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染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也稱結(jié)合位點分析法，是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的有力工具，通常用于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。 實驗流程 （1）甲醛交聯(lián)整個細胞系（組織），即將目標(biāo)蛋白與染色質(zhì)連結(jié)起來；（這一步一般會檢測下交聯(lián)情況） （2）分離基因組DNA，并用超聲波將其打斷成一定長度的小片段； （3）添加與目標(biāo)蛋白質(zhì)特異的抗體，該抗體與目標(biāo)蛋白形成免疫沉淀免疫結(jié)合復(fù)合體；（chip級別的抗體，會有效率問題存在，很考驗抗體質(zhì)量和操作） （4）去交聯(lián)，純化DNA即得到染色質(zhì)免疫沉淀的DNA樣本，準(zhǔn)備測序； （5）將準(zhǔn)備好的樣本進行深度測序（一般會準(zhǔn)備空白對照，排除假陽性，有兩種，1.input DNA：不用任何抗體拉的DNA；2.mock IP DNA：用不含有抗體的DNA） 優(yōu)缺點      |
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