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放大招!如何利用疾病已知基因快速確定研究對(duì)象?

 風(fēng)雨都停了 2019-05-25
導(dǎo)語  

在GEO數(shù)據(jù)庫找到了疾病芯片后,差異分析的結(jié)果很贊,同時(shí)也發(fā)現(xiàn)有很多差異基因,這時(shí)候的你是不是很開心!但是問題來了,在茫茫的差異基因中,哪一條基因才最有可能參與了疾病的發(fā)展呢?

沒關(guān)系,小編今天放大招,教你如何利用疾病已知基因快速確定研究對(duì)象。

1、確定哪個(gè)基因最核心

首先做個(gè)基因關(guān)聯(lián)分析,如下圖所示,這樣就能清楚的就知道哪個(gè)基因最核心。

2、排除跟疾病關(guān)系小的差異基因

確定核心基因后,發(fā)現(xiàn)芯片分析中的差異基因并不是每一個(gè)都跟疾病相關(guān)又或者關(guān)聯(lián)分析出來的核心基因跟疾病關(guān)聯(lián)不大又該怎么辦呢?

這時(shí)候你只需要在差異基因中加入疾病已知基因,(就是那些已經(jīng)有過很多研究被很多文獻(xiàn)證明與疾病有關(guān)的基因),然后再做關(guān)聯(lián)分析,就可以把那些跟疾病關(guān)系不大的差異基因排除了。

3、獲得疾病相關(guān)的已知基因

最后一步,怎么獲得疾病相關(guān)的已知基因呢?難道要去pumbed上慢慢檢索嗎?答案當(dāng)然是不用!

用之前小編推薦過的6個(gè)在線數(shù)據(jù)庫,可以讓你輕松解決疾病相關(guān)已知基因檢索問題!

6個(gè)在線數(shù)據(jù)庫,文章在這里↓↓

6個(gè)在線數(shù)據(jù)庫,讓你輕松解決疾病相關(guān)已知基因檢索問題!

另外還有2個(gè)疾病相關(guān)miRNA和lncRNA檢索數(shù)據(jù)庫

1 、疾病相關(guān) miRNA 檢索:

http://www./

2 、疾病相關(guān) lncRNA 檢索:

http://www./lncrnadisease

4、如何做關(guān)聯(lián)圖?

獲得差異基因和疾病已知基因后,就可以做上面那個(gè)看起來很厲害的關(guān)聯(lián)圖了,鏈接在這里:https:///

超簡單的使用方法:

1、點(diǎn)擊鏈接(https:///

進(jìn)入網(wǎng)站后,選擇Multiple proteins,在list of names中輸入基因名,在organism中選擇物種為人類。

2、點(diǎn)擊SEARCH,核對(duì)一下選擇基因名稱對(duì)不對(duì),然后點(diǎn)擊CONTINUE。

這樣基因關(guān)聯(lián)圖就做好了,是不是超簡單?。炜湮?img doc360img-src='http://image109.360doc.com/DownloadImg/2019/05/2508/162046858_4_20190525083856566.png' data-ratio='1' data-type='xmt-emoji' data-w='18' _width='-30px' src='http://image109.360doc.com/DownloadImg/2019/05/2508/162046858_4_20190525083856566.png'>

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