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青科沙龍第88期 | Cell Research-基于透明化包埋技術(shù)的外周神經(jīng)連接圖譜成像

 曼珠沙華xeg38t 2024-03-12 發(fā)布于湖南

基于透明化包埋技術(shù)的

外周神經(jīng)連接圖譜成像


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本期青科沙龍關(guān)鍵詞

TESOS技術(shù)                  透明化包埋

投射重建                     fMOST技術(shù)

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相關(guān)介紹

生物醫(yī)學(xué)成像正在由二維走向三維。獲取完整的生物組織介觀尺度三維結(jié)構(gòu)信息是生命科學(xué)基礎(chǔ)研究的重要目標(biāo)。然而,組織的不透明性極大地阻礙了光學(xué)成像的深度。為什么生物物質(zhì)看起來是不透明的呢?首要原因是光的散射。生物組織中含有水、脂肪、蛋白質(zhì)、礦物質(zhì)等多種成分,其不均勻分布會導(dǎo)致光發(fā)生強(qiáng)烈的散射,使光無法直接穿過組織。另一方面,機(jī)體內(nèi)的血紅蛋白、黑色素等物質(zhì)可吸收光,限制光線通過。為了解決上述兩個問題,組織透明化技術(shù)由此誕生。一方面,通過脫色技術(shù)減少光的吸收,另一方面,利用含有高折射率介質(zhì)的透明液取代樣本中水分和脂質(zhì),平衡組織折射率,減少光的散射,從而使組織實(shí)現(xiàn)光學(xué)透明。

一個常見生活現(xiàn)象可以很好地幫助我們理解組織透明化技術(shù)的原理。當(dāng)我們把一整塊透明的冰砸碎后,冰渣是不透明的白色。因?yàn)槔锩娴乃?、冰、空氣三種組分折射率差異巨大。接著我們把碎冰放入水中,冰渣會立刻變回透明。組織透明化技術(shù)的過程其實(shí)與此過程原理完全一致。


趙瑚教授團(tuán)隊(duì)是著名的全組織透明化技術(shù)PEGASOS (Polyethylene glycol (PEG) Associated Solvent System) 的開創(chuàng)者。自2018年問世以來,PEGASOS技術(shù)憑借其“透明度高、內(nèi)源性熒光保存好、易用無毒無揮發(fā),適用性廣”等優(yōu)勢獲得諸多研究者的認(rèn)可,成為一種被廣泛應(yīng)用的組織透明化方法。然而,無論是PEGASOS技術(shù)還是其他的油性、水性、水凝膠組織透明化技術(shù),至今都無法很好地實(shí)現(xiàn)全腦介觀神經(jīng)投射圖譜的構(gòu)建,而包含外周和中樞神經(jīng)在內(nèi)的全身完整神經(jīng)的高分辨率成像及投射重建似乎更是天方夜譚。究其原因,主要是:1)樣本無法做到完全透明,隨著成像深度增加,微小的光學(xué)象差累積,造成熒光信號質(zhì)量和信號強(qiáng)度的丟失;2)高分辨率鏡頭往往工作距離有限,不能拍攝太厚的樣本。

那么,有沒有一種辦法可以突破這種限制呢?新概念的TESOS透明化包埋技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。

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2024年1月3日,北京腦科學(xué)與類腦研究所趙瑚教授團(tuán)隊(duì)于Cell Research發(fā)表封面文章Mapping of individual sensory nerve axons from digits to spinal cord with the transparent embedding solvent system,報道了這一新技術(shù)及其應(yīng)用。

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研究過程


透明化包埋是趙瑚教授團(tuán)隊(duì)提出的一個透明化技術(shù)新概念。簡而言之,它是組織透明化與組織塊切割的結(jié)合。團(tuán)隊(duì)研發(fā)了一種以牙科復(fù)合樹脂單體雙酚A乙氧基二丙烯酸酯(BED)與高折射率的苯甲酸芐酯(BB)為主要組分的新型組織透明液。經(jīng)過一系列處理,這個透明液能像一般的有機(jī)溶劑類透明液一樣把各類軟硬組織變得高度透明。接著,用紫外光短時間照射后,透明液會和組織一起發(fā)生交聯(lián)聚合變成一塊堅硬透明的樹脂,樹脂本身如同有機(jī)玻璃一般透明,從內(nèi)到外把組織包埋起來,而樣本同樣維持透明,猶如一塊琥珀。與新鮮腦組織相比,透明化包埋過程將大腦強(qiáng)度提升了150倍以上,在質(zhì)地上甚至強(qiáng)于石蠟包埋樣本。良好的機(jī)械強(qiáng)度賦予了透明化包埋樣本極好的切割性能。無論是硬組織還是軟組織,對樣本進(jìn)行切削或者磨削均可獲得近乎鏡面級的加工面,從而避免了形變。值得一提的是,上述透明化包埋的技術(shù)靈感來自于牙科臨床實(shí)踐。團(tuán)隊(duì)主要成員以前均為川大華西口腔的臨床醫(yī)生,他們從口腔光固化復(fù)合樹脂修復(fù)牙體的經(jīng)歷獲得啟發(fā),從而設(shè)計出上述配方和技術(shù)路線。

