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CHX結合MG132檢測蛋白質穩(wěn)定性的方法

 智者不學生物 2023-12-31 發(fā)布于上海

CHX是灰鏈霉菌的產物,常常用于檢測蛋白質或酶的半衰期。CHX抑制細胞總蛋白合成的原理是阻斷真核細胞核糖體易位過程。用適當濃度的CHX處理細胞(通常為100μg/mL)不同時間點,收集細胞樣品進行WB實驗檢測蛋白質豐度。

半衰期短的蛋白質會隨著時間的推移迅速降解,而半衰期長的蛋白質隨著時間的推移,降解的很少。

CHX常用于檢測蛋白質的穩(wěn)定性和半衰期。在下面這個案例中,用50μg/mL的CHX處理6h和12h,WB檢測蛋白表達,發(fā)現(xiàn)敲低AHI1加速了Tyk2的蛋白質降解。

敲低AHI1加速了Tyk2的蛋白質降解(Ying Miao et al. 2023. bio protocol)

還不知道檢測蛋白質穩(wěn)定性和半衰期方法的家人可以先看看往期文章:《蛋白質穩(wěn)定性、半衰期實驗的原理、方法和應用》

MG132又稱芐氧羰基-亮氨酸-亮氨酸-亮氨酸,是一種多肽醛。MG132是大家熟知的蛋白酶體抑制劑,MG132的作用機制是通過與蛋白酶體20S催化核心的活性位點蘇氨酸殘基中的羥基半縮醛反應,從而抑制蛋白酶體活性。

在下面這個案例中,使用MG132能夠抑制蛋白質的泛素化降解,促進泛素化蛋白的積累,從而更容易檢測到蛋白質的泛素化。如下圖的圖C所示:在不添加MG132時,即使Bmi-1和Ezh2能被泛素化,也可能會迅速降解,從而檢測不到信號,MG132處理抑制蛋白酶體,導致泛素化的蛋白積累,因此更容易檢測到泛素化的蛋白。

需要特別注意的是,如下圖A和B所示,在不添加MG132時,可能檢測不到ub信號。

需要泛素化質粒的可以聯(lián)系小編。

MG132促進蛋白質泛素化(Sivaprakasam B et al. 2012. J Biol Chem)

另外,CHX和MG132也能夠結合起來驗證蛋白質的穩(wěn)定性和降解途徑。例如在下面這個案例中,左邊是MG132和CHX聯(lián)合處理,右邊是只用CHX處理,w/o MG132表示 without MG132。說明MG132增加了a-SMN蛋白的穩(wěn)定性,而MG132沒有增加FL-SMN的蛋白穩(wěn)定性。

MG132對a-SMN和FL-SMN蛋白半衰期的影響(Denise Locatelli et al. 2015. PLOS ONE)

大家可以根據(jù)自己的實驗目的靈活選擇抑制劑單獨處理或聯(lián)合處理,從而更有利于發(fā)現(xiàn)問題所在,更好的分析結果。

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