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第三章 免疫球蛋白超家族

 瀟湘劍客WJH 2019-04-07

免疫球蛋白基因的研究近年來獲得重大突破。日本學(xué)者利根川進(jìn)(Tonegawa)因在免疫球蛋白基因結(jié)構(gòu)研究有突出貢獻(xiàn)而獲得1987年諾貝爾醫(yī)學(xué)和生理學(xué)獎。應(yīng)用X結(jié)晶衍射分析、DNA序列分析和園雙色等技術(shù)研究表明,許多細(xì)胞膜表面分子和機(jī)體某些蛋白分子多肽折疊方式與Lg相似,在氨基酸組成上與免疫球蛋白可變區(qū)(V區(qū))或/和恒定區(qū)(C區(qū))有較高的同源性,它們可能從同一祖先基因(primordial ancestral gene)進(jìn)化而來。編碼這些多肽鏈的基因稱為免疫球蛋白基因超家族(immunoglobulin gene superfamily),這一基因超家族所編碼的產(chǎn)物稱為免疫球蛋白超家族(immunoglobulin superfamily,IGSF)。

Ig超家族中某些成員如FascilinNeuroglian和Amalgam等分子存在于昆蟲中,這表明Ig超家族結(jié)構(gòu)域的多樣化(diversification)在后生動物(Metazoon)進(jìn)化早期即開始發(fā)生,通過基因的復(fù)制(duplication)和隨后發(fā)生的偏離(divergence)產(chǎn)生了具有不同功能的多功能域結(jié)構(gòu)。

第一節(jié) 免疫球蛋白超家族的組成和特點(diǎn)

一、Ig超家族的組成

由于細(xì)胞表面標(biāo)志、單克隆抗體以及基因工程技術(shù)的應(yīng)用,發(fā)現(xiàn)越來越多的膜表面分子和蛋白分子屬于Ig超家族,主要包括T細(xì)胞、B細(xì)胞識別抗原受體及其信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子,免疫球蛋白重鏈和輕鏈,MHC抗原及相關(guān)分子,免疫球蛋白Fc段受體,某些細(xì)胞因子受體,與神經(jīng)系統(tǒng)功能和粘附有關(guān)的分子,某些粘附分子和分化抗原等(表3-1)。

表3-1 免疫球蛋白超家族的組成(舉例)

成 員分子量(kDa)Ig結(jié)構(gòu)域類型人染色體

定 位

主要功能
C1 C2 V
識別抗原和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)    
Igμ重鏈 4 - 114q32.33識別抗原
Igγ重鏈52~583 - 114q32.33識別抗原
Igδ重鏈 3 - 114q32.33識別抗原
Igε重連 4 - 114q32.33識別抗原
Igα重連52~563 - 114q32.33識別抗原
Igκ重連241 - 12p12識別抗原
Igλ重連241 - 122q11.12識別抗原
Ig-α(CD79a)47(一個Ig結(jié)構(gòu)域) mIg復(fù)合體成分,信號轉(zhuǎn)導(dǎo)
Ig-β(CD79b)37(一個Ig結(jié)構(gòu)域) mIg復(fù)合體成分,信號轉(zhuǎn)導(dǎo)
TCRα鏈45~601 - 114q11.12識別MHC/多肽復(fù)合物
TCRβ鏈40~501 - 17q32識別MHC/多肽復(fù)合物
TCRγ鏈45~601 - 17p15識別MHC/多肽復(fù)合物
TCRδ鏈40~601 - 114q11.2識別MHC/多肽復(fù)合物
TCRγ鏈25~28- 1 -11q23TCR信號傳導(dǎo)
TCRδ鏈20- 1 -11q23TCR信號傳導(dǎo)
TCRε鏈20- 1 -11q23TCR信號傳導(dǎo)

續(xù)表1

成 員分子量(kDa)Ig結(jié)構(gòu)域類型人染色體

定 位

主要功能
C1 C2 V
MHC抗原及相關(guān)分子    
MHCⅠ類抗原α鏈441 - -6p21.3α1、α2結(jié)合肽片段,

α3結(jié)合CD8

MHCβ2m121 - -15q21-q22穩(wěn)定MHCⅠ類分子α鏈
MHCⅡ類抗原 α鏈32~341 - -6p21.3α1結(jié)合肽片段,α2結(jié)合CD4
MHCⅡ類抗原 β鏈29~321 - -6p21.3β1結(jié)合肽片段,β2結(jié)合CD4
MHCⅡ類抗原 γ鏈30(屬IGSF) 參與Ⅱ類抗原功能
CD143~491 - -1q22-q23TCRγ/δ限制成分?
Qa/TL重鏈481 - -(小鼠)TCRγ/δ限制成分?
免疫球蛋白Fc段受體    
polyIgR100- 1 41q31-q42多聚Ig受體(肝細(xì)胞上

polyIgR是HBV受體)

FcγRⅠ(CD64)70- 3 -1q23-q24IgG Fc高親和力受體
FcγRⅡ(CD32)40- 2 -1q23-q24IgG Fc低親和力受體
FcγRⅢ(CD16)50~70- 2 -1q23-q24IgG Fc低親和力受體
FcεRⅠα鏈25- 2 -1q23-q24IgE Fc高親和力受體
FcαR(CD89)60- 2 -(尚未鑒定出)IgA Fc受體
細(xì)胞因子受體    
M-CSFR(C-fms)165-4 15q33.2-q33.3細(xì)胞因子受體
(CSF-1R)(CD115)    
SCFR(C-kit)(CD117)145-4 14q31-3細(xì)胞因子受體
IL-1RtI(CDw121a)82- 3 -2q12細(xì)胞因子受體
IL-1RtⅡ(CDw121b)68- 3 -2q12細(xì)胞因子受體
IL-6R(CD126)80- 1 - 細(xì)胞因子受體
G-CSFR150- 1 - 細(xì)胞因子受體
PDGFR180- 4 15q31-q32細(xì)胞因子受體
FGFR130(3個Ig結(jié)構(gòu)域) 細(xì)胞因子受體
gp130(CDw130)130(屬IGSF) 細(xì)胞因子受體
VEGFR (7個Ig屬結(jié)構(gòu)域) 細(xì)胞因子受體
粘附分子和分化抗原    
CD250- 2 -1p13LFA-3(CD58)配體
CD455- 1 212pter-q12結(jié)合MHCⅡ類抗原
CD740- - 117q25T細(xì)胞活化
CD8α鏈34- - 12p12結(jié)合MHCⅠ類抗原
CD8β鏈30- - 12p12結(jié)合MHCⅠ類抗原
CD1995(2個Ig樣結(jié)構(gòu)域) B細(xì)胞活化

續(xù)表2

成 員分子量(kDa)Ig結(jié)構(gòu)域類型人染色體

定 位

主要功能
C1 C2 V
CD22(MAG類似物)130/140- 5 - B細(xì)胞粘附
CD28(同源二聚體)90- - 12q33-q34T細(xì)胞活化,結(jié)合CD80
CTLA-4(CD28類同物) - - 12q33-q34活化CTL
PECAM-1(CD31)140- 6 - 粘附
CD3367(2個Ig結(jié)構(gòu)域)19q13髓樣細(xì)胞粘附?
CD48(blast-1)41~45- 1 11q21-q23B細(xì)胞粘附,結(jié)合CD2
ICAM-3 (CD50)124- 5 - LFA-1配體
ICAM-1(CD54)80~114- 5 -1qLFA-1配體(鼻病毒受體)
LFA-3(CD58)40~65- 2 -1p13?CD2配體
CEA(癌胚抗原)(CD66e)175~200- 2~6 119q13.1-q13.2粘附作用?
B7/BB1(CD80)60(2個Ig結(jié)構(gòu)域) B細(xì)胞活化抗原,結(jié)合CD28
B7-2(CD86)80(2個Ig結(jié)構(gòu)域) 活化T細(xì)胞,結(jié)合CD28
Thy-1(CDw90)17.5~18.7- - 111q23T細(xì)胞活化和粘附
CD96(TACTILE)160(3個Ig結(jié)構(gòu)域) T細(xì)胞激活
ICAM-2(CD102)60- 2 - LFA-1配體
VCAM-1(CD106) (血管細(xì)胞粘附分子-1)110- 7 - VLA-4配體
MRC OX-241~47- 1 13 
妊娠特異性蛋白54~72- 3 119q13.2-13.3粘附作用?
α1BgP(血清α1膽汁糖蛋白)63- 5 - (與CEA結(jié)構(gòu)相似)
BMLP(基底膜連接蛋白)44.5~48.5- - 1 粘附
脊髓灰質(zhì)炎病毒受體(PVR)與神經(jīng)組織細(xì)胞粘附及其它功能有關(guān)67- 2 119qV區(qū)與PV結(jié)合
NCAM(CD56)(神經(jīng)細(xì)胞粘附分子)97~220- 5 -11q23神經(jīng)細(xì)胞粘附
NCAM-L1(神經(jīng)細(xì)胞粘附分子-L1)200- 6 -(小鼠)軸索成束和延長,神經(jīng)元的移行
MAG67/72- 5 -(大鼠)髓鞘形成中軸索和神經(jīng)膠質(zhì)的相互作用
(大鼠髓鞘磷脂相關(guān)糖蛋白) 外周髓磷脂糖蛋白(po myelin protein)28~30- - 1(大鼠)使髓鞘質(zhì)緊密

