干貨：一個PubMed賬號可以有這么多用處！

小夢想在努力 2019-09-05

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且不說撰寫一個綜述類文章，就連平時的課題設(shè)計和匯報，都是動輒幾十篇文獻(xiàn)以上，那么，該如何管理這么多文獻(xiàn)呢？

筆者認(rèn)為，一個PubMed賬號足矣。

我們都知道，在生物醫(yī)藥領(lǐng)域，PubMed這個文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫的重要程度不言而喻，一是它綜合了各SCI期刊發(fā)表的期刊信息，二是在綜合信息的基礎(chǔ)上，專家們將個期刊文獻(xiàn)進(jìn)行分類、加標(biāo)注，大大減少了文獻(xiàn)搜索的技術(shù)難度和信息混雜度，三是，最重要的一點(diǎn)，資源豐富還免費(fèi)。而這三點(diǎn)，正是PubMed成為了我們科研生活必不可少的“伴侶”的原因。

而PubMed的原始使用界面，并不太友好，對篩選高質(zhì)量文獻(xiàn)、文獻(xiàn)管理、文獻(xiàn)更新等需求難以滿足。相信這也是蠻多同學(xué)剛接觸時的共識，筆者也一樣。可當(dāng)筆者接觸多的時候，越發(fā)覺得，其實(shí)PubMed是真的好用，只是我們都需要一個東西：PubMed賬號。

一、PubMed賬號

在PubMed首頁，點(diǎn)擊Sign in to NCBI，先注冊個賬號。事實(shí)上，PubMed只是NCBI的眾多數(shù)據(jù)庫之一，所以，為了便于記憶，就把NCBI賬號成為PubMed賬號了。

有了PubMed賬號，才能有了下面操作。

二、文獻(xiàn)IF篩選

文獻(xiàn)的質(zhì)量與期刊IF的高低往往成正比。但PubMed的原始界面沒有。

所以，我們得設(shè)置一個，幾個，或者更多。再審一次，有PubMed賬號就可以操作。

首先，上個網(wǎng)址：https://www./tools/issn.html

按自己的想法輸入相應(yīng)的IF范圍，操作即可。

在獲得PubMed的filter條件文本后，打開PubMed首頁，點(diǎn)擊my NCBI，看到Filters一欄，點(diǎn)manage Filters，進(jìn)入條件創(chuàng)建界面，按操作進(jìn)行即可。

特別注意，添加自己創(chuàng)建的Filters后，還需要Active一下。這樣，這些條件才能在文獻(xiàn)搜索界面正常使用。

這樣，就能開心的耍了。

三、文獻(xiàn)管理

文獻(xiàn)，早已不是什么珍稀的存在，早已爛大街了，一年幾百萬量級的發(fā)表，實(shí)在是看不過來。

雖說量多，不一定意味著自己的閱讀量也得跟著上去，但平時的課題設(shè)計、匯報啥的，基本還是需要十來幾十篇的。那么，問題來了：

1.一次需要閱讀文獻(xiàn)的數(shù)量較多時，如何管理？

2.當(dāng)匯報后一段時間，想重拾這一次的文獻(xiàn)總結(jié)，可多次的匯報文獻(xiàn)已堆積如山，如何處理？

3.再一個，如果忽然想起這次的某一篇文獻(xiàn)非常相關(guān)，可不知從哪里找，該怎么處理？

試下PubMed的Collection功能，賊棒。Collection好比是我們使用瀏覽器的書簽欄，在這里面，我們可以建立各種小書簽（如tp53-Cancer等），每個小書簽里面可以包含多篇自己感興趣的文獻(xiàn)。而且，只要你的PubMed賬號在，它就在，相當(dāng)于幫我們的文獻(xiàn)同步到了云端。

當(dāng)我們再次想找某篇文獻(xiàn)時，通過這樣的途徑，筆者相信是事半功倍的。

Ok，大概介紹完畢，接下來，看下操作。

在文獻(xiàn)搜索界面，send to的功能強(qiáng)大，其中一項(xiàng)，就是可以將感興趣的文獻(xiàn)，統(tǒng)統(tǒng)收藏到自己創(chuàng)建的collection里面，或PubMed默認(rèn)的Favorite里面。建議各位創(chuàng)建自己喜歡的還便于分類尋找的collection，這會便于以后的科研工作的文獻(xiàn)管理。

點(diǎn)擊“Add to Collections”后，會得到以下界面。

就看自己的喜歡了，記得Save就好。

同樣的，為了確認(rèn)下文獻(xiàn)是否真的感興趣，我們通常需要看下Abstract部分。在單個文獻(xiàn)界面，同樣可以操作收藏到collection里面，兩個選擇，一是send to，二是Save items。建議Save items，操作更為簡單。

我們所有的Collection，在My NCBI里面，均可看到。點(diǎn)擊其中的collection名，即可瀏覽這個collection里面的收藏的文獻(xiàn)了。

四、批量文獻(xiàn)導(dǎo)入Endnote

不知各位，在用Endnote時，是如何把那么多文獻(xiàn)的信息導(dǎo)入到里面，一篇一篇來？

筆者的話，則是基于PubMed。這算是Collection的又一絕技，可以將我們感興趣的文獻(xiàn)一次性的生成Endnote可識別的文件，進(jìn)而大批量導(dǎo)入到Endnote的一次搞定，寫起論文來，倍兒爽。

看下操作。操作也簡單，先進(jìn)My NCBI，點(diǎn)擊要操作的collection，進(jìn)入收藏文獻(xiàn)的界面，接著send to到Citation Manager，設(shè)置好導(dǎo)出數(shù)量啥的，然后點(diǎn)擊Create File，即生成引用文件。提醒下，要清楚存放Citation文件的位置，方便Endnote的后續(xù)導(dǎo)入。

接著，導(dǎo)入到Endnote即可。提醒一下，Import Option須選PubMed，以免發(fā)生導(dǎo)入不進(jìn)去的情況。

五、及時跟進(jìn)最新的相關(guān)文獻(xiàn)

這是PubMed的又一便利，利用Alert去提醒我們，在我們創(chuàng)建的特定搜索條件下，有哪些新文獻(xiàn)被納入了進(jìn)來。

這樣，就不用我們天天都得刷下PubMed，看看有沒有更新，而是PubMed第一時間主動給我們發(fā)郵件提醒，可謂暖心。

操作如下，在我們搜索結(jié)果界面的搜索框下，有個Create Alert，點(diǎn)擊進(jìn)去，填下我們偏好的信息，如更新頻率啥的，然后Save即可。

事實(shí)上，當(dāng)擁有一個PubMed賬號的時候，筆者發(fā)現(xiàn)，很多事情是可以系統(tǒng)、更有效率的作業(yè)的，如利用Collection收藏文獻(xiàn)，然后大量文獻(xiàn)一次性導(dǎo)出，再到Endnote。

以上。

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