易點(diǎn)評

在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中，除了少數(shù)可識別的生物標(biāo)志物外，循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)在檢測突變和監(jiān)測治療效果方面的作用尚未得到很好的研究。因此本文對比了在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)病例中，檢測循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)與實(shí)體瘤活檢的差異。研究表明，無論患者的臨床狀態(tài)如何，ctDNA都可以通過識別特定的突變來獲取相關(guān)信息。因此，ctDNA可以在癌癥管理和監(jiān)測中為組織活檢提供補(bǔ)充信息，并在組織活檢無法實(shí)現(xiàn)的情況下進(jìn)行檢測，這為癌癥的治療研究做出了巨大貢獻(xiàn)。

研究背景

盡管在過去的十年中癌癥的治療取得了一定進(jìn)展，但因患肺癌而死亡的人數(shù)仍在不斷攀升。非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)占所有肺癌病例的85%，并且其對化療具有一定的抗藥性。盡管EGFR和ALK酪氨酸激酶抑制劑(TKIs)等靶向療法常用于非小細(xì)胞肺癌的治療，但由于基因亞群的不同，腫瘤的異質(zhì)性限制了靶向治療的效果。雖然組織活檢被認(rèn)為是指導(dǎo)癌癥治療的金標(biāo)準(zhǔn)，但由于轉(zhuǎn)移性疾病患者病情的不斷惡化，組織活檢往往會(huì)有成本高、痛苦、風(fēng)險(xiǎn)大等缺點(diǎn)。此外，組織活檢必然會(huì)受到空間異質(zhì)性的影響。眾所周知，腫瘤會(huì)將無細(xì)胞循環(huán)DNA(CfDNA)釋放到血液中，因此對血漿樣本進(jìn)行檢測可能是實(shí)體瘤組織活檢的替代方法。檢測這些無細(xì)胞循環(huán)腫瘤DNA(CtDNA)，也稱為液體活檢，是細(xì)胞外DNA的短片段(160-180bp)，被認(rèn)為是凋亡的腫瘤細(xì)胞被酶降解的產(chǎn)物。大多數(shù)使用ctDNA治療NSCLC患者的回顧性研究都集中在單個(gè)基因的體細(xì)胞突變(通常在EGFR基因中)和相應(yīng)的靶向治療之間的關(guān)系。除了EGFR突變和EGFR靶向TKIs的臨床反應(yīng)之外，液體活檢在轉(zhuǎn)移性肺癌中的作用還沒有被探索。此外，在腫瘤及其非小細(xì)胞肺癌ctDNA樣本中，常規(guī)使用ctDNA檢測來監(jiān)測生物標(biāo)志物以確定突變的臨床有效性是有限的。最近的一項(xiàng)大范圍的ctDNA研究報(bào)道了ctDNA檢測中耐藥突變的鑒定頻率和分布與組織活檢相似，并提出ctDNA在組織活檢缺乏的情況下可以作為潛在地首要生物標(biāo)志物。因此，本研究評估了來自COH癌癥中心的回顧性NSCLC數(shù)據(jù)，來達(dá)到以下目的：i)體細(xì)胞突變及其在評估預(yù)后中的作用；ii)組織和ctDNA樣本之間的一致性；iii)通過重復(fù)的ctDNA采樣發(fā)現(xiàn)的癌癥的進(jìn)展過程。

實(shí)驗(yàn)方法

對2015年11月至2019年8月在COH接受治療的370例成人非小細(xì)胞肺癌病例進(jìn)行回顧性分析，以評估ctDNA在突變鑒定、生存期預(yù)測、腫瘤進(jìn)展以及32個(gè)基因與組織樣本一致性等方面的應(yīng)用。

實(shí)驗(yàn)結(jié)果

ctDNA突變分析在370例NSCLC病例的473份ctDNA樣本中，共檢測到1688個(gè)體細(xì)胞突變。同時(shí)，473個(gè)樣本中，有177個(gè)在FDA批準(zhǔn)的非小細(xì)胞肺癌療法中有至少一個(gè)可操作突變。同時(shí)，MET和CDK6擴(kuò)增與BRAF擴(kuò)增會(huì)同時(shí)出現(xiàn)。

組織和ctDNA樣本之間的一致性 通過ctDNA檢測到的SNV、INDELs和擴(kuò)增比通過組織活檢檢測到的更多。并且，在匹配的樣本中，ctDNA樣本10個(gè)目標(biāo)基因中的突變數(shù)量高于組織活檢。這說明在ctDNA中發(fā)現(xiàn)的靶基因突變比在組織活檢中發(fā)現(xiàn)的更多。

腫瘤的異質(zhì)性和發(fā)展進(jìn)程對患者進(jìn)行奧西美替尼治療后，組織活檢中未檢測到EGFR T790M突變，但在ctDNA中檢測到了突變。患者G8的EGFR和KRAS突變與組織活檢相比，在四個(gè)ctDNA樣本中均未檢測到。因此，雖然ctDNA檢測經(jīng)常在患者G1、G9、G59和G220中發(fā)現(xiàn)可操作突變，但它在檢測患者G8中對突變的檢測是有限的。這表明在ctDNA樣本中檢測出的突變是隨著治療過程和腫瘤進(jìn)展而變化的。

結(jié)論

雖然ctDNA表現(xiàn)出與組織活檢相似的作用，但在組織活檢中漏掉了更多的靶向基因突變。因此，將組織活檢與ctDNA評估結(jié)合起來，可能有助于檢測更多的靶向突變，以改善晚期非小細(xì)胞肺癌的臨床預(yù)后。

公司介紹

深圳市易基因科技有限公司（E-GENE）是位于深圳市坪山區(qū)的國家高新技術(shù)企業(yè)。公司主營業(yè)務(wù)包括組學(xué)技術(shù)和大數(shù)據(jù)分析及精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)檢測兩大板塊，涵蓋生命科學(xué)研究、高通量測序和體外診斷等領(lǐng)域。

基于公司在生命組學(xué)與大數(shù)據(jù)信息技術(shù)領(lǐng)域的深厚技術(shù)與資源積累，易基因建設(shè)了易基因云、腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)及AI檢索與標(biāo)志物挖掘算法系統(tǒng)，在癌癥早篩早診、伴隨診斷與輔助診斷、用藥指導(dǎo)等方向進(jìn)行系列產(chǎn)品開發(fā)，目前已經(jīng)研發(fā)成功了一系列基于DNA甲基化的針對多個(gè)癌種的早期預(yù)警和預(yù)后監(jiān)測標(biāo)志物產(chǎn)品。同時(shí)，公司還自主開發(fā)了血漿游離DNA甲基化高通量測序文庫試劑盒、靶向血漿游離 DNA甲基化測序等技術(shù)，結(jié)合易基因的信息系統(tǒng)與研發(fā)平臺(tái)，提供國際領(lǐng)先的科研和技術(shù)產(chǎn)品服務(wù)。還能夠?yàn)樯镝t(yī)藥公司、高等院校、醫(yī)院和科研院所等提供體外診斷標(biāo)志物篩選、開發(fā)與驗(yàn)證，藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)等研發(fā)外包服務(wù)。公司與國內(nèi)外多家知名企業(yè)和單位建立了戰(zhàn)略合作關(guān)系，共同致力于為生物醫(yī)藥領(lǐng)域提供性能卓越的產(chǎn)品和優(yōu)質(zhì)的服務(wù)。如果您有任何醫(yī)療、科研上的問題和需求請聯(lián)系我們！

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