從表3-1中可以看出,不同組Ig結(jié)構(gòu)域的類型和數(shù)目有以下特點(diǎn):

(1)識別抗原和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)組中,Igμ、γ、δ、ε和α重鏈各含1個V區(qū),3~4個C1區(qū);Igκ、λ輕鏈各含1個V區(qū)和1個C1區(qū);TCRα、β、γ和δ鏈各含1個V區(qū)和1個C1區(qū);CD3γ、δ和ε鏈只含1個C2區(qū)(CD3ξ和η鏈結(jié)構(gòu)與IGSF無同源性)。

(2)MHC抗原及相關(guān)分子只含1個C1區(qū),Qa/TL或CD1與β2m組成異源二聚體與MHCⅠ類抗原結(jié)構(gòu)相似,MHCⅠ類分子α1、α2結(jié)構(gòu)域,MHCⅡ類分子α1、β1結(jié)構(gòu)域具有多態(tài)性,但其結(jié)構(gòu)不屬于IGSF。

(3)免疫球蛋白Fc受體基因均定位于1號染色體,除polyIgR外,其余IgFc受體的Ig結(jié)構(gòu)域?yàn)?~3個C2區(qū)。

(4)IL-6Rα鏈、gp130和G-CSFR的胞膜外結(jié)構(gòu)除N端各含有1個C2樣區(qū)外,靠近胞膜側(cè)各有一個紅細(xì)胞生成素受體超家族結(jié)構(gòu)域,此外,還有2~4個纖粘連素結(jié)構(gòu)域。

(5)與神經(jīng)組織細(xì)胞粘附有關(guān)的粘附分子中絕大多數(shù)含有5個或6個C2區(qū)。

二、Ig超家族的特點(diǎn)

(一)Ig超家族的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)

Ig超家族成員均含有1~7個Ig樣結(jié)構(gòu)域,每個Ig樣結(jié)構(gòu)域約含70~110個氨基酸殘基。其二級結(jié)構(gòu)是兩個各含3~5個反平行β折疊股所形成的β片層(anti-parallel β-pleated sheet)平面,每個反平行β折疊股由5~10個氨基酸殘基組成,β片層內(nèi)側(cè)的疏水性氨基酸起到穩(wěn)定Ig折疊的作用。大多類結(jié)構(gòu)域內(nèi)有一個垂直連接兩個β片層的二硫鍵,組成二硫鍵的兩個半胱氨酸之間約含55~75個氨基酸。少數(shù)Ig結(jié)構(gòu)域如CD2、LFA-3第1個結(jié)構(gòu)域,PDGFR第4個結(jié)構(gòu)域,CD4第3個結(jié)構(gòu)域等缺乏二硫鍵。肽鏈這種球形結(jié)構(gòu)的折疊方式稱為免疫球蛋白折疊(Ig fold)。

人Igλ輕鏈多肽的折疊(示意圖)

圖3-1 人Igλ輕鏈多肽的折疊(示意圖)

不同IGSF分子穿膜區(qū)結(jié)構(gòu)差異較大,Thy-1缺乏胞漿部分,通過一個GPI錨連接在細(xì)胞膜上,而PDGFR胞漿區(qū)含有543個氨基酸殘基,并具有酪氨酸激酶的結(jié)構(gòu)。除CD4第一個結(jié)構(gòu)域和N-CAM分子外,Ig超家族中的一個結(jié)構(gòu)域通常由一個外顯子所編碼。有些Ig超家族成員的基因連鎖在一起,如Thy-1,N-CAM,CD3γ、δ、ε鏈的基因在11q23。Ig Fc段受體FcγRⅠ、FcγRⅡ、FcγRⅢ和FcεRⅠα鏈基因在1q23-q24。

根據(jù)IGSF結(jié)構(gòu)域中Ig折疊方式、兩個半胱氨酸之間氨基酸殘基的數(shù)目以及IgV區(qū)或C區(qū)同源性的程度,IGSF結(jié)構(gòu)域可分為V組、C1組和C2組。

免疫球蛋白超家族V組、C1組和C2組(舉例)

圖3-2 免疫球蛋白超家族V組、C1組和C2組(舉例)

1.V組 V組結(jié)構(gòu)域的兩個半胱氨酸之間含有氨基酸數(shù)量較多,約65~75個氨基酸殘基,2個β片層區(qū)共有9個反平行β折疊股,比C1、C2組多一對β折疊股。許多IGSF分子具有V組結(jié)構(gòu),如IgH鏈和L鏈V區(qū),TCRα、β、γ、δ鏈V區(qū),CD4V區(qū),CD8α、β鏈V區(qū),CD28、CTLA-4、CD7、Thy-1、pIgR和分泌型IgA中分泌成分N端四個結(jié)構(gòu)域,CEaN端第一個結(jié)構(gòu)域,M-CSFR、SCFR和PDGFR靠近胞膜的結(jié)構(gòu)域等。

2.C1組 又稱C組。C1組結(jié)構(gòu)域中二個半胱氨酸之間約含50~60個氨基酸殘基,有7個β折疊股,如IgH鏈和L鏈C區(qū)(γ、δ和α鏈的CH1~CH3或μ和ε鏈的CH1~CH4),TCRα、β、γ、δ鏈C區(qū),MHCⅠ類分子重鏈α3結(jié)構(gòu)域,β2m、MHCⅡ類分子α2和β2結(jié)構(gòu)域,CD1、Qa 和TL分子靠近胞膜結(jié)構(gòu)域等。

3.C2組 又稱H組。C2組結(jié)構(gòu)域的氨基酸排列類似V組,但形成二硫鍵的兩個半胱氨酸之間所含氨基酸殘基數(shù)約為50~60,有7個β折疊股,這種結(jié)構(gòu)介于V組和C1組之間,如CD3γ、δ和ε鏈,CD2和LFA-3(CD58),pIgR靠近胞膜結(jié)構(gòu)域,F(xiàn)cγRⅠ、FcγRⅡ、FcγRⅢ、FcεRⅠα鏈、FcαR、ICAM-1,CEA第2至7個結(jié)構(gòu)域,IL-6R、M-CSFR、G-CSFR、M-MAG、SCFR、PDGFR第1至4個結(jié)構(gòu)域,與神經(jīng)系統(tǒng)相關(guān)的分子N-CAM、N-CAM-L1、MAG、Po、F3、NILE、TAG1等以及CD22、CD48、α1-BgP分子等。某此IgH鏈中CH2和CH3可有8個β折疊,在這種情況下,其中一個β折疊股只有3個氨基酸殘基。

在V、C1和C2三組中,有些Ig超家族成員之間的同源性要大于該組中平均的類似程度,如在V組中IgV、TCR-V、和CD8V結(jié)構(gòu)域;C1組中IgC、TCR-C、MHC-C結(jié)構(gòu)域;C2組中CD2和LFA-3,NCAM、NCAM-L1和MAG,PDGFR、M-CSFR和SCFR,這些同源性較高的成員它們的功能往往也很相似。

(二)Ig超家族的功能特點(diǎn)

Ig超家族的功能是以識別為基礎(chǔ),因此又稱為識別球蛋白超家族(cognoglobulin superfamily)。Ig折疊形成一個緊密的球狀結(jié)構(gòu),提供了與不同球狀結(jié)構(gòu)多肽或化學(xué)基團(tuán)粘附的部位,使之獲得不同的生物學(xué)功能。IGSF很可能最早起源于原始的具有粘附功能的基因,通過復(fù)制和突變衍生形成了識別抗原、細(xì)胞因子受體、IgFc段受體、細(xì)胞間粘附分子以及病毒受體等不同的結(jié)構(gòu)域。IGSF識別的基本方式有以下幾種。

