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56 CNV Illucide實現(xiàn)任意基因和區(qū)域CNV鑒定

 生物_醫(yī)藥_科研 2019-07-10

如何確證上述遺傳學(xué)信息?

MLPA?

要么實驗室沒試劑盒,訂購需要1-2個月,時間等不起,要么就根本沒有對應(yīng)的檢測產(chǎn)品。

Microarray?

成本太高、分辨率太低,無法滿足需求。

qPCR?

Taqman探針成本太高,染料法靈敏度有限。

CNV Illucide

助力拷貝數(shù)變異精準(zhǔn)鑒別和突變來源確證

數(shù)字PCR金標(biāo)準(zhǔn)儀器

CNV Illucide(基于數(shù)字PCR技術(shù))

·3個探針設(shè)計 

·自主研發(fā)同管內(nèi)參(CV值低于0.1) 

·各種靶標(biāo)機動靈活,適用各種隨機區(qū)域

雙靶標(biāo)ddPCR技術(shù)原理

雙靶標(biāo)優(yōu)勢:

內(nèi)參和靶標(biāo)在同一反應(yīng)管,最大程度避免孔間差異對于實驗結(jié)果影響。

方法學(xué)穩(wěn)定性

雙靶標(biāo)數(shù)字PCR方法具有很好的靶標(biāo)間穩(wěn)定性(SD=0.085)

外顯子CNV檢測案例

臨床信息:

認知落后,運動協(xié)調(diào)性異常,牙體小,不出汗,痛覺低,有自傷行為(咬手指)智力稍落后,外染色體核型分析無異常

NGS檢測結(jié)果:

遺傳性感覺和自主神經(jīng)病4型相關(guān)基因NTRK1存在5-6號外顯子純合缺失,HPO表型高度吻合。

EGIS系統(tǒng)Exon CNV分析結(jié)果

CNV Illucide檢測結(jié)果:

先證者純合缺失突變分別來自父母雙方。

CNV Illucide驗證結(jié)果

染色體CNV檢測案例

臨床信息:

患兒特殊面容,三角鼻,牙齒稀疏,排列整齊,體質(zhì)差,易感冒,有先心病。

NGS檢測結(jié)果:

11q24.3-11q25 區(qū)域檢測到約3.4Mb大小的雜合缺失,在11q23.3-11q24.3區(qū)域檢測到約14Mb大小的雜合重復(fù)。

EGIS系統(tǒng)Chr CNV分析結(jié)果

CNV Illucide檢測結(jié)果:

兩處染色體拷貝數(shù)變異均為新發(fā)變異。

CNV Illucide驗證結(jié)果

可實現(xiàn)應(yīng)用

  1. 外顯子CNV和染色體CNV拷貝數(shù)變異鑒定。

  2. mRNA表達量鑒定(多基因、多靶標(biāo)適用、多組織)。

  3. 線粒體拷貝數(shù)鑒定。

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