在大部分遠(yuǎn)征軍回國后，留下的戍衛(wèi)部隊分配給了當(dāng)?shù)氐?1個衛(wèi)駐防，基本上控制了越南的主要城市和交通要道。為了緩解矛盾，明成祖還下令赦免全部參加過胡朝抵抗軍的當(dāng)?shù)厝耍⒊兄Z全境免稅3年。明朝還特意招募了舊官吏或讀書人，到南京接受培訓(xùn)。以便日后以大明官員的身份回家鄉(xiāng)任職。當(dāng)然，以上這些政策的成本還是來自明軍在戰(zhàn)爭中的劫掠所得。包括了完整繳獲的前胡朝府庫。等到這些資源迅速用完，明朝的統(tǒng)治便不再溫情脈脈。

已經(jīng)被安排到南部邊境的陳氏后裔，自然不滿明朝的出爾反爾之舉。他們很快就在靠近占城的邊境起兵，組織了自己的抵抗力量。1408年，僅有一隅之地的他們，選擇軍北上清化。還留守在越南的沐晟帶兵趕去鎮(zhèn)壓，結(jié)果因遭到伏擊而戰(zhàn)敗。但因為陳氏土豪的內(nèi)部紛爭，明軍得以在北部獲得了喘息之際。張輔在第二年率領(lǐng)數(shù)萬軍隊再次南下，成功擊敗了剛剛完成內(nèi)訌的陳朝復(fù)國者。但其主要成員依然在邊境各處活動，搞得明軍疲憊不堪。

為了警告不服王化的當(dāng)?shù)厝?，明軍開始在越南南部施行全面掃蕩。不僅將屠戮尸體堆積成山，還將死者的腸子抽出來掛在樹上。由于明朝水師基都用于浩大的下西洋航行，讓深處前線的明軍遭遇后勤危機。張輔的部隊便開始食用抓捕或殺死的越南當(dāng)?shù)厝?，甚至公開販?zhǔn)鄱嘤嗳巳狻８鼮榱伺腼兒腿沸枰?，恢?fù)了駭人聽聞的炮烙之刑。至此，明軍不再愿意對越南全境施行懷柔政策。

陳氏皇族后裔的留居地，在1413年被朱棣下令取消。接著，正宗的明朝式高壓統(tǒng)治在1414年全面降臨。雖然有律令規(guī)定的貢賦比例，但根本擋不住明朝流官的各種臨時加增與攤派。除了部分讀書人可以加入下級官吏隊伍，其余大部分人都可能被衛(wèi)所納入軍籍行列。這樣，他們就成為了供養(yǎng)明朝占領(lǐng)軍軍官的奴隸階層。

普通民眾也在繳納重稅之余，面臨強制徭役威脅。最倒霉的人會被要求步行去燕京地區(qū)，為明成祖修建他野心勃勃的新大都和紫禁城。至于掌握一定技能的工匠，也可能因為手藝高超而被明軍壓往國內(nèi)，從此再無機會見到故土。明成祖還特意下令在各州縣設(shè)立官學(xué)，強迫越南讀書人使用大明文字。軍隊被派往各地收繳用越南文寫成的書籍、搗毀本土文字篆刻的石碑。除了佛教與道教的典籍外，其余內(nèi)容都要一律銷毀。

至于在今天被廣大明粉口誅筆伐的“剃發(fā)易服政策”，也在1414年的越南由明軍開始強制推廣。所有男女的服飾和發(fā)型，都必須按照明朝內(nèi)陸的樣式改造。嶺南傳統(tǒng)的斷發(fā)習(xí)俗和本地婦女為了方便勞動而穿著的短裙，是明朝流官的重點消滅對象。