最近發(fā)表在開(kāi)放獲取期刊Genome Medicine 上的一項(xiàng)研究，報(bào)道了一種建立肝癌小鼠模型的新方法，即利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)快速將癌癥相關(guān)基因敲入小鼠的DNA中。

研究的通訊作者、麻省大學(xué)醫(yī)學(xué)院RNA療法研究所的王文說(shuō)：“為了更好地理解腫瘤生物學(xué)、開(kāi)展臨床前研究以及為病人找到潛在的治療策略，我們需要有效的腫瘤模型?，F(xiàn)有用來(lái)敲入致癌基因以建立癌癥模型的方法或效率很低，或難以控制敲入位置和敲入的拷貝數(shù)。CRISPR/Cas9使得在基因組特定位置——我們將這種位置稱(chēng)為目標(biāo)基因座——插入大片段DNA成為可能，并且可應(yīng)用于實(shí)驗(yàn)室的人類(lèi)細(xì)胞以及小鼠中。我們研發(fā)出了一個(gè)新的系統(tǒng)——CRISPR-SONIC，可以在肝癌小鼠模型中靈活進(jìn)行基因敲入，且準(zhǔn)確率很高?！?/p>

為了解決癌癥建模的現(xiàn)存問(wèn)題、滿(mǎn)足快速有效建立動(dòng)物模型的需求，牟海偉、Deniz Ozata和Jordan L. Smith研發(fā)了這一新系統(tǒng)，利用CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)將致癌基因插入活小鼠的基因組。CRISPR/Cas9系統(tǒng)由一段向?qū)NA和Cas9酶組成。向?qū)NA是一種核苷酸短序列，它會(huì)附著到基因組中一個(gè)特定的目標(biāo)DNA序列上。由于向?qū)NA同時(shí)也與Cas9酶相連接，它可以將Cas9導(dǎo)向目標(biāo)DNA序列。然后Cas9會(huì)對(duì)DNA進(jìn)行剪切，移除單個(gè)核苷酸/整個(gè)基因，或在DNA修復(fù)過(guò)程中插入核苷酸/整個(gè)基因。

作者在本研究中使用了具有2個(gè)向?qū)NA的CRISPR/Cas9，進(jìn)行了一個(gè)三步驟的操作。首先，其中一個(gè)向?qū)NA和Cas9酶一起對(duì)目標(biāo)DNA位置進(jìn)行切割。第二步，另一個(gè)向?qū)NA和Cas9會(huì)對(duì)一個(gè)DNA環(huán)（即質(zhì)粒供體）進(jìn)行切割，第三步則是將已經(jīng)被切割成線(xiàn)狀的質(zhì)粒環(huán)插入目標(biāo)位置。

為了驗(yàn)證這一方法，作者利用這種方法將一個(gè)綠色熒光蛋白（GFP）基因插入了實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的小鼠細(xì)胞中。這個(gè)基因在成功進(jìn)入細(xì)胞DNA后，會(huì)產(chǎn)生一種在激光下可見(jiàn)的綠色熒光蛋白，從而表明基因成功插入并被表達(dá)。在實(shí)驗(yàn)室細(xì)胞中成功檢驗(yàn)后，作者們?cè)谛∈罄餃y(cè)試了這種方法。

Deniz Ozata說(shuō)：“我們觀(guān)察到在使用了CRISPR-SONIC后，我們的樣本中約有10%的肝臟細(xì)胞成功帶上了GFP。這相對(duì)于之前那些方法大約0.5%的敲入效率來(lái)說(shuō)，是一個(gè)巨大的提升。”

隨后作者們對(duì)CRISPR-SONIC系統(tǒng)（包括向?qū)NA、Cas9酶以及一個(gè)致癌基因質(zhì)粒）進(jìn)行了測(cè)試，檢驗(yàn)它是否可以用來(lái)為肝癌中發(fā)病率第二的肝內(nèi)膽管癌進(jìn)行小鼠建模。

牟海偉說(shuō)：“導(dǎo)致這種癌癥的最常見(jiàn)基因突變發(fā)生在抑癌基因TP53（所有病例中約占26-44%）和致癌基因KRAS（所有病例中約占16-18%）中。過(guò)往研究顯示如果這兩個(gè)突變一起發(fā)生，可以在小鼠模型中引發(fā)肝內(nèi)膽管癌。我們用CRISPR-SONIC敲入了KRAS，同時(shí)加入另一個(gè)向?qū)NA敲除了抑癌基因TP53。這在癌癥建模中非常重要，因?yàn)樵趐53存在的情況下KRAS無(wú)法導(dǎo)致腫瘤的形成?！?/p>

將CRISPR-SONIC注射進(jìn)小鼠一個(gè)月后，作者觀(guān)察到小鼠肝臟中形成了腫瘤。對(duì)照組小鼠在注射了向?qū)NA、Cas9和一段發(fā)光DNA片段（而非致癌基因）之后，并未罹患腫瘤。

Jordan L. Smith說(shuō)：“我們用RAS致癌基因檢測(cè)了我們的方法，但我們認(rèn)為任何致癌基因片段都可以用這種方法定制癌癥模型。我們展示了如何利用CRISPR-SONIC建立肝癌模型，但這種方法亦有應(yīng)用到其他組織和器官的潛力?！?/p>

作者還展示了這種方法亦可用于建立生物發(fā)光癌癥模型，這種模型可以讓研究者們實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)癌細(xì)胞的生長(zhǎng)和癌癥發(fā)展。

Genome Medicine

DOI: 10.1186/s13073-019-0627-9