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Cell重磅:十年磨一劍,科學(xué)家成功合成出可正常生長分裂的 “人造細胞”

 學(xué)術(shù)頭條 2021-03-30

細胞通常被稱為生命的基本結(jié)構(gòu),也正是這一稱呼讓很多人誤以為細胞是一種非常簡單的結(jié)構(gòu)。事實上,細胞的機構(gòu)非常復(fù)雜,其中數(shù)以萬計的基因以及胞質(zhì)中無數(shù)小分子和細胞器如何協(xié)調(diào)以執(zhí)行基本的生命功能維持生命,到現(xiàn)在人類也沒有弄清楚其中的機制。

以前,生物學(xué)的研究始終致力于自上而下,即細胞組成和基因如何作用,其功能如何。而現(xiàn)在,生物學(xué)技術(shù)的進步可以使研究人員采用自下而上的策略,重建細胞生物過程,即所謂的人工細胞合成。

人工細胞的合成對于科學(xué)家理解生命與基因的奧秘具有重要意義。20 多年以來,人們一直在嘗試在實驗室中,通過將一些生物分子拼湊起來從而創(chuàng)造出可以自主控制、代謝、維持生命的人造細胞。

而現(xiàn)在,這一努力終于取得了重要突破。近日,來自美國 J. Craig Venter 研究所(JCVI),美國國家標準與技術(shù)研究院(NIST)以及麻省理工學(xué)院(MIT)的研究人員合作,成功創(chuàng)造出了一個非常簡單的人工合成細胞,該細胞可以正常生長和分裂。

該研究于 2021 年 3 月 29 日在線發(fā)表在頂級期刊《細胞》雜志。

對此,本文共同作者,NIST 細胞工程小組負責(zé)人,Elizabeth Strychalski 教授表示,“人工細胞合成的目的是為了更好地了解生命的運行模式,我們希望能通過人工細胞合成來了解每個基因的功能。不過,目前我們的了解仍舊是冰山一角,生命依舊是一個黑匣子”。

圖 | JCVI-syn3A 合成細胞在光學(xué)顯微鏡下生長和分裂的過程(來源: E. Strychalski/NIST and J. Pelletier/MIT

人工合成細胞,從夢想到現(xiàn)實

在化學(xué)領(lǐng)域,一旦化學(xué)家確定了某一新化合物的化學(xué)結(jié)構(gòu),下一步的關(guān)鍵就是嘗試人工合成該化學(xué)物質(zhì),并證明合成物質(zhì)和天然物質(zhì)具有相同功能。然而,此前,這一模式在生物學(xué)上從未實現(xiàn)。雖然,人類以及確定了 DNA 的結(jié)構(gòu)和排列順序,但從來沒有人獨立合成并驗證過這其功能。

2003 年,人類基因組計劃提前結(jié)束,基因組科學(xué)進一步發(fā)展,人類對于生物世界的探索更進一步。通過 A、T、G、C 四個字母的順序,人們可以輕松閱讀各種生命的遺傳密碼。那么,在此基礎(chǔ)上,人類能否更進一步,人工合成相關(guān)基因并激活其功能呢?

2010 年,來自 JCVI 的研究人員,在 Craig Venter、Hamilton Smith 以及 Clyde Hutchison 博士的帶領(lǐng)下,終于邁出了關(guān)鍵的一步。他們利用支原體,通過人工破壞支原體的 DNA,并用人工合成的 DNA 替代,成功創(chuàng)造了人類歷史上首個人工合成基因組細胞。這個細胞隨后被命名為 JCVI-syn1.0。

第一個人工合成基因組細胞的創(chuàng)建并不容易,這一工作耗費了 JCVI 研究所 20 多名科研人員近 15 年的時間。期間,他們開發(fā)了大量的新技術(shù)和新工具來構(gòu)建遺傳密碼,并學(xué)習(xí)如何移植基因組,將一個物種變?yōu)榱硪晃锓N。據(jù)悉,首個人工合成細胞的基因組由 108 萬個堿基組成,是當時實驗室合成最大的化學(xué)結(jié)構(gòu)。

