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Dev Cell:余逸群/余洪猛/劉環(huán)海/任雯雯繪制嗅上皮衰老的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜

 子孫滿堂康復(fù)師 2024-08-27 發(fā)布于黑龍江

來源:生物探索 2024-08-27 09:01

該研究建立了哺乳動(dòng)物嗅上皮衰老的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜(圖1),解析嗅上皮細(xì)胞類型特異性的衰老相關(guān)差異表達(dá)基因,發(fā)現(xiàn)衰老導(dǎo)致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的核心因子。

復(fù)旦大學(xué)附屬眼耳鼻喉科醫(yī)院余逸群研究員、余洪猛教授團(tuán)隊(duì)與海軍軍醫(yī)大學(xué)附屬上海長征醫(yī)院劉環(huán)海教授、任雯雯研究員團(tuán)隊(duì)合作在Developmental Cell期刊在線發(fā)表了題為A Single-Cell Transcriptomic Census of Mammalian Olfactory Epithelium Aging 的研究論文,繪制了小鼠嗅上皮衰老過程的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜,為理解衰老相關(guān)的嗅覺功能障礙的發(fā)病機(jī)制提供了實(shí)驗(yàn)依據(jù)。

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為全面地解析研究嗅覺老化的機(jī)制,研究人員使用10× Genomics對青年和老年小鼠的嗅上皮組織進(jìn)行單細(xì)胞測序并鑒定出21種主要的細(xì)胞類型。研究人員發(fā)現(xiàn)衰老導(dǎo)致多種嗅上皮細(xì)胞類型的基因表達(dá)發(fā)生變化,上調(diào)基因主要與炎癥、免疫反應(yīng)的正向調(diào)控以及凋亡信號通路的調(diào)控相關(guān),而下調(diào)基因與上皮細(xì)胞增殖、ATP合成和感覺系統(tǒng)發(fā)育的調(diào)控相關(guān)。研究人員鑒定出了一種激活的HBC亞型存在于老年嗅上皮中,但在青年嗅上皮中卻很少出現(xiàn)。通過Slingshot分析發(fā)現(xiàn),這類激活型HBC不參與支持細(xì)胞及嗅感覺神經(jīng)元的分化成熟,這意味著它們在衰老相關(guān)的嗅上皮組織穩(wěn)態(tài)中具有獨(dú)特的作用。借助Cellchat,研究人員發(fā)現(xiàn)衰老增強(qiáng)中性粒細(xì)胞和HBC之間的細(xì)胞通訊,利用NicheNet分析了中性粒細(xì)胞和HBC之間的受/配體關(guān)聯(lián),并發(fā)現(xiàn)HBC細(xì)胞中由此受/配體調(diào)控的下游靶基因Cdkn1a表達(dá)上調(diào)、Ccnd1表達(dá)下調(diào),表明衰老過程中,中性粒細(xì)胞干預(yù)HBC的增殖能力,進(jìn)而對嗅上皮穩(wěn)態(tài)產(chǎn)生影響。

研究人員通過Slingshot構(gòu)建GBC分化路徑并識(shí)別出分化軌跡上調(diào)控支持細(xì)胞及嗅感覺神經(jīng)元成熟的轉(zhuǎn)錄因子的動(dòng)態(tài)變化,發(fā)現(xiàn)衰老增強(qiáng)支持細(xì)胞分化過程中轉(zhuǎn)錄因子Egr1、Fos和Fosb的表達(dá),而嗅上皮中介導(dǎo)嗅覺受體(OR)類別選擇的轉(zhuǎn)錄因子Bcl11b的表達(dá)水平在老年組嗅感覺神經(jīng)元未成熟階段就開始下降,提示衰老可能會(huì)影響OR基因的表達(dá)選擇。研究人員進(jìn)一步通過構(gòu)建衰老相關(guān)差異基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)預(yù)測出Egr1和Cebpb分別是嗅上皮非免疫細(xì)胞和免疫細(xì)胞的核心轉(zhuǎn)錄因子。體外實(shí)驗(yàn)顯示,老年嗅上皮類器官中過表達(dá)Egr1促進(jìn)細(xì)胞增殖和神經(jīng)元分化,這表明轉(zhuǎn)錄因子Egr1在老年嗅上皮的穩(wěn)態(tài)維持中發(fā)揮重要作用。

基于單細(xì)胞表達(dá)矩陣,研究人員揭示了嗅上皮OR的表達(dá)特征如何隨衰老變化。衰老導(dǎo)致未成熟和成熟神經(jīng)元中不同OR基因的表達(dá)水平和表達(dá)頻率發(fā)生顯著變化,其中Olfr1440是一種特定的麝香受體,負(fù)責(zé)雄性小鼠的先天吸引行為。老年嗅上皮中Olfr1440的表達(dá)水平和頻率顯著增加,表明老年動(dòng)物可能需要更多的麝香受體來完成生理吸引行為。利用Hana3A細(xì)胞進(jìn)行OR表達(dá)和功能分析,研究人員篩選出受衰老調(diào)控的OR識(shí)別的氣味分子。其中,Olfr653識(shí)別一系列具有不同化學(xué)結(jié)構(gòu)的氣味分子如丁香酚、環(huán)己酮、辛酸、壬酰胺和辛醛。在老年成熟嗅感覺神經(jīng)元中顯著下調(diào)的Olfr679和Olfr689分別識(shí)別二氫茉莉酮和己酸,在老年未成熟神經(jīng)元中下調(diào)的Olfr609識(shí)別(-)-樟腦。這些數(shù)據(jù)表明衰老可能會(huì)導(dǎo)致特定氣味識(shí)別發(fā)生改變。

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圖1.哺乳動(dòng)物嗅上皮衰老的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜示意圖(Credit: Developmental Cell)

綜上,該研究建立了哺乳動(dòng)物嗅上皮衰老的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組圖譜(圖1),解析嗅上皮細(xì)胞類型特異性的衰老相關(guān)差異表達(dá)基因,發(fā)現(xiàn)衰老導(dǎo)致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是轉(zhuǎn)錄調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的核心因子,并明確衰老改變特定嗅覺受體的表達(dá)水平和頻率,這些結(jié)果為解析衰老相關(guān)嗅覺功能障礙的發(fā)病機(jī)制提供研究依據(jù)。

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