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【文章發(fā)表】首例!NGS助力結(jié)直腸癌遺傳篩查,APC和BRCA1突變首次發(fā)現(xiàn)共遺傳

 劉得光3p6n6zqq 2021-12-31

導(dǎo)讀

結(jié)直腸癌(CRC)是全球第三大常見癌癥,且具有較高的遺傳易感[1]。既往關(guān)注較多的為錯(cuò)配修復(fù)基因(MLH1,MSH2,MSH6和PMS2)胚系突變導(dǎo)致的相關(guān)遺傳疾病——林奇綜合征(Lynch Syndrome,簡(jiǎn)稱LS[2-3]。除此之外,結(jié)腸腺瘤性息肉病( adenomatous polyposis coli,APC )基因發(fā)生胚系突變引起的常染色體顯性家族性腺瘤性息肉?。‵AP)也是一種結(jié)直腸癌易感綜合征,其特征通常是患者結(jié)直腸內(nèi)會(huì)有成百上千的息肉,終身罹患腸癌的風(fēng)險(xiǎn)非常[4-5]。而BRCA1/2是與乳腺癌和卵巢癌的遺傳易感風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)的基因,目前與腸癌的遺傳風(fēng)險(xiǎn)尚不明[6-7]。

南京同仁醫(yī)院血液腫瘤科王琳教授、江蘇省中醫(yī)院腫瘤科黃偉教授與燃石醫(yī)學(xué)合作,利用燃石優(yōu)健?檢測(cè)發(fā)現(xiàn)一例20歲CRC患者具有典型FAP臨床特征,同時(shí)攜帶有APC和BRCA1基因致病胚系變異,雖然既往有報(bào)道發(fā)現(xiàn)APC和BRCA胚系共突變,但本案例首次報(bào)道APC和BRCA胚系突變共遺傳,同時(shí)本文還建立了較為完整的家系圖,提示多基因和家系篩查的重要性,相關(guān)研究結(jié)果于近期發(fā)表在Frontiers in oncology上(IF=4.848 [8]。

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病例介紹

患者是一名20歲的男性(圖1,III2),有癌癥家族史。母親(II6)于48歲首次被診斷為結(jié)腸腺癌II期并伴有多發(fā)息肉,并接受了全身化療。隨后,再評(píng)估患者母親的詳細(xì)家族史中發(fā)現(xiàn),患者的外祖父(I3)于60歲時(shí)死于胃癌?;颊叩耐庾婺福↖4)59歲時(shí)被確診為CRC?;颊叩膬蓚€(gè)姨媽(II7&II9)和舅舅(II11)分別因CRC和肺癌去世?;颊叩囊晃慌员碛H(III4)被診斷出患有CRC,隨后在30歲時(shí)接受了手術(shù)。

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圖1. 研究病例的家系圖

由于患者具有腫瘤家族史,2018年6月,研究者從患者母親(II6)收集了白細(xì)胞樣本,使用燃石優(yōu)健?檢測(cè)了癌癥相關(guān)的基因,平均測(cè)序深度為400X。檢測(cè)結(jié)果表明患者存在APC突變,拷貝數(shù)變異分析顯示APC基因中外顯子15的拷貝數(shù)為1,說明存在APC外顯子15的雜合丟失(exon15cn_del,圖2A)。研究者還對(duì)患者的兩個(gè)表親(III7&III6)進(jìn)行了基因檢測(cè),結(jié)果發(fā)現(xiàn)其男性表親(III7)具有相同的胚系A(chǔ)PC突變,而女性表親(III6)中沒有突變。此外,患者的妹妹(III1)也存在相同的胚系A(chǔ)PC突變(圖2B)。

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圖2. APC和BRCA1胚系突變的NGS結(jié)果圖

除了APC突變外,該男性患者還檢出胚系BRAC1移碼突變(c.5470_5477delATTGGGCA,p.lle1824AspfsX3,圖2C)。該患者父親的家族史中,其祖父(I1)死于胃癌。其姑媽(II4)診斷出患有卵巢癌,且檢出相同的BRAC1胚系突變。

綜上所述,該患者家族臨床病史和已檢出的APC突變高度提示家族性腺瘤性息肉?。╢amilialadenomatouspolyposis,F(xiàn)AP)。該20歲患者于2019年2月21日進(jìn)行了結(jié)腸鏡檢查,檢出息肉超過十個(gè),大小為0.4-4cm,其中一些已糜爛。結(jié)腸肝曲處發(fā)現(xiàn)三個(gè)大息肉,活檢結(jié)果顯示高級(jí)別上皮內(nèi)瘤變。該患者隨后于2019年3月25日接受結(jié)腸根治術(shù),術(shù)后病理示T3N1bM0期結(jié)腸腺癌,并伴有100多個(gè)管狀絨毛狀腺瘤,其中較大的為0.3-1cm。免疫組織化學(xué)檢測(cè)示HER2(0)、DNA錯(cuò)配修復(fù)(pMMR)和BRAF(–)?;颊唠S后接受了12個(gè)周期mFOLFOX6方案治療。

小結(jié)與啟發(fā)

該男性患者同時(shí)攜帶APC和BRAC1基因的胚系突變,利用NGS對(duì)多個(gè)家族成員進(jìn)行家系分析,能夠更好地理解該家族突變的遺傳模式?;颊叩哪赣H(先證者),患者的妹妹和患者男性表親有攜帶APC突變,而患者的姑媽則攜帶BRAC1突變,這表明前者來自母系,后者來自父系,表現(xiàn)出共遺傳性。

