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Nature:研究表明古人類腸道微生物種類更多

 PaperRSS 2021-05-13

密蘇里州-只有人類學(xué)家才能珍藏在干燥的洞穴中發(fā)現(xiàn)的具有千年歷史的人類糞便。

只需問問蒙大拿大學(xué)研究員兼UM人類學(xué)系聯(lián)席主席Meradeth Snow博士即可。

她是由哈佛醫(yī)學(xué)院附屬喬斯林糖尿病中心領(lǐng)導(dǎo)的一個國際團(tuán)隊(duì)的成員,該團(tuán)隊(duì)利用人類的“古糞便”發(fā)現(xiàn),與現(xiàn)代人相比,古代人類的腸道中存在著截然不同的微生物。

斯諾說,研究古代糞便中發(fā)現(xiàn)的腸道微生物可能為抗擊像糖尿病這樣的疾病提供線索,這些疾病困擾著當(dāng)今工業(yè)化社會中的人們。

斯諾說:“我們需要適當(dāng)比例的某些特定微生物,以使我們的身體有效運(yùn)作?!?/p>

密蘇里州-只有人類學(xué)家才能珍藏在干燥的洞穴中發(fā)現(xiàn)的具有千年歷史的人類糞便。

只需問問蒙大拿大學(xué)研究員兼UM人類學(xué)系聯(lián)席主席Meradeth Snow博士即可。

她是由哈佛醫(yī)學(xué)院附屬喬斯林糖尿病中心領(lǐng)導(dǎo)的一個國際團(tuán)隊(duì)的成員,該團(tuán)隊(duì)利用人類的“古糞便”發(fā)現(xiàn),與現(xiàn)代人相比,古代人類的腸道中存在著截然不同的微生物。

斯諾說,研究古代糞便中發(fā)現(xiàn)的腸道微生物可能為抗擊像糖尿病這樣的疾病提供線索,這些疾病困擾著當(dāng)今工業(yè)化社會中的人們。

斯諾說:“我們需要適當(dāng)比例的某些特定微生物,以使我們的身體有效運(yùn)作?!?/p>

“這是一種共生的關(guān)系。但是,當(dāng)我們今天研究地球上任何地方的人們時(shí),我們知道他們的腸道微生物群已受到我們現(xiàn)代世界的影響,無論是通過飲食,化學(xué)藥品,抗生素還是許多其他事物。所以要了解

腸道微生物組看起來像在工業(yè)化發(fā)生之前,可以幫助我們了解當(dāng)今腸道的不同之處?!?/p>

這項(xiàng)新研究于5月12日發(fā)表在著名的《自然》雜志上。

這篇文章的標(biāo)題是“從人類腸道重建古代微生物基因組”。

Snow和UM的研究生Tre Blohm是該論文的28位作者之一,來自世界各地的機(jī)構(gòu)。

斯諾說,他們研究的糞便來自猶他州和墨西哥北部的干燥洞穴。

那么,具有1000年歷史的人類排泄物是什么樣的呢?

她說:“這些古動物來自的洞穴以其驚人的保存而聞名。”

“隨著時(shí)間的流逝,通常會降解的東西看起來幾乎是全新的。因此,古糞便看起來很干,就像糞便一樣?!?/p>

Snow和Blohm親身實(shí)踐了這些珍貴的標(biāo)本,將它們安裝在UM的潔凈室實(shí)驗(yàn)室中,以免受到環(huán)境或任何其他微生物的污染-當(dāng)微小生物確實(shí)存在于所有事物之中時(shí),這并非一件容易的事。

他們會仔細(xì)收集一小部分,使他們能夠從其余材料中分離出DNA。

然后,布洛姆(Blohm)使用測序的DNA來確認(rèn)古糞便來自古代人。

《自然》雜志的資深作者是喬斯林糖尿病中心的Aleksandar Kostic。

在先前對生活在芬蘭和俄羅斯的兒童的研究中,他和他的伙伴們發(fā)現(xiàn),生活在工業(yè)化地區(qū)的兒童腸道菌群非常不同,工業(yè)化地區(qū)的兒童比非工業(yè)化地區(qū)的兒童更容易患上1型糖尿病。

Kostic說:“我們能夠鑒定出特定的微生物和微生物產(chǎn)品,我們認(rèn)為這些微生物和微生物產(chǎn)品妨礙了早期的適當(dāng)免疫教育?!?/p>

“這隨后導(dǎo)致不僅是1型糖尿病,而且還有其他自身免疫和過敏性疾病的高發(fā)事件?!?/p>

Kostic希望找到一種不受現(xiàn)代工業(yè)化影響的健康的人類微生物組,但是他堅(jiān)信,任何現(xiàn)代生活的人都不可能發(fā)生這種情況,他指出,即使是偏遠(yuǎn)亞馬遜地區(qū)的部落也正在感染COVID-19。