1.IGSF和IGSF相互識別 IGSF分子相互識別中有嗜同種的相互作用和異嗜性相互作用兩種形式。(1)嗜同種的相互作用(homophilic interaction):如相同神經(jīng)細(xì)胞粘附分子(NCAM)之間的相互識別,血小板內(nèi)皮細(xì)胞粘附分子-1(PECAM-1,CD31)的相互識別。(2)異嗜性相互作用(heterophilic interaction),如CD2與LFA-3,CD4與MHC Ⅱ類分子的單態(tài)部分(α2和β2),CD8與MHCⅠ類分子的單態(tài)部分(α3),PolyIgR與多聚Ig,F(xiàn)cγRⅠ(CD64)、FcγRⅡ(CD32)、FcγRⅢ(CD16)與Ig Fc段,F(xiàn)cεRⅠ與IgE Fc段,F(xiàn)cαR(CD89)與IgA Fc段,CD28與B7/BB1(CD80)等之間的相互識別。

2.IGSF和integrin相互識別 如ICAM-1(CD54)、ICAM-2(CD102)、ICAM-3(CD50)與LFA-1(CD11a/CD18),VCAM-1(CD106)與VLA-4(CD49d/CD29)之間的相互作用。

3.IGSF和其它分子的相互識別 包括TCR識別MHCⅠ類或Ⅱ類分子與抗原復(fù)全物,細(xì)胞因子受體識別細(xì)胞因子等。

三、CD、粘附分子與Ig超家族的關(guān)系

免疫分子的命名根據(jù)不同的角度往往有不同的歸類和命名,圖3-3歸納了人白細(xì)胞分化抗原(CD)、粘附分子(AM)、免疫球蛋白超家族(IGSF)、細(xì)胞因子受體(CKR)、補(bǔ)體受體(CR)以及主要組織兼容性復(fù)合體抗原(MHC)等免疫分子命名的相互關(guān)系。

(1)A表示CD命名范圍中的粘附分子,如CD49a/CD29、CD49b/CD29、CD49c/CD29、CD49d/CD29、CD49e/CD29、CD49f/CD29、CD51/CD29、CD11a/CD18、CD11b/CD18、CD11c/CD18、CD41/CD61、CD51/CD61、CD49f/CD104、CD2、CD4、CD8、CD28、CD31、CD50、CD54、CD56、CD58、CD80、CD102、CD106、CD62L、CD62P、CD62E、CD15、CD15s、CD44等。

(2)B表示CD命名范圍中屬IGSF結(jié)構(gòu)的分子,如CD79a、CD79b、CD1、CD64、CD32、CD16、CD115、CD117、CDw121a、CDw121b、CD126、CDw130、CD2、CD4、CD7、CD8、CD19、CD28、CD31、CD48、CD50、CD54、CD58、CD66e、CD80、CDw90、CD96、CD102、CD106、CD56等。

(3)C表示粘附分子中屬IGSF結(jié)構(gòu)的分子,無CD編號,如MHCⅠ類和Ⅱ類分子。

(4)D表示CD命名范圍中,具有粘附功能且屬于IGSF結(jié)構(gòu)的分子,如CD2、CD4、CD8、CD28、CD31、CD50、CD54、CD56、CD58、CD80、CD102、CD106等。

(5)有CD命名的CR有CR1(CD35)、CR2(CD21)、CR3(CD11b/CD18)、CR4(CD11c/CD18)和C5aR(CD88),其中CR3和CR4屬于粘附分子中整合素超家族成員。

(6)有CD編號的CKR有CD115~CDw130;屬于IGSF結(jié)構(gòu)的CKR有CD115、CD117、CDw121a、CDw121b、CD126、CDw130、G-CSFR、PDGFR和VEGFR等。

免疫分子命名的相互關(guān)系

圖3-3 免疫分子命名的相互關(guān)系

第二節(jié) 免疫球蛋白基因的結(jié)構(gòu)和多樣性

表3-2 免疫球蛋白基因定位

編碼多肽鏈基因符號(人)基因定位(染色體)
小鼠
κ輕鏈IGK2p116
λ輕鏈IGL22q1116
H重鏈IGH14q32.312

免疫球蛋白(Ig)的分子由IGK、IGL和IGH基因編碼。IGK、IGL和IGH基因定位于不同的染色體(表3-2)。編碼一條Ig多肽鏈的基因是由胚系中數(shù)個分隔開的DNA片段(基因片段)經(jīng)重排而形成。1965年Dreyer和Bennet首先提出假說,認(rèn)為Ig的V區(qū)和C區(qū)由分隔存在的基因所編碼,在淋巴細(xì)胞發(fā)育過程中這兩個基因發(fā)生易位而重排在一起。1976年Hozumi和Tonegawa應(yīng)用DNA重組技術(shù)證實(shí)了這一假說。

一、 Ig重鏈基因的結(jié)構(gòu)和重排

Ig重鏈基因是由V、D、J和C四種不同基因片段所組成。

(一)Ig重鏈可變區(qū)(V區(qū))基因

重鏈可變區(qū)基因是由V、D、J三種基因片段經(jīng)重排后所形成。

1.重鏈V區(qū)基因的組成 編碼重鏈V區(qū)基因長約1000~2000kb,包括V、D、J三組基因片段。

(1)重鏈V基因片段:小鼠VH基因片段數(shù)目為250~1000個。根據(jù)VH基因片段核酸序列的相似性(>80%同源性),至少可分為11個家族(family).人V基因片段約為100個,至少可分為6個家族,每個家族含有2~60個成員不等。V基因片段由2個編碼區(qū)(codingregions)組成:第一個編碼區(qū)編碼大部分信號序列;第二個編碼區(qū)編碼信號序列羧基端側(cè)的4個氨基酸殘基和可變區(qū)約98個氨基酸殘基,包括互補(bǔ)決定區(qū)1和2(complementarity determining region 1和2,CDR1和CDR2)。

(2)重鏈D基因片段:D(diversity)是指多樣性。DH基因片段僅存在于重鏈基因中而不存在于輕鏈基因。D基因片段編碼重鏈V區(qū)大部分CDR3。小鼠DH共有12個片段,位于VH和JH基因片段之間,大部分DH片段較為集中,約占60~80kb,但靠上游的DH可能位于VH區(qū)域內(nèi),最后一個DH片段與JH基因5'端相距約0.7kb。人類DH片段可能有10~20個左右。

(3)重鏈的J基因片段:J(joining)指連接,是連接V和C基因片段。JH編碼約15~17個氨基酸殘基,包括重鏈V區(qū)CDR3除DH編碼外的其余部分和第4骨架區(qū)。小鼠JH基因片段有4個,與Cμ相距約6.5kb。人有9個JH其中6個是有功能的JH基因片段。

V、D、J基因片段經(jīng)重組連接在一起,組成2個外顯子,一個外顯子編碼信號序列的大部分,另一個外顯子編碼信號序列的其余部分和重鏈可變區(qū)。

小鼠和人在胚系中Ig基因的結(jié)構(gòu)見圖3-4和圖3-5。

2.重鏈可變區(qū)基因的移位 在重鏈基因重排開始時,二條染色體上都發(fā)生D基因片段移位到J基因片段而發(fā)生D-J基因連接。在此以后,只有其中一條染色體上的V基因片段與D-J基因片段連接。VH基因片段5'端含有啟動子(promoter),JH和Cμ基因片段之間的內(nèi)含子中含有轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子(transcriptinalenhancer)。如果一條染色體VH基因與D-J基因重排無效(non-productive),另一條染色體的VH基因片段開始發(fā)生移位,與D-J基因片段連接。

某些與Ig基因片段重排有關(guān)的特殊序列稱為識別序列(recognition sequences),位于V基因片段的3'端與J基因片段的5'端之間以及D基因片段的兩側(cè)。V基因片段3'端、J基因片段5'端以及D基因片段的兩側(cè)也是DNA重排識別信號所在區(qū)域,這些識別信號包括三部分:(1)高度保守的回文結(jié)構(gòu)的七聚體(palindromic heptamer);(2)較少保守、富含A/T的九聚體(nonamer);(3)七聚體和九聚體之間不保守的間隔序列(spacer sequence),含有12±1堿基對或23±1堿基對。根據(jù)12/23堿基對間隔規(guī)則(或稱1圈/2圈定律),兩個基因片段的重組僅發(fā)生在兩個基因片段之間:各有一個12個堿基對片段和一個23個堿基對片段的結(jié)構(gòu)(圖3-6)。

小鼠Ig基因結(jié)構(gòu)

圖3-4 小鼠Ig基因結(jié)構(gòu)

