強(qiáng)烈推薦！21個(gè)超實(shí)用的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫，趕緊收藏

swordinhand 2024-09-03 發(fā)布于美國

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醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫包含著各身體組織的各種類型（CT、MRI和X射線等）影像數(shù)據(jù)，在臨床實(shí)踐和醫(yī)學(xué)研究中具有廣泛的應(yīng)用價(jià)值。在臨床上，醫(yī)生可以通過數(shù)據(jù)庫中的影像數(shù)據(jù)進(jìn)行??疾病診斷和治療方案的選擇，還有進(jìn)行教學(xué)培訓(xùn)。

在醫(yī)學(xué)研究中，通過??對(duì)大規(guī)模的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，可以發(fā)現(xiàn)潛在的疾病特征和模式，為疾病的早期診斷和治療提供支持。

那么現(xiàn)在，就讓小編給大家分享一些『常用的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫』吧???♀?！

01人腦連接組計(jì)劃

?網(wǎng)址：http://www./

人腦連接組計(jì)劃是由美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）于2009年出資啟動(dòng)的大規(guī)模收集和共享人腦詳盡數(shù)據(jù)的研究計(jì)劃，其核心目標(biāo)是采用多模態(tài)神經(jīng)影像技術(shù)在腦區(qū)水平上描繪人腦結(jié)構(gòu)和功能連接模式并探索個(gè)體間的差異。

該項(xiàng)目包括兩個(gè)階段，階段一（2010-2012）為調(diào)試階段，旨在探索最佳的數(shù)據(jù)收集及分析方法；階段二（2012-2015）采集1200名健康成人數(shù)據(jù)，并在采集過程中不斷更新公開數(shù)據(jù)集。該數(shù)據(jù)庫采集自2個(gè)中心，1200人，包括sMRI、r-fMRI、t-fMRI、dMRI、MEG模態(tài)，其他數(shù)據(jù)還包括人口統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)、神經(jīng)心理學(xué)數(shù)據(jù)、基因數(shù)據(jù)。

02自閉癥腦成像交換數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/abide/

ABIDE數(shù)據(jù)庫收集了1112 個(gè)數(shù)據(jù)，其中 539 個(gè)來自ASD個(gè)體，573 個(gè)來自典型對(duì)照組（年齡 7-64 歲）的靜息態(tài)功能磁共振成像（R-fMRI）、解剖學(xué)和表型數(shù)據(jù)。此匯總于 2012 年 8 月發(fā)布。它的建立證明了跨站點(diǎn)匯總靜息態(tài)fMRI和結(jié)構(gòu)MRI數(shù)據(jù)的可行性。

1000功能連接組計(jì)劃

?網(wǎng)址：

http://fcon_1000.projects.nitrc.org/fcpClassic/FcpTable.html

2009年12月，由功能磁共振成像社區(qū)的領(lǐng)導(dǎo)成員合作推出了1000人的功能連接組計(jì)劃。該項(xiàng)目通過對(duì)神經(jīng)影像數(shù)據(jù)的積極共享，為人類腦功能的研究開創(chuàng)了新的時(shí)代。項(xiàng)目對(duì)來自35個(gè)中心獨(dú)立收集的一千多人的磁共振影像數(shù)據(jù)集進(jìn)行了公開發(fā)布，致力于推進(jìn)靜息態(tài)功能磁共振技術(shù)的探索和完善，增強(qiáng)大家的共享協(xié)作意識(shí)。該數(shù)據(jù)庫采集自35個(gè)中心，1355名被試，包括sMRI、r-fMRI模態(tài)，其他數(shù)據(jù)還包括人口統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)。

04國際神經(jīng)影像信度與可重復(fù)性聯(lián)盟

?網(wǎng)址：

http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/CoRR/html/index.html

05英國生物銀行

?網(wǎng)址：https://www./

英國生物銀行的目的在于改善、預(yù)防和治療各種嚴(yán)重和危及生命的疾病。在過去十年間，該項(xiàng)目收集了50萬參與者的大量數(shù)據(jù)——包括他們的生活方式、體重、身高、認(rèn)知功能和基因等數(shù)據(jù)。

