豬流行性腹瀉（PED）是由豬流行性腹瀉病毒（PEDV）引起的一種以腹瀉、嘔吐、脫水為主要特征的一種急性、高度接觸性的豬腸道疾病。該病主要危害哺乳仔豬，通過(guò)糞口傳播導(dǎo)致7日齡仔豬發(fā)病率和死亡率接近100%。

該病于1971年在英國(guó)和比利時(shí)首次報(bào)道，隨后在其他歐洲國(guó)家和亞洲的多個(gè)國(guó)家流行爆發(fā)，給養(yǎng)豬業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。

在2010年之前的時(shí)期內(nèi)，來(lái)自經(jīng)典亞群（GIa）的PEDV株在東亞造成了廣泛流行。2010年以來(lái)，隨著新毒株的出現(xiàn)，GIIa亞群PEDV毒株導(dǎo)致大規(guī)模PED疫情，給亞洲養(yǎng)豬業(yè)帶來(lái)了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。

2013年以來(lái)，在北美出現(xiàn)了一種被歸類為G2b亞群的高毒力PEDV，此后不久，它迅速席卷了全球多個(gè)國(guó)家。G2b毒株暴發(fā)后，在美國(guó)出現(xiàn)了S基因缺失和插入的新變體，這些變體被歸類為S-INDEL亞群。自2010年以來(lái)在中國(guó)發(fā)現(xiàn)的PEDV毒株如CH-SCMY-1/2014、CH-SCZY103/2017、CH-HNLH/2015、CH-JXJA/2017一起被分為一個(gè)不同的亞群，命名為GIIc亞群。

接種疫苗是控制PED的重要方法。自1994年以來(lái)，已開(kāi)發(fā)出PEDV CV777株滅活和減毒活疫苗，滅活和減毒PEDV疫苗已在中國(guó)豬群中廣泛應(yīng)用，在控制PEDV感染方面發(fā)揮了重要作用。

然而，大多數(shù)減毒疫苗是由G1a株生產(chǎn)的，對(duì)2013年以來(lái)出現(xiàn)的高致病性株的保護(hù)作用減弱。除了經(jīng)典菌株的傳統(tǒng)疫苗外，基于AJ1102毒株的PEDV滅活疫苗和減毒疫苗，即PEDV疫苗中使用的第一個(gè)G2b毒株，于2017年12月成功上市并廣泛使用，從而更有效地控制了該疾病。

然而，近年來(lái)的流行病學(xué)調(diào)查報(bào)告表明，PED仍然是困擾養(yǎng)豬業(yè)的主要疾病之一，主要原因是PEDV作為一種冠狀病毒，其極易發(fā)生重組和變異，導(dǎo)致現(xiàn)有疫苗對(duì)其預(yù)防效果下降，GIIc亞群的出現(xiàn)和近期在國(guó)內(nèi)主要生豬養(yǎng)殖區(qū)的流行給PED防控帶來(lái)了新的挑戰(zhàn)。

2017年至2021年，對(duì)中國(guó)16個(gè)省的303個(gè)農(nóng)場(chǎng)收集的882份死亡仔豬糞便和小腸樣本進(jìn)行RT-qPCR分析顯示：五年內(nèi)，52.15%（158/303）的檢測(cè)農(nóng)場(chǎng)PEDV核酸呈陽(yáng)性。五個(gè)地區(qū)農(nóng)場(chǎng)的陽(yáng)性率從46.94%到55.00%不等。在882份樣本中，共發(fā)現(xiàn)564份PEDV陽(yáng)性。樣本水平的陽(yáng)性率從53.85%到68.51%不等，總陽(yáng)性率為63.95%。

從毒株基因型看華東地區(qū)G IIc占比71.43%、西南地區(qū)G IIc占比19.05%、華北地區(qū)G IIc占比78.95%、華南地區(qū)G IIc占比93.75%、華中地區(qū)G IIc占比92.31%。綜合來(lái)看G IIc毒株占比為68.27%，因此需要密切關(guān)注可能的大流行。系統(tǒng)發(fā)育表明G2c亞群是從重組事件進(jìn)化而來(lái)的，S基因的5′部分是從G2b組獲得的，3′部分基因組區(qū)域是從S-INDEL獲得的。

具體信息詳見(jiàn)表1、圖1。

表1 2017～2021年中國(guó)PEDV流行分離株及其基因型分布

（數(shù)據(jù)引自國(guó)內(nèi)某大型養(yǎng)殖集團(tuán)已發(fā)表文獻(xiàn)）

圖1 不同基因亞群PEDV S1遺傳進(jìn)化樹(shù)

通過(guò)對(duì)2017至2021中國(guó)PED臨床腹瀉樣本分離到的PEDV測(cè)序的S基因S1片段與每個(gè)亞群的代表毒株進(jìn)行比較，從遺傳進(jìn)化樹(shù)來(lái)近年來(lái)新出現(xiàn)的GⅡc亞群與GⅡa亞群、GⅡb亞群遺傳距離較遠(yuǎn)，且新出現(xiàn)的GⅡc亞群臨床分離率最高，預(yù)測(cè)2022年秋冬季豬流行性腹瀉的流行毒株很大可能以GⅡc亞群為主，提請(qǐng)國(guó)內(nèi)生豬養(yǎng)殖者要重視PEDV GⅡc亞群的流行動(dòng)態(tài)，并提前做好對(duì)PEDV GⅡc亞群田間流行毒株的針對(duì)性防范，尤其在疫苗的選用上，盡量選用近年來(lái)（2014年以后）的分離毒株生產(chǎn)的疫苗進(jìn)行免疫預(yù)防，會(huì)有更為明顯的效果！降低豬流行性腹瀉造成的臨床損失。