注:(1)L:先導(dǎo)序列基因片段 V:可變區(qū)基因片段 D:D基因片段

J:J基因片段 C:恒定區(qū)基因片段 E:轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子

S:轉(zhuǎn)換區(qū) *:假基因

(2)內(nèi)含子區(qū)域所標(biāo)數(shù)字表示DNA長度(kb)。

(3)每個CH基因用一個方框表示,實(shí)際上包括幾個外顯子,如Cμ含有6個外顯子。

(4)λ基因增強(qiáng)子位于Cλ4和Cλ1基因片段的下游。

人Ig基因結(jié)構(gòu)

圖3-5 人Ig基因結(jié)構(gòu)

注:(1)L:先導(dǎo)序列基因片段 V:可變區(qū)基因片段 D:D基因片段

J:J基因片段 C:恒定區(qū)基因片 *:假基因

(2)內(nèi)含子區(qū)域所標(biāo)數(shù)字表示DNA長度(kb)

(3)每個CH基因用一個方框表示,實(shí)際上包括幾個外顯子

參與V/(D)/J基因重組過程的酶稱為V/(D)/J重組酶(recombinase),有關(guān)于執(zhí)行識別、切割和重新連接基因片段重組酶的純化和鑒定工作還剛開始。重組酶實(shí)際上包括重組過程中多種酶的活性。最近在前B細(xì)胞(pre-b cell)中已經(jīng)鑒定出兩種刺激Ig基因重排的基因,稱為重組激活基因1(recombinationactivating gene 1,RAG-1)和重組激活基因2(RAG-2),其確切的作用機(jī)理還不太清楚。重組酶作用的特點(diǎn)是:(1)淋巴細(xì)胞特異性的,非淋巴樣細(xì)胞如成纖維細(xì)胞無重組酶活性,這可能解釋了Ig基因的重排僅見于B淋巴細(xì)胞。目前一般認(rèn)為T細(xì)胞TCR基因重排中的重組酶與B細(xì)胞中重組酶相同或相似。(2)重組酶發(fā)揮其功能僅限于B細(xì)胞發(fā)育早期,未成熟B細(xì)胞如前B細(xì)胞(pre-b cell)細(xì)胞系重組酶活性很高,但抗體生成細(xì)胞或骨髓瘤細(xì)胞無明顯重組酶活性,因此時B細(xì)胞已經(jīng)分泌某一特異性抗體,不再發(fā)生重排其它的Ig基因,因此也不會改變原先所產(chǎn)生抗體的特異性。轉(zhuǎn)換重組酶(switch recom-binase)可能與VDJ重組酶(VDJ recombinase)相似,但缺乏七聚體/九聚體(heptamer/nonamer)識別蛋白。重組酶功能異??蓪?dǎo)致機(jī)體不能產(chǎn)生Ig和TCR,很可能與重癥聯(lián)合免疫缺陷(severe combinedimmunodeficiency,SCID)的發(fā)生有關(guān)。例如SCID小鼠16號染色體著絲點(diǎn)末端存在一個scid基因,為單基因常染色體遺傳基因。scid基因純合將影響DNA重組酶的識別功能,在TCR或BCR基因片段重排時不能識別正確的位點(diǎn),使T細(xì)胞、B細(xì)胞在淋巴干細(xì)胞發(fā)育早期即夭折,導(dǎo)致重癥聯(lián)合免疫缺陷。

參與Ig基因重排組酶識別的DNA序列

圖3-6 參與Ig基因重排組酶識別的DNA序列

(二)Ig重鏈恒定區(qū)(C區(qū))基因

1.重鏈C基因片段 重鏈恒定區(qū)基因由多個外顯子組成,位于J基因片段的下游,至少相隔1.3kb。每1個外顯子編碼1個結(jié)構(gòu)域(domain),鉸鏈區(qū)(hinge region)是由單獨(dú)的外顯子所編碼,但α重鏈的鉸鏈區(qū)是由CH2外顯子的5'端所編碼。大多分泌的Ig重鏈羧基端片段或稱尾端“tail piece”是由最后一個CH外顯子的3'端所編碼,而δ鏈的“tailpiece”是由一個單獨(dú)的外顯子所編碼。小鼠CH基因約占2000kb,其外顯子從5'端到3'排列的順序是Cμ-Cδ-Cγ3-Cγ1-Cγ2b-Cγ2a-Cε-Cα。人CH基因外顯子排列的順序是Cμ-Cδ-Cγ3-Cγ1-Cε2(pseudo基因)Cα1-Cγ2-Cγ4-Cε1-Cα2。其中基因片段Cγ3-Cγ1-Cε2-Cα1和基因片段Cγ2-Cγ4-Cε1-Cα2可能是一個片段經(jīng)過一次復(fù)制而得,為研究CH基因的起源和進(jìn)化提供有用的依據(jù)。

2.免疫球蛋白類型轉(zhuǎn)換 1964年Nossal等發(fā)現(xiàn)B淋巴細(xì)胞存在著類型的轉(zhuǎn)換。Ig類型轉(zhuǎn)換(class switch)或稱同種型轉(zhuǎn)換(isotype switch)是指一個B淋巴細(xì)胞克隆在分化過程中VH基因片段保持不變,而發(fā)生CH基因節(jié)段的重排、比較CH基因片段重排后基因編碼的產(chǎn)物,V區(qū)相同而C區(qū)不同,即識別抗原特異性不變,而類或亞類發(fā)生改變。這種類型轉(zhuǎn)換在無明顯誘因下可自發(fā)產(chǎn)生。

局部微環(huán)境和細(xì)胞因子可影響和調(diào)節(jié)免疫球蛋白類型的轉(zhuǎn)換,如在腸道派伊爾氏結(jié)的B細(xì)胞V基因片段優(yōu)先轉(zhuǎn)換到Cα1進(jìn)行重排,因此主要合成和分泌IgA。在體外向經(jīng)LPS刺激的小鼠B細(xì)胞中加入IL-4,可促進(jìn)B細(xì)胞產(chǎn)生IgG1和IgE,抑制IgG2b產(chǎn)生;低濃度的IL-4主要誘導(dǎo)產(chǎn)生IgG1,高濃度IL-4主要誘導(dǎo)產(chǎn)生IgE。面IFN-γ則誘導(dǎo)小鼠B細(xì)胞合成IgG2a,抑制IgE的產(chǎn)生。TGF-β、IL-5和IL-6對IgA的產(chǎn)生具有促進(jìn)作用(表3-3)。細(xì)胞因子調(diào)節(jié)B細(xì)胞Ig類別轉(zhuǎn)換的機(jī)理可能是:(1)刺激某些細(xì)胞的克隆選擇性的增殖,使分泌某特定類、亞類抗體的克隆細(xì)胞增加,如IL-5、IL-6促進(jìn)IgA。產(chǎn)生除通過同種型轉(zhuǎn)換進(jìn)行調(diào)節(jié)外,還可選擇性促進(jìn)IgA定向細(xì)胞分化增殖為IgA分泌細(xì)胞。(2)通過誘導(dǎo)特定位置上兩個轉(zhuǎn)換區(qū)的重組,誘導(dǎo)B細(xì)胞由分泌IgM向某一同種型Ig轉(zhuǎn)換。如高濃度IL-4促進(jìn)LPS誘導(dǎo)小鼠B細(xì)胞產(chǎn)生IgE,主要是使Cε轉(zhuǎn)換區(qū)與重組酶的接近(accessibility),通過同種型轉(zhuǎn)換促進(jìn)IgE的產(chǎn)生。

表3-3 細(xì)胞因子對LPS誘導(dǎo)的Ig類和

亞類轉(zhuǎn)換的調(diào)節(jié)作用(占總Ig%)

細(xì)胞因子IgMIgG1IgG2aIgEIgA
對照(不加外源性細(xì)胞因子)852<1<1<1
IL-47020<15<1
IFN-γ80210<1<1
THF-β和IL-2752<1<115

注:(1)純化的小鼠IgM+IgD+B細(xì)胞體外培養(yǎng)時,加入不同的細(xì)胞因子和LPS,然后檢 LPS,然后檢測不同類或亞類免疫球蛋白的百分比。

