在線工具一般具有“功能強大、操作簡單、無需安裝、用完就走”的特點,因此深受科研人員的喜愛。基迪奧生物公眾號已持續(xù)為大家分享過很多在線工具的使用教程,這里做個簡單的整理。 RNA二級結(jié)構(gòu) 1 Mfold 工具鏈接: http://unafold.rna./?q=mfold 2 RNAfold 工具鏈接: http://rna.tbi./cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi 蛋白互作網(wǎng)絡(luò) 3 String 工具鏈接: https:/// 基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò) 4 Coexpedia 工具鏈接: http://www.coexpedia.org/ 序列Motif 5 MEME 工具鏈接: http:/// 6 Weblogo 工具鏈接: http://weblogo./ 基因信息查找 7 Genecard 工具鏈接: http://www. 序列展示 8 ESPript 工具鏈接: http://espript./ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi Gene ID轉(zhuǎn)化 9 BioMart 工具鏈接: http://www./index.html 10 g:profiler 工具鏈接: https://biit.cs./gprofiler/convert 韋恩圖 11 Venny2.0 工具鏈接: http://bioinfogp.cnb./tools/venny/index.html 12 OmicShare 韋恩圖工具 工具鏈接: 三元圖 13 Ternary plot maker 工具鏈接: https://www./ 基因結(jié)構(gòu)分析 14 FGENES 工具鏈接: http:/// 范例結(jié)果: 系統(tǒng)發(fā)育分析 15 iTOL 工具鏈接: https://itol./ 16 Evolview 工具鏈接: http://www./evolview/ 啟動子預(yù)測 17 Promoter Scan 工具鏈接: http://www.cbs./services/Promoter/ 蛋白一級結(jié)構(gòu)預(yù)測 18 PredictProte 工具鏈接: https://www./home 19 ProtParam tool 工具鏈接: http://web./protparam/ 信號肽預(yù)測 20 SignalP 工具鏈接: http://www.cbs./services/SignalP/ 跨膜結(jié)構(gòu)域 21 TMHMM Server v. 2.0 工具鏈接: http://www.cbs./services/TMHMM/ 亞細(xì)胞定位 22 PSORT 工具鏈接: https://www./ 蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測 23 SWISS-MODEL 工具鏈接: https://swissmodel./ 24 Phyre2 工具鏈接: http://www.sbg.bio./phyre2/html/page.cgi?id=index 短序列拼接 25 Cap3 工具鏈接: http://doua./software/cap3 GO富集分析 26 OmicShare GO富集分析工具 工具鏈接: http://www./tools/home/report/goenrich.html KEGG富集分析 27 OmicShare KEGG富集分析工具 工具鏈接: http://www./tools/home/report/koenrich.html 趨勢分析 28 OmicShare 趨勢分析工具 工具鏈接: http://www./tools/Home/Soft/trend 蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測 29 Pfam 工具鏈接: http://pfam./search 基因組雜合性評估 30 GenomeScope 工具鏈接: http://qb./genomescope/analysis.php?code=example2 圈圖 31 CIRCOS 工具鏈接: http://mkweb./tableviewer/visualize/ 熱圖 32 Omicshare熱圖工具 工具鏈接: http://www./tools/Home/Soft/heatmap |
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