軍隊(duì)的基礎(chǔ)是可靠的民眾，清朝擊敗了準(zhǔn)噶爾汗國(guó)，覆滅了和卓政權(quán)，但滿清和民國(guó)在新疆的軍事力量都不強(qiáng)，總兵力只有四萬(wàn)人的浩罕國(guó)就多次入侵新疆，沙俄也對(duì)新疆虎視眈眈，這些問(wèn)題的根源就是新疆中國(guó)政權(quán)可以依賴的民眾太少。

乾隆把新疆歸入版圖后，還一度遭到了阿富汗帝國(guó)的挑戰(zhàn)，皇阿瑪?shù)姆磻?yīng)就是不理睬自己的屬國(guó)，兩眼一閉全當(dāng)沒(méi)看見(jiàn)。這是很正常的反應(yīng)，因?yàn)榍r(shí)期清軍綠營(yíng)在新疆的總兵力是11，000人，兵力最多時(shí)達(dá)到過(guò)16，000人。滿清還把索倫人等新滿洲兵力調(diào)往新疆，當(dāng)時(shí)新疆有卡倫七十多座，索倫、錫伯、察哈爾、額魯特四營(yíng)按照每個(gè)卡倫十幾到三十人的兵力進(jìn)行常駐，兵力最多為6000人，平時(shí)只能保持2000人左右的常駐兵力。

截至到1944年，新疆進(jìn)行人口統(tǒng)計(jì)時(shí)，錫伯族人口僅僅時(shí)1萬(wàn)零624人，達(dá)斡爾族更是只有2508人。整個(gè)新疆，滿清可以動(dòng)用的兵力最多不超過(guò)兩萬(wàn)人。阿富汗杜蘭尼王朝最多能出動(dòng)20萬(wàn)人，它在乾隆時(shí)期重創(chuàng)了莫臥兒帝國(guó)，還多次和此大陸強(qiáng)權(quán)馬拉塔聯(lián)盟開(kāi)戰(zhàn)并獲勝，當(dāng)時(shí)的阿富汗帝國(guó)可是非常不好惹。乾隆時(shí)期滿清還能和阿富汗人掰掰腕子，到了嘉慶、道光時(shí)期，滿清就難以應(yīng)對(duì)浩罕國(guó)的挑戰(zhàn)。

浩罕國(guó)多次支持和卓的后裔在新疆鬧大新聞，還派出自己的上萬(wàn)部隊(duì)參與其中。嘉慶道光年間，滿清在新疆的總兵力不超過(guò)15000人，有半數(shù)還集中在北疆烏魯木齊一帶（烏魯木齊4500多人，鎮(zhèn)西府2000多人），和卓后裔、浩罕國(guó)一聯(lián)手就能在新疆拉起三四萬(wàn)的隊(duì)伍，對(duì)南疆的清軍形成兵力優(yōu)勢(shì)。

好在當(dāng)時(shí)浩罕國(guó)的軍隊(duì)?wèi)?zhàn)力并不強(qiáng)，鴉片戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期的敗將奕山都帶著4700多名清軍擊敗3萬(wàn)多人的浩罕國(guó)大軍。滿清雖然能擊敗浩罕國(guó)，卻無(wú)法徹底征服這個(gè)國(guó)家。浩罕國(guó)反而借助同道光簽訂的條約，把6000多名本國(guó)商人派到新疆。除了浩罕國(guó)商人，清朝末年新疆還有12萬(wàn)來(lái)自中亞的各色人等。這些人對(duì)中國(guó)政府的統(tǒng)治形成了巨大威脅，因?yàn)樾陆钡?850年才有各族人口73萬(wàn)4389人，他們相當(dāng)于新疆人口的六分之一。

滿清可以利用的綠營(yíng)及其家屬不超過(guò)十萬(wàn)人，漢人民戶最多有十五萬(wàn)人，遣犯及其家屬也有五萬(wàn)人，加上商戶，滿清手中的漢人只有30萬(wàn)人左右。新疆的滿洲八旗、索倫、錫伯、察哈爾、額魯特四營(yíng)加起來(lái)也只有兩萬(wàn)人左右的兵力儲(chǔ)備（這還是人多時(shí)），整個(gè)新疆滿清最放心的人力資源只有三十多萬(wàn)。

中亞各國(guó)不請(qǐng)自來(lái)的人員已經(jīng)是漢人的四成，他們還被浩漢國(guó)商人憑借特權(quán)集合在一起，成了新疆的重大威脅。在歷次和卓之亂中，他們都給浩罕國(guó)帶路。阿古柏侵入新疆時(shí)，也是他們給了阿古柏支持，讓阿古柏從幾十個(gè)手下的流亡軍頭變成了擁兵上萬(wàn)的新疆巨頭。浩罕國(guó)滅亡、阿古柏政權(quán)覆滅后，這些中亞人士又都換了沙俄的身份證，幫助沙俄侵略新疆。

民國(guó)建立后，新疆的漢族人口依舊稀少，1948年新疆的漢人也只有29萬(wàn)人，青壯年男子更是只有4萬(wàn)多人。新疆的主體民族人口過(guò)少，周邊涌入的外來(lái)人口過(guò)多，讓清末、民國(guó)時(shí)期的新疆烽火不斷。