(2)由于未檢測所有類和亞類Ig,所以每組Ig總百分比不到或接近100%。

Ig類型轉(zhuǎn)換可能通過以下兩種機(jī)理。

(1)缺失模型(deletion model):又稱linear orderly deletiom ofH chain genes。以小鼠CH基因?yàn)槔鏑μ和Cδ基因片段被缺失,那么先前重排的VDJ就會按照順序與下一個CH基因即Cγ3發(fā)生重排,經(jīng)轉(zhuǎn)錄和翻譯后,編碼γ3重鏈;如缺失所有的γ鏈亞類基因,依次會產(chǎn)生ε鏈。上述模型在被刺激后小鼠B細(xì)胞在體外培養(yǎng)中產(chǎn)生Ig類別的順序得到證實(shí),即先產(chǎn)生IgM,然后依次產(chǎn)生IgG3和IgG1等。但這個模型不能解釋免疫動物或抗原刺激B細(xì)胞培養(yǎng)中單個B細(xì)胞可同時表達(dá)幾種不同類或亞類的重鏈。

(2)RNA的不同剪接:除DNA水平的Ig類型轉(zhuǎn)換形成外,RNA水平的不同剪接(alternative RNA splicing)也可產(chǎn)生不同的Ig類型。 Cμ和Cδ基因片段之間無S區(qū),IgM和IgD共表達(dá)的B細(xì)胞系DNA分析表明,Cμ和Cδ基因片段沒有發(fā)生重排,相同的VH出現(xiàn)在μ或δ鏈的mRNA上,表明它們可能有一個共同的mRNA前體,通過不同的或差異剪接(differential splicing)分別形成μ鏈和δ鏈mRNA。初級RNA轉(zhuǎn)錄本(primary RNa transcript)是由VDJ復(fù)合體連接Cμ和Cδ基因片段經(jīng)轉(zhuǎn)錄后形成。如果在剪接過程中切除初級RNA轉(zhuǎn)錄本中的Cδ部分,經(jīng)加工后形成μmRNA;如去除初級RNA轉(zhuǎn)錄本中的Cμ部分,則加工后形成δmRNA。這兩種mRNA分別被翻譯,使單個B細(xì)胞同時產(chǎn)生μ和δ鏈,同時表達(dá)IgM和IgD。同樣的機(jī)理可從一條長的primary RNA轉(zhuǎn)錄本中加工為 μmRNA和εmRNA(或其它重鏈mRNA),同時表達(dá)IgM、IgE或其它類Ig。

Ig類型轉(zhuǎn)換缺失模型

圖3-7 Ig類型轉(zhuǎn)換缺失模型

(三)膜表面Ig重鏈基因

膜表面Ig(mIg)重鏈基因的外顯子結(jié)構(gòu)與分泌性Ig重鏈的基因外顯子結(jié)構(gòu)基本相同,但在基因組的3'端有所不同。作為識別抗原受體的mIg,其重鏈羧基端有一段疏水性氨基酸插入到胞膜雙層脂質(zhì)中,mIg重鏈的轉(zhuǎn)錄本要比分泌性重鏈轉(zhuǎn)錄本多1~2個外顯子,與分泌性重鏈基因最后一個外顯子至少相隔1.4kb,這1~2個外顯子編碼重鏈的羧基端部分,這部分氨基酸殘基的數(shù)目視重鏈不同而有所差異,如鼠或人mIgμ鏈的這一部分約為41個氨基酸殘基,而鼠mIgε鏈這部分卻有72個氨基酸殘基。這個區(qū)域可分為三個部分:(1)一個酸性間隔子,靠氨基端側(cè),與最后一個CH結(jié)構(gòu)域相連,位于細(xì)胞膜外側(cè);(2)跨膜部分,由26個不帶電荷的疏水氨基酸形成一個α螺旋,穿過胞膜的脂質(zhì)雙層;(3)胞漿內(nèi)羧基端部分,3~28個氨基酸殘基不等,可能與信號傳遞有關(guān)。

RNA的差異拼接與IgM和IgD共同表達(dá)在一個B細(xì)胞上

圖3-8 RNA的差異拼接與IgM和IgD共同表達(dá)在一個B細(xì)胞上

分泌形式的μ、α和δ重鏈最后一個結(jié)構(gòu)域后有一段額外延長的由帶電荷氨基酸組成的序列,稱為尾片(tail pieces),約含20個氨基酸,在IgM和IgA分子中,單體Ig尾片通過二硫鍵相互連接或與J鏈形成二聚體或多聚體。分泌形式μ鏈的mRNA含有V、D、J、Cμ1、Cμ2、Cμ3、Cμ4和Cμ43'端一個小的外顯子轉(zhuǎn)錄區(qū)。

Ig重鏈基因除L、V、D、J和C基因片段外,在內(nèi)含子中還有一些與mRNA轉(zhuǎn)錄和免疫球蛋白類的轉(zhuǎn)換有關(guān)的結(jié)構(gòu)。

(1)插入順序(intervening sepuence,IS):有IS1、IS2、IS3……等。

(2)轉(zhuǎn)換區(qū)序列:即S區(qū)(switch region)。除Cδ外,各個恒定區(qū)基因片段上游都有一個同源重復(fù)序列的S區(qū),約占2~10kb,分別命名為Sμ、Sγ、Sα和Sε等,與Ig類和亞類的轉(zhuǎn)換有關(guān)。S區(qū)含有眾多串聯(lián)的高度保守的DNA重復(fù)序列,每個重復(fù)序列可長到52bp,其確切的功能還不清楚。如Sμ的結(jié)構(gòu)為[(GAGCT)nGGGGT]m,n一般為2~5,但有時可達(dá)17,m可達(dá)150。目前關(guān)于H鏈轉(zhuǎn)換區(qū)的研究主要以小鼠為模型,如4個Sγ是由49bp長的基序的重復(fù)序列所組成。Sα至少由長為80pb的15個重復(fù)序列,Sε的重復(fù)序列長為60bp。在小鼠,B淋巴細(xì)胞經(jīng)T細(xì)胞非依賴性活化后常發(fā)生Sμ/Sγ3和Sμ/Sγ2b的重組,因此在無T細(xì)胞存在條件下,LPS活化小鼠B細(xì)胞成為淋巴母細(xì)胞,主要轉(zhuǎn)換Ig的亞類為IgG3和IgG2b。

(3)啟動子:靠近每個V基因轉(zhuǎn)錄位點(diǎn)的上游,含有TATA盒,控制RNA多聚酶Ⅱ作用下的轉(zhuǎn)錄過程。大多數(shù)Ig的啟動子含有許多DNA序列,包括一個保守的8個核苷酸序列,可能是核DNA結(jié)合蛋白(nuclear DNA-binding proteins)結(jié)合部位,在轉(zhuǎn)錄過程中起著重要作用。由于核DNA結(jié)合蛋白是由其它基因所編碼,因此這種作用方式被稱為反式作用(transacting).

膜表面和分泌的Igμ基因及μ鏈羧基端結(jié)構(gòu)的比較

圖3-9 膜表面和分泌的Igμ基因及μ鏈羧基端結(jié)構(gòu)的比較

注:(a)初級RNA轉(zhuǎn)錄本通過不同的剪接加工,分別形成分泌型μmRNA和膜型μmRNA。

(b)蘇氨酸(T)為Cμ4第556位氨基酸。膜表面μ重鏈的556氨基酸后還有41個氨基酸,其中富含帶負(fù)電氨基酸胞膜外區(qū)12個氨基酸,26個疏水性氨基酸組成的穿膜區(qū)以及胞漿區(qū)3個氨基酸;分泌型μ重鏈在556位氨基酸后有20個氨基酸組成的尾片,C末端倒數(shù)第二個為半胱氨酸。

(4)增強(qiáng)子(E):在人和小鼠和重鏈和κ輕鏈中發(fā)現(xiàn)有增強(qiáng)子,其核苷酸序列為TGGTAAG。在H鏈基因中,增強(qiáng)子位于JH3'端側(cè)。當(dāng)H鏈VDJ或κ鏈VJ重排后,V基因上游的啟動子靠近增強(qiáng)子,使V(D)JC基因重排后開始更為有效的轉(zhuǎn)錄。增強(qiáng)子作用方式與啟動子不同,呈方向非依賴方式(orientation-independent manner),即增強(qiáng)子可作用于被轉(zhuǎn)錄基因的上游或下游。此外,增強(qiáng)子的作用是細(xì)胞特異性。

已重排Ig基因的轉(zhuǎn)錄起始于TATA盒下游約20核苷酸處,轉(zhuǎn)錄至C基因后,產(chǎn)生初級RNA(primary RNA)轉(zhuǎn)錄本,在3'端切斷后進(jìn)行多聚腺苷酸化(polyadenylation),剪接掉不編碼的內(nèi)容含子,如J區(qū)與C區(qū)之間的不編碼序列是在RNA水平上被剪接掉。

