神圣羅馬帝國(guó)的繼任者腓特烈二世于1215年被監(jiān)護(hù)人英諾森三世加冕為帝，教皇希望腓特烈二世參加第五次的十字軍東征，但是由于意大利發(fā)生了叛亂，使他不得不留了下來(lái)。第五次十字軍失敗后，尤蘭達(dá)接替約翰成為了耶路撒冷王國(guó)的女王，隨后尤蘭達(dá)從耶路撒冷首都阿克來(lái)到意大利與腓特烈二世結(jié)婚。耶路撒冷王國(guó)與神圣羅馬帝國(guó)聯(lián)成了一體，因此收復(fù)圣地耶路撒冷成為腓特烈二世不得不面對(duì)的責(zé)任，但是腓特烈二世因?yàn)橹T多原因就是不肯東征。

但由于遲遲不肯履行諾言，新繼位的教皇格列高九世，威脅要將腓特烈二世革出天主教教門。1227年腓特烈二世不得不出征，先是在阿普利亞（今意大利南部巴里?。┘Y(jié)軍隊(duì)，隨后腓特烈二世與林堡公爵率軍隊(duì)出海，在出海之前就已經(jīng)病倒的腓特烈二世經(jīng)過(guò)三天考慮又回到奧特蘭托（今奧特朗托）上岸治療。（見(jiàn)圖一）

聽(tīng)到腓特烈二世登岸沒(méi)有前往耶路撒冷，憤怒的教皇將腓特烈二世革出了教門，1228年6月28日腓特烈二世在次帶部隊(duì)前往耶路撒冷，一些部下不愿跟隨一個(gè)被革教籍的人出征，很多人回家了。所以當(dāng)他到達(dá)巴勒斯坦后，他的軍隊(duì)已經(jīng)大大縮小了，并且他的妻子尤蘭達(dá)女王也已去世，耶路撒冷王國(guó)的許多騎士并不把他看成合法的國(guó)王，因此腓特烈二世在巴勒斯坦地區(qū)的行動(dòng)受到了阻力。

腓特烈二世在1228年的9月到達(dá)了耶路撒冷王國(guó)首都阿克港（今阿克里），同時(shí)教皇的革教令也到了。腓特烈二世手下的非神圣羅馬帝國(guó)部隊(duì)全部與他斷絕了關(guān)系，腓特烈二世無(wú)法依靠只有幾千人的神圣羅馬帝國(guó)部隊(duì)發(fā)動(dòng)進(jìn)攻耶路撒冷的戰(zhàn)爭(zhēng)，只好在阿克原地等待。

薩拉丁去世后的阿尤布王朝逐漸四分五裂，到1228年形成了兩個(gè)較強(qiáng)的地方軍閥，分別是埃及蘇丹卡米勒和敘利亞蘇丹穆阿扎姆。為了對(duì)付敘利亞蘇丹，埃及蘇丹與腓特烈二世達(dá)成協(xié)議，只要腓特烈二世派兵支持卡米勒對(duì)敘利亞蘇丹的戰(zhàn)爭(zhēng)，卡米勒蘇丹會(huì)將耶路撒冷交付給他作為回報(bào)。1227年底，埃及的卡米勒利用阿扎姆去世的機(jī)會(huì)，派兵圍攻大馬士革。（見(jiàn)圖三）

1228年11月，腓特烈二世決定發(fā)動(dòng)對(duì)卡米勒的戰(zhàn)爭(zhēng)，迫使其履行承諾，卡米勒由于還沒(méi)從敘利亞戰(zhàn)場(chǎng)抽身，不得不與腓特烈二世達(dá)成了協(xié)定。協(xié)議歸定從耶路撒冷到雅法的走廊地帶歸還耶路撒冷王國(guó)，但是保留圣城內(nèi)的清真寺，穆斯林可以自由出入圣城；簽訂10年的停戰(zhàn)協(xié)議；歸還雙方戰(zhàn)俘。（圖四紅圈內(nèi)領(lǐng)土）

達(dá)成協(xié)議之后，穆斯林都很不滿卡米勒的決定。而西方也在指責(zé)腓特烈二世，認(rèn)為他沒(méi)有在戰(zhàn)場(chǎng)上堂堂正正的打敗異教徒，耶路撒冷也沒(méi)有防御能力，隨時(shí)會(huì)被穆斯林攻占。

3月17日，腓特烈二世進(jìn)入圣城，在空無(wú)一人的圣約翰醫(yī)院，大膽的給自己加冕為耶路撒冷國(guó)王。5月1日晨，腓特烈二世啟程回國(guó)，第六次東征在不流血的協(xié)議中結(jié)束。