推薦：江舜堯

編譯：微遺傳

編輯：馬莉

2019年5月23日北京大學(xué)第一醫(yī)院生命科學(xué)學(xué)院張寧、白凡團(tuán)隊以及中山大學(xué)腫瘤防治中心曾木圣團(tuán)隊等在《Cancer Cell》雜志在線發(fā)表了題為“Genomic and Transcriptomic Profiling of Combined Hepatocellular andIntrahepatic Cholangiocarcinoma Reveals Distinct Molecular Subtypes”的文章。該文章發(fā)現(xiàn)肝細(xì)胞合并肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌（cHCC-ICC）顯示的Nestin有更高的表達(dá)，表明Nestin可以作為診斷cHCC-ICC的生物標(biāo)志物，該結(jié)果為cHCC-ICC提供了重要的生物學(xué)和臨床見解。

導(dǎo)讀

肝細(xì)胞癌（HCC）和肝內(nèi)膽管癌（ICC）是原發(fā)性肝癌（PLC）的兩種主要類型，分別占約80％和15％。cHCC-ICC是一種罕見的PLC，研究顯示肝細(xì)胞和膽管上皮分化發(fā)病率在0.4％和14.2％之間變化。與HCC和ICC相比，cHCC-ICC具有更強(qiáng)的侵襲行為和更差的預(yù)后。但是，cHCC-ICC沒有特異的治療方法，手術(shù)切除仍然是主要的治療選擇，但其益處可以忽略不計。因此迫切需要cHCC-ICC的分子表征以幫助生物標(biāo)志物研發(fā)，促進(jìn)準(zhǔn)確診斷并加速特異療法的開發(fā)。

研究亮點

1.構(gòu)建了133個cHCC-ICCs的基因組和轉(zhuǎn)錄組景觀

2.整合基因組分析揭示不同的cHCC-ICCs亞型

3.確定cHCC-ICCs的單克隆和多克隆起源

4.Nestin表達(dá)可作為cHCC-ICC診斷和預(yù)后的生物標(biāo)志物

圖解摘要

本研究中，他們進(jìn)行了泛亞多中心研究，涉及8家醫(yī)院，并對133例cHCC-ICC病例進(jìn)行了大規(guī)模綜合分析，包括全外顯子組測序（WES），全基因組測序（WGS），RNA測序（RNA- seq）和單核測序（SNS）。根據(jù)Allen和Lisa的標(biāo)準(zhǔn)，將cHCC-ICC病例分為三種亞型。具有物理分離和組織學(xué)不同病變的病例被定義為分離型（表示為Sep_ID）。在相同腫瘤中具有明確限定的HCC和ICC組分區(qū)域的病例被定義為結(jié)合型（表示為Com_ID）。在沒有明確邊界的相同腫瘤中具有緊密混合的HCC和ICC組分的病例被定義為混合型（表示為Mix_ID）。

在121例分類病例中，6例為分離型，56例為結(jié)合型，59例為混合型。針對每個亞型設(shè)計了不同的處理策略。通過激光捕獲顯微切割（LCM）在3種單獨類型和41種結(jié)合型cHCC-ICC病例中收集多個腫瘤樣品。病因?qū)W上，100例乙型肝炎病毒（HBV）陽性，7例丙型肝炎病毒（HCV）陽性，1例雙陽性，25例雙陰性?？偟膩碚f，除了正常對照外，對來自121例的173個腫瘤樣本進(jìn)行了WES，對來自37個腫瘤的41個腫瘤樣本進(jìn)行了WGS，對來自77個腫瘤的97個腫瘤樣本進(jìn)行了RNA-seq。 WES的平均深度對于腫瘤是108×，對于正常樣品是101×。

總結(jié)

研究人員對133例cHCC-ICC進(jìn)行基因組和轉(zhuǎn)錄組測序，包括分離型、結(jié)合型和混合亞型。cHCC-ICC與肝細(xì)胞癌和肝內(nèi)膽管癌的綜合比較顯示，結(jié)合和混合型cHCC-ICC是具有不同臨床和分子特征的不同亞型。整合激光顯微切割，癌細(xì)胞分?jǐn)?shù)分析和單核測序，研究人員揭示了單獨類型cHCC-ICC中的單克隆和多克隆起源，而結(jié)合和混合型cHCC-ICC都是單克隆來源。值得注意的是，cHCC-ICC顯示的Nestin有更高的表達(dá)，表明Nestin可以作為診斷cHCC-ICC的生物標(biāo)志物。該結(jié)果為cHCC-ICC提供了重要的生物學(xué)和臨床見解。