小鼠μ鏈的基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成

圖3-10 小鼠μ鏈的基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成

(四)重鏈基因重排、轉(zhuǎn)錄和多肽鏈的合成。

以μ鏈基因的重排順序、轉(zhuǎn)錄和μ鏈合成為例,見圖3-10。

二、Ig輕鏈基因的結(jié)構(gòu)和重排

在Ig重鏈基因重排后,輕鏈的可變區(qū)基因片段隨之發(fā)生重排,V與J基因片段并列在一起。κ輕鏈基因先發(fā)生重排,如果κ基因重排無效,隨即發(fā)生λ基因的重排。

(一)κ鏈基因的結(jié)構(gòu)和重排

在小鼠,Vκ基因片段約有250個,間隔距離平均為10~12kb;Jκ有5個,其中4個有功能:Cκ只有1個。在人類,Vκ基因片段約有85~100個,編碼V區(qū)氨基端的1~95位氨基酸,包括CDR1、CDR2和部分CDR3。根據(jù)DNA相似性程度,Vκ可分為16個組。在胚系DNA水平上,Vκ基因片段分散約占2000kb之長,占人2號染色體長度的百分之一左右。Jκ基因片段有5個,編碼第96~108氨基酸。Jκ與最后一個Vκ基因片段的3′端相距為23kb,但與Cκ外顯子靠得較近。Cκ也只有1個,編碼C區(qū)(109~214氨基酸),所有κ輕鏈具有同一結(jié)構(gòu)的C區(qū)。人和鼠Cκ距最后一個Jκ基因片段約2.5kb。Vκ與Cκ之間以隨機(jī)的方式發(fā)生重組連接。人κ輕鏈V基因的排列多樣性約為100Vκ×5Jκ=500。

(二)λ鏈基因的結(jié)構(gòu)和重排

小鼠Igλ輕鏈基因結(jié)構(gòu)見表3-4。在大多數(shù)近交系小鼠中,有4個Jλ和4個Cλ,根據(jù)其在胚系DNA上的分布位置可分為兩組(cluster):Jλ2Cλ2Jλ4Cλ4(C2-C4組)和Jλ3Cλ3Jλ1Cλ1(C3-C1組),每組基因片段長約為5kb。

表3-4 λ鏈基因結(jié)構(gòu)和編碼的氨基酸

分類名稱在基因片段中的位置編碼氨基酸在輕鏈中的位置編碼氨基酸數(shù)
 先導(dǎo)序列基因片段
 L1基因組5′端第-19~-5先導(dǎo)肽段15
外顯子L2緊接V基因5′端第-4~-1先導(dǎo)肽段4
V基因片段L2的3′端V區(qū)1~96或9896或98
 J基因片段V基因片段3′端V區(qū)97或99~11214或16
 C基因片段J基因片段3′端C區(qū)113~214102
內(nèi)含子IS1在L1與L2之間93 bp(不編碼)
IS2J與C之間1205 bp(不編碼)

λ基因組中共含有Vλ1、Vλ2和Vλx3個Vλ基因片段,Vλ2與“C2-C4組”(Jλ2Cλ2Jλ4Cλ4)的5′端相距73kb;Vλ1與“C3-C1組”(Jλ3Cλ3Jλ1Cλ1)相距19kb;VλX與Vλ23′端相距19kb;Vλ重因片段與Jλ、Cλ基因片段的連接并不完全隨機(jī),Vλ1與Jλ3或J1重排,組成Vλ1Jλ3Cλ3基因或Vλ1Jλ1Cλ1基因,而Vλ2似乎只與Jλ2重排組成Vλ2Jλ2Cλ2基因,偶爾可見Vλ2與Jλ3或Jλ1重排,分別組成Vλ2Jλ3Cλ3基因和Vλ2Jλ1Cλ1基因。Jλ4、Cλ4不具備功能。目前尚未發(fā)現(xiàn)Vλ1與Jλ2重排。VλX只發(fā)現(xiàn)與Jλ2重排。

在人類,λ基因位于第22號染色體,Vλ約有100個,不同亞型含Cλ數(shù)量在6~9個之間,每個Cλ與各自的Jλ基因片段相鄰。λ輕鏈的轉(zhuǎn)錄過程是某一個Vλ基因片段與某一個Jλ片段連接成Vλ/Jλ外顯子,然后與鄰近Cλ基因片段重組轉(zhuǎn)錄為初級mRNA,再通過mRNA的剪接、翻譯及修飾,成為成熟的λ輕鏈。

小鼠κ輕鏈基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成

圖3-11 小鼠κ輕鏈基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成

三、免疫球蛋白基因表達(dá)的調(diào)節(jié)

(一)核因子對Ig基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)作用

Ig基因轉(zhuǎn)錄活性是由兩個順式作用組件(cis-acting elements)即啟動子(promoter,P)和增強(qiáng)子(enhancer,E)來調(diào)節(jié)。而啟動子和增強(qiáng)子的功能又由反式作用的核因子(trans-acting nuclear factor)所控制。這些核因子也稱為DNA結(jié)合蛋白(DNA-binding proteins,DBP),結(jié)合到啟動子或增強(qiáng)子內(nèi)特異的核苷酸序列,從而抑制或刺激啟動子和增強(qiáng)子的活性。許多種類細(xì)胞受到某些刺激后可誘導(dǎo)或活化特定的DBP。

1.ATGCAAAT序列及其核因子 Ig重鏈啟動子含有8個保守的核苷酸序列ATGCAAAT,這個序列也存在于κ輕鏈的啟動子、重鏈增強(qiáng)子以及許多非Ig的啟動子中。B細(xì)胞Ig基因的轉(zhuǎn)錄依賴于啟動子中這一完整的ATGCAAAT序列的存在。哺乳動物細(xì)胞中至少存在三種特異性結(jié)合ATGCAAAT的蛋白質(zhì),即Oct1、Oct2(OTF2A)和OTF2B。Oct1又稱OTF1(octamer transcription factor 1),廣泛存在于哺乳動物的細(xì)胞中;OTF2A和OTF2B為淋巴細(xì)胞特異性,活化Ig基因的轉(zhuǎn)錄。

2.GGGACTTTCC序列和NF-κB 小鼠κ鏈增強(qiáng)子含有GGGACTTTCC10bp 的序列,是一種稱之為NF-κB(nuclearfactor of kappa B)DNA結(jié)合蛋白結(jié)合的靶序列。

(1)NF-κB結(jié)合靶序列的分布:NF-κB結(jié)合的DNA序列也存在于許多其它淋巴細(xì)胞、非淋巴細(xì)胞、病毒基因增強(qiáng)子和啟動子以及HIV-1的長未端重復(fù)序列中,如某些MHCⅠ類基因,IL-2Rα鏈,TCRβ鏈,IL-2、IL-3、IL-6、IFN-α、IFN-β、IFN調(diào)節(jié)因子、GM-CSF、SV40基因等。在不轉(zhuǎn)錄κ基因的前B細(xì)胞(pre-b cell)系中無NF-κB活性,這些細(xì)胞用LPS處理后可誘導(dǎo)出有功能的NF-κB,隨之也刺激κ鏈基因的轉(zhuǎn)錄。

(2)NF-κB結(jié)構(gòu)及作用特點(diǎn):NF-κB是一個異源四聚體復(fù)合物,包含兩個與DNA結(jié)合的50kDa多肽和兩個不與DNA直接結(jié)合的65kDa多肽鏈NF-κB解離常數(shù)在10-12~10-13M之間,這種高親和力是它發(fā)揮功能所必需的。在大多數(shù)細(xì)胞系中由于抑制因子IκB與p65的偶聯(lián)作用,使整個NF-κB分子以無活性的形式存在于細(xì)胞質(zhì)內(nèi)。IκB由于磷酸化(如PKC作用)或其它的修飾作用喪失功能,從NF-κB/IκB復(fù)合物上解離下來,洲離的NF-κB隨即進(jìn)入細(xì)胞核,結(jié)合靶基因的特定序列,從而激活這一基因的轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。如抗原結(jié)合到B細(xì)胞mIg后刺激B細(xì)胞內(nèi)PKC活化。LPS也可活化PKC。NF-κB在有效合成κ鏈的骨髓瘤細(xì)胞中是無活性或是缺乏的,提示NF-κB和κ鏈基因的增強(qiáng)子在B細(xì)胞分化早期對于起始κ基因轉(zhuǎn)錄是需要的,但對于分化后期維持轉(zhuǎn)錄過程中并不是必需的。

免疫球蛋白基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)

圖3-12 免疫球蛋白基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)

