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新藥研發(fā):諾華FGFR4共價(jià)抑制劑Roblitinib的發(fā)現(xiàn)|半胱氨酸|癌癥|FGFR抑制劑|成纖維細(xì)胞|

 新用戶7234U9JM 2022-10-10 發(fā)布于四川

成纖維細(xì)胞生長因子相關(guān)信號(hào)異常是許多癌癥的驅(qū)動(dòng)因素,近年來FGFR抑制劑的研究取得很大成功,2019年首個(gè)FGFR泛抑制劑ErdafitinibFDA批準(zhǔn)上市,目前FGFRs抑制劑的研究則集中于實(shí)現(xiàn)亞型的高選擇性。

   

                       

通過四個(gè)亞型的序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)FGFR4GK+2位置存在非常獨(dú)特的552位半胱氨酸,而其他三個(gè)亞型則為酪氨酸,同時(shí)在其他類型激酶中僅發(fā)現(xiàn)4個(gè)激酶的GK+2位置存在半胱氨酸(MAPKAPK2,MAPKAPK3,p70S6KbTTK),這為發(fā)現(xiàn)共價(jià)結(jié)合于C552的具有高選擇性FGFR4抑制劑提供了理論基礎(chǔ)。

本項(xiàng)目通過高通量的篩選發(fā)現(xiàn)化合物78存在FGFR4高抑制活性,均能共價(jià)結(jié)合于半胱胺酸殘基,并且對(duì)FGFR2有超過50倍的選擇性,同時(shí)對(duì)50種激酶進(jìn)行篩選也表現(xiàn)出顯著選擇性,其中本項(xiàng)目選擇化合物8作為hit進(jìn)一步研究。

基于hit compound 8進(jìn)行了初步的構(gòu)效關(guān)系研究,將喹啉骨架改為苯并脂肪雜環(huán),并替換共價(jià)基團(tuán)醛基為氰基,末端吡啶環(huán)的R取代,其活性表明化合物16類骨架具有較好活性,可進(jìn)一步優(yōu)化。

進(jìn)而確定醛基為共價(jià)基團(tuán)、優(yōu)化吡啶并哌啶骨架分子的不同取代,其中末端吡啶環(huán)優(yōu)化側(cè)鏈獲得的化合物2729活性顯著提升。

 

隨后評(píng)價(jià)了化合物24的成藥性,發(fā)現(xiàn)其生物利用度僅4%,肝臟微粒體存在明顯不穩(wěn)定,其主要是哌啶環(huán)的羥基化及醛基的還原。

基于此,該類骨架穩(wěn)定性優(yōu)化成為下一步主要工作,如下圖,主要通過醛基鄰位及末端吡啶環(huán)的不同取代進(jìn)行優(yōu)化,實(shí)現(xiàn)了代謝穩(wěn)定性的提高。

進(jìn)而對(duì)較優(yōu)化合物43(酶活IC502.9 nM,Hep3B細(xì)胞IC5073 nM)進(jìn)行成藥性及體內(nèi)活性評(píng)價(jià),但是其生物利用度仍然比較低(22%),在60mg/kg的劑量口服劑量下(每日兩次)才表現(xiàn)出較好的抑制活性。

進(jìn)而對(duì)化合物43進(jìn)一步結(jié)構(gòu)優(yōu)化以實(shí)現(xiàn)活性及穩(wěn)定性的最優(yōu)平衡,著重修飾了醛基鄰位的N乙?;〈?,與Arg483構(gòu)建氫鍵相互作用,化合物61-69酶活均顯著提高。

通過優(yōu)選化合物42、48、6168的成藥性評(píng)價(jià),并選擇化合物68(生物度可達(dá)25%)進(jìn)行體內(nèi)活性評(píng)價(jià),其體內(nèi)活性有較明顯的提升,其溶解性<6 uM可能是限制其生物利用度的原因。

 

針對(duì)該類化合物的溶解性差的問題進(jìn)行了進(jìn)一步的結(jié)構(gòu)優(yōu)化,主要是通過N乙酰基環(huán)化形成內(nèi)酰胺類化合物,綜合評(píng)價(jià)后確定最優(yōu)化合物84,即Roblitinib,其結(jié)構(gòu)如下圖。其在FGFR亞型及其他激酶中表現(xiàn)出非常高的選擇性,并表現(xiàn)出最優(yōu)的體內(nèi)抗腫瘤活性。

 

總結(jié):

Roblitinib2014年被FDA批準(zhǔn)為首個(gè)進(jìn)入臨床的高選擇性FGFR4抑制劑,該文章詳細(xì)的介紹了該項(xiàng)目的研究過程,該項(xiàng)目的立項(xiàng)依據(jù)非常值得研讀,發(fā)現(xiàn)高選擇性抑制劑的基礎(chǔ)是靶點(diǎn)結(jié)構(gòu)的特異性(C552);其次本文提供了一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的hitleadcandidate的經(jīng)典案例,hitlead的過程注重活性的提升,從leadcandidate則是成藥性和藥效的平衡優(yōu)化。

注:本文著重截取了改構(gòu)優(yōu)化思路,更多活性相關(guān)詳情請見原文。

參考文獻(xiàn):

[1] Robin A. Fairhurst. Discoveryof Roblitinib (FGF401) as a Reversible-Covalent Inhibitor of the KinaseActivity of Fibroblast Growth Factor Receptor 4. J. Med.Chem. 2020.DOI:10.1021/acs.jmedchem.0c01019.

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