2016年，由醫(yī)學(xué)研究理事會(huì)、維康信托基金會(huì)和英國心臟基金會(huì)資助該項(xiàng)目的世界上最大的醫(yī)學(xué)影像研究正式啟動(dòng)，將對(duì)10萬參與者的大腦、心臟、骨骼、頸動(dòng)脈以及腹部脂肪的樣本進(jìn)行掃描成像。該數(shù)據(jù)庫采集自3個(gè)中心，5000名被試（目標(biāo)100,000人），包括sMRI、r-fMRI、t-fMRI、dMRI模態(tài)，其他數(shù)據(jù)還包括人口統(tǒng)計(jì)學(xué)數(shù)據(jù)、神經(jīng)心理學(xué)數(shù)據(jù)、基因數(shù)據(jù)、血液數(shù)據(jù)。

06神經(jīng)影像實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：https://ida.loni./login.jsp

神經(jīng)影像實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)庫（LONI）數(shù)據(jù)庫由美國加州大學(xué)馬克分校神經(jīng)成像實(shí)驗(yàn)室( LONI )和瑪麗史蒂文斯神經(jīng)成像與信息研究所運(yùn)營。該實(shí)驗(yàn)室于20世紀(jì)90年代末首先開始管理用于多中心研究的神經(jīng)影像學(xué)數(shù)據(jù)，以促進(jìn)數(shù)據(jù)的保存、探索和共享。LONI數(shù)據(jù)庫提供了用于去標(biāo)識(shí)化、整合、搜索、可視化和共享各種神經(jīng)科學(xué)數(shù)據(jù)。

07中國AD臨床前期聯(lián)盟多中心認(rèn)知下降縱向研究數(shù)據(jù)庫

中國AD臨床前期聯(lián)盟多中心認(rèn)知下降縱向研究數(shù)據(jù)庫（SILCODE數(shù)據(jù)庫）是國家老年疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心（宣武醫(yī)院）-中國AD臨床前期聯(lián)盟發(fā)起的多中心認(rèn)知下降縱向研究數(shù)據(jù)庫，一直在收集認(rèn)知正常的健康人和AD各個(gè)階段的多模態(tài)磁共振成像和PET數(shù)據(jù)，包括神經(jīng)心理量表在內(nèi)的臨床與行為學(xué)數(shù)據(jù)。

08OBIA 數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：https://ngdc./obia/home

作為中國國家生物信息中心的核心數(shù)據(jù)庫資源，OBIA 接受來自世界各地的圖像提交并提供所有公開數(shù)據(jù)的免費(fèi)開放訪問，它支持對(duì)影像數(shù)據(jù)的去標(biāo)識(shí)化 (de-identification)、管理和質(zhì)量控制 (quality control)，提供瀏覽、檢索和下載等數(shù)據(jù)服務(wù)，可促進(jìn)現(xiàn)有圖像數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)的重復(fù)利用。采用 5 種數(shù)據(jù)對(duì)象 (Collection, Individual, Study, Series, Image) 進(jìn)行數(shù)據(jù)組織，接受多模態(tài)、多器官、多疾病的生物醫(yī)學(xué)圖像提交。

為保護(hù)個(gè)人隱私，OBIA 制定了統(tǒng)一的去標(biāo)識(shí)化和質(zhì)量控制流程，并為數(shù)據(jù)提交、瀏覽和檢索以及圖像檢索，提供直觀友好的 Web 界面?？傮w來講，OBIA 為國內(nèi)生物醫(yī)學(xué)成像數(shù)據(jù)管理提供了一個(gè)可靠的平臺(tái)，有助于支持全球生物醫(yī)學(xué)研究。