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TESOS透明化包埋方法能夠?qū)崿F(xiàn)組織良好的透明度和機(jī)械強(qiáng)度

接著,研究團(tuán)隊(duì)設(shè)計了一套放置樣本的Magmount裝置。該裝置用于將透明化包埋樣本放置于顯微鏡載物臺,同時實(shí)現(xiàn)樣本的靈活轉(zhuǎn)移和精確復(fù)位。有了透明化包埋樣本 Magmount裝置 石蠟切片機(jī),TESOS技術(shù)可以與市面上幾乎所有商用正置共聚焦/雙光子/光片顯微鏡體系(Leica, Nikon, Olympus, Zeiss, 3i等等)結(jié)合,實(shí)現(xiàn)任意組織類型大樣本高分辨成像。無需單獨(dú)開發(fā)專用成像系統(tǒng),也無需對顯微鏡本身做改動。這種高度的靈活性是TESOS技術(shù)的一個巨大優(yōu)勢。與傳統(tǒng)切片成像體系比如fMOST,ViSoR 或者M(jìn)ouselight相比,TESOS大大降低了神經(jīng)連接圖譜成像這一高大上技術(shù)的實(shí)現(xiàn)成本。

透明化包埋后的樣本拍攝過程簡單明了。樣本粘結(jié)于Magmount裝置,一起固定于載物臺上,用選定鏡頭像拍切片一樣對樣本表面三維圖像塊進(jìn)行深度成像。拍攝深度取決于鏡頭工作距離以及對分辨率的需求。拍完表淺區(qū)塊后,將樣本轉(zhuǎn)移至石蠟切片機(jī)切削掉成像過的區(qū)域(或使用電機(jī)磨削),然后再轉(zhuǎn)移回顯微鏡拍攝下一個三維圖像塊。最后基于圖像塊之間的重疊區(qū)域拼接為完整的大三維圖像塊。比如說,我們可以使用最常用于拍攝切片的高分辨率40×/1.3NA 油鏡 (工作距離240微米)拍攝樣本表面大概350微米厚度的樣本(TESOS樣本無需蓋玻片,從而可以拓展170微米的工作距離),然后切片機(jī)切削去約300微米厚度,接著拍攝下一個350微米厚度組織塊。最后通過約50微米的重疊區(qū)將上下兩個圖像塊拼接成為一個650微米厚度連續(xù)圖像塊。重復(fù)上述操作,就可使用高分辨率短工作距離鏡頭拍攝任意大小樣本。小型的圖像數(shù)據(jù)拼接(小于100GB)可以用Image J實(shí)現(xiàn)。團(tuán)隊(duì)自己也編寫了TESOS-Stitcher軟件用于更大規(guī)模圖像數(shù)據(jù)的拼接。

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TESOS透明化包埋方法成像及數(shù)據(jù)處理流程

利用TESOS透明化包埋方法,團(tuán)隊(duì)挑戰(zhàn)了一項(xiàng)高難度任務(wù)——進(jìn)行完整成年小鼠全身神經(jīng)均一微米級分辨率的三維成像與重建。帶皮膚、帶內(nèi)臟的完整六周齡Thy1-YFP-16小鼠(標(biāo)記全身神經(jīng))經(jīng)處理后變得高度透明。團(tuán)隊(duì)利用自改裝的帶磨削平臺的ASI SPIM光片顯微鏡進(jìn)行成像,同時建立了完整的個性化圖像拼接和重建流程,將包含中樞和外周神經(jīng)系統(tǒng)的小鼠全身神經(jīng)投射悉數(shù)展現(xiàn)在讀者眼前。
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TESOS透明化包埋后利用光片顯微鏡進(jìn)行成年小鼠全身神經(jīng)成像

(雙通道拍攝,樣本總體積100×35×20mm3,總拍攝時長120小時,原始數(shù)據(jù)量約70TB)


與光片顯微鏡相比,共聚焦顯微鏡具有更高的成像分辨率、更好的成像效果,高倍鏡下能夠獲得更多的生物學(xué)細(xì)節(jié)。團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步利用TESOS透明化包埋結(jié)合徠卡共聚焦顯微鏡20×/0.95NA鏡頭成像,對新生小鼠全身的神經(jīng)分布進(jìn)行了亞微米級分辨率的重建。

大樣本的高質(zhì)量高分辨率成像是神經(jīng)投射研究的重要挑戰(zhàn)之一。團(tuán)隊(duì)充分發(fā)揮TESOS透明化包埋的技術(shù)優(yōu)勢,利用共聚焦顯微鏡40×/1.3NA鏡頭,先后完成了小鼠大腦皮層一個1.5毫米厚度腦組織塊的亞微米級分辨率成像、包含肌肉和椎骨的小鼠背根神經(jīng)節(jié)及相應(yīng)的脊髓內(nèi)感覺神經(jīng)亞微米級分辨率成像、以小鼠前爪為代表的單軸突分辨率外周神經(jīng)組織成像,并通過病毒標(biāo)記的手段完成了支配小鼠前爪肉墊的其中12個感覺神經(jīng)元在脊髓內(nèi)投射的重建及分析。

