內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)(internal ribosome entry site,IRES) 是位于mRNA 的5'端非編碼區(qū)的一段特殊序列, 核糖體能夠直接結(jié)合這段序列,從而起始mRNA的翻譯。IRES允許研究人員在同一啟動(dòng)子的控制下共表達(dá)多個(gè)基因。在過(guò)去的幾十年中,IRES已被用于開發(fā)數(shù)百種轉(zhuǎn)基因模型,并被認(rèn)為是嚙齒動(dòng)物模型中轉(zhuǎn)基因共表達(dá)的“首選”技術(shù)。 IRES作用機(jī)制:靶基因的內(nèi)源性啟動(dòng)子指導(dǎo)單個(gè)mRNA的轉(zhuǎn)錄,該mRNA包含目的基因(見(jiàn)下圖,藍(lán)色)和熒光報(bào)告基因(見(jiàn)下圖,紅色)的編碼區(qū)。報(bào)告基因和目的基因表達(dá)為兩種獨(dú)立的蛋白質(zhì)(非融合),最終使報(bào)告基因保持完全功能。盡可能保留目的基因的內(nèi)源性表達(dá)。 除了IRES可以共表達(dá)多個(gè)基因外,2A肽也有類似的功能,不知道2A肽是什么,怎么用2A肽的家人們可以看我往期精彩內(nèi)容:干貨分享|2A肽在病毒學(xué)研究中的應(yīng)用 IRES作用機(jī)制(圖片來(lái)源:www.genoway.com) IRES序列最早是Pelletier等人于1988年脊髓灰質(zhì)炎病毒 ( poliovirus) 中發(fā)現(xiàn)的。目前人們?cè)谒形⑿『颂呛怂岵《竞推渌《局卸及l(fā)現(xiàn)了類似的IRES序列。例如DNA病毒,包括卡波西肉瘤病毒(KSHV)和皰疹病毒液編碼IRES序列。除了病毒以為,真核生物的mRNA的5'端非編碼區(qū)也可能含有IRES序列。目前很多表達(dá)質(zhì)粒載體上都有IRES序列。 IRES的應(yīng)用: (1)構(gòu)建基于多基因的疾病模型 IRES已成功用于構(gòu)建模擬各種人類病理的模型。多個(gè)cDNA可以在同一啟動(dòng)子的控制下表達(dá)。這導(dǎo)致這些基因在同一細(xì)胞或組織中共表達(dá)。作者利用IRES共表達(dá)hAPP和hTau蛋白,從而成功構(gòu)建了阿爾茲海默病小鼠模型。 利用IRES共表達(dá)hAPP和hTau蛋白構(gòu)建阿爾茲海默病小鼠模型(Bettina Platt et al. 2011. PLoS One) (2)構(gòu)建報(bào)告基因模型 IRES 可用于在目的基因的 3' UTR 處插入報(bào)告基因。激活后,包含構(gòu)建 IRES 報(bào)告基因靶基因的 mRNA 被翻譯為兩個(gè)獨(dú)立的蛋白質(zhì)。 報(bào)告基因使研究人員能夠量化基因表達(dá)水平,追蹤表達(dá)目標(biāo)基因的細(xì)胞,并監(jiān)測(cè)基因的調(diào)控。從歷史上看,已經(jīng)成功構(gòu)建了這樣的模型,例如,量化調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的效應(yīng)功能,量化細(xì)胞因子的產(chǎn)生,在時(shí)間上跟蹤產(chǎn)生細(xì)胞因子的細(xì)胞,以及可視化嗅覺(jué)神經(jīng)元中的特定氣味受體。 (3)構(gòu)建細(xì)胞譜系追蹤模型 在目標(biāo)基因的3' UTR處插入IRES使我們能夠開發(fā)用于細(xì)胞譜系跟蹤的模型。研究人員可以使用這些模型來(lái)研究和分析給定細(xì)胞群的時(shí)空細(xì)胞命運(yùn)。 (4)監(jiān)測(cè)KO模型中的細(xì)胞表達(dá)模式 IRES系統(tǒng)廣泛用于KOMP、EUCOMM和NorCOMM等高通量基因聯(lián)合敲除開發(fā)的條件性基因敲除小鼠模型。這些系統(tǒng)使研究人員能夠監(jiān)測(cè)各種組織和細(xì)胞中的基因表達(dá)模式和基因調(diào)控。 (5)生成組織特異性 Cre 驅(qū)動(dòng)細(xì)胞系 IRES通常用于生成Knock-in Cre驅(qū)動(dòng)的細(xì)胞系。Knock-in方法允許被驅(qū)動(dòng)的細(xì)胞系忠實(shí)地反映所選Cre表達(dá)位點(diǎn)的表達(dá)模式。IRES序列保留了靶基因的表達(dá)或允許報(bào)告基因的共表達(dá)。報(bào)告基因可以提供有關(guān)Cre重組酶表達(dá)水平或表達(dá)模式的信息。 剛?cè)肟拥募胰?,不知道怎么研究一個(gè)蛋白質(zhì)的功能的,或者想學(xué)基礎(chǔ)知識(shí)的,可以購(gòu)買下方鏈接的《功能蛋白質(zhì)研究》。小編當(dāng)時(shí)買的價(jià)格是126,這本書知道的少,賣的不好,庫(kù)存少,價(jià)格可能會(huì)有幾塊錢的上下浮動(dòng)。整本書大約430頁(yè),目錄都占了7頁(yè),內(nèi)容相當(dāng)全。小編本碩博一路都看這本書,非常給力。 如果你覺(jué)得有用的話,就幫忙點(diǎn)個(gè)「贊」和「再看」吧。 |
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