注:VDJ重排使啟動子(P)靠近位于Jκ和Cκ之間的增強(qiáng)子,增加了已重排V2基因的轉(zhuǎn)錄水平,DNA結(jié)合蛋白NF-κB結(jié)合到增強(qiáng)子內(nèi)靶序列,Oct1、Oct2可結(jié)合到啟動子上。

(二)等位基因排斥現(xiàn)象

免疫球蛋白基因表達(dá)中一個重要的發(fā)現(xiàn)是等位基因排斥現(xiàn)象(allelic exclusion)。編碼人Ig重鏈基因位于第14對染色體上,在B細(xì)胞發(fā)育過程中,這一對同源染色體中僅有一條染色體Ig基因得到表達(dá)。例如一個人B細(xì)胞內(nèi)來自母本的染色體上的Ig重鏈基因得到表達(dá),則來自父本的第14號染色體的Ig重鏈基因受到抑制而不表達(dá)。這可能是通過已發(fā)生有效重排的染色體產(chǎn)生反饋抑制(feedbackinhibition)信號抑制另一條同源染色體上的Ig重鏈基因發(fā)生重排。一條染色體上Ig重鏈基因的有效重排,一方面抑制了另一條同源染色體重鏈基因的重排,另一方面可發(fā)出信號使第2號染色體上Igκ輕鏈基因發(fā)生重排,如果一對同源染色體上的κ輕鏈基因重排均無效,才發(fā)生22號染色體λ輕鏈基因重排,這種現(xiàn)象稱為輕鏈同種型排斥現(xiàn)象(light chain isotype exclusion)。

四、免疫球蛋白的多樣性

機(jī)體對外界環(huán)境中眾多抗原刺激可產(chǎn)生相應(yīng)的特異性抗體,有人推算抗體的多樣性在107以上,這種抗體多樣性主要是由遺傳控制的。引起免疫球蛋白多樣性的原因主要有以下幾個方面。

1.胚系中眾多的V、D、J基因片段 胚系(germ line)中未重排的(unrearranged) DNA有眾多的V基因片段以及一定數(shù)量的D、J基因片段。以小鼠為例。VH、DH和JH基因片段分別為1000、12和4,單獨(dú)重鏈重組的多樣性可達(dá)4.8×104左右;Vκ和Jκ分別約為250和4,κ輕鏈V-J重排的多樣性為1.0×103。經(jīng)重鏈與κ輕鏈隨機(jī)配對后推算的多樣性為(4.8×104)×(1.0×103)=4.8×107

表3-5 小鼠Ig胚系基因片段和重鏈、κ輕鏈配對的多樣性

多肽鏈基因片段數(shù)可變區(qū)基因經(jīng)重排和隨機(jī)配對后 
V J重組方式推算的多樣性數(shù)目 
重 鏈1000 12 4V-D-J4.8×104 
    4.8×107
κ輕鏈250V-J1.0×103 

注:多樣性數(shù)目不包括VDJ連接多樣性、N區(qū)插入和體細(xì)胞突變所增加的多樣性數(shù)目。

2.VDJ連接的多樣性 輕鏈基因重排過程中,VJ連接點(diǎn)以及重鏈基因重排過程中D-J以及V-D-J連接點(diǎn)有一定的變異范圍。例如輕鏈VL因片段3′端5個核苷酸CCTCC和JL基因片段5′端4個核苷酸GTGG連接時,9個核苷酸中只有6個核苷酸編碼輕鏈第95、96位氨基酸,可產(chǎn)生8種不同的連接方式(圖3-13)。

3.體細(xì)胞突變(somatic mutation) 體細(xì)胞在發(fā)育過程中可發(fā)生基因的突變。以長期體外培養(yǎng)的B細(xì)胞前體為例,每個細(xì)胞每個堿基對的突變率為1~3×10-5,這種類型突變主要發(fā)生在V基因。體細(xì)胞突變擴(kuò)展了原有胚系眾多基因片段的多樣性。

4.N區(qū)的插入(insert of N region) 在Ig重鏈基因片段重排過程中,有時可通過無模板指導(dǎo)的機(jī)理(non-temple directed mechanism)在重組后D基因片段的兩側(cè)即VH-DH或DH-JH連接處插入稱之為N區(qū)的幾個核苷酸。N區(qū)不是由胚系基因所編碼。在N區(qū)插入前,先通過外切酶切除VH-DH或DH-JH連接處的兒個堿基對,然后通過末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(terminal deoxynucleotidyl transferase,TdT)連接上N區(qū)。由于額外插入了N區(qū),可發(fā)生移碼突變(frameshift mutation),使插入部位以及下游密碼子發(fā)生改變,從而編碼不同的氨基酸,增加了抗體的多樣性。

輕鏈基因V-J連接多樣性舉例

圖3-13 輕鏈基因V-J連接多樣性舉例

N區(qū)插入D-J連的接處(示意圖)

圖3-14 N區(qū)插入D-J連的接處(示意圖)

5.輕鏈重鏈相互隨機(jī)配對 如表3-5所示,小鼠重鏈與κ輕鏈隨機(jī)配對后推算的多樣性可達(dá)4.8×107,如果再加上重鏈與λ輕鏈的隨機(jī)配對其多樣性就更多了。

第三節(jié) T細(xì)胞受體基因

編碼T細(xì)胞受體(T cell receptor,TCR)α、β、γ和δ鏈的基因定位于不同的染色體(表3-6)。人和小鼠δ基因都位于α基因的復(fù)合體中,均位于14號染色體;人TCRβ和γ鏈基因分別位于第7對染色體的長臂和短臂,小鼠β和γ鏈基因則分別位于第6和13號染色體。

表3-6 TCR多肽鏈基因定位

TCR基因染色體定位
小鼠
α 鏈14q11.1214
β 鏈7q326
γ 鏈7p1513
δ 鏈14q11.214

一、TCR基因的結(jié)構(gòu)

TCR基因的結(jié)構(gòu)和重排與Ig基因有許多相似之處。在胚系中,編碼TCR多肽鏈的DNA是由幾個分隔開的DNA片段組成,在胸腺細(xì)胞中重排后,形成編碼一條完整多肽的基因。TCR多肽鏈可變區(qū)基因是由2~4個基因片段通過重排連接在一起。V基因片段編碼信號序列和可變區(qū)氨基端95~100個氨基酸殘基;J基因片段編碼可變區(qū)羧基端13~23個氨基酸殘基。TCRβ、δ鏈V區(qū)基因除V、J基因片段外,還有1~2個D基因片段,編碼V與J之間數(shù)個氨基酸殘基。TCR不同多肽鏈可變區(qū)基因的重排可有V-J、V-D-J或V-D-D-J等幾種方式。TCR多肽鏈C基因片段通常由3~4個外顯子所組成,位于J基因片段的下游。與IgC基因片段不同,TCrC基因片段是由數(shù)個外顯子編碼一個結(jié)構(gòu)域,如β鏈的連接肽(connectingpeptide)是由3個分隔的外顯子所編碼。

(一)TCRα鏈基因

TCRα鏈基因與TCRβ鏈和Ig基因結(jié)構(gòu)有很大差別。小鼠α鏈V基因約100個,至少可分為12個家族。人Vα大約在100個左右,長約數(shù)百個kb。TCRα基因沒有Dα基因片段。人和小鼠α鏈基因都含有J基因片段(Jα),小鼠約有60個,相互間隔至少500bp。VαJα連接具有多樣性。TCRα鏈基因只有1個Cα基因片段,含有4個外顯子。在TCRα鏈基因座中有TCRδ鏈基因。TCRα鏈基因重組信號中長的間隔序列(23bp)3′端靠近Vα,短的間隔序列(12bp)的5′端靠近Jα,這種重組信號的排列方式類似Ig輕鏈V區(qū)的基因,允許Vα基因直接與Jα基因重排,而不需要VD基因片段。

(二)TCRβ鏈基因

小鼠胚系中未重排的β鏈基因結(jié)構(gòu)已經(jīng)搞清,長約數(shù)百kb。Vβ基因數(shù)目約30個,大多數(shù)Vβ基因片段位于Cβ1的上游,至少有1個Vβ(Vβ14)在Cβ2基因3′下游10kb處,與轉(zhuǎn)錄的方向相反。人Vβ基因片段約有100個。小鼠和人都有2個Dβ基因片段,12~14bp長,分別位于Jβ1和Jβ2基因片段組上游約500~600bp處。小鼠和人都有2組(cluster)Jβ基因片段,稱為Jβ1和Jβ2,與相應(yīng)的Cβ1和Cβ2基因片段間隔2~3kb。小鼠Jβ1和Jβ2各含7個Jβ基因片段,其中6個有功能,Jβ基因片段相互間隔36~421bp。人Jβ1和Jβ2各含7個有功能的Jβ基因片段。人和鼠TCRβ基因都有2個基本相同的Cβ基因片段,各含4個外顯子。Cβ1和Cβ2高度同源,2個Cβ基因片段的編碼產(chǎn)物中只有4個氨基酸殘基(小鼠)或5個氨基酸(人)不同。