因此,當(dāng)研究人員轉(zhuǎn)向從北美西南部干旱環(huán)境中收集的樣本時(shí)。

將八個保存完好的古代腸道樣本的DNA與789個現(xiàn)代樣本的DNA進(jìn)行了比較。

現(xiàn)代樣本中有一半來自飲食飲食人群,其中大部分食物來自雜貨店,其余則來自食用非工業(yè)化食品的人,這些食物大多是在自己的社區(qū)種植的。

微生物組之間的差異是驚人的。

例如,研究小組分析的不是一種被稱為“工業(yè)化”人群的微生物,而是一種被稱為“梅毒螺旋體”的細(xì)菌,而是存在于八個古老微生物群中的每一個。

但是研究人員發(fā)現(xiàn),古老的微生物群確實(shí)與現(xiàn)代非工業(yè)化人群的微生物群更加匹配。

科學(xué)家發(fā)現(xiàn),幾乎40%的古代微生物物種以前從未見過。

Kostic對導(dǎo)致高遺傳變異性的原因進(jìn)行了推測:

Kostic說:“在古代文化中,您所吃的食物種類繁多,可以支持更多折衷的微生物?!?/p>

“但是,當(dāng)您朝著工業(yè)化和更多雜貨店飲食的方向邁進(jìn)時(shí),您會損失大量營養(yǎng),這些營養(yǎng)無法幫助支持更多樣化的微生物組?!?/p>

而且,古老的微生物種群摻入了與抗生素抗性相關(guān)的基因較少。

古代樣品還具有較少數(shù)量的基因,這些基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì)可降解腸道粘液層,然后可產(chǎn)生與各種疾病有關(guān)的炎癥。

斯諾(Snow)和幾位合著者以及博物館館藏經(jīng)理也領(lǐng)導(dǎo)了一個項(xiàng)目,以確保將土著觀點(diǎn)納入研究。

圖 蒙大拿大學(xué)的研究人員梅拉德斯·斯諾拿著一個裝有古代人類DNA的小瓶。

她說:“這是必須進(jìn)行這類研究的工作中至關(guān)重要的部分。”

“最初,我們發(fā)出了多封信和電子郵件,并召集了西南地區(qū)所有公認(rèn)部落的部落歷史保護(hù)官員。然后,我們遇到了感興趣的任何人,做了簡短的介紹并回答了問題,并與感興趣的各方進(jìn)行了跟進(jìn)。

她說:“我們收到的反饋是值得注意的,因?yàn)槲覀冃枰斡涍@些古動物必須與他們的祖先聯(lián)系在一起,我們需要-并希望一直-盡可能尊重他們?!?/p>

“長期以來濫用土著社區(qū)遺傳數(shù)據(jù)的歷史很久,我們努力與盡可能多的人會面和交談以獲取他們的見解和觀點(diǎn),以謹(jǐn)記這一點(diǎn)。我們希望這將為我們樹立先例

過去和現(xiàn)在,都是科學(xué)家和其他人與土著社區(qū)的遺傳物質(zhì)一起工作?!?/p>

斯諾說,這項(xiàng)研究總體上揭示了一些令人著迷的事情。

她說:“最大的發(fā)現(xiàn)是,過去的腸道微生物組比今天的更加多樣化-這種多樣性的喪失是我們在全世界人類中所看到的?!?/p>

“重要的是,我們必須更多地了解這些小微生物及其在共生關(guān)系中對我們的作用。

“最終,它可以使我們所有人更加健康?!?/p>

“這是一種共生的關(guān)系。但是,當(dāng)我們今天研究地球上任何地方的人們時(shí),我們知道他們的腸道微生物群已受到我們現(xiàn)代世界的影響,無論是通過飲食,化學(xué)藥品,抗生素還是許多其他事物。所以要了解

腸道微生物組看起來像在工業(yè)化發(fā)生之前,可以幫助我們了解當(dāng)今腸道的不同之處?!?/p>

這項(xiàng)新研究于5月12日發(fā)表在著名的《自然》雜志上。

這篇文章的標(biāo)題是“從人類腸道重建古代微生物基因組”。

Snow和UM的研究生Tre Blohm是該論文的28位作者之一,來自世界各地的機(jī)構(gòu)。

斯諾說,他們研究的糞便來自猶他州和墨西哥北部的干燥洞穴。

那么,具有1000年歷史的人類排泄物是什么樣的呢?

