上節(jié)教程結(jié)束后，有同學(xué)問：我每次用R語言解決實(shí)際問題的時(shí)候都要像第3節(jié)中那樣用鍵盤將每個(gè)數(shù)據(jù)輸入電腦里面嗎？答案當(dāng)然是否定的。R語言給我們配套了多種輸入數(shù)據(jù)的方法和接口，能夠快速靈活的處理多種格式的數(shù)據(jù)（如圖1）。這節(jié)課的主要內(nèi)容就是R語言中數(shù)據(jù)的輸入。

圖1:R語言數(shù)據(jù)輸入的示意圖

下面來逐一學(xué)習(xí)不同的數(shù)據(jù)導(dǎo)入方法。

在上一次的學(xué)習(xí)中，大家已經(jīng)接觸了很多了創(chuàng)建不同類型變量的方法，這里再給大家提供幾個(gè)從鍵盤輸入數(shù)據(jù)的方法。如圖2、圖3、圖4所示：

圖2:函數(shù)read.table()的鍵盤輸入用法

圖3:函數(shù)fix()的使用（1）

圖4：函數(shù)fix()的使用（2）

第一種方法是在創(chuàng)建data.txt字符串之后，用函數(shù)read.table()創(chuàng)建數(shù)據(jù)框data.1。這種用法可以讓我們把數(shù)據(jù)嵌入R代碼中去。此處切記，read.table()函數(shù)是我們最為常用的讀取外部數(shù)據(jù)的函數(shù)，下文還會(huì)詳細(xì)解讀。

第二種方法是用函數(shù)fix()創(chuàng)建了一個(gè)和data.1一樣的數(shù)據(jù)框data.2，函數(shù)edit()也有同樣的效果，大家可以在幫助文檔里面找一下函數(shù)edit()的具體用法。

這些在處理一些小數(shù)據(jù)集的時(shí)候是很有效的，但是面對(duì)大數(shù)據(jù)的問題就力不從心了，并且也不夠靈活，而下面要介紹的方法就是要解決這兩個(gè)問題。

在上文的第一種方法中，函數(shù)read.table()是從鍵盤輸入的字符串變量里面創(chuàng)建數(shù)據(jù)框的，這種方法并不適用，實(shí)際上read.table()函數(shù)的功能要更加強(qiáng)大一些。函數(shù)read.table()更加常用的是從帶有分隔符的文本文件中讀入數(shù)據(jù)并創(chuàng)建數(shù)據(jù)框（實(shí)際上csv文件就是常見的帶分隔符的文本文件，其分隔符是逗號(hào)“，”，csv文件可以通過文本編輯器或者excel軟件創(chuàng)建，也可以是perl、python腳本的輸出結(jié)果）。

在Rstduio中輸入read之后會(huì)自動(dòng)聯(lián)想出函數(shù)read.table()、read.csv()和read.csv2()，這三個(gè)函數(shù)的用法比較接近，這里就只介紹read.table()，另外兩個(gè)函數(shù)大家可以自己嘗試。

可能有些同學(xué)已經(jīng)發(fā)現(xiàn)在R的幫助文檔里面，函數(shù)read.table()的參數(shù)很多，看上去很復(fù)雜，不用擔(dān)心，實(shí)際使用中我們需要調(diào)整的參數(shù)并不多，下面列出了一些關(guān)鍵的參數(shù)用法：

表1:函數(shù)read.table()的參數(shù)及用法

以文件example.csv為例（測(cè)試數(shù)據(jù)見文末，聯(lián)系胖雨小姐姐可得）來演示一下，文件中以逗號(hào)作分隔符，每個(gè)數(shù)據(jù)都用雙引號(hào)圍住。

圖5:example的一部分?jǐn)?shù)據(jù)

文件example.csv里面前7行是主體數(shù)據(jù)的注釋，第一列是基因名。如果直接用函數(shù)read.table()讀取，如圖6。

圖6:直接讀取的示意圖

圖7:調(diào)整參數(shù)之后的示意圖

可以看到圖6中的讀取效果并不理想，在圖7中，加上skip和row.names兩個(gè)參數(shù)之后，數(shù)據(jù)就顯得有條理了。函數(shù)read.table()還有很多其他的參數(shù)，感興趣的同學(xué)可以多嘗試一下。

對(duì)于平時(shí)更多使用excel軟件的同學(xué)而言，xlsx格式的表格文件比csv要更常見，所以這里也提一下怎么把xlsx文件導(dǎo)入R語言（其實(shí)在excel軟件包里面，大家可以直接把xlsx文件另存為csv文件，就可以直接用函數(shù)read.table()、read.csv()和read.csv2()了）。

在有些R語言教程中，推薦了R包xlsx，但是這個(gè)包依賴與xlsxjars和rJava包（關(guān)于R包的內(nèi)容，請(qǐng)參考前期文章：挖掘GEO速成SCI文章系列教程（3）-R語言基礎(chǔ)），以及一個(gè)正常工作的Java，安裝起來較為麻煩。

這里我給大家推薦一個(gè)不需要這些依賴的R包：openxlsx（openxlsx包的安裝如圖8）。openxlsx包的幫助文檔里介紹了三個(gè)寫入數(shù)據(jù)和一個(gè)讀取數(shù)據(jù)的函數(shù)，其中讀取數(shù)據(jù)的函數(shù)read.xlsx()就能實(shí)現(xiàn)xlsx文件的讀取。這個(gè)函數(shù)的命名和用法都和read.table()非常類似（如圖9），大家不妨自己嘗試一下如何使用這個(gè)函數(shù)。

圖8:包openxlsx的安裝

圖9:函數(shù)read.xlsx()的參數(shù)

讀取數(shù)據(jù)之后，大家就可以開始做一些簡單的數(shù)據(jù)處理了。R語言中有很多常用的函數(shù)，這里先給大家一個(gè)簡短的表格，供大家在讀取數(shù)據(jù)后做一些練習(xí)。一些更加復(fù)雜的函數(shù)在下次再集中給大家介紹。

小結(jié)

實(shí)際上數(shù)據(jù)的讀取只是R語言的冰山一角，但是也是開始一個(gè)數(shù)據(jù)分析項(xiàng)目的不可或缺的一步。上面只介紹了三種數(shù)據(jù)輸入的方法，也是大家在自己項(xiàng)目中最可能遇到的情況，R語言還可以讀取XML、網(wǎng)頁、數(shù)據(jù)庫（MySQL、Oracle等等）、SPSS和SAS等數(shù)據(jù)，篇幅有限，就不一一介紹了，如果有同學(xué)需要這方面的幫助，我們也可以單獨(dú)再出一期和大家交流一下。當(dāng)然，大家在數(shù)據(jù)準(zhǔn)備和輸入過程也可能會(huì)遇到很多問題，歡迎和我們一起交流討論。

文末有本節(jié)課程的測(cè)試數(shù)據(jù)和代碼哦~~

最后跟大家嘮幾句：任何事物的學(xué)習(xí)都要循序漸進(jìn)，一口吃不了個(gè)胖子，希望大家能夠沉下心來，力爭每節(jié)課都能掌握，這樣等到最后課程結(jié)束的時(shí)候，再回過來看，你會(huì)突然發(fā)現(xiàn)，自己已經(jīng)掌握了R語言的精髓?？傊?，希望隨著課程的推進(jìn)，希望大家每天都有所收獲。