最后的終極技術(shù)挑戰(zhàn)是感覺神經(jīng)元的全貌重建。一個感覺神經(jīng)元其外周末梢可以遠(yuǎn)在指尖,連接的傳入神經(jīng)纖維穿行于各類復(fù)雜軟硬組織,將承載著感覺信號的電刺激傳遞到位于脊髓背根神經(jīng)節(jié)的胞體,然后再通過中樞分支投射到脊髓內(nèi)部。正是由于這樣復(fù)雜而長的組織結(jié)構(gòu),哺乳動物的單個感覺神經(jīng)的全貌從來沒有被完整重建。

團(tuán)隊(duì)利用成體Thy1-EGFP小鼠,進(jìn)行了皮膚上的感覺神經(jīng)末梢到背根神經(jīng)節(jié)再到脊髓的跟蹤拍攝,繪制了5個神經(jīng)元的完整投射行程,實(shí)現(xiàn)了單個神經(jīng)元從外周到中樞投射重建的技術(shù)突破。

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研究結(jié)論

TESOS是對傳統(tǒng)組織透明化及三維成像技術(shù)的一種理念革新。其核心概念在于“透明”和“包埋”?!巴该鳌笔荰ESOS與基于超薄切片的大尺度三維成像技術(shù)(以fMOST為代表)的最大區(qū)別。聚合后的良好透明度保證了成像質(zhì)量,也使得TESOS技術(shù)與包含光片顯微鏡、共聚焦顯微鏡等多種成像系統(tǒng)的有機(jī)結(jié)合成為可能。TESOS包埋形成的有機(jī)樹脂與其他水性透明化技術(shù)中的瓊脂糖包埋凝膠截然不同,其良好的機(jī)械硬度及切割性能大大提高了操作的穩(wěn)定性,切削(磨削)后樣品變形小,數(shù)據(jù)拼接及重建具有良好的準(zhǔn)確性。這一特性使得TESOS相較于ViSoR2(目前多用于大腦樣品處理)有更廣泛的適用范圍,能夠同時適用于中樞及外周的處理與成像。

TESOS透明化包埋處理流程清晰,實(shí)驗(yàn)試劑易得,兼容AAV標(biāo)記及免疫熒光染色,在配備有石蠟切片機(jī)、共聚焦顯微鏡的實(shí)驗(yàn)室即可實(shí)現(xiàn)完整的技術(shù)流程,體系靈活性高。

原文鏈接

Mapping of individual sensory nerve axons from digits to spinal cord with the transparent embedding solvent system | Cell Research (nature.com)




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四川大學(xué)華西口腔醫(yī)學(xué)院伊亞婷博士、張士文博士、門乙博士、北京腦科學(xué)與類腦研究所博士生研究生李有淇為論文的共同第一作者,北京腦科學(xué)與類腦研究所趙瑚教授、戈鵡平教授、曲靖醫(yī)科大學(xué)何永文教授為論文的共同通訊作者。

神經(jīng)成像的相關(guān)研究一直是科研的熱門方向,在調(diào)研了一線科研工作者的需求后,我們聯(lián)系并邀請到了本文通訊作者:北京腦科學(xué)與類腦研究中心高級研究員——趙瑚對本項(xiàng)研究進(jìn)行分享。

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趙瑚,北京腦中心高級研究員。2001年于四川大學(xué)華西口腔醫(yī)學(xué)院獲得口腔醫(yī)學(xué)博士學(xué)位,2003年于University of Virginia獲得生物學(xué)碩士學(xué)位,2011年于UCLA牙學(xué)院獲得臨床牙科博士學(xué)位 (DDS)。于2003-2009和2011-2015在University Of Southern California牙學(xué)院柴洋實(shí)驗(yàn)室從事博士后工作,于2016年加入Texas A&M University牙學(xué)院從事助理教授工作和兼職臨床牙醫(yī)工作。于2021年通過大學(xué)tenure委員會的評估。于2021年八月份在北京腦科學(xué)中心入職。趙瑚實(shí)驗(yàn)室的研究方向集中在兩個領(lǐng)域。一個領(lǐng)域是開發(fā)基于新型透明化技術(shù)的中樞和外周神經(jīng)組織連接圖譜成像平臺曾開發(fā)出PEGASOS透明化技術(shù)以及TESOS透明化技術(shù)。另一個領(lǐng)域是顱面發(fā)育與干細(xì)胞生物學(xué),研究顱頜面軟硬組織的發(fā)育還有成體顱頜面牙,骨組織的干細(xì)胞調(diào)控機(jī)制。

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講者信息

北京腦科學(xué)與類腦研究中心高級研究員——趙瑚

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主辦平臺

華安生物、深究科學(xué)、生物世界

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直播時間

2024年3月12日 20:00-21:00

Deep Science預(yù)印本

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