隨后,科學(xué)家們便一直努力將該人工合成的細胞優(yōu)化,盡可能降低其堿基數(shù)目,并嘗試全人工合成細胞。直到 2016 年,JCVI 的研究人員在 Craig Venter 博士等人的帶領(lǐng)下,首次創(chuàng)造出了最簡單的人造合成細胞,其基因組是迄今為止最小的,僅包含 473 個基因,這一細胞被命名為 JNCI-syn3.0。相比之下,人類細胞的基因數(shù)量超過 2 萬個。

不過,即便只有 473 個基因,該人工合成細胞依然能夠維持生命的基本活動,并具有自我復(fù)制能力。對于這一研究結(jié)果,Craig Venter 博士曾表示,“生命是如此復(fù)雜且神奇。事實上,哪怕是僅包含 473 個基因的如此簡單的細胞,我們依舊無法完全確定其每個基因的功能。顯然,生命是一曲交響樂,而不僅僅多個基因功能的組合”。

十年磨一劍,首個可正常生長分裂人造細胞問世

現(xiàn)在,人造細胞的合成已不再困難,只需 8 種成分:2 種蛋白、3 種緩沖劑、2 種脂肪和一些能量物質(zhì),就可以創(chuàng)建一個基本的類細胞結(jié)構(gòu)。5 年前,研究人員雖然成功合成了人類歷史上最簡單的活細胞,但是,該細胞在生長和分裂時表現(xiàn)異常,產(chǎn)生的都是形狀和大小完全不同的細胞。

隨后,在 John Glass 博士的領(lǐng)導(dǎo)下,JCVI 的合成生物學(xué)小組花費了近 5 年時間,終于找到了 7 個基因,可以幫助調(diào)節(jié)細胞的增殖和生長。隨后,研究人員通過系統(tǒng)的添加和刪除基因,構(gòu)建了數(shù)十種變異株,并觀察不同基因變化對于細胞生長和分裂的影響如何。

而在這一研究中,NIST 的作用就是通過顯微鏡觀察細胞生長和分裂。雖然,用顯微鏡觀察死細胞是一件非常容易的事情。但是,通過顯微鏡觀察活細胞則是一項艱巨的挑戰(zhàn)。因為,在實驗中,活細胞非常小巧且很難被固定,輕微的撕扯都會對其造成致命損傷。

為了解決這個問題,NIST 細胞工程組負責(zé)人 Strychalski 博士和 MIT 的 James Pelletier,Andreas Mershin 和 Neil Gershenfeld 博士設(shè)計了一種微流控恒溫裝置。這一裝置可以協(xié)調(diào)微小細胞的運動,使其在光學(xué)顯微鏡下任意移動,并保持正常的生命活動。通過這一技術(shù),人們對 5 年前創(chuàng)建的 JCVI-syn3.0 細胞進行了觀察,結(jié)果發(fā)現(xiàn),其增殖后的細胞形狀和大小均不同,不過基因組仍舊是相同的。

圖 | 合成 JCVIsyn3.0 在光學(xué)顯微鏡下生長和分裂

通過這一技術(shù),研究人員最終發(fā)現(xiàn),在向 JCVI-syn3.0 細胞中加入了 19 個基因后(包含 7 個調(diào)控生長增殖的基因),合成的新細胞 JCVI-syn3A,可以實現(xiàn)正常的分裂增殖。

圖 | 合成細胞 JCVI-syn3A 的圖示(來源:Emily Pelletier)

對此,Pelletier 博士表示,“我們的目標是了解每個基因的功能,以便開發(fā)出一個完整的人造細胞。然而,這個目標本次試驗尚未完成,在我們添加到其中的控制正常分裂的 7 個基因,僅有 2 個基因的功能是明確的,剩余 5 個基因的作用依舊不清楚”。

參考資料:

https://www./cell/fulltext/S0092-8674 (21) 00293-2

https://www./news-events/news/2021/03/scientists-create-simple-synthetic-cell-grows-and-divides-normally

https://www./pub_releases/2021-03/nios-scs032221.php

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