表達(dá)一定的分支關(guān)系。(5)應(yīng)根據(jù)證據(jù)的時(shí)序性質(zhì),同時(shí)利用“姐妹群”與“祖先-后裔”的概念,從而建立起一種系統(tǒng)發(fā)育的假設(shè)時(shí),要利用盡可能多的性狀梯度變異的已知的或推想的極向,利用共有的衍生性狀,和通過(guò)對(duì)生物學(xué)上各個(gè)不同種類的共同衍生性狀的系統(tǒng)發(fā)育聯(lián)系程度的權(quán)衡(特別參看Hecht和Edwards, 1976)。

——對(duì)生命科學(xué)的哲學(xué)思考｜文化縱橫。[7]合成生物學(xué)作為21世紀(jì)最新興的合成生物學(xué)是集合了生物學(xué)、化學(xué)、工程學(xué)、計(jì)算、生物信息等多學(xué)科的交叉科學(xué)，它采用工程化設(shè)計(jì)理念，對(duì)生物體進(jìn)行有目標(biāo)的設(shè)計(jì)改造乃至重新合成，因此，合成生物學(xué)的研究探索及其技術(shù)開發(fā)應(yīng)用正在突飛猛進(jìn)，不但將對(duì)人類面臨的環(huán)境、資源、健康、安全等嚴(yán)重問題提供革命性的解決方案，也對(duì)人類認(rèn)識(shí)和揭示生命本質(zhì)和探索生命活動(dòng)規(guī)律具有重要意義。