根據(jù)基因檢測(cè)結(jié)果,患者從結(jié)腸鏡檢查和隨后的治療中受益。該案例說明了在癌癥患者中進(jìn)行家族史評(píng)估以及進(jìn)行多基因NGS panel檢測(cè)的重要性,可以幫助我們識(shí)別更多遺傳易感基因變異,并為預(yù)防和更早發(fā)現(xiàn)癌癥提供幫助。此外,這項(xiàng)研究也提示兩種不同遺傳性腫瘤綜合征的致病突變有可能并存,在這種情況下,對(duì)特定癌癥的易感性有待進(jìn)一步研究。

專家介紹 

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王琳 教授

南京同仁醫(yī)院

血液腫瘤科主任  主任醫(yī)師 

中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)大腸癌專業(yè)委員會(huì)委員 

中國(guó)醫(yī)師協(xié)會(huì)大腸癌MDT專業(yè)委員會(huì)委員

CSCO大腸癌專業(yè)委員會(huì)委員

CSCO腫瘤營(yíng)養(yǎng)專業(yè)委員會(huì)委員

CSCO患者教育專業(yè)委員會(huì)委員

江蘇省醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤化療與生物治療分會(huì)胃腸腫瘤學(xué)組 副組長(zhǎng)

江蘇省醫(yī)師協(xié)會(huì)大腸癌專業(yè)委員會(huì)委員

江蘇省抗癌協(xié)會(huì)肺癌專業(yè)委員會(huì)委員

江蘇省抗癌協(xié)會(huì)淋巴瘤專業(yè)委員會(huì)委員

南京醫(yī)學(xué)會(huì)腫瘤專委會(huì)委員

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黃 偉

江蘇省中醫(yī)院  腫瘤科

江蘇省中醫(yī)院、南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院腫瘤科 主治醫(yī)師

醫(yī)學(xué)博士在讀

2012-2020年 解放軍第八一醫(yī)院腫瘤內(nèi)科

曾擔(dān)任院“大腸癌多學(xué)科聯(lián)合會(huì)診(MDT)”秘書

發(fā)表中文核心期刊及SCI論文10余篇,參編專著1部

主持院青年基金課題1項(xiàng),參與中國(guó)抗癌協(xié)會(huì)課題2項(xiàng)

獲院中青年優(yōu)秀論文一等獎(jiǎng)1項(xiàng),院醫(yī)療成果三等獎(jiǎng)1項(xiàng)

參考文獻(xiàn)

1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. Global cancer statistics 2020: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin. 2021 Feb 4.

2. Yurgelun MB, Allen B, Kaldate RR, Bowles KR, Judkins T, Kaushik P, et al. Identification of a Variety of Mutations in Cancer Predisposition Genes in Patients With Suspected Lynch Syndrome. Gastroenterology (2015) 149 (3):604–13.e20.

3. Pearlman R, Frankel WL, Swanson B, Zhao W, Yilmaz A, Miller K, et al. Prevalence and Spectrum of Germline Cancer Susceptibility Gene Mutations Among Patients With Early-Onset Colorectal Cancer. JAMA Oncol (2017) 3 (4):464–71.

4. Aitchison A, Hakkaart C, Day RC, Morrin HR, Frizelle FA, Keenan JI. APC Mutations Are Not Confined to Hotspot Regions in Early-Onset Colorectal Cancer. Cancers (Basel) (2020) 12(12):3829.

5. Jasperson KW, Patel SG, Ahnen DJ. APC-Associated Polyposis Conditions. In: MP Adam, HH Ardinger, RA Pagon, SE Wallace, LJH Bean, K Stephens, editors. GeneReviews((R)). Seattle (WA): University of Washington, Seattle (1993).

6. Venkitaraman AR. Functions of BRCA1 and BRCA2 in the biological response to DNA damage. J Cell Sci (2001) 114(Pt 20):3591–8.

7. ChenS, Parmigiani G.Meta-analysis of BRCA1 and BRCA2 penetrance. J Clin Oncol (2007) 25(11):1329–33.

8. Huang, Wei, Jin Bian,  Lin Wang. 'Case Report: Coinheritance of Germline Mutations in APC and BRCA1 in Colorectal Cancer.' Frontiers in Oncology 11 (2021): 978.

關(guān)于燃石醫(yī)學(xué)

燃石醫(yī)學(xué)(納斯達(dá)克代碼:BNR)成立于2014年,公司使命為“用科學(xué)守護(hù)生命之光”,專注于為腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療提供具有臨床價(jià)值的二代基因測(cè)序(NGS)。公司業(yè)務(wù)及研發(fā)方向主要覆蓋:1)基于NGS的腫瘤患病人群檢測(cè),累計(jì)檢測(cè)樣本超過27萬例,在中國(guó)擁有領(lǐng)先的市場(chǎng)份額;2)基于NGS的癌癥早檢,目前已經(jīng)進(jìn)入臨床驗(yàn)證階段。燃石醫(yī)學(xué)于2018年7月獲國(guó)家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)頒發(fā)的中國(guó)腫瘤NGS檢測(cè)試劑盒第一證,在體外診斷領(lǐng)域具有里程碑式意義。位于中國(guó)廣州的實(shí)驗(yàn)室通過廣東省臨檢中心頒發(fā)的“高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)室”技術(shù)審核,獲得美國(guó)CLIA和CAP實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量體系資質(zhì)認(rèn)證;位于美國(guó)加利福尼亞州的實(shí)驗(yàn)室也已獲得CLIA和CAP實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量體系資質(zhì)認(rèn)證。公司將繼續(xù)致力于開發(fā)創(chuàng)新可靠的NGS檢測(cè)產(chǎn)品,推動(dòng)腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的發(fā)展。

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