TCRα和β鏈V基因編碼區(qū)域包括了相當(dāng)于Ig的CDR1和CDR2,主要是識別MHC分子和抗原的復(fù)合物。CDR3主要是由于V-D-J或V-D-D-J連接的多樣性(junctionaldiversity)和廣泛分布的N核苷酸插入(Nnucleotide insertion)所造成,其有高度的多樣性,可識別眾多種類的抗原。

小鼠TCR基因的結(jié)構(gòu)

圖3-15 小鼠TCR基因的結(jié)構(gòu)

(三)TCRγ鏈基因

Vγ基因片段數(shù)較少,在Balb/c小鼠Vγ基因片段有7個,分為5個家族,其中4個家族各只含1個Vγ,另一家族有3個Vγ。人Vγ有14個,其中8個是有功能的。人和小鼠TCRγ鏈基因均不含D基因片段。在小鼠,有4個Jγ基因片段,基中Jγ1、Jγ3和Jγ4分別位于3個Cγ基因片段的上游,Jγ3為假基因。在人類共有5個Jγ基因片段,可分為Jγ1和Jγ2兩組,其中Jγ1的3個片段位于Cγ1上游,Jγ2的2個片段位于Cγ2基因片段的上游。不鼠有4個Cγ基因片段,其中Cγ3是假基因。人有2個Cγ基因片段,相距約10kb,其中1個Cγ有3個外顯子,另一個Cγ含有4個或5個外顯子。編碼γ鏈連接肽部分的兩個Cγ基因外顯子組成存在著差異,有一個Cγ基因片段不編碼半胱氨酸,因此造成了TCRγ鏈在分子量、N-連接糖基化的形式以及是否與TCRδ鏈之間形成二硫鍵有所不同。

人TCR基因的結(jié)構(gòu)

圖3-16 人TCR基因的結(jié)構(gòu)

(四)TCRδ鏈基因

人和小鼠TCr δ鏈基因結(jié)構(gòu)十分相似,均位于α鏈基因座內(nèi)。在Balb/c小鼠,Vδ基因片段數(shù)約為8個。在小鼠δ鏈基因中有2個Dδ、2個Jδ和1個Cδ基因。在胸腺細(xì)胞分化過程中,δ鏈先于α鏈表達(dá)。Vα與Jα重排可導(dǎo)致δ基因復(fù)合物中D、J和C基因片段的缺失。在人δ鏈基因中有8個Vδ基因片段,2個Dδ、3個Jδ和1個Cδ。某些Vδ基因片段是與TCRα鏈Vα基因共用的。

TCRδ鏈基因連接信號的排列方式是:每個Vδ基因片段的3′端緊靠著“七聚體-長間隔序列-九聚體”(7-23-9)結(jié)構(gòu);Dδ基因片段5′端是“九聚體-短間隔序列-七聚體(9-12-7)結(jié)構(gòu),3′端是“7-23-9”結(jié)構(gòu);2個Jδ基因片段的5′端是“9-12-7”結(jié)構(gòu)。這種TCRδ鏈基因重組信號排列的方式使得V、D、J鏈接可有以下幾種不同方式:(1)V-D-J連接,在小鼠胚胎TCRγδ胸腺細(xì)胞最常見到Vδ-Dδ2-Jδ的連接,人胚胎胸腺細(xì)胞最常見到Vδ-Dδ3-Jδ;(2)V-J的直接連接;(3)大多數(shù)成年小鼠TCRγδ胸腺細(xì)胞以Vδ-Dδ1-Dδ2-Jδ連接,人妊娠后期胎兒TCRγδ胸腺細(xì)胞也存在著Vδ-Dδ1-Dδ2-Jδ的排列方式。Vδ基因位于Vα基因之中,同一個V基因片段可用作Vδ或Vα,如果V基因片段是用作Vδ,多發(fā)生V-D(-D)-J重排。

小鼠TCRγδ T細(xì)胞γ和δ鏈配對的,Vδ1幾乎總是和Vγ5或Vγ6配對。小鼠TCRγδ陽性樹突狀表皮細(xì)胞(DEC)幾乎都是Vγ5與Vδ1配對。在人Vδ2幾乎總是與Vγ9配對。

小鼠TCRβ基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成

圖3-17 小鼠TCRβ基因重排順序、轉(zhuǎn)錄和合成

二、TCR基因的重排

T細(xì)胞在胸腺中發(fā)育成熟過程中,TCR基因按照一定的順序發(fā)生重排。TCR基因的重排順序和表達(dá)與免疫球蛋白基因的重排和表達(dá)十分相似。在基因組中的識別序列包括了一個保守的七聚體和九聚體,七聚體與九聚體之間含有一個不保守的12堿基對或23堿基對間隔序列(spacer sequence)。

TCRβ鏈基因座的重排要先于α鏈。首先是一個Dβ片段與一個Jβ片段連接,然后D-J與一個Vβ片段相連,完成了VDJ基因的重組。TCRβ鏈初級的RNA轉(zhuǎn)錄本在重組的VDJ和C基因之間含有內(nèi)含子。VDJ與Cβ1或Cβ2的重排是隨機(jī)的,目前尚未發(fā)現(xiàn)Cβ類似Ig重鏈類別轉(zhuǎn)換那樣從一個Cβ基因轉(zhuǎn)換到另一個Cβ基因上。在小鼠Cβ2基因的3′端推測有一個增強(qiáng)子。

TCRβ鏈基因的功能性重排和表達(dá),誘導(dǎo)了TCRα基因的重排。α鏈基因的重排與β鏈相似,由于α鏈基因不存在D片段,故α鏈基因只有V-J的連接。小鼠Vα轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)的5′端有一個啟動子,Cα基因的3′端也有一個增強(qiáng)子。此外,靠近α鏈增強(qiáng)子處有“靜息順序”(silencersequences),這些順序可抑制非T細(xì)胞或者是TCRγδT細(xì)胞中α鏈的轉(zhuǎn)錄。由于α鏈只有一個Cα基因,因此一旦初始的轉(zhuǎn)錄本形成后,經(jīng)過RNA加工只能產(chǎn)生一種完整的α鏈mRNA。

如同Ig基因的重排和表達(dá),TCRα和β鏈基因的重排和表達(dá)也有等位基因排斥現(xiàn)象(al-lelicexclusion),如果在一條染色體上TCR基因的重排是有效的,那末就可以抑制另一條染色體相應(yīng)等位基因座的重排。當(dāng)一條染色體上α鏈或β鏈基因座的重排、轉(zhuǎn)錄或翻譯無效時,則另一條染色體上相應(yīng)α或β鏈相應(yīng)的等位基因座開始發(fā)生重排。如果兩條染色體上TCRα或β鏈基因重排都無效,則未成熟的T細(xì)胞死亡。

三、T細(xì)胞庫的多樣性

推測T細(xì)胞庫(T cell repertoire)中多樣性在1010以上,其多樣性的原因與Ig相似,主要有以下幾方面。

1.胚系中有眾多的V、D和J基因片段 盡管TCRα和β基因中V基因片段數(shù)比Ig基因少,但J基因片段明顯比Ig基因?yàn)槎?,如小鼠中約50~100個Jα和至少12個Jβ基因片段,而IgH和κ鏈基因座中J基因片段各只有4個。

2.連接處連接的多樣性 與IgVDJ連接的多樣性相似。

3.N區(qū)的插入 N區(qū)插入在Ig基因重排中只發(fā)生在重鏈基因,而TCRα和β鏈基因均可發(fā)生N區(qū)的插入。此外,在TCRα和β鏈基因中都發(fā)現(xiàn)一種稱之為“易變性”(flexibility)的現(xiàn)象,如有一個以上Vα基因3′端可以連接到Jα片段。

4.TCRα與β鏈的隨機(jī)配對 人TCRαβ庫多樣性可推算為:α鏈(Vα(100)×Jα(100))×β鏈(Vβ(100)×Dβ(2)×Jβ(14))=2.8×107,這種多樣性尚未包括N區(qū)插入所擴(kuò)展的多樣性。

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