09MIAS乳腺X光數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

http://peipa./info/mias.html

MIAS MiniMammographic數(shù)據(jù)庫由乳腺X光圖像分析學(xué)會(huì)（MIAS）建立，從英國國家乳房篩查計(jì)劃中拍攝的膠片已使用Joyce-Loebl掃描微密度計(jì)數(shù)字化為50微米像素邊緣，該設(shè)備在光密度范圍為0-3.2，并用8位字表示每個(gè)像素。該數(shù)據(jù)庫包含 322 部數(shù)字化膠片，可在 2.3GB 8mm（ExaByte）磁帶上使用。它還包括放射科醫(yī)生對(duì)可能存在的任何異常位置的“真相”標(biāo)記。數(shù)據(jù)庫已縮小到 200 微米像素邊緣并填充/剪裁，以便所有圖像均為 1024x1024。

10乳腺X光數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

http://www.eng./cvprg/Mammography/Database.html

乳腺X光數(shù)據(jù)庫（DDSM數(shù)據(jù)庫）是一個(gè)針對(duì)乳腺X光的的數(shù)據(jù)庫，主要用于計(jì)算機(jī)輔助診斷領(lǐng)域的自動(dòng)檢測(cè)任務(wù)，通常用于開發(fā)和評(píng)估深度學(xué)習(xí)模型的性能。其包含大約2500項(xiàng)研究，每項(xiàng)研究包括每個(gè)乳房的圖像，以及一些相關(guān)患者信息（研究時(shí)的年齡、ACR 乳腺密度評(píng)級(jí)、異常的微妙評(píng)級(jí)、異常的ACR關(guān)鍵字描述）和圖像信息（掃描儀，空間分辨率等）。包含可疑區(qū)域的圖像具有與可疑區(qū)域的位置和類型相關(guān)的像素級(jí)'真實(shí)'信息。此外，還提供了用于獲取乳腺X線圖像和真實(shí)圖像的軟件，以及用于計(jì)算自動(dòng)圖像分析算法的性能指標(biāo)的軟件。

11MURA數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

https://stanfordmlgroup./competitions/mura/

MURA數(shù)據(jù)庫是目前最大的骨骼X光數(shù)據(jù)庫之一。該數(shù)據(jù)庫中包含了源自14982項(xiàng)病例的40895張肌肉骨骼X光片。1萬多項(xiàng)病例里有9067例正常的上級(jí)肌肉骨骼和5915例上肢異常肌肉骨骼的X光片，部位包括肩部、肱骨、手肘、前臂、手腕、手掌和手指。每個(gè)病例包含一個(gè)或多個(gè)圖像，均由放射科醫(yī)師手動(dòng)標(biāo)記。

12阿爾茨海默病神經(jīng)影像學(xué)計(jì)劃數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：https://adni.loni./

ADNI數(shù)據(jù)庫主要針對(duì)AD以及輕度認(rèn)知障礙患者，數(shù)據(jù)類型包括MRI和PET圖像、遺傳學(xué)、認(rèn)知測(cè)試、CSF和血液生物標(biāo)志物等。北美ADNI研究的研究資源和數(shù)據(jù)可通過該網(wǎng)站獲得，其中包括阿爾茨海默氏病患者，輕度認(rèn)知障礙受試者和老年人對(duì)照。

13NIH Chest X-rays數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

https://www./datasets/nih-chest-xrays/data

NIH Chest X-ray數(shù)據(jù)庫是一個(gè)胸部X射線數(shù)據(jù)集，由美國國立衛(wèi)生研究院臨床中心發(fā)布，總共收集了30000多名患者的，100000多張胸部X射線數(shù)據(jù)集，其中包括許多患有晚期肺部疾病的患者。

14Bitewing Radiology數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

https://www./open-datasets/bitewing-radiology-dataset

Bitewing Radiology數(shù)據(jù)集是一個(gè)牙齒X射線數(shù)據(jù)集，包含了從 120 名患者那里收集了 120 張咬合圖像，用來對(duì)牙齒的不同部位進(jìn)行圖像分割。

15CAMUS數(shù)據(jù)集數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：https://www.creatis./Challenge/camus/

