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新菌種介紹:精液嗜血桿菌

 板橋胡同37號 2024-08-26 發(fā)布于天津

者及單位


屈平華:醫(yī)驗(yàn)

導(dǎo)

精液嗜血桿菌(Haemophilus seminalis)是2019年發(fā)現(xiàn)并于2020年合格命名的一個(gè)新菌種,因最初的2個(gè)實(shí)驗(yàn)菌株均分離于男性精液標(biāo)本中,故而命名。經(jīng)兩年多時(shí)間的后續(xù)追蹤,我們發(fā)現(xiàn),精液嗜血桿菌可正常定植于人體呼吸道和生殖道,且可能是一種低毒力的機(jī)會(huì)致病菌。為方便各位檢驗(yàn)同行提高對于該菌的認(rèn)識,現(xiàn)將其生物學(xué)特征介紹如下:

01

基本信息

      精液嗜血桿菌是2020年發(fā)表的新菌種,論文第一作者是廣州中醫(yī)藥大學(xué)第二附屬醫(yī)院/廣東省中醫(yī)院的碩士研究生鄭敏玲。該菌種的模式菌株為SZYH1已保存在中國普通微生物菌種保藏管理中心和日本技術(shù)評價(jià)研究所生物資源中心,獲得的永外保藏號分別為CGMCC 1.17137和NBRC 113782。模式菌株SZYH1和16S rRNA基因和基因組草圖已上傳GenBank,序列號分別為MK796039和VCED00000000。


02

菌體形態(tài)和培養(yǎng)特性

       精液嗜血桿菌為革蘭陰性小桿菌,菌體形態(tài)與流感嗜血桿菌非常相似(圖1)。在巧克力平板上,精液嗜血桿菌為圓形、光滑、突起的無色透明露滴樣菌落,與流感嗜血桿菌亦非常相似(圖2)。但在營養(yǎng)需求方面,精液嗜血桿菌為V因子依賴,不同于流感嗜血桿菌的V+X因子依賴特性(圖3)。

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圖1、精液嗜血桿菌的菌體形態(tài)圖 (注:左,電鏡;右,革蘭染色)



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圖2、精液嗜血桿菌菌落形態(tài)

注:嗜血巧克力平板培養(yǎng)48h菌落

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圖3、精液嗜血桿菌的因子需求試驗(yàn)結(jié)果

03

分子特征和鑒定

在親緣關(guān)系上,精液嗜血桿菌與溶血嗜血桿菌最為接近(圖4),其與溶血嗜血桿菌的基因組ANI為94.4%,低于95%基因組ANI的物種鑒定閾值。而采用MALDI-TOF質(zhì)譜聚類分析,亦與溶血嗜血桿菌比較接近(圖5)。但需要注意的是,精液嗜血桿菌是2020年命名的新菌種,不在當(dāng)前常規(guī)鑒定系統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫范圍內(nèi),其采用因子試驗(yàn),可能會(huì)誤鑒定為副流感嗜血桿菌;而采用生化鑒定系統(tǒng),可能會(huì)誤鑒定為流感嗜血桿菌;而采用MALDI-TOF質(zhì)譜鑒定,則可能無法鑒定或誤鑒定為溶血嗜血桿菌。

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圖4、精液嗜血桿菌及相關(guān)菌株的全基因組進(jìn)化樹

注:黑體標(biāo)注為精液嗜血桿菌

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圖5、精液嗜血桿菌及相關(guān)菌株的MALDI-TOF質(zhì)譜聚類分析

注:黑體標(biāo)注為精液嗜血桿菌

04

臨床意義

自2019年從精液標(biāo)本中分離以來,經(jīng)兩年多時(shí)間的后續(xù)追蹤,我們發(fā)現(xiàn),精液嗜血桿菌除存在于人體生殖道外,也存在于人體呼吸道中,并且,該菌種可能是一種低毒力的機(jī)會(huì)致病菌。目前,本實(shí)驗(yàn)室已發(fā)現(xiàn)一例疑似精液嗜血桿菌引起的尿路感染。該菌株為尿培養(yǎng)標(biāo)本中偶然分離精液嗜血桿菌對X不依賴,故能在輕微溶血的血平板上微弱生長,患者的臨床診斷為尿路感染和結(jié)石,尿常規(guī)顯示W(wǎng)BC 3+,NIT 陽性;尿培養(yǎng)菌落計(jì)數(shù)>10^5(圖6)。

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圖6、尿培養(yǎng)標(biāo)本中分離的精液嗜血桿菌樣菌株

05

結(jié)

目前隨著分子生物學(xué)技術(shù)在臨床微生物學(xué)中應(yīng)用,以及我國微生物人員技術(shù)水平的提高,從臨床中發(fā)現(xiàn)和命名新菌種,將變得日益尋常。本研究先是從臨床的精液培養(yǎng)標(biāo)本中,發(fā)現(xiàn)了兩株常規(guī)方法鑒定有誤的細(xì)菌,最終發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的精液嗜血桿菌新種;后通過進(jìn)一步的追蹤,發(fā)現(xiàn)精液嗜血桿菌還存在于人體呼吸道;再然后,通過一個(gè)偶然的尿培養(yǎng),發(fā)現(xiàn)精液嗜血桿菌可能為低毒力的條件致病菌。

 需要指出的是,國際上推薦以MALDI-TOF質(zhì)譜和16S rRNA基因測序技術(shù)作為臨床菌種鑒定的參考方法,當(dāng)MALDI-TOF質(zhì)譜不能鑒定而16S rRNA基因與已知菌種之間低于98.65%,則可以初步判定為未分類的新菌種(圖7)。

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圖7、推薦的菌種鑒定流程和初步發(fā)現(xiàn)新菌種的方法

獻(xiàn)


[1]  Zheng ML, Li LH, Liu B, Lin YB, Zhang XT, Chen C, Qu PH, Zeng J. Haemophilus seminalis sp. nov., isolated from human semen. Int J Syst Evol Microbiol 2020; 70:2581-2588.

[2]  Oren A, Garrity GM. Notification list. Notification that new names and new combinations have appeared in volume 70, part 4 of the IJSEM. Int J Syst Evol Microbiol 2020; 70:4050-4060.

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