她說:“這些古動物來自的洞穴以其驚人的保存而聞名。”

“隨著時(shí)間的流逝,通常會降解的東西看起來幾乎是全新的。因此,古糞便看起來很干,就像糞便一樣?!?/strong>

Snow和Blohm親身實(shí)踐了這些珍貴的標(biāo)本,將它們安裝在UM的潔凈室實(shí)驗(yàn)室中,以免受到環(huán)境或任何其他微生物的污染-當(dāng)微小生物確實(shí)存在于所有事物之中時(shí),這并非一件容易的事。

他們會仔細(xì)收集一小部分,使他們能夠從其余材料中分離出DNA。

然后,布洛姆(Blohm)使用測序的DNA來確認(rèn)古糞便來自古代人。

《自然》雜志的資深作者是喬斯林糖尿病中心的Aleksandar Kostic。

在先前對生活在芬蘭和俄羅斯的兒童的研究中,他和他的伙伴們發(fā)現(xiàn),生活在工業(yè)化地區(qū)的兒童腸道菌群非常不同,工業(yè)化地區(qū)的兒童比非工業(yè)化地區(qū)的兒童更容易患上1型糖尿病。

Kostic說:“我們能夠鑒定出特定的微生物和微生物產(chǎn)品,我們認(rèn)為這些微生物和微生物產(chǎn)品妨礙了早期的適當(dāng)免疫教育?!?/p>

“這隨后導(dǎo)致不僅是1型糖尿病,而且還有其他自身免疫和過敏性疾病的高發(fā)事件?!?/p>

Kostic希望找到一種不受現(xiàn)代工業(yè)化影響的健康的人類微生物組,但是他堅(jiān)信,任何現(xiàn)代生活的人都不可能發(fā)生這種情況,他指出,即使是偏遠(yuǎn)亞馬遜地區(qū)的部落也正在感染COVID-19。

因此,當(dāng)研究人員轉(zhuǎn)向從北美西南部干旱環(huán)境中收集的樣本時(shí)。

將八個保存完好的古代腸道樣本的DNA與789個現(xiàn)代樣本的DNA進(jìn)行了比較。

現(xiàn)代樣本中有一半來自飲食飲食人群,其中大部分食物來自雜貨店,其余則來自食用非工業(yè)化食品的人,這些食物大多是在自己的社區(qū)種植的。

微生物組之間的差異是驚人的。

例如,研究小組分析的不是一種被稱為“工業(yè)化”人群的微生物,而是一種被稱為“梅毒螺旋體”的細(xì)菌,而是存在于八個古老微生物群中的每一個。

但是研究人員發(fā)現(xiàn),古老的微生物群確實(shí)與現(xiàn)代非工業(yè)化人群的微生物群更加匹配。

科學(xué)家發(fā)現(xiàn),幾乎40%的古代微生物物種以前從未見過。

Kostic對導(dǎo)致高遺傳變異性的原因進(jìn)行了推測:

Kostic說:“在古代文化中,您所吃的食物種類繁多,可以支持更多折衷的微生物?!?/strong>

“但是,當(dāng)您朝著工業(yè)化和更多雜貨店飲食的方向邁進(jìn)時(shí),您會損失大量營養(yǎng),這些營養(yǎng)無法幫助支持更多樣化的微生物組?!?/p>

而且,古老的微生物種群摻入了與抗生素抗性相關(guān)的基因較少。

古代樣品還具有較少數(shù)量的基因,這些基因產(chǎn)生的蛋白質(zhì)可降解腸道粘液層,然后可產(chǎn)生與各種疾病有關(guān)的炎癥。

斯諾(Snow)和幾位合著者以及博物館館藏經(jīng)理也領(lǐng)導(dǎo)了一個項(xiàng)目,以確保將土著觀點(diǎn)納入研究。

她說:“這是必須進(jìn)行這類研究的工作中至關(guān)重要的部分?!?/p>

“最初,我們發(fā)出了多封信和電子郵件,并召集了西南地區(qū)所有公認(rèn)部落的部落歷史保護(hù)官員。然后,我們遇到了感興趣的任何人,做了簡短的介紹并回答了問題,并與感興趣的各方進(jìn)行了跟進(jìn)。

她說:“我們收到的反饋是值得注意的,因?yàn)槲覀冃枰斡涍@些古動物必須與他們的祖先聯(lián)系在一起,我們需要-并希望一直-盡可能尊重他們?!?/p>

“長期以來濫用土著社區(qū)遺傳數(shù)據(jù)的歷史很久,我們努力與盡可能多的人會面和交談以獲取他們的見解和觀點(diǎn),以謹(jǐn)記這一點(diǎn)。我們希望這將為我們樹立先例

過去和現(xiàn)在,都是科學(xué)家和其他人與土著社區(qū)的遺傳物質(zhì)一起工作?!?/p>

斯諾說,這項(xiàng)研究總體上揭示了一些令人著迷的事情。

她說:“最大的發(fā)現(xiàn)是,過去的腸道微生物組比今天的更加多樣化-這種多樣性的喪失是我們在全世界人類中所看到的?!?/strong>

“重要的是,我們必須更多地了解這些小微生物及其在共生關(guān)系中對我們的作用。

“最終,它可以使我們所有人更加健康?!?/strong>

來源:

https://www./news/2021/05/051221pale.php

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