CAMUS數(shù)據(jù)庫是由哈馬德醫(yī)療公司 (HMC)在2018年和2019年間在HMC醫(yī)院獲得的160個(gè)超聲記錄。該數(shù)據(jù)集納入的病例中有89名心肌梗死患者（均為首次發(fā)病和急性MI），其余為正常。在MI患者中，有13名女性和76名男性，包含心肌梗死的診斷證據(jù)為心電圖、心肌酶等數(shù)據(jù)。

16EchoNet-Dynamic數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：https://echonet./dynamic/

EchoNet-Dynamic數(shù)據(jù)庫是公開的最大的醫(yī)學(xué)視頻數(shù)據(jù)庫，包含了10030 個(gè)超聲心動(dòng)圖視頻，涵蓋了典型超聲心動(dòng)圖實(shí)驗(yàn)室成像采集條件與參數(shù)，相應(yīng)的標(biāo)記包括射血分?jǐn)?shù)、收縮末期和舒張末期的左心室容積，以及人類專家對(duì)左心室的描記每個(gè)視頻都被裁剪和屏蔽，以去除掃描區(qū)域外的文字和信息。然后將得到的圖像通過立方插值降采樣為標(biāo)準(zhǔn)化的112x112像素的視頻。

17LUNA16數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：https://luna16./

LUNA16數(shù)據(jù)庫是肺部腫瘤檢測(cè)最常用的數(shù)據(jù)集之一，它包含2016-2018年期間的888個(gè)CT圖像，1084個(gè)腫瘤，圖像質(zhì)量和腫瘤大小的范圍比較理想。

18肺CT圖像數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

https://wiki./pages/viewpage.action?pageId=1966254

LIDC-IDRI數(shù)據(jù)庫含 1018 例肺結(jié)節(jié)的病例數(shù)據(jù)。每個(gè)受試者都包括來自臨床胸部 CT 掃描的圖像和相關(guān)的圖像注釋結(jié)果的XML文件。

19癌癥影像數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

https://www./

TCIA數(shù)據(jù)庫是一項(xiàng)去標(biāo)識(shí)化服務(wù)，并托管了可供公眾下載的大型癌癥醫(yī)學(xué)圖像檔案。數(shù)據(jù)庫主要為患者的影像學(xué)與常見疾病（例如肺癌）、圖像模式或類型（MRI、CT、數(shù)字組織病理學(xué)等）或研究重點(diǎn)等有關(guān)內(nèi)容。DICOM 是 TCIA 用于放射成像的主要文件格式，與圖像相關(guān)的支持?jǐn)?shù)據(jù)，如患者結(jié)果、治療細(xì)節(jié)、基因組學(xué)和專家分析等也有提供。

20MIMIC-CXR數(shù)據(jù)庫

?網(wǎng)址：

https://mimic./docs/iv/modules/cxr/

MIMIC-CXR數(shù)據(jù)庫包含2011 - 2016年以色列Beth Deaconess醫(yī)療中心急診科64588例患者的227835項(xiàng)影像學(xué)研究。數(shù)據(jù)集中共有377110張圖片可用。每一項(xiàng)影像學(xué)研究可以包含一幅或多幅圖像，通常是正面視圖和側(cè)面視圖。并且提供一份包含圖像結(jié)果的放射學(xué)報(bào)告。

21Grand-challenge平臺(tái)

?網(wǎng)址：https:///

Grand-challenge是用于生物醫(yī)學(xué)成像機(jī)器學(xué)習(xí)解決方案端到端開發(fā)的平臺(tái)。Grand Challenge 的相關(guān)軟件是開源的，主要由Radboud大學(xué)醫(yī)學(xué)中心診斷圖像分析小組的研究軟件工程師團(tuán)隊(duì)編寫。用戶可以通過上傳去標(biāo)識(shí)的醫(yī)學(xué)成像數(shù)據(jù)來試用該平臺(tái)提供的機(jī)器學(xué)習(xí)算法。

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來自： swordinhand > 《Research》

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